康熙二十一年（１６８２年）八月开纂，至次年
十二月完成，康熙二十三年（１６８４年）二月告庙颁谱，共刊印１００部。
参加纂修者共７人，设鉴定、监修、督刊、编次、校阅等职，以衍圣公孔毓圻
为鉴定，孔尚任为编次。在开局修谱前后，衍圣公及家庭族长先后向族人４次
榜示，提出修谱要“严核假冒，表彰懿行，斥除匪类，务秉至公”，并规定凡
不孝、不悌、干名、犯义、僧道、邪巫、优卒、贱役和不按规定行辈表字命名
的，均不准入谱。这次修谱按《史记·孔子世家》定名为《孔子世家谱》，在
内容安排及分户上也作了一些调整。该谱共２４卷。卷首有衍圣公孔毓圻、世
职知县孔兴 的序文和凡例等。卷一为姓源，卷二为年表，卷三为
世系，卷四为中兴，卷五至卷二十四分别记载了２０派６０户的繁衍状况。卷
末附有《流寓记》和《跋》。《流寓记》概括记述了外徙１０个支派，包括浙
江衢州西安县孔传子孙，河南开封仪封县孔惟时子孙，镇江府丹阳县孔绚子孙
等，其后裔人名未作详载。