孔庙是中国著名的宫殿式建筑群之一，历史悠久，建筑众多。由于历代越来越尊崇孔子，孔子庙建筑规模也越来越大，当然建筑的年代也越来越晚。现存建筑104座，466间，分别建于金、元、明、清时期，民国年间曾经维修，新中国成立后不断维修，并重建来早已倒塌的神厨正厅、西厢和庙后的西仓等。
仰圣门 曲阜城的正南门。明正德八年（1513年），为保护孔庙，“移县城卫庙”，以孔庙为中心营建新县城。初建时，庙前原无城门，万历二十二年（1594年）始于庙前城墙上辟门，命名“仰圣门”，习称正南门。门砖砌券栱，重门，中夹瓮城。前门南面有额，阴刻“万仞宫墙”四字，是根据子贡赞扬孔子的“夫子之墙数仞”语来命名的。额原为明山东巡抚胡缵宗题，清乾隆十三年（1748年），高宗弘历重题，书体端庄典雅，秀丽中透刚健之气。门上有重檐城楼，1930年蒋冯阎大战时被毁，1989年重建。四柱前后廊式木架，灰瓦歇山顶，原有额“万代瞻仰”。两侧城墙1977年春被拆除，2003年重建。门过去平时紧闭，只有皇帝祭孔或派人祭孔时才开启，如同孔庙的大门。
金声玉振坊 明嘉靖十七年（1538年），山东巡抚胡缵宗建，据孟子赞扬孔子的“孔子之谓集大成。集大成也者，金声而玉振之也”命名题额。坊三门四柱三楼冲天柱式，高5.6米（柱顶，下同），长13.5米（柱中至柱中，下同）。柱八角形，前后石抱鼓夹抱，柱头仰莲座，顶踞圆雕（一种石雕做法，将物刻成完全立体，不附着任何背景，可以四面欣赏）石兽。石兽鳞甲独角，造型古拙，雕刻精美。明间额枋稍高，阴刻“金声玉振”四字，书体刚健雄浑。两稍间额枋稍低，平钑（一种石雕做法，在石平面上阴刻线条构成图形）云龙图案，线条流畅优美。额枋均覆屋盖，整石刻成瓦陇形，悬山顶，有脊无吻。
下马碑 位于庙门前，棂星门两侧。阴刻“官员人等至此下马”，习称下马碑。碑始立于金明昌二年（1191年），明永乐十五年（1417年）重刻。过去不论文武官员还是庶民百姓，从孔庙前经过都要下马下轿，皇帝祭祀孔子也是步行进庙，以示尊敬。
泮水桥 清康熙十六年（1677年），孔子六十七代孙、衍圣公孔毓圻建，雍正三年（1725年）修庙时曾更换桥北栏板十一块、栏柱四根。桥单孔，栱形，宽4.45米，长7.38米，中置浅浮雕（石雕的一种做法，将圆形刻出，高出周围底面几毫米至三四厘米）龙陛。两侧有桥栏，桥北端沿河也置石栏，栏北折与庙墙相连，与棂星门组成一个长21.1米、深8.55米的半封闭空间，桥下河水呈半圆形从庙前穿过。
棂星门 孔庙的第一道门。棂星，又名灵星、天田星，古人认为“主得士之庆”，帝王祭天时要先祭棂星。曲阜孔庙在明宣德九年（1434年）以前就有棂星门，但位置不详，约明嘉靖初年建于庙门前，原为木质，清乾隆十九年（1754年），七十一代衍圣公孔昭焕改为石质。棂星门名为门，实为坊，三间四柱火焰冲天柱式，三间均安设栅栏门，左右接墙垣。坊高10.34米，长13米。圆柱，前后石抱鼓夹抱，上下两节，两节相交处加石戗柱斜撑。柱头刻云罐，分刻圆雕四大天王。柱出头用云板，但高在额枋以上四五十厘米处，与一般石坊做法不同。额枋以铁梁承托，每梁上各铸有四个龙头阀阅。额枋明间两层，稍间一层。明间上层与稍间两侧刻绦环花纹，明间中刻二龙戏珠，稍间中刻云鹤，均为浅浮雕，顶上圆雕火焰宝珠。明间下层两端浮雕云鹤，中刻阳文“棂星门”三字，书体隽秀，清乾隆十三年（1748年）高宗弘历题。坊结构匀称，造型清秀，雕刻精美。
曲阜孔子庙棂星门
太和元气坊 太和典出《易》：“保合大和，乃利贞。”后人解释说：“乃能保安合会大利之道，乃能利贞于万物。”“大和”即“太和”，后世因以指阴阳会合、冲和的元气。元气，本指产生和构成天地万物的原始物质，宋程颢以此比喻孔子思想，明英宗朱祁镇又以“太和元气”赞颂孔子。明嘉靖二十三年（1544年），山东巡按郑芸建坊时命名为“太和元气”，山东巡抚曾铣书额，书体端庄雄雅。
至圣庙坊 位于圣时门前，未见始建年代，始见于明弘治庙图中，当为弘治十三年（1500年）修庙时所添建。时名“宣圣庙”坊，清雍正七年（1729年）改名为“至圣庙”。坊为汉白玉质，三门四柱冲天柱式，形式简朴，无楼，额枋也仅为一层，明间额枋顶上刻圆雕火焰宝珠，中阴刻篆书“至圣庙”三字，笃重典雅，不知何人所书。两稍间额枋平钑镌刻云龙图案，线条柔畅，构图匀称，雕刻精细。中二柱仰莲座下出云板，向内一侧刻日形，以宝瓶支于额枋上。
德侔天地坊 位于圣时门东庙墙上，是孔庙的第一道偏门。坊始建于明永乐十三年（1415年），明弘治、清康熙、雍正、乾隆、嘉庆、光绪间均重修，光绪三十四年（1908年），并改换黄瓦，但更换部件不多。现存建筑为木构，三间四柱五楼，柱不出头。黄色琉璃瓦顶，如意斗栱，明间庑殿顶，斗栱十三踩，两稍间歇山顶，斗栱九踩，明稍间之间有小屋顶，斗栱五踩。两层额枋间装花板，明间阳刻“德侔天地”，楷书，书者不详，两稍间刻云纹。额枋高瘦，平板枋扁宽。柱下夹杆石圆雕石狮、天禄各八只，形象古拙，须弥座所刻圆角柱、卷草雕刻粗放，都显示着明初的风格。
道冠古今坊 位于圣时门西庙墙上，建筑年代、形制与德侔天地坊相同。
圣时门 孔庙的大门，始建于明永乐十三年（1415年），原为三间，弘治十三年（1500年）修庙时“新添两间，退后二丈，两傍各添八字墙”，以上等青绿间金妆饰。清康熙二年（1663年）曾重修，时名宣圣门，雍正七年（1729年）又重修，八年（1730年），世宗钦定为圣时门，据《孟子》“孔子，圣之时者也”命名。乾隆十三年（1748年）高宗题匾，乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）均重修。光绪二十三年（1897年），“上顶木料，琉璃瓦脱落十之八九”，“几无一椽一瓦之可用”，揭顶拆卸到地重新建造，换大梁四根，斗栱七十朵等木构件。现存门屋五间，灰瓦绿边单檐歇山顶。高12.09米（室内地面至正脊上皮，下同），长23.03米，深11米（墙至墙）。砖木结构，下部砖砌，中三间发券为栱顶洞门，上部木结构，五踩斗栱，斗欹有 ，柱头科斗昂仅宽1.5斗口，平板枋扁而宽，仍保留了明代特点。圣时门斗栱比较奇特，明次间补间用四 ，稍门用两 ，稍间斗栱栱长几乎为明次间栱长的二倍。栱长不一，不合程序，是一种地方做法。门立于1.15米高的台基上，两侧门前后设台阶，中门前后御道设陛石，浮雕双龙戏珠，以山水云朵相衬，行云流畅，波涛汹涌，山势高峻，二龙翻转腾跃，图像生动，雕刻精美，是明初不可多得的石刻佳品。
璧水桥 位于弘道门前，明永乐十三年（1415年）添建，用国学辟雍水“壅绕如璧”命名。弘治十三年（1500年）庙工时于桥上添加石栏，河岸砌石，并砌小墙。清康熙十六年（1677年），河岸小墙也改为石栏，雍正庙工时曾以大成殿旧料等更换部分栏板、栏柱。桥三座，以砖石券栱，中桥宽10.3米，长6.68米，两翼辅桥宽3.43米，长13.35米。
