一、省属机构
（一）山东省医学科学院
省政府直属的集医药科研、临床医疗、疾病防治、研究生教育和医药科技支撑于一体的正厅级事业单位。1986年，省医学科学院（简称省医科院）下设省劳动卫生职业病防治研究所（简称省劳研所）、省寄研所、省皮研所、省肿瘤防治研究院和医学情报研究所、基础医学研究所、放射医学研究所、药物研究所。在职职工959人，其中高级职称31人、中级职称162人，有硕士学位学科2个。
当年，申请国家科委“七五”攻关课题“矽肺驱纤性实验研究”获立项资助。建筑面积7224平方米的科研楼启用。
1987年，建立电子显微镜研究室，独立开展分子水平研究。评聘高级职称163人，中级职称215人。
1988年，建筑面积2818平方米的图书情报楼竣工。1989年，建筑面积1225平方米的综合楼启用。
1990年，3个科研课题获国家自然科学基金资助。在动物实验室基础上成立山东省实验动物中心(含实验动物监测中心、实验动物监测站)，承担全省实验动物监督监测、人员培训、实验动物供应和科学研究。
1991年4月，直属眼科研究所成立，设在青岛市。1992年，成立临床部，后改为省医科院附属医院。
1993年1月，眼科研究所加挂省医科院眼科医院牌子。当年，评聘正高级职称37人，副高级职称63人，中级职称120人。
1995年5月，省医科院眼科研究所综合楼启用，建筑面积7100平方米。7月，省人事厅批准成立山东省医学科学院省级继续教育基地，承担全系统继续教育，并面向社会开展医药新知识、新技术和外语、微机培训。1996年，承办第二届国际暨第五届全国乳腺癌学术会议。医学情报研究所馆藏图书增至20万册，中外文杂志500余种，各类光盘、数据库20余种。
1997年4月，山东省医药生物技术研究中心成立，承担的“重组人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)研制”课题，被列入山东省十大高新技术产品研究开发工程项目。6月，建成山东省医学信息计算机网络——鲁医网和医药信息电子阅览室。
1998年，硕士学位授权学科增至9个，招收全日制硕士研究生。省动物中心建成细菌、病毒、真菌、寄生虫、病理、理化、遗传实验动物检测室。年底，省医科院累计公派出国留学、进修人员75人，其中国家公派17人，省公派19人，WHO和卫生部公派17人，单位公派13人，其他公派9人。自费出国留学进修13人。参加国际学术会议、培训、考察168人。当年，投入科研、教学、医疗和办公自动化设备资金2540万元。
1999年，药物研究所研发的中药“瓦松栓”获国家药品监督管理局三类新药证书及生产批文，并被列为1999—2001年中国医药工业投资重点项目。新研发的国家一类新药“抗乙肝八宝素及注射用八宝素”转让广东大日药业集团，合同转让金800万元，二类新药GM-CSF转让金450万元。当年，建筑面积2000平方米的实验动物中心改建工程竣工。
2000年5月，省医科院眼科研究所更名为山东省眼科研究所，硕士学位授权学科增至11个。省动物中心建成300平方米10万级净化检测室和60平方米万级净化SPF动物实验室，并通过国家实验动物质量检测中心技术审查和省质量技术监督局计量认证。2001年，山东省内分泌与代谢病研究所暨医院成立，结合临床开展科研。
2002年1月，省医科院被国务院学位委员会批准为“开展以研究生毕业同等学力申请硕士学位”授权单位，招收首批学员。4月，省医科院研究生教育中心成立。5月，由山东省政府和古巴科技与环境部共同主办、省医科院和省科技厅承办的中国——古巴生物技术应用国际论坛在济南举行。10月，医学情报研究所更名为山东省医药卫生科技信息研究所。12月，1.56万平方米的科研办公大楼竣工。
2003年，承担国家级科研课题7项。2004年，建筑面积6512平方米的综合楼竣工。当年，承担国家级科研课题16项，有10个国家59名专家到访考察、讲学或开展学术交流、合作研究。
