20世纪80年代中期开始，各级卫生部门以提高城乡食品卫生质量为目标，不断加强饮食业和集贸市场监督管理，运用宣传、典型引导、建章立制、检查整顿等手段，规范食品从业者的经营行为。1986—2005年，全省卫生监督部门依法查处食品卫生违法行为47万余起，推动了“食品质量放心”工程的实施。
1986年，省食品卫生领导小组抽调卫生等9部门人员组成检查团，赴各地检查饮食业和集贸市场。省卫生厅、省商业厅联合下发《关于推行分餐制的通知》，确定在青岛市试点。制定食品卫生示范县标准，推动示范县创建活动。
1987年7月，省食品卫生领导小组下发《关于立即清查、处理进口毛豆油、毛菜油的紧急通知》，经努力，各地基本查清进口毛豆油情况，即行封存处理。当年，省卫生厅印发《山东省食品卫生检验出证管理办法》。省卫生厅、省商业厅联合组织评选表彰商业系统食品卫生信得过单位474个。
1988年，山东省卫生、质检部门从食品生产企业中推荐88个企业的98个产品，为年度全省预选优质食品。省卫生厅、省司法厅等9部门在全省组织开展《食品卫生法（试行）》实施5周年纪念活动，印发食品卫生彩色宣传挂图3万套，摄制播放《食品卫生监鉴录》电视片10集。
1989年8月，全省食品卫生示范县工作会议在海阳县召开，推广海阳经验。每市（地）选择1～2个县作为示范县建设单位进行重点指导。1990年，卫生部在全国开展创建食品卫生达标县活动，省卫生厅首选海阳县为试点。年底，海阳、荣成等9个县（市、区）通过省级食品卫生达标县验收。全省商业系统5278个单位参加创建“食品卫生信得过单位”活动，其中800个单位获此称号。9.95万名食品从业人员接受食品卫生法律法规知识培训，占总数的83%。枣庄市调查处理一起铁路运输造成60吨白糖污染事故，经毒理学试验查出污染物，采取补救措施后挽回经济损失5万元。
1989年，省卫生厅印发《山东省食品卫生监督机构考核标准》《山东省食品卫生许可证发放验收标准》等文件。建成全省食品卫生数据统计报告网络。
1991年，省卫生厅印发《山东省食品卫生达标县（市、区）考核标准》。省检查济南市15家扒鸡店调味品，对检出罂粟壳的店铺移交当地公安部门处理。
1992年，根据商业部《四川省部分地区发生药物引流活猪胆汁情况的调查报告》，省卫生防疫站通知各地，不准收购、屠宰引流生猪，禁止其肉品入库和上市销售；推广生猪“定点屠宰、集中检验”办法，从根本上解决病害肉品危害群众健康问题。
1993年，省卫生厅在全省推行卫生监督、监测分级管理，扩大监督覆盖面，加强街头食品和新资源食品、食品用产品卫生管理。
1994年，卫生部批准荣成、环翠、莱州、莱阳、诸城、胶南、邹城、博兴县（市、区）为“全国食品卫生示范县”。
1995年，省卫生厅连续5次召开新闻发布会，纪念《食品卫生法（试行）》颁布12周年，迎接新的《食品卫生法》颁布实施。省卫生厅和山东电视台等8家新闻单位联合举办“健康杯”食品卫生齐鲁行活动，宣传报道卫生监督执法行动，对伪劣食品予以曝光。
1996年4月，依照新的《食品卫生法》，省卫生厅修订印发《食品卫生许可证发放管理办法》《采购食品索证管理办法》《饮食单位卫生许可证发放验收标准》。7—9月，省卫生厅在全省组织开展强化卫生监督执法活动，“拉网式”检查中小型饮食单位、街头食品摊点、建筑工地食堂、学校集体食堂。省卫生厅、省人大教科文卫委员会主办“96‘健康杯’食品卫生齐鲁行”活动，省委书记赵志浩为活动题词。山东电视台、大众日报等新闻媒体集中宣传报道食品卫生监督执法行动。
1998年，省卫生厅派员参加全省性“打假”活动，赴潍坊等4个市（地）11个县（市、区）抽查副食品市场，查处了一批假冒伪劣食品、保健品。
1999年5—7月，省卫生防疫站组织开展全省性集体食堂食品卫生监督检查，重点检查各类学校、幼儿园和企事业单位、建筑工地食堂。并对客座200人以下的宾馆、饭店、餐馆、酒店、招待所和车站、码头、城区街头食品摊点群，进行“拉网式”检查整顿。
2000年6—11月，省、市卫生部门和新闻单位共同举办“齐鲁食品卫生世纪行”活动，现场检查食品企业100余家，依法处罚一批严重违法单位，销毁处理大批不合格食品，播发、刊登各类宣传稿件100余篇。7月，省卫生厅通报山东歌舞剧院骑术学校、滕州市育才中学、山东医科大学卫生学校、山东省武术院武术学校4起共352人食物中毒事件，组织各地对学校食堂卫生进行“拉网式”检查整顿。
2001年4—5月，省卫生厅组织实施《山东省卫生监督执法新世纪行动方案》，开展食品卫生、公共场所、健康相关产品专项治理。6月，省卫生厅制定健康相关产品打假活动方案，在全省开展食品、化妆品、一次性输液（输血、注射）器专项打假活动。7—10月，省卫生厅在全省开展食品广告专项监督检查。
2002年，全省集中开展小型食品企业、保健食品、桶装饮用水和卫生许可证专项整顿，检查食品生产经营单位25.9万个，责令整改61608家。检查保健食品生产经营单位1334家，没收销毁伪劣产品5000余件。检查桶装饮用水企业577家，样品合格率76.6%，取缔非法加工点58个。对207家生产经营单位注销卫生许可证。
2003年1—2月，省卫生监督所完善保健食品卫生许可申办程序，对省管保健食品生产企业进行现场审核、量化评分，对关键项目不符合标准者，实行一票否决制。5月，省卫生监督所下发《关于开展食品卫生监督量化分级管理和HACCP试点活动的通知》，启动量化分级管理试点。9月，印发《山东省全面实施食品监督量化分级管理制度方案》，在餐饮业和各类学校、幼儿园施行。11—12月，省卫生监督所在省直管饮食单位中评定A级单位5家，B级单位31家，C级单位4家。
当年，全省卫生监督机构以实施食品放心工程为契机，检查食品生产、加工、经营单位87126户，查处违法行为3743起，涉及货值426万元；立案查处638起，罚款486.25万元，移送司法机关144起，逮捕1人，销毁假冒伪劣食品4.8万千克。省卫生监督所在全省组织开展非法宣传改善性功能食品专项整治活动，检查综合商场保健食品专柜30个、保健食品批发市场35处、商店310家，查处违规食品250余种。
2004年，省卫生监督所制定保健食品GMP审查方案和审查程序，实行专家审查制，坚持先审查后许可原则，凡未通过GMP审查认证的生产企业，不得办理卫生许可证。2月，经专家考核验收，12家省直管宾馆、学校食堂被定为A级餐饮单位。4月，省卫生厅组织全省性假劣奶粉“拉网式”检查整治活动，要求各地发现与安徽阜阳事件相关奶粉、“三无奶粉”、过期奶粉、可疑劣质奶粉立即查封。6月，省卫生厅等8部门下发《山东省食品安全信用体系建设工作实施方案》。7月，省卫生监督所下发《关于开展罐头食品专项检查的紧急通知》《关于开展食品生产经营单位安全诚信活动的通知》。11月，省卫生监督所抽查各地建筑工地食堂48个，发现多为临时搭建，设施简陋，无卫生许可证者占21%，无清洗、消毒设施的占87.5%。对违法情节严重者交当地卫生监督机构处理。
