元至元十三年(公元1276年),改博州路为东昌路；明洪武 元年(公元1372年),改东昌路为东昌府，治所均在聊城。从此， 东昌府之称谓一直延续到清末。鸦片战争(1840年)后，东昌府 为山东省所辖十府之一。东昌府为承上启下的地方行政机构，上 受司、道的领导，下辖一州九县，分别为高唐州及聊城、堂邑、博 平、茌平、清平、莘县、冠县、馆陶、恩县各县。
东昌府设行政长官知府一人，为正印官，掌一府政令，官秩 从四品。知府下设辅佐官同知一人，分理府内各项事务，官秩正 五品，在公文中称“丞”,尊称“司马”。东昌府还设有儒学教授一 人，复设训导(康熙元年，即公元1662年，大学裁训导留教谕一 人，小学裁教谕留训导一人，康熙十九年全复通省教职，故有复 设教谕、复设训导之名.见民国《山东通志》第十三册第1767页) 一人，为分掌东昌府生员学习儒学事务的官员。
东昌知府的办事机构称知府衙门，其内部组织机构由府堂 及经历司、司狱司等组成。府堂是知府衙门内一个综合性的办事 机构，直接为知府服务，内置典吏若干人，按吏、户、礼、兵、刑、工
六房办事；经历司是知府衙门内掌管出纳文移诸事的机构，设经 历一人，官秩为正八品；司狱司是知府衙门内掌察理狱囚诸事的 机构，设司狱一人，官秩为从九品。司狱司后被裁减。
除知府衙门内的办事机构外，东昌府还设有下列所属机构： 一是阴阳学，设正术一人，品秩未入流，是府的阴阳官，兼辖星 学。二是医学，设正科一人，品秩未入流，是府属的医官。三是僧 纲司，设都纲一人，品秩从九品；副都纲一人，品秩未入流，是府 内管理僧人的官员。四是道纪司，设都纪一人，品秩从九品；副都 纪一人，品秩未入流，是府内管理道士的官员。以上机构各设典 吏若干人，攒典一人。
另，山东省专职机构如督粮道衙门还在东昌设有管粮通判， 在东昌、临清设有卫领运官等专职官员，分级管理省内漕粮事 务；运河道衙门还在聊城、堂邑、清平、馆陶、张秋设有管河通判 等官。
第一节 晚清时期行政组织：一、知府衙门
元至元十三年(公元1276年),改博州路为东昌路；明洪武 元年(公元1372年),改东昌路为东昌府，治所均在聊城。从此， 东昌府之称谓一直延续到清末。鸦片战争(1840年)后，东昌府 为山东省所辖十府之一。东昌府为承上启下的地方行政机构，上 受司、道的领导，下辖一州九县，分别为高唐州及聊城、堂邑、博 平、茌平、清平、莘县、冠县、馆陶、恩县各县。
东昌府设行政长官知府一人，为正印官，掌一府政令，官秩 从四品。知府下设辅佐官同知一人，分理府内各项事务，官秩正 五品，在公文中称“丞”,尊称“司马”。东昌府还设有儒学教授一 人，复设训导(康熙元年，即公元1662年，大学裁训导留教谕一 人，小学裁教谕留训导一人，康熙十九年全复通省教职，故有复 设教谕、复设训导之名.见民国《山东通志》第十三册第1767页) 一人，为分掌东昌府生员学习儒学事务的官员。
东昌知府的办事机构称知府衙门，其内部组织机构由府堂 及经历司、司狱司等组成。府堂是知府衙门内一个综合性的办事 机构，直接为知府服务，内置典吏若干人，按吏、户、礼、兵、刑、工
六房办事；经历司是知府衙门内掌管出纳文移诸事的机构，设经 历一人，官秩为正八品；司狱司是知府衙门内掌察理狱囚诸事的 机构，设司狱一人，官秩为从九品。司狱司后被裁减。
除知府衙门内的办事机构外，东昌府还设有下列所属机构： 一是阴阳学，设正术一人，品秩未入流，是府的阴阳官，兼辖星 学。二是医学，设正科一人，品秩未入流，是府属的医官。三是僧 纲司，设都纲一人，品秩从九品；副都纲一人，品秩未入流，是府 内管理僧人的官员。四是道纪司，设都纪一人，品秩从九品；副都 纪一人，品秩未入流，是府内管理道士的官员。以上机构各设典 吏若干人，攒典一人。
另，山东省专职机构如督粮道衙门还在东昌设有管粮通判， 在东昌、临清设有卫领运官等专职官员，分级管理省内漕粮事 务；运河道衙门还在聊城、堂邑、清平、馆陶、张秋设有管河通判 等官。