2005年，承担国家级科研课题11项。在章丘市规划土地1000亩，筹建东部新院区，拟设山东省药物研究院、医学与生命学院、高新技术产业化基地。当年，省医科院有直属科研院所14个，均为处级事业单位。其中院部设省职业卫生与职业病防治研究院、省医药卫生科技信息研究所、省内分泌与代谢病研究所、省医药生物技术研究中心、省实验动物中心和省医科院基础医学研究所、放射医学研究所、药物研究所、研究生教育中心、附属医院。院外设省寄研所、省皮研所、省肿瘤防治院、省眼科研究所。全院职工1931人，其中专业技术人员1670人。拥有博士及硕士学位者185人，高级职称616人，含工程院院士1人、国家百千万人才工程第一及第二层次人选1人、国家有突出贡献中青年专家1人、卫生部有突出贡献中青年专家1人、山东省有突出贡献专家3人、“泰山学者”特聘专家2人、享受政府特殊津贴53人。并先后聘请30位国外专家学者和17位中国工程院院士担任名誉院长、顾问、客座教授或名誉教授。拥有硕士学位授权学科17个，与高校联合培养博士研究生学科6个。累计招收全日制硕士研究生512人、同等学力申请硕士学位人员388人。拥有省部共建国家重点实验室培育基地1个、卫生部重点实验室1个、省重点实验室5个、省医药卫生重点实验室3个、省医药卫生重点学科7个。大型、超大型仪器设备400余台（件），固定资产总值9.17亿元。
1986—2005年，累计获各类科技成果奖631项，其中国家科技进步奖6项，国家部委奖15项，省科技进步奖199项。承担医疗服务的7个单位共有病床1746张，万元以上诊疗设备780台(件)，年门诊27.75万人次，住院病人1.81万人次。
1986—2005年山东省医学科学院历任负责人一览表
表9-3
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┃ 姓名 │ 职务 │ 任职时间 ┃
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┃ 李遵友 │ 党委书记 │ 1983.10-1990.05 ┃
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┃ 张广业 │ 党委书记 │ 1990.12-1992.06 ┃
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┃ │ 党委副书记 │ 1982.01-1990.12 ┃
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┃ 耿德祥 │ 党委书记 │ 1992.06-1998.06 ┃
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┃ 邢来田 │ 党委书记 │ 1998.06-2003.04 ┃
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┃ │ 院长 │ 1997.12-2003.04 ┃
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┃ 刘海鹏 │ 党委书记 │ 2003.04- ┃
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┃ │ 副院长 │ 1997.12-2003.04 ┃
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┃ 阮景纯 │ 院长 │ 1983.10-1990.12 ┃
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┃ 于百川 │ 院长 │ 1990.12-1994.09 ┃
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┃ │ 副院长 │ 1983.10-1990.12 ┃
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┃ 陆巽生 │ 院长、党委副书记 │ 1994.09-1997.12 ┃
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┃ 韩金祥 │ 院长、党委副书记 │ 2003.04- ┃
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┃ │ 副院长 │ 2001.05-2003.04 ┃
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┃ 王学仁 │ 党委副书记 │ 1990.06-1995.08 ┃