2005年1月，省卫生厅公布济南、烟台、潍坊、临沂4市100家食品生产经营企业为食品卫生监督量化分级管理A级单位。3月，省卫生监督所组织开展全省性食品生产经营企业卫生许可专项清理整顿活动，检查食品生产企业9581户、经营企业46267户，处罚违规违法单位8467家。当月，中央电视台曝光“苏丹红1号事件”后，全省各级卫生监督机构迅即开展食品添加剂生产企业“拉网式”检查。共查食用色素、面粉改良剂、食用香精等生产企业102家，责令整改47家，取缔无证生产企业3家。4月，省卫生监督所组织开展违法宣传改善性功能保健食品专项检查，依法查处伪造、冒用卫生部批准文号、明示或暗示改善性功能及减肥功能的产品42种。
1986—2005年山东省食品卫生违法行为行政处罚一览表
表2-3
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┃年│ 食品生产 │ 警告并 │责令追│没收或销│罚款/总 │责令停│吊销│ 备注 ┃
┃份│经营者/监 │限期改进│回 │毁 │额 │业 │卫生│ ┃
┃ │督 │（户次）│ 产品 │伪劣产品│（户次/ │ 改进 │许可│ ┃
┃ │（户/户次 │ │（户次│（户次/ │万元） │（户次│证（│ ┃
┃ │） │ │/万千 │万千克）│ │） │个）│ ┃
┃ │ │ │克） │ │ │ │ │ ┃
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┃19│ 181689/ │ 17261 │ 2719 │ 缺如/ │ 10137/ │ 5531 │114 │ ┃
┃86│389665 │ │ │210.5 │71.48 │ │ │ ┃
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┃19│ 914437/ │ 20044 │ 2421 │ 缺如/ │9961/缺 │ 5285 │ 57 │ ┃
┃87│592030 │ │ │224.26 │如 │ │ │ ┃
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┃19│ 352150/ │ 17669 │ 544 │ 4977/ │9979/缺 │ 5027 │ 63 │ ┃
┃88│595560 │ │ │178.8 │如 │ │ │ ┃
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┃19│ 341169/ │ 17096 │ 448 │ 4580/ │ 8394/ │ 3561 │ 82 │ ┃
┃89│690092 │ │ │103.4 │76.15 │ │ │ ┃
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┃19│ 355435/ │ 23472 │ 692 │ 6948/ │ 7572/ │ 4098 │101 │ ┃
┃90│902808 │ │ │102.16 │71.4 │ │ │ ┃
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┃19│ 359787/ │ 24131 │ 缺如 │ 5288/ │ 13622/ │ 4543 │158 │合格278071户┃
┃91│340341 │ │ │84.7 │126 │ │ │处罚41274户 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │行政诉讼31次┃
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┃19│ 420936 │ 20200 │ 缺如 │ 4164/ │ 7862/ │ 4363 │ 90 │合格361745户┃
┃92│ │ │ │69.25 │136.96 │ │ │行政诉讼2次 ┃
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┃19│ 833470 │ 16751 │ 缺如 │ 2641/ │5202/缺 │ 3248 │139 │处罚20275户 ┃
┃93│ │ │ │27.89 │如 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │行政诉讼12次┃
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┃19│ 406667/ │ 19773 │ 缺如 │ 4053/ │7556/缺 │ 4302 │ 89 │合格350758户┃
┃94│949100 │ │ │66.5 │如 │ │ │处罚32512户 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │行政诉讼2次 ┃
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┃19│ 1032372 │ 16828 │ 缺如 │ 2784/ │ 7087/ │ 5023 │521 │处罚25925户 ┃
┃95│ │ │ │16.26 │535.83 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │行政诉讼47次┃
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┃19│ 764108 │ 9119 │ 缺如 │ 1850/ │ 5366/ │ 3044 │209 │处罚18835户 ┃
┃96│ │ │ │21.7 │247.3 │ │ │次 ┃
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┃19│ │ 10796/ │ 218/ │301/7.71│ 3994/ │ 1178 │ 46 │处罚24868户 ┃
┃97│ │9867 │3.57 │，1162/ │291.17 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │18.02 │ │ │ │取缔834户次 ┃
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┃19│ │ 15289/ │ 183/ │ 2782/ │ 4808/ │ 1737 │ 98 │处罚31981户 ┃
┃98│ │10984 │3.27 │22.3 │207.5 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │没收违法所得┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │202户次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │ 15.5万元 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔1057户次┃