弘道门 始建于明洪武十年（1377年），是当时孔庙的大门，三间。永乐十三年（1415年）后成为二门，弘治十三年（1500年）庙工时重建，扩成五间，石柱木构。清初名天阶门，雍正八年（1730年）清世宗据孔子“人能弘道，非道弘人”语钦名为“弘道门”。雍正七年（1729年）、乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）均重修。到光绪二十三年（1897年）时“木材俱已糟朽，琉璃瓦脱落残破，几无一椽一瓦之可用”，是年重修，更换梁枋斗栱等木构件。现存建筑就是这次维修的遗物，门屋高9.92米，面阔五间，长7.28米，深二间，8.96米。中三间开门。单檐歇山顶，灰瓦绿边，七檩三柱分心式木架，檐下施五踩重昂斗栱。梁枋肥宽，平板枋高狭，都呈清代特点，只有外檐八角石柱侧脚生起，当是明代遗物。
仰高门 位于圣时门后西墙上，是孔庙的第二道偏门。始建于明弘治十三年（1500年）庙工时，清康熙十六年（1677年）、雍正七年（1729年）、乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）均重修，到光绪二十三年（1897年）时，“木柱仅存，琉璃瓦全无”，山东巡抚命“照毓粹、观德门式修盖一新”。今存规模形制与清雍正修庙记载相同，当是照原样重建的。门屋三间，三门，单檐悬山顶，灰瓦绿边，五檩三柱分心式木架，无斗栱。门原为方便人们拜庙添建的，过去是人们拜谒孔庙的进入通道，据颜回赞扬孔子“仰之弥高”而命名。门匾竖于中门上，字正书，笔势刚健，书体端庄，匾缘云纹，极其简洁，仍显示明代风格。
快 门 与仰高门相对，是过去拜谒孔庙后出庙的通道，寓意先睹为快。建筑维修与仰高门相同，唯光绪二十三年（1897年）时“坍塌尤甚，基址仅存”，“木料全损，琉璃瓦无存”，照原样重建。
大中门 始见于金代孔庙图中，是当时孔庙的大门，三间，当是五十代衍圣公于大定年间新建。金末免于兵火，明弘治十三年（1500年），庙工时扩建成五间，明天启六年（1626年）、清康熙二年（1663年）、雍正七年（1729年）均重修，乾隆十三年（1748年）高宗题写门匾，乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）、1940年、1978年又重修。门屋五间，高9.42米，长20.44米，深7.49米。三门、单檐悬山顶，灰瓦绿边，五檩三柱分心式木架，檐下、脊檩下均施一斗三升斗栱，木架纤弱，做法简率，当是清同治十一年重修的遗构，檐柱柱顶石镌宝装莲瓣，构图匀称，当是初建的遗物。
角楼 共四座，前两座位于大中门两侧院墙的终端与庙墙交接处，后两座分别建于庙北端东北、西北角。角楼始于元至顺二年（1331年），五十四代衍圣公孔思晦奏请依前代故事，起围墙，四隅建角楼，仿王宫之制。明代未见修葺记载，从弘治庙图碑看，角楼位置与今无异，形制似亦相似。清康熙二年（1663年）曾重修，雍正七年（1729年）东北一座重建，其他三座维修彩画，其后乾隆二十三年（1758年）维修，嘉庆二十一年重修，1956年、1988年又重修。今存角楼平面为曲尺形，三间，每面见两间，单檐，绿瓦歇山顶，五檩二柱通檐式木架，檐下施重昂五踩斗栱。楼下是庙墙转角形成的高台，向庙内一侧有马道供上下。
同文门 始建于北宋初期，是当时孔庙的大门，五间，两侧有回廊，金代成为二门，明代孔庙南拓，门逐渐退居次要地位。清初名参同门，清雍正七年（1729年）维修，八年（1730年）世宗据《礼记》“书同文”钦命为“同文门”，乾隆十三年（1748年）高宗题写门匾。嘉庆二十一年（1758年）、同治十一年（1872年）均重修，1927年大修，换角科等部分木构件，并改换为黄瓦，1978年又重修。门独立院中，周无墙垣。门屋五间，高10.62米，长16.9米，深9.34米。中三间辟门，单檐黄瓦歇山顶，七檩三柱分心式木架。脊檩下施一斗二升交麻叶斗栱，檐下设重昂五踩斗栱，明、次、稍间均用补间斗栱两 ，因间宽不同，为使各 斗栱之间距离相近，设计者就以栱的长短来调节，所以明间斗栱的栱很长，次稍间的很短。特别奇特的是中二柱柱头科，在明间一侧栱长，次间一侧栱短，同一钻斗栱左右不同，是比较罕见的，这是明清时期曲阜一带流行的地方做法。门东南立有明成化四年（1468年）“御制重修九子庙碑”，碑文说：“天不生孔子……万古如长夜”，“天生孔子，实所以为天地立心，为生民立命，为往圣继绝学，为万世开大平者也”，赞颂“孔子之道之在天下，如布帛粟菽，民生日用不可暂阙”，“生民之休戚系焉，国家之治乱关焉。有天下者诚不可一日无孔子之道焉”。西南立明弘治十七年（1504年）“御制重建阙里孔子庙碑”，二碑原均有亭，清中期已无，现仍露天。
奎文阁 本名御书楼，过去多认为始建于宋天禧二年（1018年），但早在至道三年（公元997年）就有“曲阜县文宣王庙有书楼而无典籍”的记载，书楼可能始建于太平兴国八年（公元983年）。从《宋阙里庙制》图看，宋时书楼立于高台上，重檐五间，下檐之上有平座，两侧有廊。金明昌六年（1195年）扩建，章宗完颜璟赐名为“奎文阁”。“奎”本为二十八宿之一，有星十六颗，“屈曲相钩，似文字之画”，古人便认为“奎主文章”。从《金阙里庙制》图看，阁仍为五间，但已成三檐，下檐之上仍有平座，两侧有掖门，门东西有廊。金贞佑二年（1214年）兵火毁孔庙，阁幸免于难。元至元三年（1266年）权衍圣公孔之全曾修葺，明洪武、永乐间又重修。弘治十二年（1499年）庙火犹存，但在维修时，因“规摹不称”，为使“与殿等栋宇相埒”撤而新之，扩建为七间，三檐，高七丈四尺，阔九丈，深五丈五尺，前面擎檐俱石柱。清顺治十二年（1655年）、康熙二年（1663年）均维修。雍正七年（1729年）重修，拆卸西北上中下三角及西南上檐角，更换子角梁等木质构件。乾隆十三年（1748年），高宗弘历题写阁匾，二十三年（1758年）维修，嘉庆二十一年（1816年）因二层歪斜进行拆修，同治十一年（1872年）维修，光绪三十四年（1908年）改换为黄瓦。1985年落架大修，校正大架，加固、更换部分木构件，并彩画外檐，找补室内彩画，耗资一百一十万元。现存建筑为弘治十七年（1504年）扩建，高24.35米，面阔七间，30.1米，进深五间，17.62米，歇山黄琉璃瓦顶。三重檐，四层斗栱。上层斗栱单翘重昂七踩，承上檐，中层斗栱单昂三踩，承附檐，另一层重翘五踩，承平坐，下层重昂五踩，承下檐。补问斗栱明间为四 ，其他均为二 ，因间阔不同， 间距离不同，明间、次间的栱长短也不相同，明次间、次稍间柱斗科栱长也不一。奎文阁内部两层，中夹暗层，为层叠式木构架，上层柱立于下层的斗栱之上。下层南一间为走廊，后四间为阁身，外围用八棱石柱二十四根，内柱用木柱二十二根，为使用方便，减去了明间南面二金柱。柱同高，柱头以额枋相连，上施斗栱，室内为五踩品字斗栱，斗栱承承重梁或桃尖梁，梁上安天花。暗层上层柱为通柱，外金柱直达上檐斗栱之下，内金柱（省去了南面明次间的内金柱）高十三米多，直达三架梁之下，童柱立于下层廊的桃尖梁上，穿过平坐，直通上层附檐斗栱之下，平坐斗栱自童柱半身伸出，这些做法在中国古建筑中是不多见的。阁下层在孔氏族人家祭时存放祝版，御祭时存放香帛，祭前设孔子、四配、十二哲虚位，供祭祀官员演习祭祀礼仪。暗层仅靠垫栱板上的古钱形孔采光，光线很暗，过去只存印书木版，上层才藏御赐经书。前廊下存有明李东阳撰“奎文阁赋”碑和熊相撰“奎文阁重置典籍碑”。