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┃ 王秀娟 │ 党委副书记、副院长 │ 1997.12-2003.02 ┃
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┃ 李鸿雁 │ 副院长 │ 1982.04-1990.12 ┃
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┃ 王维鉴 │ 副院长 │ 1983.10-1985.07 ┃
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┃ 张青林 │ 副院长 │ 1985.07-1988.05 ┃
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┃ 刘以伟 │ 副院长 │ 1990.12-1999.08 ┃
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┃ 王美岭 │ 副院长 │ 1991.07-1998.04 ┃
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┃ 贺迎昌 │ 副院长 │ 1992.02-1996.10 ┃
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┃ 谢立信 │ 副院长 │ 1996.10-2003.04 ┃
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┃ 王本群 │ 副院长 │ 1996.11-2001.01 ┃
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┃ 刘 奇 │ 副院长 │ 1999.08-2003.10 ┃
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┃ 侯锦如 │ 副院长 │ 2001.05- ┃
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┃ │ 纪委书记 │ 1997.11-2001.04 ┃
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┃ 寻建华 │ 副院长 │ 2004.07- ┃
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┃ │ 纪委书记 │ 2001.04-2004.07 ┃
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┃ 黄 涛 │ 副院长 │ 2004.07- ┃
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┃ 孙春玲 │ 副院长 │ 2004.07- ┃
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┃ 张福萏 │ 纪委书记 │ 1991.06-1997.11 ┃
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（二）山东省职业卫生与职业病防治研究院
始称省劳动卫生研究所（简称省劳研所），建于1959年。1985年，职工92人，其中高级职称7人。业务用房1900平方米，万元以上设备4台，其中10万元以上设备2台。
1987年4月，承接卫生部“全国尘肺流行病学调查研究”项目。9月，组织专业人员现场抢救济南化学试剂总厂西分厂氯气泄漏事故中毒人员，136名中毒者均脱险。10月，增设业务科，负责全省劳动卫生和职业病防治管理与指导。
1988年，承担并负责实施卫生部、农业部“全国乡镇企业劳动卫生试点”任务，淄博市张店区被列为试点单位。1989年，增设劳动卫生监察检测室。省卫生毒理学会、省劳动卫生检验学会成立，挂靠该所。
1990年9月，依照《山东省农药毒性试验暂行管理办法》，承担农药毒性试验和技术监督职能，负责组织农药毒性试验实施和安全评价。10月，获卫生部“全国尘肺流行病学调查全优奖”。1991年，派员参与抢救菏泽氰化物泄漏事故中毒人员，使200余名中毒者转危为安。组织开展全省建材行业职业危害调查，提出预防和控制措施。
