西汉高祖刘邦首开皇帝祭祀曲阜孔子庙的先河，历史上许多皇帝纷纷仿效，一直到清高宗的1900多年间先后有十二位皇帝十九次亲自到曲阜阙里孔子庙祭祀孔子。
西汉高祖十二年（公元前195年）十一月，高祖刘邦自淮南过鲁，以太牢祭祀孔子。
东汉建武五年（公元29年）十月，光武帝击败董宪于昌虑，还过阙里，命大司空宋弘祭孔子。光武帝“坐孔子讲堂，顾指子路室谓左右曰：‘此吾太仆之室也’”。
东汉永平十五年（公元72年）三月，明帝刘庄命诸王齐来鲁国祭祀东海恭王陵墓。还至阙里孔子故宅，祭祀孔子及七十二弟子，并“亲御讲堂，命皇太子、诸王说经”。
东汉元和二年（公元85年）三月，章帝刘炟幸鲁，祭祀东海恭王刘彊陵墓，“庚寅，祀孔子于阙里，及七十二弟子，赐褒成侯及诸孔男女帛”。《后汉书·儒林传上·孔僖》记载比较详细，“元和二年春，帝东巡狩，还过鲁，幸阙里，以太牢祠孔子及七十二弟子，作六代之乐，大会孔氏男子二十以上者六十三人，命儒者讲论（语）。僖因自陈谢。帝曰：‘今日之会，宁于卿宗有光荣乎？’对曰：‘臣闻明王圣主，莫不尊师贵道，今陛下亲屈万乘，辱临敝里，此乃崇礼先师，增辉圣德。至于光荣，非所敢承。’帝大笑曰：‘非圣者子孙，焉有斯言乎！’遂拜僖郎中，赐褒成侯损及孔氏男女钱帛”。《頖宫礼乐疏》记载：“帝升庙西面，群臣中庭北面，皆再拜。”①
①〔明〕李之藻《頖宫礼乐疏》。
东汉延光三年（公元124年）春二月，安帝刘祜东巡狩，三月至曲阜，戊辰祀孔子及七十二弟子于阙里，自鲁相、令、丞、尉及孔氏亲属、妇女、诸生悉会，赐褒成侯以下帛各有差。
北魏太和十九年（公元495年）夏四月，孝文帝元宏至曲阜，庚申行幸鲁城，亲祠孔子庙。辛酉，诏拜孔氏四人、颜氏二人为官。诏选诸孔宗子一人封崇圣侯，邑一百户，奉孔子之祀。又诏兖州为孔子起园柏，修饰坟垄，更建碑铭，褒扬圣德。
唐乾封元年（公元666年）春正月，高宗李治封禅泰山，二月至曲阜祭祀孔子。甲午，次曲阜县，幸孔子庙，追赠太师，增修祠宇，以少牢致祭，免褒圣侯德伦及子孙赋役。
唐玄宗开元十三年（公元725年）十一月，玄宗李隆基封禅泰山，丙申，幸孔子宅，遣使以太牢祭其墓，给复近墓五户。赋诗《经鲁祭孔子而叹之》：“夫子何为者，栖栖一代中。地犹鄹氏邑，宅即鲁王宫。叹凤嗟身否，伤麟泣道穷。今看两楹奠，当与梦时同。”
后周广顺二年（公元952年）夏六月乙酉朔，太祖郭威至曲阜县，谒孔子祠。奠酒后将要致拜，左右曰：“仲尼，人臣也，无致帝拜。”太祖曰：“文宣王百代帝王师也，得无敬乎？”即拜奠于祠前，将所奠酒器、银炉等留于孔子庙，又到孔林拜谒孔子墓。太祖问左右近臣说：“仲尼、亚圣之后今有何人？”左右回答说：“前曲阜县令、袭封文宣公孔仁玉是仲尼四十三代孙，乡贡三礼颜涉是是颜渊之后。”太祖即召见孔仁玉，赐绯，口授曲阜县令，授颜涉曲阜县主簿，就令上任视事。仍敕兖州修葺孔子宅宇，禁止墓园樵采。
宋真宗大中祥符元年（1008年）冬十月，真宗赵恒封禅泰山，十一月至曲阜祭祀孔子，追谥孔子玄圣文宣王，追封孔子父叔梁纥为齐国公，母颜氏为齐国太夫人，妻并官氏为郓国夫人，授孔子四十六代孙、文宣公孔圣佑为太常寺奉礼郎，赐孔族六人出身、孔氏家钱三十万、帛三百匹、祭田一百顷，赐孔子庙经史书籍、太宗御制御书一百五十卷，将祭祀孔子使用的银炉、祭器、御香等留于庙中。
