孔林是孔子家族的墓地，虽然墓葬很多，但是由于封建社会的礼制中没有关于墓葬建筑的规定，所以孔林的建筑很少，只有明清时期的木石建筑二十余座。建筑主要集中在主轴上，个别的衍圣公墓前建有碑亭、石坊、石门等建筑。
一、神道建筑
万古长春坊 位于孔林神道上，明万历二十二年（1594年）山东巡抚郑汝璧、巡按连标添建。坊石质、仿木结构，庑殿顶，除明间外，其他四间向内一端切断。檐下斗栱富有地方特色，没有生硬仿造木斗栱，而是结合石质的受力特性和加工条件以简化的座斗承托两层如意斗栱。额枋、立柱、花板遍布精美雕刻，柱、枋高浮雕，花板浅浮雕。明间两石柱前后各浮雕两条盘龙，再外两石柱只上部各雕一条，边柱上部各雕一只立凤。明间额枋南雕双龙戏珠、北雕双狮戏球，次间均雕双凤朝阳，稍间前后雕双龙戏珠。龙门枋明间前后均雕二龙戏珠，两次间雕双凤朝阳，稍间雕一条行龙。花板雕刻祥云、瑞草等图案。坊额刻于明间花板上，字正书，笔势沉厚，字体端庄，形制如匾，匾缘也用浮雕，前后各不相同。南面上缘饰祥云，下缘饰三只凤凰，左右缘各饰一条团龙，北面上缘饰缠枝蔓草，下缘四只行走麒麟，左右缘各饰一只蹲立麒麟。石柱前后用石抱鼓，鼓上浮雕石狮，两侧面上分别浮雕龙、鹿、牡丹等图案。坊通宽约19米，通高约9.7米，矗立于旷野之中，益显得雄伟精美。
曲阜孔林万古长春坊
神道碑亭 位于万古长春坊东侧偏南，内立“大成至圣先师孔子神道碑”，明万历二十二年（1594年）山东巡抚郑汝璧、巡按连标立石，碑亭也当为此时建造。亭方形，明间南面洞开，东、西、北三面设石栏，次间均砌实墙。重檐绿瓦歇山顶，上下檐均用一斗二升交麻叶斗栱，明间三 ，次间一 ，麻叶头雕成云纹，出锋。座斗斗欹有 ，额枋高瘦，平板枋扁宽，角柱略有升起。上檐因踩步金梁较低，老角梁坡度平缓，屋角高翘，下檐角梁尾插入金柱，梁尾位置较高，使下檐坡度变陡，致使屋角升起平缓，上下檐适成对比。从整个木架看，虽经明崇祯年间及清代几次重修，仍保存着明代特点。
万历重修林庙碑亭 位于孔林神道西侧，万古长春坊略南。亭重檐歇山顶，结构全如神道碑亭。亭内立“阙里重修林庙碑”，于慎行撰文，杨巍书丹，赵焕篆额，记述山东巡抚郑汝璧、巡按连标维修孔子林庙并周公庙、颜子庙事。碑立于万历二十三年（1595年），碑亭也当为此时建。
至圣林坊 位于孔林正门前，原名“宣圣林”坊，大约在清雍正七年（1729年）与孔庙同时改称“宣圣”。四柱三间三楼式牌坊，绿琉璃庑殿顶，侧楼向内一侧切断。正脊高约9米，通宽10.5米（柱中至柱中）。明间用重翘三昂十一踩斗栱，平身科六 ，次间用单翘重昂七踩斗栱、平身科二 。昂嘴刻云纹形并向上翻起，昂下刻有华头子线。四柱前后用夹杆石和戗木，中柱通到座斗后缩为灯笼榫直通屋顶脊檩，次柱直托转角斗栱。坊始见于明正德本《阙里志》，从文献记载看，明永乐二十二年（1424年）曾“创门宇以严锁钥，建铺舍以便巡卫”，而至圣林坊正是门的形制，柱间设栅栏，柱外栅栏与两侧八字墙相接。柱子肥硕，仍存早期建筑特点，当是此时所建。