1992年1月，获卫生部、农业部“乡镇工业职业卫生服务需求与对策研究特殊贡献奖”。6月，派员参与救治滕州种衣剂拌种急性中毒人员，362名中毒者无一死亡。1993年，主持完成鲁南水泥厂竣工验收项目劳动卫生评价。会同省黄金公司开展全省12个大型金矿凿岩作业局部振动危害调查，提出防治措施。
1994年8月，先后派员组织救治泗水县、邹城市农药中毒事故，使800余名中毒者多数脱险。
1995年2月，职业病防治科改为临床部。8月，省卫生厅批准成立省劳动卫生职业病防治研究所职业病医院，设病床60张。9月，省卫生厅将济南柴油机厂等8个大企业劳动卫生监督任务划归省劳研所。12月，获省科技进步奖2项。
1996年4—5月，承办全国职业病防治培训班3期。9月，寿光实验中学发生严重食物中毒事故，数百人中毒，派员协同当地医疗机构全力救治，无死亡。
1997年，扩建的1200平方米职业病科研楼启用。获省科技进步二等奖两项。1998年，省卫生厅批准毒理研究室为省医药卫生重点学科。
1999年，劳动卫生监督检测科与中心实验室合并为职业卫生监测科。省劳动与社会保障厅批准，职业病医院为全省职业病与工伤劳动能力鉴定定点医院。
2000年2月，获“全国职业卫生先进集体”称号。12月，派专家现场组织抢救烟台合成革厂30余人中毒的光气中毒事故，无一死亡。承担国家体育总局组织的国民体质监测工作，完成济南、烟台、滨州城市人口体质监测1万余人。2001年，先后派员抢救鲁中冶金矿业公司、青岛阳光农药厂、枣庄市山亭区发生的化学品和农药中毒事故，无死亡病例。
2002年1月，通过省卫生厅职业卫生监测资质和建设项目职业卫生评价资质评估。8—12月，通过卫生部化学品毒性鉴定机构资质认证评审；通过省卫生厅健康相关产品检验机构资质认证，被批准为全省职业病诊断机构。经省司法厅批准，成立山东省职业病司法鉴定所。
2003年，经卫生部批准，获化学品毒性鉴定机构乙级资质。
2004年7月，省编委批复省劳研所与省石油化学职业病防治研究所合并，组建山东省职业卫生与职业病防治研究院（简称省职防院）。12月，省卫生厅批准省职防院保留山东省职业病医院。
2005年5—6月，举办全省职业危害检测检验培训班4期，349人受训。当年，设办公室、业务科、质控科等7个管理科室和毒理研究室、职业卫生检测科等4个业务科室，职工231人，其中高级职称59人。有硕士学位授权学科1个，招收硕士研究生6人。财政拨款887.7万元，创收1618.3万元。建筑面积3.88万平方米，固定资产3898万元，拥有原子吸收分光光度仪、气相色谱-质谱联用仪、高效液相、气相色谱仪、X线机、CT、全自动生化仪等仪器设备135台（件）。所属省职业病医院病床240张。
（三）山东省寄生虫病防治研究所
建于1960年，处级事业单位，隶属省医科院。1985年，建筑面积1.71万平方米，职工145人。设疟疾、丝虫病、检验和临床等业务科室，拥有一批寄生虫病研究设备。黑热病、丝虫病、疟疾等防治研究水平领先全国。
1986年，与世界卫生组织顾问奥蒂森联合开展丝虫单克隆抗体实验研究。1987年，程义亮、朱育光被聘为卫生部寄生虫病专家咨询委员会委员。
1989年，受卫生部委托，举办全国晚期丝虫病讲习班，10个丝虫病流行省（区）专业人员受训。完成的“山东省基本消灭疟疾研究”获省科技进步一等奖。
1990年，建筑面积3500平方米的门诊病房楼启用。完成的“山东省疟疾流行区疟疾防治研究”获国家科技进步三等奖。1991年，受卫生部与世界卫生组织委托，承办新技术在疟疾防治监测中应用讲习班。
1992年9月，山东省囊虫病治疗中心成立，挂靠该所。
1993年12月，完成的“高效灭蚊转基因蓝藻研究”获省科技进步一等奖。1995年10月，全国恶性疟疾防治研讨会在该所召开。
1996年，临床部门诊9933人，收院治疗833人。1997年，世界卫生组织淋巴丝虫病和绦囊虫病合作中心在该所成立。
1998年10月，承办全国绦、囊虫病学术交流会，13个省（市）专业技术人员与会。1999年，承担参加长江流域抗洪抢险山东籍转业退役官兵血吸虫病查治工作。
2000年，建筑面积7000平方米的综合楼启用。该所完成的“中国阻断淋巴丝虫病传播策略和技术措施研究”获美国杜邦科技创新奖，2001年获国家科技进步一等奖。