清康熙二十三年（1684年）十一月圣祖至曲阜，己卯亲自祭祀孔子，行三跪九叩头礼，遣内阁学士麻尔图等分别祭祀四配、十哲、两庑先贤先儒，国子监祭酒阿瑚祭祀启圣祠，颁给御书“万世师表”额，在诗礼堂听孔尚任、孔尚 分讲《圣经》首节和《易经》首节，周览庙中古迹，将御用曲柄黄盖留于庙中，又到孔林祭祀孔子墓，行一跪三叩头礼，令扩大孔林一千一百多亩，赐衍圣公、五经博士及孔氏族人书籍、貂蟒、银币不等。讲经监生孔尚任、举人孔尚 破格授为国子监博士，陪祀观礼生员十五人作为恩贡送国子监读书，应升孔氏官员以应升之缺选用，候补和候选官荫生二十三人、举人六人都以应得之缺选用，贡生等十一人待考定职衔选用，世袭官员均加一级，题褒衍圣公祖母“节并松筠”，封周公后裔东野沛然为世袭翰林院五经博士。
清乾隆十三年（1748年）二月戊寅，高宗第一次至曲阜，当即到孔子庙上香，三跪九叩头，周览庙中古迹。第二天，举行隆重的正式祭祀释奠礼，礼行三献，三跪九叩，命左都御史刘统勋等分献四配、十二哲、两庑先贤先儒，诫亲王分献崇圣祠，在诗礼堂听孔继汾讲《中庸》“凡为天下国家有九经”章，孔继涑讲《周易》临卦象辞，至孔林祭祀孔子墓，一跪三叩头，题写御书大成殿、诗礼堂和孔庙各门门额、对联，留曲柄黄盖，授孔继汾内阁中书舍人，赐衍圣公孔昭焕貂裘蟒服表里、经史书籍，赐十三氏子孙宴，赏十三氏进士、举人每人银十两，贡监生员每人银五两，有职者皆加一级，令学臣选拔十三氏文学可观、读书立品子孙贡入国子监。
乾隆二十一年（1756年）三月己巳，高宗第二次至曲阜，仍旧先到孔子庙上香行礼，第二天举行在孔子庙释奠礼，到孔林酹酒，仪式与上次一样。路经梁公林，派大学士陈世倌到叔梁纥墓前奠酒。
乾隆二十二年（1757年）四月己巳，高宗第三次到曲阜，到孔子庙上香，行三跪九叩礼，次日到孔林酹酒，没有举行正式祭祀，赐衍圣公孔昭焕高祖母黄氏“六代含饴”额。
乾隆二十七年四月庚辰，高宗第四次到曲阜，入棂星门下马，由中道步入大成殿上香，行两跪六叩礼，出德侔天地坊去古泮池行宫。第二天，去孔林酹酒。
第五次是在乾隆三十六年（1771年）三月乙巳，高宗第五次至曲阜，乘步辇由德侔天地坊入庙，奏“仙源九祝之曲”，至大成门外下辇，到大成殿上香，次日举行释奠礼，三献九拜，全如十三年仪式，令工部尚书、和硕额驸福隆安等分献四配、十二哲、先贤先儒，令协办大学士、户部尚书于敏中分献崇圣祠，令曹秀先、金甡、钱维城、申甫分祭颜子、曾子、子思、孟子庙。赐衍圣公孔昭焕以下衣服银币不等，令颁内府所藏周代十件铜器与孔子庙。
乾隆四十一年（1776年）二月，高宗因平定金川，奉母东巡，三月第六次至曲阜，举行释奠礼，并谒孔子墓酹酒。
乾隆四十九年（1784年）二月，高宗南巡第七次到曲阜，释奠孔子庙，谒孔林酹酒。
乾隆五十五年（1790年）三月十五日，高宗第八次到曲阜孔子庙释奠，谒孔林酹酒。