奎文阁掖门 东西各一座，均面阔三间，深二间，单檐硬山顶，灰瓦绿边。掖门始见于金代《阙里庙制》图中，当为明昌扩建奎文阁时添建。明弘治十七年（1504年）扩建奎文阁时重建，清雍正七年（1729年）、乾隆二十三年（1758年）均维修，嘉庆二十一年（1816年）东门重新拆盖，西门拨正。1986年为使屋面避开奎文阁雨水，两门均重新拆建，向外移动0.25米。门五檩三柱分心式木架，无斗栱。现存木架当为弘治遗构，角替短小，柱身粗矮，保存着明代特征。
值房 各五间，在奎文阁掖门左右，灰瓦硬山顶，低小狭窄，原是祭祀前族人、礼乐生等斋宿的地方。本为三十间，明弘治十七年（1504年）维修，清雍正七年（1729年）时已各为五间，西值房重建，东值房维修，改为陪祭官员的斋所。
洪武碑亭 内立明洪武四年（1371年）太祖诏旨碑，始建年代不详，明弘治十二（1499年）年庙灾时，“延烧家庙五间……大成门五间，植桧一株，太祖高皇帝诏旨碑文并楼”，似当在大成门前，弘治庙工时重新刻碑建亭，移于奎文阁前。据记载，亭二檐，清雍正七年（1729年）维修，乾隆二十三年（1758年）维修时为布瓦，嘉庆二十一年（1816年）上面坍塌，进行拆修，1927年又大修，更换很多木构件。碑亭在雍正时仍为“重复檐歇山转角，上下檐斗科成造”，但1927年维修时更换檐椽梁柱等木构件，毫未提及斗栱，可能在嘉庆拆修时省去。碑亭方形，每面三间，重檐布瓦顶，无斗栱。亭壁上内外镶嵌十方元、明谒庙诗文题记刻石，亭内还立有四幢谒庙诗碑和一幢祭文碑。
永乐碑亭 内立明永乐十五年（1417年）成祖“御制孔子庙碑”，重刻、重建、重修同洪武碑亭，唯清雍正初年亭已不存，七年（1729年）重建。碑文赞扬孔子“参天地，赞化育，明王道，正彝伦，使君君臣臣、父父子子、夫夫妇妇各得以尽其分”，命有司维修孔庙，“撤其久而新之”，以期“作我士类，世有才贤，佐我大明，于万斯年”。
东斋宿 始见于弘治十七年（1504年）修庙记载。《阙里志》说“衍圣公斋居十一间”，从弘治庙图碑看，斋居正厅五间，单檐，中三间辟门，南北厢各三间，大门一间，均单檐。康熙二年（1663年）重修，康熙末年或雍正初年重修，所以雍正七年（1729年）修庙时未加修葺，乾隆二十三年（1758年）重修，并添建屏门一座，嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）均重修，1959年维修并彩画。现存东斋宿与《阙里志》记载的基本相同，但已非明代原构，是清代官式小式建筑。厅房均为七檩四柱前后廊式木架，正厅檐下施一斗二升交麻叶斗栱。大门内为屏门，七踩二昂斗栱，始建时为金琢墨，龙凤枋心，沥粉大点金彩画。现斗栱为烟琢墨，额枋为小点金。正房、厢房、游廊原来也贴金，彩画规格颇高，这是因为清圣祖、清高宗致祭时均在此院休息，所以又名驻跸，现在均改为雅五墨。
西斋宿 建筑年代同东斋宿，原是县官等祭祀前斋居的地方。清康熙二十六年（1687年）建筑即已不存，现仅存大门。道光十八年（1838年），孔子七十一代孙孔昭熏将庙内宋、金、元、明、清文人谒庙碑一百三十余块集中镶嵌在院墙上，习称碑院，著名的有宋杜衍书札、元郭守敬谒庙题记等。
十三碑亭 位于奎文阁后一处东西狭长的庭院内，南八北五，横向排列，五十余块石碑露天林立，东南西南，各自成区。碑亭院历史上变化比较大，宋代时，院落较小，略成方形，四面有廊，东西廊与中路两庑相连，院中只有两座碑亭。金代东西两廊外移，并添建居仁门、由义门，再外添建了毓粹门、观德门。元代未见变动记载，约大德六年（1302年）、后至元五年（1339年）于原碑亭之内靠近轴线处分别添建了一座碑亭。明初，院内增建了洪武、永乐两座碑亭，位置大约靠近大成门，所以弘治十二年（1499年）庙火被延烧，迁于奎文阁前重建。弘治修庙或以前，碑亭院还有一点变动，即省去了居仁门、由义门，院落已同现在形制。清代，院内添建了九座碑亭，南排四座，金元碑亭以外每侧各两座，西二座约建于顺治、康熙初年，东二座约建于雍正年间。北排五座，自东至西分别始建于乾隆十三年（1748年）、雍正八年（1730年）、康熙二十六年（1687年）、康熙三十三年（1694年）、雍正八年（1730年）。碑亭院在宋金时期，四周回廊，两亭对立庭中，布局十分合理，元代于金碑亭之内添建两座碑亭，过于靠近轴线，挡住了正门的视线。清代添建九座，北边一排碑亭占压了东西向通道和金声门、玉振门的甬道，挡住了大成门及掖门的立面，庭院拥挤不堪，空间壅阻不畅，完全破坏了旧有布局。碑亭形式大同小异，重檐歇山，黄琉璃瓦顶，平面呈方形，三间见方，明间开敞，稍间砌墙。其中两座为金代遗构，一座为元代遗构，其他十座均为清代建筑。亭内存唐、宋、金、元、明、清、民国石碑五十余块。
金代碑亭 两座，即南排东起第三座和西起第三座。碑亭始见于宋代庙图，单檐，十字脊，悬山顶，金代庙图中成为重檐歇山顶。金末幸免于兵火，明洪武十年（1376年）、弘治十七年（1504年）、清康熙二年（1663年）均重修。雍正七年（1729年）大修，角柱均改为石柱（旧料），修理添换了斗栱，梁枋等，更换了部分桁椽，亭顶由灰瓦绿边改为全部绿色琉璃，是碑亭建成后最大规模的维修。以后乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年），1976年均重修。亭顶在道光四年仍为绿瓦，可能是嘉庆或同治修庙时改为黄色琉璃。亭结构大致相同，重檐，上下檐均施斗栱，明间补间两朵，稍间不用。下檐五铺作，单抄单下昂，重栱造，外跳计心，里跳偷心，昂尾施于串枋上，上承重栱，栱承承椽枋。上檐六铺作，单抄双下昂，里跳减一抄，重栱计心造，昂尾直接承托屋盖干架的榑枋。斗栱的瓜栱、令栱、慢栱长度依次递增，阑额高瘦，普柏枋扁宽，都显示着宋式建筑的特点。这两座碑亭可能建于金明昌二年至六年（1191—1195年）的大修工程中，是孔庙现存最古老的建筑。东亭内存三碑，一为吕蒙正撰《大宋重修兖州文宣王庙碑铭》，白崇矩书丹并篆额，宋太平兴国八年（公元983年）刻，碑阴刻蒙古杨奂等八则题记等。一为党怀英撰文、书丹并篆额的“大金重修至圣文宣王庙碑”，金明昌六年（1195年）立，碑阴刻元好问、杨奂、郝经等金、元题记、题诗等十六则。三为刘翊撰“大明重修宣圣庙记”碑，明弘治元年（1488年）立。三碑均是研究孔庙修建历史的重要史料。西亭存四碑，一为“大唐赠泰师鲁先圣孔宣尼碑”，隶书，孙师范书，崔行功撰文，唐总章元年（公元668年）立，碑阴刻武德九年（公元626年）太宗封孔嗣悊为褒圣侯诏书、乾封元年（公元666年）追赠孔子太师诏书、乾封元年遣扶余隆致祭曲阜孔庙祝文、皇太子李弘请立碑孔庙奏文等。二为“鲁孔夫子庙碑”，李邕文，张庭珪书，隶书，开元七年（公元719年）立。碑阴及两侧满刻唐、宋、金、元、明、清六代题记二十三则，元代墨书二则。二碑对研究唐代思想史、孔庙史具有很大价值，书法艺术水平也很高。其他二碑为元碑，刻皇帝遣官致祭祝文等。
