1854年(清咸丰四年) 2月24日，巨野县城被粤义军攻陷，县令朱远昌、学官辛
本榷， 率团练在县城固守，战死守城团练1312人。4月，起义军由临清败归巨野，
守城团练132人死亡。
1858年(清咸丰八年)11月，皖军(捻军)孙癸心率众入巨野，驻巨野清兵团练迫
战玉山集(今独山集) 。皖军击溃郓城、巨野两县清兵427人。1860年11月10日，清
廷僧格林沁统兵驻县城，15日在金乡县葛山被皖军打败。此仗，副都统格鸿额被打
死。16日僧兵自独山败退。1861年4月25日，清兵与皖军在巨野北部郓城南部大战。
5月上旬，僧兵在巨野龙固西大战。两次大战伤亡数百人。同年7月15日，捻军李嘉
英、赵浩然等陆续过大义，至9月，自坡东败回。
1894年(清光绪二十年) 6月18日，菏泽农民悍军王朋率众攻陷龙固防营，杀死
清官兵17人。 翌年2月，王朋打算竖旗起义，因大雪封门，行动不便，后被清兵镇
压，陆续解散。
1890年，巨野“大刀会”(亦称“义和团”)崛起，反清、反洋、反贪官污吏，
影响全县。会员遍布县东部大多数乡村，持有大刀、长枪，有少量的“洋枪”，与
清兵开展搏斗，先后杀死官兵数百人。1902年，“大刀会”领袖曹言学、王昆伦与
成武、定陶、单县等地义和团联合，动员上万人，日夜活动，已形成反洋、反封建
的强大力量。
1912年2月， 邬景山等带领湖团农民数百人回巨野，被曹州镇守使张善义帅千
余兵镇压赶回。是年冬，曹州镇守使施从滨第五师营长王康福驻巨野防守。
1917年范炳心和王庚烈 (外号白天祖) 等， 在金山聚众万余人，于次年7月以
“替天行道、 杀富济贫”为旗号，南征湖团，北破肥城，直至8月，被国民军镇压
散失。