大林门 孔林的正门，位于至圣林坊后。门屋三间，宽10.8米，深5.3米（均柱中至柱中），正脊高6.7米。断砌造，门筑于高台上（台高1.1米），明间留出车道，是宋元时期的流行做法，与元至顺二年（1331年）“作周垣，建重门”的记载正吻合，此门即为这年始建。现存门屋绿瓦悬山顶、五檩三柱分心式木架，无斗栱，中柱柱顶直承脊檩，边柱略有侧脚，均用鼓礅为柱础，悬山挑山很小，单双步梁的断面均近方形，都呈清代建筑特点。门初建时榜名“宣圣林”，大约在明永乐添建“宣圣林”坊后改称大林门。
二林门 位于大林门后。本为鲁城北墙的缺口（旧文献记为龙门遗址，但近年考古记为此处非门），金代时此处无门，元至顺二年（1331年）始建，明弘治七年（1494年）六十一代衍圣公孔弘泰添建门楼，“神门隘陋也，架以楼观”。今存门楼五间，面阔21.8米，进深10.89米，五檩重檐绿瓦歇山顶，无斗栱，室内深一间，阔三间，下檐有一周副阶。明间前后辟门，次间只设槛窗。次间前后加老檐柱支承朱步金梁是比较特殊的做法，三架梁上用叉手，仍采用古老的做法，外檐柱均用鼓墩柱础，但檐柱肥硕，当是清代重修仍用旧料。
二、孔子墓前建筑
洙水桥坊 位于孔子墓轴线南端，石质，三间四柱冲天柱式，柱为方形抹角，有收分，边柱有侧脚，前后以抱鼓石夹持，柱顶圆雕石兽，独角披鳞，仰天蹲坐。柱以石枋相连接，枋上覆盖石雕屋顶。明间额枋阴刻“洙水桥”坊额，二次间均减地平钑二龙戏柱图案，造型简朴庄重。
洙水桥 位于孔子墓轴线南端，洙水桥坊后。拱形，石券，宽6.6米，长25.24米。桥面拱起如虹，遮住人们北望的视线，以示墓室深藏。始建年代不详，金代孔元措《孔氏祖庭广记》“孔林图”中已有此桥，明弘治七年（1494年）六十一代衍圣公孔弘泰“以石桥卑小，增以栏杆”，并于左右两侧各添建一座辅桥。
墓门 位于孔子墓轴线中部，门屋三间，绿瓦悬山顶，三柱五檩分心式木架。檐下用一斗二升交麻叶斗栱，麻叶并未雕刻云纹，只以颜色画出。平身科明间四 ，次间三 。墓门之建始于汉永寿三年（公元157年），金代时位于今享殿处，明永乐十二年（1414年）重建。现存建筑不用平板枋，雀替前部呈巨大S形，坐斗斗欹无 ，都呈清代建筑特点，当是清代重建。但檐柱肥短，高约3.5米，直径却近0.4米，应是明代旧物。墓门两侧也设八字墙，如同阳间住宅。门基高1.31米，用以遮挡人们视线，南设八级台阶，北设六级，均取双数。三间均设门，每扇门上均施门钉九排，每排九个，已是最高等级的装饰。
享殿 祭祀时设置香坛的地方。始见于金孔元措《孔氏祖庭广记》“孔林图”中，孔子祖孙三代墓前各有一座，明正德本《阙里志》，万历本《兖州府志》“孔林图”中均作一座享殿，考之于文献，当为明弘治七年（1494年）六十一代衍圣公孔弘泰创建。明万历二十二年（1594年）重修，清雍正九年重修并改为黄瓦。现存建筑五间，面阔20.3米，进深约9.7米（柱中至柱中），脊高约10米。九檩单檐黄瓦歇山顶，前后廊式木架，前为廊。檐下用重昂五踩斗栱，每间均为两 ，布置疏朗。柱斗科头昂宽度为1.5个斗口，梁头作耍头形，因间宽不一，为照顾栱间距离，柱头科两侧栱长不一样。殿内和前廊无用平棋天花，沥粉贴金龙，额枋为金龙和玺彩画。室内置供案，存有清世宗维修孔林“纶言”碑和高宗御制诗碑，诗碑四面刻高宗五次谒孔林诗五首。