2001年10月，受卫生部委托，举办全国人体重要寄生虫病现状调查技术培训班，全国37个单位105名专业人员受训。
2002年1月，承担的“转基因工程藻及其他方法生物防治蚊虫研究”被评为2001年度山东省十大科技成果。12月，该所医学昆虫学被定为省医药卫生重点学科。
2004年1月，承担的“南水北调工程对北方地区寄生虫病影响”研究课题启动。4月，世界卫生组织淋巴丝虫病和绦囊虫病合作中心第六届任期获WHO批准，任期4年。
2005年2月，邓绪礼被聘为卫生部寄生虫病专家咨询委员会副主任委员兼丝虫病专家组组长。6月，参加卫生部《丝虫病诊断标准》起草工作。12月，在青岛市承办全国消除淋巴性丝虫病国家报告起草组会议。当年，职工123人，其中高级职称65人。设流行病学部、分子医学部、医学昆虫学部、临床部（省医科院济宁清华医院、山东囊虫病治疗中心）等12个部室，床位100张。万元以上科研、医疗设备70余台（件），固定资产值2730万元。累计承担国家、省部级科研课题33项，获省部级以上科技进步奖26项，其中国家级5项。
（四）山东省皮肤病性病防治研究所
前身为省皮肤病防治研究所，处级事业单位，隶属省医科院。1999年更名为山东省皮肤病性病预防研究所。1985年，编制86人。设皮研一室、皮研二室、病检室、政工科、办公室、总务科。1986年，增设皮研三室和业务科。
1987年1月，增加性病防治研究和技术指导职能，承担全省性病防治、科研、人员培训、技术指导任务。3月，省性病防治咨询委员会成立，设于该所，赵天恩任所长。1988年，科室调整为办公室、总务科、麻研室、皮研室、康复整形室、性病防治研究室、病检室，在济南经四纬三路开设第一门诊部，编制增至110人。
1989年2月，省性病防治办公室挂靠该所。4月，在青岛市举办全省首届性病防治师资培训班，学员57人。10月，举办性病实验室诊断学习班，26人受训。1990年，负责全省性病疫情收集、汇总、上报。
1993年，被国务院学位委员会批准为皮肤病与性病学硕士学位授予点。
1995年，制作防治性病宣传板54块、录像1部，在省科技馆和济南、临沂、潍坊、枣庄、泰安等地巡回展出。在《山东卫生报》《齐鲁晚报》连载性病防治文章18篇。在省和济南市广播电台举办性病防治知识讲座，1265万余人次接受教育。组织开展7类不同职业人群性病普查，共查20万余人。承担的“加速消灭麻风病综合防治措施和实施研究”获山东省科技进步一等奖。
1996年，建立国家级规范化性病专科门诊，省银屑病防治中心设于该所，诊治各类性病2000余例。承担的“加速消灭麻风病综合防治措施和实施研究”获国家科技进步二等奖。
1999年4月，举办激光治疗中心开业典礼暨皮肤激光临床应用学术研讨会，各市（地）、县（市、区）皮防机构和济南市各医院100余人参加。
2000年4月，投资近50万元购入EFHS-300内生场热疗系统。7月，山东省性病防治技术研究推广中心、山东省性病艾滋病研究中心设于该所。省卫生厅批准，加挂山东省皮肤病性病医院牌子。2001年，门诊9.87万人次、各类手术860例，业务收入2585万元。
2002年，建筑面积5000平方米的科研综合楼启用，设床位100张。2004年，被卫生部评为化妆品皮肤病诊断机构。
2005年，通过国家药物临床试验机构资质认定，获省卫生厅健康相关产品检验机构资质认定证书。累计承担国家、省部、厅局科研课题30项，获国家、山东省科技进步奖和医学科技创新成果奖12项，招收皮肤病性病学硕士研究生56名，毕业27名。承担的《天疱疮的实验与临床研究》获山东省科技进步二等奖。当年，业务用房1万余平方米，职工124人，其中高级职称45人，硕士研究生导师9人。设皮肤病诊疗中心、性病诊疗中心、整形外科中心、银屑病诊疗中心、临床检验中心、激光美容科、理疗科、病理室等业务科室和济南市区一、二门诊部。价值万元以上医疗设备61台（件），其中20万元以上17台，固定资产总值4900万元。门诊10.05万人次，住院756人，手术996人，业务收入2411万元。
（五）山东省肿瘤防治研究院
处级事业单位，占地面积20.33万平方米，隶属省医科院。
1986年，设肿瘤、化疗、放疗、麻醉、药剂等业务科室。
1989年3月，举办肿瘤防治临床医师学习班，为期1年。6—7月，增设党委办公室、生活服务科、基建科，撤销政工科。
1990年，增设干部保健科、职工保健科、胸外科、普外科、放射物理室、生物研究室，化疗科改为内科。省编委批准事业编制800人。1991年，增设预防科、头颈外科、劳动服务公司。