第三节 皇帝幸鲁亲祭
西汉高祖刘邦首开皇帝祭祀曲阜孔子庙的先河，历史上许多皇帝纷纷仿效，一直到清高宗的1900多年间先后有十二位皇帝十九次亲自到曲阜阙里孔子庙祭祀孔子。
西汉高祖十二年（公元前195年）十一月，高祖刘邦自淮南过鲁，以太牢祭祀孔子。
东汉建武五年（公元29年）十月，光武帝击败董宪于昌虑，还过阙里，命大司空宋弘祭孔子。光武帝“坐孔子讲堂，顾指子路室谓左右曰：‘此吾太仆之室也’”。
东汉永平十五年（公元72年）三月，明帝刘庄命诸王齐来鲁国祭祀东海恭王陵墓。还至阙里孔子故宅，祭祀孔子及七十二弟子，并“亲御讲堂，命皇太子、诸王说经”。
东汉元和二年（公元85年）三月，章帝刘炟幸鲁，祭祀东海恭王刘彊陵墓，“庚寅，祀孔子于阙里，及七十二弟子，赐褒成侯及诸孔男女帛”。《后汉书·儒林传上·孔僖》记载比较详细，“元和二年春，帝东巡狩，还过鲁，幸阙里，以太牢祠孔子及七十二弟子，作六代之乐，大会孔氏男子二十以上者六十三人，命儒者讲论（语）。僖因自陈谢。帝曰：‘今日之会，宁于卿宗有光荣乎？’对曰：‘臣闻明王圣主，莫不尊师贵道，今陛下亲屈万乘，辱临敝里，此乃崇礼先师，增辉圣德。至于光荣，非所敢承。’帝大笑曰：‘非圣者子孙，焉有斯言乎！’遂拜僖郎中，赐褒成侯损及孔氏男女钱帛”。《頖宫礼乐疏》记载：“帝升庙西面，群臣中庭北面，皆再拜。”①
①〔明〕李之藻《頖宫礼乐疏》。
东汉延光三年（公元124年）春二月，安帝刘祜东巡狩，三月至曲阜，戊辰祀孔子及七十二弟子于阙里，自鲁相、令、丞、尉及孔氏亲属、妇女、诸生悉会，赐褒成侯以下帛各有差。
北魏太和十九年（公元495年）夏四月，孝文帝元宏至曲阜，庚申行幸鲁城，亲祠孔子庙。辛酉，诏拜孔氏四人、颜氏二人为官。诏选诸孔宗子一人封崇圣侯，邑一百户，奉孔子之祀。又诏兖州为孔子起园柏，修饰坟垄，更建碑铭，褒扬圣德。
唐乾封元年（公元666年）春正月，高宗李治封禅泰山，二月至曲阜祭祀孔子。甲午，次曲阜县，幸孔子庙，追赠太师，增修祠宇，以少牢致祭，免褒圣侯德伦及子孙赋役。
唐玄宗开元十三年（公元725年）十一月，玄宗李隆基封禅泰山，丙申，幸孔子宅，遣使以太牢祭其墓，给复近墓五户。赋诗《经鲁祭孔子而叹之》：“夫子何为者，栖栖一代中。地犹鄹氏邑，宅即鲁王宫。叹凤嗟身否，伤麟泣道穷。今看两楹奠，当与梦时同。”
后周广顺二年（公元952年）夏六月乙酉朔，太祖郭威至曲阜县，谒孔子祠。奠酒后将要致拜，左右曰：“仲尼，人臣也，无致帝拜。”太祖曰：“文宣王百代帝王师也，得无敬乎？”即拜奠于祠前，将所奠酒器、银炉等留于孔子庙，又到孔林拜谒孔子墓。太祖问左右近臣说：“仲尼、亚圣之后今有何人？”左右回答说：“前曲阜县令、袭封文宣公孔仁玉是仲尼四十三代孙，乡贡三礼颜涉是是颜渊之后。”太祖即召见孔仁玉，赐绯，口授曲阜县令，授颜涉曲阜县主簿，就令上任视事。仍敕兖州修葺孔子宅宇，禁止墓园樵采。
