山东神学院创办于1987年9月，院长为王神荫主教。山东神学院实行省基督教两会领导下的院长负责制，设教务处、总务处等机构。
1987年，山东神学院首届录取新生54人。1989年，山东神学院第一届毕业生52人；1991年，第二届毕业生58人；1993年，第三届毕业生57人；1995年，第四届毕业生42人；1997年，第五届毕业生23人。1987—1997年，山东神学院共培养两年制神学专科毕业生5届，一年制教牧义工培训班1届，总人数262人。
1997年5月，山东神学院开始修建新校区，第一期工程建成总面积4000平方米的综合教学楼及食堂、师生宿舍。1998年11月22日，山东神学院迁入新校舍，办学条件大为改观。搬入新校区以后，山东神学院招收第六届神学专科生，学制由二年改为三年。同时，大力开展为期一年、半年或三个月不等的专职教牧同工、教会义工的教牧培训或圣乐培训。
图5-18 山东神学院旧址（济南市经二路67号）
图5-19 1998年11月22日，山东神学院新校（济南市美里湖开发区粟山路356号）落成典礼在济南举行
1999年，山东神学院第二期工程开工。新建礼拜堂1座、学生宿舍楼1幢，总面积1400平方米，总投资100万元。2000年3月，第二期工程建成使用。
图5-20 2000年3月，山东神学院新校区礼拜堂建成使用
一、招生
1987—1997年，山东神学院招收二年制神学专科生，共招收5届，1993年，招收一届一年制义工培训班，共30人。1998—2005年，山东神学院招收三年制神学专科生，共招3届，总人数116人。自2001年起，开始招收一年制义工培训班，至2005年，共招5届总人数280人。
报考山东神学院的信徒，年龄均在20～35周岁，身体健康，具有高中以上学历，爱国爱教，品行端正，接受洗礼1年以上，有为山东教会服务的奉献心志，由所在教会及市、县两会按条件选拔、推荐，经省基督教两会审查合格后，参加山东神学院组织的统一考试，考试后择优录取。山东神学院对修完规定课程且成绩合格者，发给毕业证书。
二、师资和课程
山东神学院的师资分为专职教师和兼职教师。截至2005年，山东神学院共有专职教师9人，其中6人具有神学硕士学位。宗教课的兼职教师主要是济南、青岛、烟台等地教会中有资深经历和丰富学识的牧师。文化课和艺术课的教师主要是由驻济南的山东省大专院校的教师兼任。
山东神学院主要针对神学专科教育和短期教牧培训设置和安排课程。按照中国基督教神学教育委员会规定的课程比例框架，并兼顾山东教会的特点，宗教课占全部课程的70%，政治、文化、艺术课占30%。宗教课包括《圣经》基础知识、解经、神学、教会历史及教牧实践类的课程；政治课主要内容是政策法规教育和爱国主义教育；文化课开设大学语文、哲学史、世界通史、英语、计算机知识；艺术课有音乐方面的声乐、钢琴等，以及实用美术和软笔书法课。