楷亭 位于享殿后，墓道东侧，纪念子贡手植楷树的建筑，又传为子贡偃息处。楷亭始见于清孔尚任《阙里志》。今亭方形，每面阔5.50米，一间，攒尖灰瓦顶，不用斗栱，不设门窗墙体，四面空透，柱用鼓礅柱础，木料纤细，当为清晚期重建。亭内立有楷图碑，为清康熙五十一年（1712年）刻立。
清高宗驻跸亭 位于孔子墓道东侧，楷亭之北。亭一间，方形，每面约6.5米，黄瓦攒尖顶，南面设门，北面为墙，东、西面设格窗。檐下用一斗二升交麻叶云斗栱，每面四 ，也是绘出云纹。室内以抹角梁承金檩，下装平棋天花。北墙悬挂清高宗乾隆十三年（1748年）御制诗木牌：“宫墙亲释莫，林墓此重来。地辟天开处，泗南洙北隈。春鸣仙乐鸟，冬绿石碑苔。教泽垂千古，泰山终未颓。”清高宗八次来曲阜，多次至孔子墓前亲行一跪三叩礼。
清圣祖驻跸亭 位于孔子墓道东侧。亭方形，面阔约6.5米，一间，黄瓦歇山顶。南面设槅扇门，北面设墙，东西设窗。檐下用一斗二升交麻叶斗栱，每间二 。南北二面以扒梁头出麻叶头，宽约二斗口，扒梁上架三架梁，瓜柱皆有角背，刻三幅云及云纹，收山大于一檩径。亭内有碑，题“圣祖仁皇帝驻跸亭”。清康熙二十三年（1684年），圣祖曾至孔林亲祭孔子墓。为纪念此事，衍圣公于林内建亭，乾隆间亭曾倒塌，即依原样重建。
宋真宗驻跸亭 位于孔子墓道东侧。宋真宗于大中祥符元年（1008年）至曲阜，亲拜孔子墓，孔子后代即建亭纪念。金代时亭在今二林门略外，明代时在今享殿甬道东侧，清康熙间已位于今处。亭方形，面阔5.6米，绿瓦歇山顶。南面设门，东西面设窗，北面为墙，檐下用一斗二升交麻叶斗栱，每面两 。坐斗尺度较大、斗欹有 ，额枋高瘦，平板枋扁宽，出榫平切，转角处置斗口跳，不设斜向麻叶头，屋顶收山大于一檩径，仍存有明代建筑的特点，亭内立碑一通，阴刻“宋真宗驻跸亭”。
子贡庐墓堂 位于孔子墓前两侧，明嘉靖二年（1523年）山东巡抚陈凤梧为纪念子贡为孔子守墓创建，后经多次维修。现存建筑三间，东向，灰瓦硬山顶，五檩抬梁式木架，无斗栱。明间设门，两次间设直棂窗，室内原设有端木赐神位。堂前有“子贡庐墓处”石碑。
思堂 又名斋厅，位于孔子墓轴线东侧，墓门之东，是孔子后代祭祀孔子墓之后宴饮之处。始建于东汉永寿三年（公元157年），金代时位于甬道之东，即今二林门东北。蒙古乃马真后四年（1245年）曾重修，明永乐十九年（1421年）五十九代衍圣公孔彦缙扩建，面阔由三丈五尺扩至四丈五尺，进深由一丈八尺扩至二丈八尺，高一丈七尺扩至二丈一尺，并建大门三间。万历二十二年（1594年）、清道光二年（1821年）多次重修。现存建筑为三合院，正厅三间，七檩灰瓦悬山顶，四柱前后廊式木架，前出廊。柱高3.25米，直径近0.4米，比例短粗，挑山很大，出墙米许，建筑尺度低矮，仍存明代风格。西山有一间耳室，两侧各有三间厢房，五檩灰瓦悬山顶，前出廊。再前有照壁一堵，大门一间。门灰瓦悬山顶，三柱分心式木架，前面有垂花，而后面却无。院西北设一门，砖墙承重，灰瓦庑殿顶，直接通向孔子墓甬道。两厢墙上镶嵌宋、元、明代谒林题记、题诗石刻39块，较为著名的有宋李格非、明吴宽等人的题记。