大德碑亭 即南排东起第五座，始建于元大德六年（1302年），几经修建，已经全失元代风格。下檐为五踩重昂溜金斗栱，上檐为五踩重昂斗栱，后尾全偷心，不用斗，明间补间斗栱两 ，布置虽然疏朗，但用料细小，呈现出晚清风格。亭内现存六碑，主碑为大德五年（1504年）“大元重建至圣文宣王庙之碑”，阎复撰文，刘赓书丹，刘愻篆额。
至元碑亭 即南排东起第四亭，始建于至元五年（1339年），明洪武十年（1376年）、弘治十七年（1504年）、清康熙二年（1663年）均加以维修。清雍正七年（1729年）大修，修补了金柱，添补了所有斗栱，亭顶由绿瓦剪边改为绿色琉璃。其后乾隆十三年（1748年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）、1977年均维修。亭顶约与金碑亭同时改为黄色琉璃。碑亭重檐，上下檐均施斗栱，明间补间三朵，稍间不用。下檐斗栱五铺作双下昂，上檐斗栱六铺作单抄双下昂，但都为假昂，昂嘴弧形，下皮线向上弯曲，也是比较独特的做法。亭内现存八碑，重要的有：（一）元武宗加封孔子为大成至圣文宣王诏书碑，汉文、八思巴文逐字对刻；（二）欧阳玄撰文“大元敕修曲阜宣圣庙碑”，巎巎书丹，张起岩篆额，至元五年（1339年）立；（三）元崇奉颁诏碑，全为八思巴文；（四）清同治十一年（1872年）丁宝桢立“重修至圣庙碑记”碑，碑阴刻光绪二年（1876年）“续修至圣庙碑”，都具有很高的史料价值。
清御制碑亭 五座，均位于北排。西起第二、第三座分别始建于康熙三十三年（1694年）、二十六年（1697年），初为绿琉璃瓦，雍正二年（1724年）孔庙雷火时被延烧，雍正庙工时重建。西起第一、第四亭为雍正修庙时新建，第五亭为乾隆十三年（1748年）新建。清嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）、光绪三十四年（1908年），1978年均加以维修。五亭因存御制碑，规格等级高，斗栱下檐用五踩重昂，上檐用七踩单翘重昂。明间施平身科四朵，亭内有天花，彩画用沥粉金云龙。亭内各存一碑，西一为雍正八年遣皇五子弘画御祭碑；西二为康熙三十二年“大清皇帝御制重修至圣先师孔子庙碑”，朱镐篆额；西三为康熙二十五年“大清皇帝御制阙里至圣先师孔子庙碑”，圣祖御书，朱汉雯篆额；西四为雍正八年“大清皇帝御制重修至圣先师孔子庙碑”，张照篆额；东为乾隆十三年“大清皇帝躬诣阙里孔子庙庭御制碑”，汪由敦篆额，高宗御书。
清遣官致祭碑亭 四座，即南排西起第一、二座及东起第一、二座。西二亭建于康熙二十六年（1687年），前、东二亭当为雍正间所建。西二亭雍正二年（1724年）庙工时拆卸重建，并将绿瓦改为黄瓦。其后维修与御祭碑亭相同。碑亭因存遣官致祭碑，规格较御制碑较低，所以虽然也为重檐歇山顶，但均无斗栱，彩画也仅为雅五墨。
毓粹门 位于十三碑亭院东墙上，是孔庙的第三道侧门。门始见于金代庙图中，三间单檐，当为金明昌二年（1191年）庙工增建。金末幸免于火，元初犹存，明弘治十七年（1504年）、清康熙十六年（1677年）、雍正七年（1729年）、乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）均维修，光绪三十四年（1908年）改为黄瓦，1978年揭瓷重修。现存门屋为五檩三柱分心式木架，无斗栱，进深两间，面阔三间，明间辟门，稍间砌墙，柱有侧脚，额枋略有升起，仍保持着早期建筑的特点。
观德门 位于十三碑亭院西墙上，与毓粹门相对，此二门建筑年代、维修、形制均相同。
大成门 原名仪门，宋崇宁三年（1104年）因大成殿而得名。北宋时，门三间，立于台基之上，单檐，檐下有斗栱，两侧有廊与两庑相连，并向外延伸，分别与西庙墙和东院墙相接。金代曾加重修，于门两侧添建掖门，金贞佑二年（1214年）被焚。元大德六年（1302年）重建，“转裹五间，周围亦皆石柱，基高一丈，殿门皆琉璃沿裹，碾玉桩饰”。明弘治十二年火后重建，屋顶为绿色琉璃。雍正二年（1724年），大成门再次被焚，七年重建落成，屋顶改为黄色琉璃，柱子门扇槛框朱红油饰，枋心沥粉金云龙地伏五色妆颜彩画，斗科金琢墨，重建用银一万三千余两。嘉庆二十一年（1816年）、光绪三十四年（1908年）、1979年多次维修，但主要部件并没有更换。现存门屋高13.53米，面阔五间，24.68米，进深两间，11.2米，单檐黄瓦歇山顶，七檩三柱分心式木架，檐下用五踩重昂溜金斗栱，金龙和玺彩画。擎檐为石柱，明间前后石柱高浮雕（一种镌刻做法，将图形周围的石面剔去，使图形高出五六厘米甚至十厘米以上）二龙戏珠，其余为八棱石柱，减地平钑（一种镌刻做法，在石平面上阴刻线条图形，将图形以外的石面浅浅砍去一层，使图形更加明显）小幅云龙。高浮雕石柱云朵线条流畅，龙猪嘴姿态生动，可能是明代遗作。清雍正修庙预算中曾有重刻大成门龙柱的造价，恐没有全部重新刻制。浮雕石柱祥云飘逸，波涛激射，龙躯夭矫自如，龙鬣随首飘拂，充满了动态美，恍如二龙飞腾嬉戏于云水之间。门上悬“大成门”竖匾，两侧悬“先觉先知为万古伦常立极、至诚至圣与两间功化同流”对联，清世宗雍正七年题书，匾联木雕贴金，高浮雕云龙。大成门立于台基之上，台基高1.65米，石须弥座，束腰部分所刻卷草和圭脚部分所刻云纹构图匀称，线条圆和，当是明代所刻。门前后各有六级台阶，中用陛石，浅浮雕云龙山水，雕刻非常精美。大成门两侧有掖门，各三间，并非独立，而与两庑连檐，这样既突出了大成门作为正门的地位，又避免了单立门屋缺少整体联系的弊病，处理方式非常巧妙。
金声门 大成门的西掖门，始见于金代庙图，明弘治庙工时重建，位置较金代外移，与今存形式相同。清雍正二年（1724年）火后重建，“三间，各面阔一丈六尺六寸，通面板四丈九尺八寸，进深二丈四尺八寸，前檐柱高一丈一尺二寸五分，后檐柱高一丈六寸，系七檩六搭椽，如檐斗口单昂斗科，后檐一斗二升麻叶斗科”，屋顶改为黄瓦剪边，前后檐头用石碾玉大点金彩画。乾隆十三年（1748年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）、1956年、1987年曾多次维修。门屋三间，一门，西与西庑连檐，三柱七檩分心式木架，檐下用一斗二升交麻叶斗栱，雅五墨彩画，加黄线。
玉振门 大成门东掖门，与东庑连檐，修建规制与金声门相同。
曲阜孔子庙杏坛