1993年，购入日本800毫安X线机、E-CT，总价值353万元。被国务院学位委员会批准为肿瘤学硕士学位授予单位。
1994年，购入日产CT彩色扫描仪，价值72万元。增设核医学科、审计科，医务科改为医务部。1995年，改感染办公室为感染科，购入美国BSD-2000型微波加温治疗机，招收硕士研究生2名。
1996年，被省卫生厅公布为三级甲等医院。山东省抗癌协会临床化疗专业委员会设于院内。成立肝胆外科、头颈外科，分别下设介入治疗室、医用激光研究室。门诊3.05万人次，住院病人3539人次。
1997年，购入美国产螺旋式PQ2000SV型CT。与深圳奥沃国际科技发展有限公司合作成立中国鲁奥质子治疗研究中心，启动全身r刀、X刀、中子后装技术、质子治疗技术研究。山东省乳腺病防治中心、山东省乳病诊断和综合治疗技术研究推广中心设于该院。
1998年7月，成立肿瘤基础研究中心，下设放射生物等14个研究室。中国癌症研究基金会无创伤治疗研究中心设于院内。9月，增设营养科、输血科。1999年，加挂山东省肿瘤医院牌子。
2000年4月，获“全国卫生系统先进集体”“山东省百佳医院”称号。11月，实施住院费用一日清单和用药双处方制度。2001年，在肥城建立省肿瘤防治研究基地。被国家药品监督管理局、卫生部批准为国家药品临床研究基地。
2002年，建筑面积9818平方米的内科病房楼启用。经省卫生厅批准，山东省肝胆胰肿瘤防治中心设于院内。增设放射六科，病床44张。购入派特和电子回旋加速器，价值3000万元。被定为全省医疗保险转诊定点医院。
2003年9月，“肿瘤精确放疗临床应用系列研究”获省科技进步一等奖。11月，乳腺肿瘤科、肿瘤放疗实验室分别被评为山东省重点学科、医药卫生重点实验室。
2005年，核医学诊断与治疗专业被定为省医科院重点学科，胸部肿瘤外科被定为省特色专科。设肿瘤外科、肿瘤内科、放射治疗科、妇瘤科、麻醉、急诊等临床科室17个；医学影像、核医学、病理学、检验、药剂等医技科室20个；放射生物、放射物理、肿瘤药物、肿瘤流行病等基础研究室14个。开放床位834张，简易病床300张，固定资产4.1亿元，价值万元以上医疗设备581台（件）。职工898人，专业技术人员810人，其中高级职称399人。拥有省级拔尖人才和享受政府特殊津贴6人，研究生导师30人。累计招收硕士研究生113人，毕业64人，培养及授予硕士研究生同等学力8人。门诊3.22万人次，住院病人1.18万人次。
（六）山东省医药卫生科技信息研究所
建于1981年，始称山东省医学情报研究所，处级事业单位，隶属于省医科院，2002年，更名为山东省医药科技信息研究所。
1986年12月，山东省医学情报图书协作网和《中国卫生信息报》山东记者站成立，分别为网长单位和站长单位。
1987年，成立检索室，在全省率先开展医学科技检索查新工作。摄制的录像片《荣成县妇幼保健程序化管理》获卫生部科普优秀作品奖。获省科技情报成果二等奖1项、三等奖3项。
1988年，引进世界最大生物医学文献数据库Medline检索只读光盘数据库。获省医学科技进步二等奖1项。1989年，获省科技情报成果一等奖1项。
1990年，获华东地区电视节目一等奖1项、医学科技录像译制片优秀奖3项。新建医学情报楼启用。1991年，省卫生厅确定该所为全省卫生系统科研立项、成果鉴定和成果申报查新咨询定点单位。
1992年，山东省医学情报工作管理委员会成立，隶属省卫生厅，挂靠省医学情报研究所。省医学情报图书协作网更名为省医学情报图书协会，为会长单位。1993年，山东英华外语培训学院设于所内。
1994年7月，承担省卫生厅委托的全省医药卫生科技成果通讯鉴定工作。
1996年12月，被省科委批准为省级科技查新咨询单位。1997年，医学信息计算机网络系统和电子阅览室建成启用，对计算机终端用户和来所阅读者提供医学信息服务。2000年4月，承建的省医药卫生信息网和省医科院局域网启用，负责网络管理。12月，通过卫生部专家组“医药卫生科技项目查新咨询定点”验收。2001年，省医学会医学信息专业委员会挂靠该所。
2002年4月，被省人事厅批准为全省专业技术人员计算机应用能力考核培训点。2003年4月，刘亚民任所长。
2005年，设期刊出版、查新咨询、信息网络等9个科室和一个培训中心。职工50人，其中高级职称25人。固定资产值660万元。拥有医药卫生数据库20个、微机100台和多媒体投影仪、非线性编辑系统。