后土祠 奉祀孔林土地的地方。明正德本《阙里志》、万历本《兖州府志》“孔林图”中均已记载，均位于思堂之东，面西。今后土祠仍位于思堂之东，面南，有门相通。祠三间，灰瓦硬山顶。
神庖 祭祀孔子时治办祭品的地方，明正德本《阙里志》、万历本《兖州府志》“孔林图”中均名厨房，面西，位于思堂之东，后土之南。今神庖位于后土之东，独立成院。前有门，一间，砖墙承重，门上嵌砖阴刻“神庖”二字，正房三间，灰瓦硬山顶。
三、衍圣公墓前建筑
孔毓圻墓碑亭 位于孔林东部孔毓圻墓前。清雍正元年（1723年），世宗追封孔子上五代为王爵，衍圣公孔毓圻入朝谢恩，病逝于北京，世宗追谥恭悫，并御制碑文，次年立碑建亭。亭方形，阔8米，每面三间，中间设栅栏，次间砖砌实墙。灰瓦重檐歇山顶，上下檐均用重昂五踩斗栱，明间两 。斗口较小，昂头雕云纹，向上翻起，昂下刻华头子线。柱头科昂宽约两个半斗口，有剥腮，角科有附角斗，连有三个座斗。歇山顶没有收山，反而跳出柱中心线外一檩径，是奇特的做法，加长了歇山正脊的长度，调整了比例，外观显得庄重匀称。亭内石碑龟趺螭首，东刻汉文，西刻满文。梁枋施旋子彩画。
儒宗在念坊 位于七十代衍圣公孔广棨墓前。三间四柱冲天柱式石坊，柱八棱形，前后以石鼓夹抱，中柱顶饰圆雕蹲兽，边柱顶饰宝瓶。额枋一层，上施平板枋、枋上施山形饰物，两次间浮雕云纹，明间浮雕二龙捧珠，珠下刻出竖匾形，阴刻“恩荣”二字。明间额枋边饰云龙纹，减地阴刻，中刻“儒宗在念”坊名，坊名正中上刻“玉音”二字，阴刻二龙捧护。孔广榮卒于清乾隆八年（1743年），坊当略晚于这年建。
于氏坊 位于孔林东北部的七十二代衍圣公孔宪培墓前。清道光三年（1823年）十二月二十八日，孔宪培元配夫人于氏（相传为清高宗之女，其实为于敏中之女）去世，五年（1825年）皇帝循例派人御祭，七十三代衍圣公建坊，将祭文刻于正面，背面刻“鸾音褒德”四字。三间四柱三楼式木牌坊，明楼灰瓦庑殿顶，次间向内一侧切断，向外一侧为歇山顶。明闾楼下用重翘三昂十一踩斗栱，补间六 。次间用单翘重昂七踩斗栱，补问二 。柱左右用夹杆石，中柱两层，直托龙门枋。
孔彦缙墓神门 位于孔林西部孔彦缙墓前。神门一间，石构。双柱方形，抹角，前后以石鼓夹抱。额枋一层，阴刻“荣禄大夫衍圣公神门”，额枋顶上中间雕宝珠，宝珠外两侧各雕一朵祥云，再外即柱顶上部各雕一只蹲兽，兽首相向，均为圆雕，且舆额枋为一体。孔彦缙卒于明景泰六年（1455年），神道碑立于天顺二年（1458年），神门当刻于此间。检《明史》，二品官墓前石仪可立石翁仲、石虎、石羊、石马、望柱，并无神门的规定，自孔彦缙之后，衍圣公墓前多立神门。