杏坛亭 专为纪念孔子办学设教建造的纪念物。宋天禧五年（1021年）大修孔庙，正殿北移，“旧基不欲毁拆”，因《庄子》中有“孔子游乎缁帷之林，休坐乎杏坛之上，弟子读书，孔子弦歌”的记载，即以“瓴甓为坛，环植以杏，鲁人因名曰杏坛”。从宋庙图看，当时为名副其实的坛，三层台。金代始于台上建亭，单檐，似为十字脊，四面悬山。元至元四年（1267年）曾重修，明弘治十七年（1504年）大修时，“杏坛仍旧，用上等青绿间金彩画，盖瓦绿色琉璃”。从弘治庙图看，仍作单檐，十字脊。隆庆三年（1569年）重建，“杏坛旧制则撤而更新，增置石楹重檐”。清雍正二年（1724年）幸免于庙火，是时，杏坛“见方二丈二尺九寸五分，二次间各面阔四尺八寸，四檐柱高一丈一尺三寸。四面显山，十字脊，重复檐，歇山转角成造”，尺寸、形制与今存建筑相同。雍正七年维修，没有更换木构件，只进行揭瓦、彩画，柱子朱红油漆，枋梁大木石碾玉大点金，天花沥粉金云龙五彩妆颜，斗科金琢墨。其后，嘉庆二十一年（1816年）揭瓦，同治十一年（1872年）维修。光绪三十四（1908年）年改换为黄色琉璃瓦顶，更换四老角、四子角。1973年揭瓦彩画。现存建筑仍为隆庆遗构，高12.5米，阔7.34米，平面正方形，四面敞开，每面三间。每面中柱为石柱，金柱为木柱，用料粗大，角柱也为木柱，但砍作八角形。屋盖十字结脊，四面悬山，重檐，上下檐均为五踩重昂斗栱，明间用补间斗栱三 。亭内上下檐均用天花，上层天花中心用斗八藻井，细小斗栱装饰，纤巧可爱。枋梁大木为金龙和玺彩画，斗栱金琢黑。坛基两层，上层用石栏杆，南面八根栏柱下用螭首，异常美观。东南西北每面都有踏跺，刻圭角形云纹。亭内存有金党怀英篆书“杏坛碑”和清高宗御制“杏坛赞”碑。
大成殿 孔庙的主殿，供奉孔子的塑像，在此进行祭祀活动。唐代时为五间，约在今杏坛处。宋天禧五年（1021年）大修孔庙，移于今处，并扩建为七间重檐，两侧建廊与两庑相连。崇宁三年（1104年）宋徽宗赵佶取《孟子》“孔子之谓集大成”语“诏名文宣王殿曰‘大成’”，政和四年（1114年）并自书殿额颁予曲阜孔庙。北宋末年，孔庙被火，金天会七年（1129年）“殿火犹未息”，皇统九年（1149年）重建。金代时，大成殿仍为七间重檐，两侧改为斜廊与两庑相连，“殿庑皆以碧瓦为缘，外柱以石，刻为龙文，其藻栱之饰，涂以青碧……栏槛栊并朱漆之”。金贞祐二年（1214年）焚于兵火，元大德四年（1300年）重建，六年（1302年）九月十二日落成，“七间，复檐，重基，高一丈有奇，内外皆石柱，外柱二十六，皆刻龙形”，“殿门皆琉璃沿裹，碾玉妆饰”。明成化十九年（1483年）扩建为九间，“柱石镂以龙凤之形，轮奂绘以金碧之色”。弘治十二年（1499年）被焚，十三年（1500年）重建，十七年（1504年）落成，仍为九间两檐，屋顶用绿色琉璃瓦，台基两层，镌花石须弥座，石栏杆，两面磨光。殿两侧无廊、门，独立院中，石柱由徽州工匠錾刻。清雍正二年（1724年），雷落大成殿被焚，三年（1725年）重建，八年（1730年）秋落成，仍为九间，屋顶瓦黄色琉璃。这次重建，不计瓦件，用银五万五千多两。嘉庆六年（1801年）修西北角，二十一年（1816年）揭瓦，光绪二十四年（1898年）维修后檐，1952、1957年分别拆东山、西山，1970年揭瓦，更换两次间、东北角部分木构件，并彩画外檐。1988年全部重新揭瓦。为了突出孔子的崇高地位，大成殿被建成全庙最高的建筑物，无论瓦色、开间、彩画都是最高规格。殿高24.8米，面阔九间，45.69米，进深五间，24.85米，重檐九脊，黄瓦歇山顶，金龙和玺彩画。基高2.1米，重层石阶，前与站台相连，后与寝殿相连。殿基为须弥座，两层栏杆，上层为火焰宝珠柱顶，下层为重层覆莲瓣柱顶，柱下有螭首外探，雕刻古拙，连同踏道云龙山水御道，多是明代遗物。大成殿雄峙在高台上，加之回廊围绕的建筑形式，益发显得雄伟壮丽。殿的柱、架简洁整齐，柱网由外、中、内三圈柱列形成。外围为二十八根石檐柱，高近6米，围绕为廊，承下檐斗栱及围廊天花；中圈为十六根木金柱，高约15米，承上檐斗栱及殿内外槽天花；内圈为十六根木内金柱，高约18米，承殿内槽天花，殿内正中为斗八藻井。檐柱用石，是本地建筑的一个特点，在曲阜比较普遍。但大成殿的石檐柱最有代表性。檐柱均以整石刻成，高约6米，前檐十根为高浮雕，直径80厘米，两山及后檐十八根为减地平钑，直径75厘米。减地平钑刻小幅团龙，石柱八面，每面九条，每柱七十二条，并衬以云朵。高浮雕刻二龙戏珠，一为升龙，一为降龙，上下对翔，盘绕升腾。龙周遍刻云朵，柱下端刻山石波涛，雕刻极深，几成圆雕，二龙宛如腾海升空，穿云飞翔。十根龙柱图案各具变化，两两相对，无一雷同，造型优美生动，雕刻玲珑剔透，刀法刚劲有力，龙姿栩栩如生，是我国罕见的石刻艺术品。郭沫若曾写诗赞说“石柱盘龙二十株，大成一殿此尤殊”，“天工开物眼前是，梓匠何曾读圣书”，歌颂了劳动人民的智慧和才华。大成殿用刻龙石柱始于金代，明弘治庙火后征调徽州工匠重刻，清雍正二年（1724年）火后又重刻。从《孔府档案》记载看，清代高浮雕龙柱每根价银九十一两一钱八分，减地平钑石柱每根价银六十八两八钱二分七厘，莲花柱础每个价银二十两，从雕刻风格看，今存龙柱当为雍正时重刻。大成殿下檐为七踩单翘重昂斗栱，施于外围回廊石柱以上；上檐为九踩单翘三昂斗栱，施于中围金柱之上。补间斗栱明间用四 ，次稍间用三 ，下檐尽间用一 。殿内内额坊及内小额坊之间为一斗六升斗栱，内额枋上用以承托天花者为七踩品字斗栱，但金柱纵缝上斗栱仅露明一面出踩，隐入天花一面斫齐，不加卷杀。斗栱用材很大，规格很高，平身科斗口平均为12.5厘米，比故宫太和殿的斗口（9厘米）还大，这种相当于清代《工程做法》四寸斗口，一般只用于城楼而不用于殿堂，这是一个比较少见的例子。殿内悬挂着清康熙二十三年（1684年）御书“万世师表”，清乾隆三年（1738年）、十三年（1748年）、三十六年（1771年）分别御书“与天地参”、“时中立极”、“化成悠久”、仁宗嘉庆四年（1799年）御书“圣集大成”、宣宗道光元年（1821年）御书“圣协时中”、文宗道光三十年（1850年）御书“德斋畴载”、穆宗同治元年（1862年）御书“圣神天纵”、德宗光绪十四年（1888年）御书“斯文在兹”九块匾额，明间前后内金柱上分别悬挂清高宗乾隆十三年（1748年）御书“觉世牖民诗书易象春秋永垂道法，出类拔萃河海泰山麟凤莫喻圣人”、“气备四时与天地鬼神日月合其德，教垂万世继尧舜禹汤文武作之师”对联。明间正中为孔子塑像，冕十二旒，服十二章，手执镇圭，东西两侧分别为颜回、子思、曾参、孟子四配塑像，再外两侧分别为闵损、冉雍、端木赐、仲由、卜商、有若和冉耕、宰予、冉求、言偃、颛孙师、朱熹十二哲塑像，手执躬圭，冕九旒，服九章，玄衣 裳。孔子为一龛，四配十二哲均二人一龛。龛均为木雕，贴金彩绘。明间前金柱上悬挂清世宗雍正七年（1729年）御书“德冠生民溯地辟天开咸尊首出，道隆群圣统金声玉振共仰大成”对联，上悬雍正四年（1726年）御书“生民未有”匾额。
曲阜孔子庙大成殿内景
曲阜孔子庙大成殿龙柱
