1986—2002年，省卫生防疫站、省环境卫生监测站按照分工分别承担部分公共卫生监督任务。2003年1月起，按照卫生部要求，上述两个单位被撤销，监督职能和专业人员转入新成立的省卫生监督所。
一、山东省卫生防疫站
1986年，省卫生防疫站依据《食品卫生法（试行）》等法律法规，承担全省食品卫生、公共场所卫生、饮用水卫生、放射卫生、学校卫生、化妆品卫生监督监测和技术指导任务。内设食品卫生监督检验所、放射防护科、学校卫生科和中心实验室，监督检验人员87人。配备日本三洋低温冰箱、丹麦电测听、国产热释光剂量仪等设备18台（件）。
1991年，监督检验人员82人，其中食品卫生监督检验所47人，放射防护科13人，学校卫生科11人，中心实验室11人。
1995年8月，增设综合监督科。省卫生防疫站对驻济南的山东大学、南郊宾馆等25个单位实施直接综合卫生监督。1996年，撤销中心实验室，人员、设备并入食品卫生监督检验所。
2000年，监督检验人员增至90人，其中食品卫生监督检验所56人，放射防护科16人，学校卫生科10人，综合监督科8人。
2001—2002年，购置美国产高效液相色谱仪和固相萃取机、德国产带光照生化培养箱、日本产全自动高压灭菌器等设备13台（件）。2002年，主管医、技师职称以上人员占50%。千元以上现场监督监测设备和万元以上检验设备100余台（件）。
2003年1月，该站被撤销。
二、山东省环境卫生监测站
省卫生厅直属全额预算管理处级事业单位，编制40人。与省卫生防疫站“一个机构，两块牌子”。负责环境卫生、饮用水卫生、公共场所卫生、化妆品卫生、预防性卫生监督和理化检测检验工作。
1987年，设环境流行病科、预防性卫生监督科、理化检验科和办公室，代管省卫生防疫站环境卫生科。职工45人，其中专业技术人员44人，行政管理人员1人。
1989年，撤销办公室，安排2人到省卫生防疫站微生物检验室工作。
1990年，职工47人，其中业务人员46人。
1993年，环境卫生科更名为环境卫生一科，环境流行病科更名为环境卫生二科。
1994年3月，与省卫生厅签订《省卫生防疫站综合目标管理责任书》，实行站长负责制，对站内各科实行综合目标管理。
1996年12月，环境卫生一、二科合并为环境卫生科。1997年，因人员调动，预防性卫生监督科无人开展工作，编制、职责保留。
1999年，检验科并入环境卫生科。充实预防性卫生监督科人员，恢复职能，与省卫生防疫站学校卫生科合署办公。辖环境卫生科和预防性卫生监督科，业务人员27人。
2002年，职工23人，均为业务人员，其中副主任医师8人，主管医师10人，医师（士）5人。现场和实验室监测设备130余台。
2003年1月，该站被撤销。
三、山东省卫生厅卫生监督所
成立于2003年1月。为省卫生厅履行卫生监督职责的执行机构，全额预算管理处级事业单位，全省卫生监督执法业务指导中心。编制100人，设11个科室，含办公室、人事科、法制稽查科、许可审办科、宣传培训科、卫生监督一科、卫生监督二科、卫生监督三科、卫生监督四科、卫生监督五科、卫生监督六科。承担《食品卫生法》《职业病防治法》《传染病防治法》等卫生法律法规和部门规章监督执法任务，依法行使食品卫生监督、职业卫生监督、放射卫生监督、公共场所卫生监督、化妆品卫生监督、生活饮用水卫生监督和传染病防治、医疗市场监管等监督执法职能，具体负责法律法规规定由省级办理的卫生许可受理、审查和发证，受理投诉、举报、法律咨询和卫生监督稽查、重大卫生行政案件查处。
2003年，财政补助经费481万元，购入监督检验和办公设备，年末有各类计算机57台，卫生检测等专业设备59件，汽车9辆，固定资产总额439.8万元，事业基金60.8万元。
2004年2月，印发内部管理制度19项。5月，省卫生厅与该所领导班子签订任期目标责任书，时间至2007年12月，提出工作目标及考核标准。10月，调整该所业务职能：（1）将食品、保健品、化妆品的综合监督、组织协调、重大事故查处职能和保健品许可、抽验检测职能划给省食品药品监督管理局。（2）加强突发公共卫生事件应急处理工作，有效预防、及时控制和消除突发公共卫生事件的危害，保障人民健康与生命安全。
2005年4月，通过ISO9001质量管理体系认证，获方圆标志认证中心颁发的证书（证书号0205Q11904R0M）。建立PDCA循环管理模式，按照计划——执行——检查——处置程序规范和改进工作，提高监督执法水平。5月，10名专业技术人员调入省食品药品监督管理局，编制减至90人。增设医政监督办公室，科室调整为12个，含办公室和人力资源、法制稽查、信息宣传、许可受理、公共卫生、职业卫生、传染病监督、医政监督、预防性卫生监督办公室及食品卫生监督一室、食品卫生监督二室。
当年，实有职工87人，其中业务人员75人，行政、工勤人员各6人，大专以上学历占86%。财政补助经费779.38万元。有计算机86台，卫生检测等专业设备61台，汽车15辆，固定资产609.46万元，流动资产105.4万元。
2003—2005年省卫生监督所人员学历、职称构成一览表
表2-1 单位：人
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┃ 年份 │总数│ 学历构成 │ 职称构成 ┃
┃ │ ├───┬───┬──┬──┬───┼──┬──┬───┬──┬──┨
┃ │ │研究生│ 大本 │大专│中专│ 其他 │正高│副高│ 中级 │初级│其他┃
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┃ 2003 │ 84 │ 6 │ 42 │ 22 │ 9 │ 5 │ 4 │ 21 │ 33 │ 12 │ 14 ┃
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┃ 2004 │ 92 │ 8 │ 48 │ 23 │ 9 │ 4 │ 8 │ 25 │ 29 │ 12 │ 18 ┃
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┃ 2005 │ 87 │ 9 │ 48 │ 18 │ 8 │ 4 │ 8 │ 21 │ 25 │ 21 │ 12 ┃
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