1958年11月，山东省莱阳专员公署改称山东省烟台地区行政专员公署。是年，专署机构设有办公室、行政管理处、民政局、公安处、法院、检察院、交际处、经济计划委员会、劳动局、物资供应局、建筑工程局、重工业局、轻工业局、冶金工业局、矿冶局、基本建设委员会、交通局、邮电局、农林局、水利建设指挥部、财政局、商业局、粮食局、人民银行烟台地区中心支行、建设银行、文教局、卫生局。此后，专署工作机构屡有裁并和增设。1966年，专署机构设有办公室、计划委员会、劳动局、统计局、物资局、经济委员会、工业局、交通局、机械工业局、电业局、手工业管理局、手工业联社、专酿专卖事业管理局、财贸办公室、财政局、税务局、商业局、供销社、粮食局、人民银行烟台专区中心支行、建设银行、工商银行、物价委员会、人事监察局、档案局、民政局、公安处、法院、检察院、外事办公室、交际处、外贸局、建筑工程局、邮电局、农业局、林业局、水产局、水利建设指挥部、多种经营办公室、专卖管理处、盐管处、盐务管理局、文教局、卫生局、计划生育办公室。
1967年2月，烟台专员公署由烟台地区革命委员会取代。
烟台专署领导人
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┃ 姓名 │ 职务 │ 任职时间 ┃
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┃ 刘健 │ 专员 │ 1958.11～1967.2 ┃
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┃ 孙超 │ 副专员 │ 1958.11～1967.2 ┃
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┃ 李镇东 │ 副专员 │ 1958.11～1962.9 ┃
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┃ 陈英序 │ 副专员 ┃ 1958.11～1967.2 ┃
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┃ 丁江 │ 副专员 ┃ 1958.11～1961.4 ┃
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┃ 曲百里 │ 副专员 ┃ 1958.11～1962.9 ┃
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┃ 孙长林 │ 副专员 │ 1960.7～1967.2 ┃
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