曲阜孔子庙大成殿藻井
曲阜孔子庙东庑内景
两庑 位于大成殿东西两侧，供奉孔子弟子及历代先贤先儒，两庑连同转角掖门共一百间，每侧正面均为四十间，长近170米，象征着儒家思想的源远流长。唐贞观二十一年（公元647年）始以先儒左丘明等二十二人配享孔庙，开元八年（公元720年）又以孔子弟子七十二贤从祀，那时孔庙就有两庑之设，供奉先贤先儒，“图绘于壁上”。宋代时，两庑北端分别与寝殿两侧的泗水侯殿、沂水侯殿相联，与寝殿行廊相接，南接书楼行廊，与寝殿、大成殿、仪门、书楼及两侧行廊构呈“且”字形。宋末被毁，金正隆元年（1156年）重修，明昌二年（1191年）改两庑画像为塑像。从金庙图看，两庑又名东贤廊、西贤廊，北端与宋代相同，但南端只接大成门行廊。金贞祐二年（1214年）兵火，两庑也被焚。元大德四年（1300年）才“照已拟间座起盖”，六年（1302年）九月完工，“碾玉妆饰七十二贤廊”。此时两庑的间数，从明洪武七年（1374年）修庙奏书看，当均为三十三间。洪武十年（1377年）重建东庑，永乐十年（1412年）重修。弘治十二年（1499年）火灾报告却说东庑二十八间，当是计算方法不同所致。弘治十七年（1504年）重建落成，清雍正二年（1724年）被焚，七年（1729年）重建落成，乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）、1956年均重修，1973年彩画前檐，1987、1988年分别全部揭瓦。今存两庑为雍正重建遗构，“连转角共八十八间，各面阔五十一丈九尺三寸。前檐柱高一丈六寸，后檐柱高一丈一尺一寸五分”。两庑每间尺寸并不一致，南部“二十八间各面板一丈一尺四寸”，中间腰门“一间面板一丈三尺七寸”，北部“十一间各面阔一丈二尺四寸”。雍正重建当是依循弘治旧制，连同寝殿掖门、大成门掖门也是共一百间。两庑供奉从祀先贤儒的木主，祭祀规格较低，因此建筑的规格也较低，木架用七檩四柱前后廊式，前为廊，用一斗二升交麻叶斗栱，屋顶用绿色琉璃，而以黄色琉璃剪边，彩画用雅五墨，前檐头原为大点金，现也为雅五墨（加黄线），是殿庭院落中规格最低的建筑。
寝殿 位于正殿庭院的北端，是供奉孔子夫人的专祠。夫人为宋国人，她的姓氏汉碑作并官氏，后人作亓官氏。她大约在孔子十九岁时与孔子结婚，孔子六十六岁时去世。汉魏晋南北朝时与孔子同室祭祀，宋大中祥符元年（1008年）追封为郓国夫人。天禧修庙时，增大殿像，时为重檐，阔五间，两侧有行廊与两庑相连。宋末金兵南下时被焚，金大定十八年（1178年）重建，有司吝于出纳，欲“破广为狭，刬崇为卑”，五十代衍圣公孔搃另筹经费，并率庙丁到东蒙山采树，终于恢复旧制。从庙图看，殿前有廊与正殿相连，采用了宋金时期盛行的工字殿形式。贞祐二年（1214年）庙火，寝殿也被焚，元定宗三年（1248年）恢复寝殿，但改为正殿使用，供奉孔子、十哲神像。大德六年（1302年）重建大成殿后，“黼座既迁，更塑郓国夫人于后寝”。当时的寝殿，左右仍有十八间回廊，但到明洪武七年（1374年）时回廊已废坏无存。成化十九年（1483年）大扩庙制，寝殿扩建为七间，弘治十二年（1499年）被焚，十七年（1504年）重建落成。重建后，“七间，附檐，高六丈四尺，阔九丈五尺，深五丈，四周擎檐俱镌花石柱、木柱槅扇等银朱，天花凤板、内外枋檩斗栱俱用上等青绿间金妆绘，绿色琉璃瓦顶”。清雍正二年（1724年），殿又一次被焚，八年（1730年）重建落成，《曲阜县志》所记尺寸与明代《阙里志》所记相同，但《孔府档案》则记为面阔十丈四尺五寸，进深五丈五尺八寸，以今存建筑尺寸验证，《孔府档案》是正确的。重建后的寝殿，“檐柱高一丈五尺，金柱高三丈三尺四寸七分，中柱高五丈六尺一寸，重复檐歇山转角。下檐斗口重昂斗科，上覆檐单翘重昂斗科，内里隔井天花，外廊周围隔井天花，连挑檐，拾一檩成造”。柱子槛框朱红油饰，上架枋檩柁梁俱沥粉金云龙地伏五色妆颜彩画，屋顶绿瓦，黄瓦剪边，估价二万七千六百多两白银。今存寝殿即为雍正间所重建，乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治八年（1869年）均维修，1925年揭瓦大修，改为全黄瓦，更换四角等六根金柱、全部椽望及部分斗栱，并重新油漆彩画，用洋七万元。1988年重新揭瓦。殿重檐九脊，黄瓦歇山顶。面阔七间，33.44米，进深四间，17.86米，高约20米（砖面至殿顶）。殿身阔五间，深二间，周为回廊，有八角形镌花石檐柱二十二根，满镌减地平钑小幅凤凰牡丹图案。殿基高2.06米，南面为须弥座，石栏杆两层，前有平台与大成殿殿基相连，呈“工”字形平面，后面及两山为普通台基，也无栏杆，这是建筑上一种少见的处理方式，寝殿的木架形式是由殿堂分心槽式发展而来的，三柱分心，外加一周回廊。在殿中心正脊下纵向加一列中柱的木架形式，一般只用于门屋，中柱一列便于安装门扇，而很少用于殿堂，因为它不利于建筑空间的使用，观瞻效果不佳，寝殿是一个比较特殊的例子。殿的斗栱比正殿低一等，上檐为七踩单翘重昂，下檐为五踩重昂。明间补间四 ，次、稍间三 ，下檐尽间一 。彩画为龙凤和玺，枋心绘龙，天花绘凤，俱沥粉贴金。殿中置木刻神龛，供孔子夫人神位，有砖刻须弥座，为雍正年间所刻。
圣迹殿 明万历二十年（1592年），山东巡按御史何出光为保存《圣迹图》创建。清康熙、雍正、乾隆间均维修，但工程不大，独嘉庆十一年（1806年）耗银三千二百两重修，可能更换构件较多，同治十一年（1872年）、1959年、1980年均重修。雍正七年（1729年）、嘉庆二十五年（1820年）均重新彩画，现彩画为1959年所绘。殿高12.55米，面阔五间，30.69米，深三间，10.22米，单檐绿瓦歇山顶。彩画为旋子大点金，木架为七檩四柱前后廊式，檐下用五踩单翘单昂斗栱，明间补间六 ，次、稍间四 。昂嘴下刻出华头子线道，平板枋略宽于额枋，额枋高而瘦，都保存着明代的手法，但经多次维修，有些构件被更换，造成细部式样参差不一，坐斗斗欹或无 ，或有 ，瓜栱、厢栱相互错用。殿内保存石刻《圣迹图》和晋顾恺之、唐吴道子所绘孔子像的宋代石刻，清康熙、乾隆皇帝御制石碑等。
承圣门 东门的大门。孔庙三路之设始于宋代，东路自奎文阁以东起，有斋厅、斋堂、宅厅之设，主要供孔氏族人斋居、讲书、接待宾客之用。金代略有变化，南自大成门以东起，有斋厅、金丝堂、家庙等建筑。明弘治修庙后，东路有诗礼堂、家庙、神厨等建筑，功能已不同于宋代，分别供讲书、习礼、宣训族规、家祭、制作祭品所用。清雍正元年（1723年）改家庙为崇圣祠，祭祀孔子上五代先人及大成殿四配等圣贤之父，功能大变，以显示报功崇德推恩先人为主。东路南起承圣门，北至家庙，与正殿殿庭等长，分别以诗礼堂、崇圣祠、家庙三座主要建筑构成三进庭院。东路大门始建于宋代，单檐三间，两侧有廊，金代名燕申门。明弘治十七年（1504年）、清康熙十六年（1677年）均重修，雍正七年（1729年）诏改名为承圣门，是年维修彩画，枋梁大木用雅五墨，斗栱用烟琢墨。其后乾隆二十三年（1758年）、嘉庆二十一年（1816年）、同治十一年（1872年）又加以维修，1959年揭瓦，枋梁大木以旋子点金彩画。承圣门三间三门，五檩三柱分心式木架，檐下施三踩单昂斗栱，悬山顶，灰瓦，以绿瓦剪边。檐柱有侧脚，高约3.1米，直径却达0.36米，肥短粗壮，额枋高瘦，平板枋扁宽，斗栱用假昂尾，不与昂嘴相联，昂嘴下有的刻华头子线道，柱斗科上的梁头与梁齐平，略高于蚂蚱头，平身科用两朵，疏朗简洁，脊檩两侧用叉手，都呈现着早期建筑的特征。