宋真宗大中祥符元年（1008年）冬十月，真宗赵恒封禅泰山，十一月至曲阜祭祀孔子，追谥孔子玄圣文宣王，追封孔子父叔梁纥为齐国公，母颜氏为齐国太夫人，妻并官氏为郓国夫人，授孔子四十六代孙、文宣公孔圣佑为太常寺奉礼郎，赐孔族六人出身、孔氏家钱三十万、帛三百匹、祭田一百顷，赐孔子庙经史书籍、太宗御制御书一百五十卷，将祭祀孔子使用的银炉、祭器、御香等留于庙中。
清康熙二十三年（1684年）十一月圣祖至曲阜，己卯亲自祭祀孔子，行三跪九叩头礼，遣内阁学士麻尔图等分别祭祀四配、十哲、两庑先贤先儒，国子监祭酒阿瑚祭祀启圣祠，颁给御书“万世师表”额，在诗礼堂听孔尚任、孔尚 分讲《圣经》首节和《易经》首节，周览庙中古迹，将御用曲柄黄盖留于庙中，又到孔林祭祀孔子墓，行一跪三叩头礼，令扩大孔林一千一百多亩，赐衍圣公、五经博士及孔氏族人书籍、貂蟒、银币不等。讲经监生孔尚任、举人孔尚 破格授为国子监博士，陪祀观礼生员十五人作为恩贡送国子监读书，应升孔氏官员以应升之缺选用，候补和候选官荫生二十三人、举人六人都以应得之缺选用，贡生等十一人待考定职衔选用，世袭官员均加一级，题褒衍圣公祖母“节并松筠”，封周公后裔东野沛然为世袭翰林院五经博士。
清乾隆十三年（1748年）二月戊寅，高宗第一次至曲阜，当即到孔子庙上香，三跪九叩头，周览庙中古迹。第二天，举行隆重的正式祭祀释奠礼，礼行三献，三跪九叩，命左都御史刘统勋等分献四配、十二哲、两庑先贤先儒，诫亲王分献崇圣祠，在诗礼堂听孔继汾讲《中庸》“凡为天下国家有九经”章，孔继涑讲《周易》临卦象辞，至孔林祭祀孔子墓，一跪三叩头，题写御书大成殿、诗礼堂和孔庙各门门额、对联，留曲柄黄盖，授孔继汾内阁中书舍人，赐衍圣公孔昭焕貂裘蟒服表里、经史书籍，赐十三氏子孙宴，赏十三氏进士、举人每人银十两，贡监生员每人银五两，有职者皆加一级，令学臣选拔十三氏文学可观、读书立品子孙贡入国子监。
乾隆二十一年（1756年）三月己巳，高宗第二次至曲阜，仍旧先到孔子庙上香行礼，第二天举行在孔子庙释奠礼，到孔林酹酒，仪式与上次一样。路经梁公林，派大学士陈世倌到叔梁纥墓前奠酒。
乾隆二十二年（1757年）四月己巳，高宗第三次到曲阜，到孔子庙上香，行三跪九叩礼，次日到孔林酹酒，没有举行正式祭祀，赐衍圣公孔昭焕高祖母黄氏“六代含饴”额。
乾隆二十七年四月庚辰，高宗第四次到曲阜，入棂星门下马，由中道步入大成殿上香，行两跪六叩礼，出德侔天地坊去古泮池行宫。第二天，去孔林酹酒。
第五次是在乾隆三十六年（1771年）三月乙巳，高宗第五次至曲阜，乘步辇由德侔天地坊入庙，奏“仙源九祝之曲”，至大成门外下辇，到大成殿上香，次日举行释奠礼，三献九拜，全如十三年仪式，令工部尚书、和硕额驸福隆安等分献四配、十二哲、先贤先儒，令协办大学士、户部尚书于敏中分献崇圣祠，令曹秀先、金甡、钱维城、申甫分祭颜子、曾子、子思、孟子庙。赐衍圣公孔昭焕以下衣服银币不等，令颁内府所藏周代十件铜器与孔子庙。
乾隆四十一年（1776年）二月，高宗因平定金川，奉母东巡，三月第六次至曲阜，举行释奠礼，并谒孔子墓酹酒。
乾隆四十九年（1784年）二月，高宗南巡第七次到曲阜，释奠孔子庙，谒孔林酹酒。
乾隆五十五年（1790年）三月十五日，高宗第八次到曲阜孔子庙释奠，谒孔林酹酒。