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┃19│ │ 12080/ │ 195/ │ 1749/ │ 3777/ │ 1035 │ 35 │处罚24558户 ┃
┃99│ │11059 │28.5 │18.9 │263.3 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │没收违法所得┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │95户次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │ 15.14万元 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔944户次 ┃
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┃20│ 344123 │ 13454 │ 231/ │ 1750/ │ 3273/ │ 851 │ 35 │ 从业人员 ┃
┃00│ │ │24058 │19.35 │309.97 │ │ │1033528人 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │检查342569户┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │处罚29125户 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │没收违法所得┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │15户次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │ 14.4万元 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔688户次 ┃
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┃20│ │ 11908/ │ 312/ │ 7593/ │ 6839/ │ 1012 │282 │没收违法所得┃
┃01│ │21651 │7.18 │32.1 │407.8 │ │ │206户次43.34┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │万元 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔568户次 ┃
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┃20│ │ 13718/ │ 774/ │ 2473/ │ 89843/ │ 1248 │ 80 │处罚30494户 ┃
┃02│ │15455 │19.5 │38.1 │385.95 │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │没收违法所得┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │8291户次79.7┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │万元 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔1061户次┃
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┃20│ │ │ │缺如/4.8│ 缺如/ │ │ │检查87126户 ┃
┃03│ │ │ │ │486.25 │ │ │查处违法行为┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │3743起 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │立案查处638 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │起 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │移送司法机关┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │144起 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │ 逮捕1人 ┃
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┃20│ │ │ │缺如/162│ │ │139 │检查食品生产┃
┃04│ │ │ │吨 │ │ │ │、加工、经营┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │单位95.8万户┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │次 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │查处违法行为┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │10902起 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │取缔无证经营┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │业户220家 ┃
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┃20│ │ 19490 │ │ │缺如/273│ │137 │检查餐饮业、┃
┃05│ │ │ │ │ │ │ │集体食堂 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │87616户 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │ 取缔1425户 ┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │没收违法所得┃
┃ │ │ │ │ │ │ │ │21.6万元 ┃
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