诗礼堂 始建于宋代，本是宋真宗大中祥符元年（1008年）拜谒孔庙驻跸之所，“诏去其吻，许本家为厅”，供孔氏族人祭祀时斋居，并作讲学之用。时为单檐三间，穿心有廊，与斋堂相联，呈宋代常用的工字形平面。金代重建，两侧加廊，但省去了穿堂。明弘治时为纪念孔子教育儿子孔鲤学《诗》学《礼》而命名。十七年（1504年）因东庑东迁，“稍迁而东”重建，“五间，高二丈八尺，阔七丈五尺，深四丈二尺”，次等青绿彩画，绿色琉璃屋顶。清康熙十六年（1677年）维修，但未换木构件，只重新油漆彩画，外檐枋桁为大点金，斗栱为金琢墨。嘉庆二十一年（1816年）拆卸揭瓦，1959年揭瓦彩画，1987年揭瓦重修。现存诗礼堂面阔五间，进深三间，南面敞开，不设门窗。屋盖为绿瓦紫心悬山顶，彩画为雅五墨，檐下点金，木架为九檩前后廊式，比例纤细，前檐下用一斗二升交麻叶云斗栱，斗欹无 。清代时诗礼堂功能有所改变，祭祀前在此演礼，康熙、乾隆皇帝祭祀孔子时又在此听孔子后裔讲解儒家经书。堂内明间正中上悬两块匾额，上为清乾隆十三年（1748年）高宗在此堂听孔子后裔讲经后对衍圣公孔昭焕等孔氏族人的谕示，赞扬孔子思想“至圣之道，参天地，赞化育，立人极，为万世师表”，要孔子后裔“务学道敦伦，修身慎行，克秉先师之彝训”，下匾为高宗御题“诗礼堂”。原还有“则古称先”额和“绍绪仰斯文识大识小，趋庭传至教学礼学诗”对联。院中有古槐一株，银杏二株，习称唐槐、宋银杏，密叶蟠空，为院生色不少。堂后有故井、鲁壁。
礼器库 位于诗礼堂东侧，是存放祭祀礼器的地方。始见于金代庙图中，位于庙宅门内，为东厢房，五间，单檐，位置约在今故宅门内偏东。明洪武十年（1377年）时名庙库，弘治十七年（1504年）重修孔庙后，“库房九间，高一丈六尺，阔八丈五尺”，位置已在今处。清雍正七年（1729年）维修彩画，用雅五墨，并没有更换木构件，其后乾隆、嘉庆、同治间及1959年均维修。现存礼器库面阔九间，中间辟门，是由孔子故宅门进入孔庙东路的通道。进深三间，西为廊，施一斗二升交麻叶云斗栱。屋架为五檩四柱前后廊式，顶为灰瓦绿边，硬山顶。室内有“礼器赞”碑，西廊下有“故井诗”碑，均为清高宗御制。
故宅门赞碑亭 一间见方，单檐歇山顶，黄瓦，木架，檐下施一斗二升交麻叶斗栱。亭内立清高宗乾隆十三年（1748年）撰书“故宅门赞”碑，亭也为是年所建。
崇圣祠 西值大成殿。宋代时，此处为斋堂，金代为金丝堂，弘治十七年（1504年）重建后为家庙，“五间，高三丈，阔七丈二尺，深三丈六尺。前面擎檐中二根盘龙，傍四根镌花，俱石柱……内外枋檩斗栱俱用上等青绿间金妆画”，屋顶用绿色琉璃。从庙图看，为单檐庑殿顶。殿内供奉孔子夫妇和儿子孔鲤夫妇、孙子孔伋夫妇及四十三代孙、孔氏中兴祖孔仁玉夫妇，是衍圣公举行家祭的地方。清雍正元年（1723年），世宗追封孔子上五代先人为王，将旧家庙改为崇圣祠以供祭祀。雍正二年（1724年），孔庙火灾报告说：“新建崇圣祠……幸得无恙。”近人多将崇圣祠建筑年代定为雍正二年。其实，雍正二年改崇圣祠，并非重建，只是“将神牌祭器等项修制”。所以到雍正七年（1729年）大修孔庙时，屋面要“拔草捉节，夹陇齐檐，添补瓦片”。今存建筑面阔五间，进深三间，单檐绿瓦庑殿顶，旋子大点金彩画。木架为九檩四柱前后廊式，檐下斗栱为五踩重昂，明次间补间四 ，稍间两 。前有廊，檐柱至前金柱间深六尺一寸（约1.95米），后檐柱至后金柱深一丈二寸（约3.26米），远深过前廊，这是为了在后廊安置神龛的需要。所以前廊用单步梁，后廊用双步梁。前金柱直支老檐枋下，后金柱直支下金枋下。前檐柱为石柱，中二根为高浮雕蟠龙，傍四根为减地平钑花卉，刻牡丹、菊花、荷花、西番莲等。高浮雕龙柱线条流畅，构图和谐，龙嘴猪形，龙鬣前伸，颈细身粗，都呈现出明代中期的特征，当为弘治十三年（1500年）修庙时所刻。殿内正中奉祀孔子五世祖肇圣王木金父，东祀高祖裕圣王祈父、祖父昌圣王伯夏，西祀曾祖诒圣王防叔、父启圣王叔梁纥，两侧分别以颜无繇（颜子之父）、孔鲤（孔伋之父）、曾点（曾参之父）、孟孙激（孟轲之父）配享，再外两侧分别以周辅成（周敦颐之父）、程垧（程颢、程颐之父）、蔡元定（蔡沈之父）和张迪（张载之父）、朱松（朱熹之父）从祀。殿独立成院，前有院门三座，砖墙承重，木过梁，中门为绿瓦歇山顶，掖门为灰瓦硬山顶。
家庙 孔子长孙家祭的专祠。宋代孔庙就建有家庙，是一处独立的小院，位置约在今土地祠处，仅有三间正房，一间正门。金代亦然，但位置南移于今家庙处。明代家庙仍位于正殿之东，弘治十二年（1499年）雷落家庙，引起正殿殿庭被焚，重建后的家庙即今崇圣祠，规格较高。清雍正二年（1724年）家庙改称崇圣祠后，于今址新建家庙。家庙面阔七间，进深三间，灰瓦绿边，硬山顶，雅五墨彩画，木架为七檩四柱前后廊式，前为廊，不施斗栱，脊桁下以叉手支撑，梁枋瘦小。院前三门，砖墙承重，均为灰瓦硬山顶。
启圣门 西路正门。西路南起启圣门，北至启圣寝殿，与正殿殿庭院等长，分别以金丝堂、启圣殿为主体构成两进庭院。西路之设始于宋代，主要功能是祭祀孔子父母，当时规制略简于东路，只有孤立的一座门，三座殿堂——齐国公殿、鲁国太夫人殿、五贤堂，没有用以界分庭院的廊或墙。金代规制大变，成为一个独立的庭院。正门两侧有廊，西面不再借用庙墙，于庙墙内建廊，北面也建廊，东面仍借用正殿西庑，轴线上仍建齐国公殿及鲁国太夫人殿，五贤堂移建于西廊为西厢房，齐国公殿以西添建毓圣侯殿。五贤堂本为景佑二年（1035年）孔道辅添建，祭祀孟子、荀子、扬雄、王通、韩愈五人，毓圣侯殿当为宋皇佑二年（1050年）后添建，是年宋仁宗封尼山山神为“毓圣侯”，当建祠奉祀。毓圣侯殿于明弘治十二年（1499年）被焚，五贤堂也被省去，改建为金丝堂。今存规制即为明弘治十二年布置，只雍正七年（1729年）又添建了礼器库。启圣门始见于宋庙图，三间单檐，周无墙垣，独立院中，位置在今门处稍前，金代移于今处。门名始见于明弘治大修孔庙记载，“燕申、毓粹、启圣、观德四门仍旧”，其后清康熙十六年（1677年）、同治十一年（1872年）又维修。今存启圣门三间三门，形制结构与承圣门相同，年代当亦相近。
金丝堂 始见于金代庙图，单檐、三间，位于东路斋厅之后，即宋代斋堂之处，当是根据鲁恭王拆除孔子故居、闻金石丝竹之声而发现古文经书命名的。明洪武七年（1374年）时，“金丝堂五间”已“废坏不存”，至宣德九年（1434年）工部侍郎周忱及苏州知府况钟等捐俸重建，次年八月落成，“高二寻有二尺”。弘治十七年（1504年）庙工时移往孔庙西路，“五间，高二丈八尺，阔七丈五尺，深四丈二尺”，次等青绿彩画，绿瓦顶。清雍正二年（1724年）被焚，七年（1729年）重建落成，“五间，内明间面阔一丈七尺二寸，二次间各面阔一丈五尺五寸，两稍间各面阔一丈四尺，通面阔七丈六尺二寸；通进深三丈二尺二寸，内前后廊各六尺一寸；檐柱高一丈三尺五寸，金柱高一丈七尺五寸”，雅五墨彩画，与今存建筑相同。该建筑经嘉庆、同治重修，虽更换大梁等构件，1988年揭瓦维修时又改接角柱，但基本为雍正遗构。堂面阔五间，中三间辟门，稍间安槛窗，进深三间，绿瓦悬山顶，七檩前后廊式木架，檐下用一斗二升交麻叶云斗栱，雅五墨彩画。堂的主要功能是祭祀前演习乐舞，祭祀后合族燕享，为便于活动，堂内省去了明间南面二金柱。
乐器库 面阔九间，中间辟门；进深一间，前有廊，硬山顶，灰瓦绿边，檐下用一斗二开交麻叶云斗栱，雅五墨彩画。乐器库建筑年代较晚，雍正七年（1729年），为保存康熙皇帝赐予孔庙的中和乐器奏请皇帝同意添建。
启圣王殿 又名启圣祠，是奉祀孔子父亲叔梁纥的祠堂。宋初孔庙即有叔梁纥专祠，宋大中祥符元年（1008年），真宗祭祀孔庙，曾幸祠堂，并追封叔梁纥为齐国公。从宋庙图看，齐国公殿位于孔庙西侧，约在今金丝堂稍后，三间，单檐，有廊与夫人殿相连呈工字形。金正隆二年（1157年）、元至元三年（1266年）均重修，至顺元年（1330年），叔梁纥被加封为启圣王后改称启圣王殿。明初时，殿五间，歇山转角。弘治十二年（1499年）被延烧，十七年（1504年）重建，五间，庑殿顶，“高三丈，阔七丈二尺，深三丈六尺，前面擎檐，中二根盘龙，傍四根俱镌花石柱”，彩画用上等青绿间金，屋顶用绿色琉璃。清雍正二年（1724年）被延烧，七年（1729年）重建。“五间，内明间面阔一丈七尺一寸，二次间各面阔一丈五尺六寸，两稍间各面阔一丈一尺七寸，通面阔七丈一尺八寸，进深三丈六尺三寸，内前廊六尺，后廊一丈零五分，檐柱高一丈三尺六寸，庑殿顶，单檐，斗口重昂斗科成造”，“枋檩柁梁枋心沥粉金云龙地伏五色妆颜彩画，斗科烟琢墨”。今存建筑即为雍正重建遗物。形制构造与崇圣祠基本相同，但前檐石柱为雍正间重刻，不如崇圣祠石柱雕刻水平高。殿内中置神龛，供奉叔梁纥塑像，冕九旒，服九章，手捧躬圭。
启圣王寝殿 祭祀孔子母亲颜征在的专祠。颜征在于宋大中祥符元年（1008年）被追封为鲁国太夫人，与齐国公同殿祭祀。庆历八年（1048年），四十五代孙孔彦辅被旨监修祖庙，奏准“迁于后殿奉安”，始有专祠。从庙图看，三间，单檐。元至顺元年（1330年）被追封为启圣王夫人，改称启圣王夫人殿。明天顺四年（1460年）殿圮毁，六十一代衍圣公孔弘绪“撤旧而新之”，将启圣王殿重建，“五间，高一丈七尺，深视高杀二尺，广袤称是，穿心有廊，以通前后，歇山转角，规模壮丽”。弘治十七年（1504年）庙工后，“寝殿三间，原移过，从新盖瓦，油漆彩画”，不知何时移往何处，又自何处移建于今处。清雍正二年（1724年）免于火灾，时“明间面阔一丈四尺五寸，二次间各面阔一丈四寸，通面阔三丈五尺三寸；进深二丈五尺，山明间一丈六尺五寸，前后廊各四尺二寸五分，檐柱高一丈二尺，七檩歇山转角”，重修时没有更换大构件，只揭瓦彩画，枋桁大木为雅五墨，斗栱烟琢墨。今存建筑与雍正时记载相同，灰瓦绿边单檐悬山顶，七檩四柱前后廊式木架，檐下施五踩重昂斗栱。
神庖 是祭祀前准备牺牲——宰杀牛、羊、猪的地方。明洪武十年（1377年）庙制位于寝殿之后，弘治十七年（1504年）“暂改燕申堂为神厨，而神庖则附于神厨焉，”将神庖、神厨合二为一，移于寝殿之东，今崇圣祠之后。据记载，“神厨二十四间，高一丈二尺，共面阔二十五丈六尺，深各一丈六尺”。从庙图看，正房两厢各七间，大门二间。神厨、神庖分建和移于今处时间不详，但雍正七年（1729年）时神庖、神厨形制已经与今制相同，重修时，神庖正房、西厢已倒坏，神厨两厢歪斜，俱拆卸重新盖造，可见，神庖、神厨最迟是清初分建的。神庖位于后院的东北角，有正厅五间，两厢各五间，大门一间。大门为灰瓦悬山顶，五檩分心式木架，用一斗二升交麻叶斗栱。正、厢房均为灰瓦硬山顶，五檩三柱式木架，无斗栱。
神厨 位于庙后西北角，是制作祭品的地方。约清初重建，维修同神庖，原仅存大门、东厢，1993年复原正厅和东厢。
后土祠 供奉孔庙土地神主，位于圣迹殿东南，与焚帛所东西相对，也是一处独立的小院。后土祠，始见于金代庙图，位于寝殿之北偏东，是一处独立的庭院，正房、两厢各三间，门一间。明弘治火后，土地祠位于今处，但仅为孤立的正房。清雍正七年（1729年）重修已成独立院落，形制与今存相同。围墙十六丈，门阔五尺二寸，正祠明间面阔一丈，二次间各面阔七尺，进深一丈七尺，其中前后廊各三尺，檐柱高八尺四寸，雅五墨彩画。乾隆十三年（1748年）维修，嘉庆二十一年（1816年）正祠坍塌重修，1988年重修。正房三间，灰瓦硬山顶，七檩四柱前后廊式木架，前为廊。门一间，砖墙承重，木过梁，灰瓦硬山顶。
焚帛所 祭祀时迎神后瘗埋牺牲毛血、送神后焚烧香帛之处。位于圣迹殿西南、神厨东南，是一处院墙围绕的空院，院内设瘗坎与焚帛池。前辟门，砖墙承重，木过梁，灰瓦。焚帛所始见于明洪武十年（1377年）庙制，位于寝殿后，弘治后位于今处，形制与今相同。
钟楼 位于阙里街中部，西接孔庙东南角楼。钟楼始见于明弘治修庙之后李东阳所撰《重修阙里庙图序》，“在右为钟鼓楼，与角楼而六”。清初已废，“钟楼在观德门之上，规模未称也，今悬钟处本为金代庙宅外门，是依庙居住的孔子裔孙出入的外门。清初名端门，是为迎合汉儒神化孔子西狩获麟“天下血书鲁端门”①命名的。今存钟楼单檐悬山顶，灰瓦绿边，五檩二柱木架，无斗栱。三间，明间敞开，不设门，次间不设窗。内置铜、铁钟各一，铜钟为明嘉靖元年（1522年）山东巡抚陈凤梧造。楼下为砖砌高台，高5.6米，南北向辟券门一洞。台无马道，借用孔庙东南角楼马道上下。
①《春秋公羊传·哀公十四年》何休注。
鼓楼 位于毓粹门之东。始建于明弘治年间，清中期以后毁于火，同治十一年（1872年）重建。楼高约16米，面阔五间，深三间，周为回廊，重檐歇山顶，绿瓦，前后廊式木架，无斗栱。楼下为砖砌方台，高7.2米，南北长25.4米，东西深12.1米，中间辟东西向券形栱门一洞，台南侧设马道供上下。台上楼内置大鼓，供孔庙祭祀和平时报时用。
汉石人亭 1953年添建。亭内存有二石人，“一者峨冠介而侍，一冕执殳拖修绅”。峨冠者在西，高2.54米，腰间佩剑，胸腹间阴刻篆书“汉故乐安太守庑君亭长”；执殳者在东，高2.2米，双手执殳（殳尖已残），胸腹间阴刻篆书“府门之卒”四字。二石人原在城东南八里的张曲古墓前，乾隆五十九年（1794年）阮元移存于庙西矍相圃，1953年移入孔庙。乐安为郡国，始设于东汉和帝永元七年（公元95年），石人当刻于东汉。孔庙漠礼器碑（公元156年立）有故乐安相庑季公捐款题名。