（七）山东省医科院基础医学研究所
始称省医科院基础部，1983年12月更名为山东省医科院基础医学研究所。处级事业单位，编制117人。
1987年5月，细胞学研究室划归省医科院药物研究所。被省科委、省经委、省体改委确定为全省“放活科研机构、放活科研人员”试点单位。
1989年5月，省编委批复同意山东肿瘤生物治疗研究中心设于该所。编制增至130人。
1990年1月，3个课题获国家自然科学基金资助。4月，经省科委批准，开展科学事业费与科研任务挂钩管理试点。
1991年1月，“人参皂甙促IL-6mRNA翻译的生物学效应”“脑纳素基因合成研究”获国家自然科学基金资助。5月，承办全国第二届肿瘤生物治疗学术会议。当年，山东免疫学会挂靠该所。
1992年，“血管生长抑制剂治疗肿瘤作用机理研究”获国家自然科学基金资助。“IL-2/LAK/TIL抗癌系统建立、大规模制备及临床应用研究”列入省“八五”攻关项目。编制减至110人。1993年，山东省临床免疫研究中心设于该所。
1994年6月，省科委公布1993年度省属科研机构动态管理类别，被评为一类科研所。当年，被省编委、省财政厅认定为全额预算管理单位，获国家自然科学基金资助项目2项，增设门诊部。
1995年，“人类IL-13的基因克隆重组表达与免疫学功能”研究课题获国家自然科学基金资助。
1996年，获山东省首届优秀中青年科学家奖励基金1项。
1997年4月，编制减至100人。承担省重点攻关课题“造血干细胞体外扩增相关6种细胞因子的克隆表达及CD34+干细胞大规模扩增体系的建立”。7月，组建山东省肿瘤免疫与基因工程重点实验室。当年，免疫学被批准为省医药卫生重点学科。“基因工程人血小板生成素研制”被定为省重点科技攻关项目。
1998年，被国家教委、卫生部批准为病原生物学和流行病、卫生统计学博士培养点。“芋螺素/白介素6融合免疫毒素研制与应用”被列入国家863生物技术海洋领域青年基金资助项目。“基因工程SCF的研制”被定为省重点攻关课题。1999年，与山东东阿阿胶股份有限公司联合组建山东阿华生物技术研究所。省肿瘤免疫与医学基因工程实验室被定为省级重点实验室。
2000年12月，免疫学专业被批准为博士培养学科。2002年，省医科院心脑血管病防治研究中心设于所内。
2004年10月，整合免疫学、血液肿瘤学、中西医结合研究室资源，充实医药卫生肿瘤免疫学与中药免疫学实验室，整合后研究人员18人，其中博士学位2人，硕士学位4人。
2005年，与省职业病防治研究院签订科学研究、医疗、疾病防治、研究生教育合作协议。经省司法厅批准，内设山东省医科院司法鉴定所。“拟菌颗粒佐剂制备方法及应用”项目获发明专利。承担科研课题29项，其中国家自然科学基金课题5项，省自然科学基金课题7项，省科技厅攻关课题4项。
当年，设省医学遗传学与基因工程重点实验室、省肿瘤免疫学与中药免疫学重点实验室、省医科院心脑血管病防治研究中心、实验病理学与生理学研究室、微生物学研究室、科技咨询服务中心、卫生检测中心和办公室等10个科室。科研设备698台（件），其中价值10万元以上24台（件），固定资产值1077万元。职工84人，其中高级职称43人、中级职称16人。有博士研究生导师2名，硕士研究生导师17名。1986—2005年累计承担科研课题258项，获科技奖励153项，其中省部级以上科技进步奖67项。培养硕士研究生123人，与山东大学联合培养博士生12人。
（八）山东省医科院放射医学研究所
建于1959年。设办公室、辐射防护室、辐射监测室、辐射效应室、核医学室、《中国辐射卫生》杂志编辑部和开发服务部。
1986年4月，苏联切尔诺贝利核电站发生爆炸，造成全球性放射性污染，遵卫生部指示，对济南地区污染进行近两月监测，结果报卫生部。
1987年10月，参加核试验场外监测，17人获卫生部、国防科工委“核试验场外监测人员”证书。12月，卫生部射线防护器材防护质量监测中心设于该所内，负责全国射线防护器材生产企业产品防护质量监测与管理。1993年11月，卫生部决定射线防护器材防护质量监测中心移至北京，相应监测任务移交卫生部工业卫生实验所。
1988年，成立齐鲁射线防护科学技术开发公司，后更名为放射医学研究所开发服务部。同年，举办全国油（气）田测井密封型放射源放射卫生防护标准培训班，石油工业总公司、海洋石油总公司30名专业人员受训。
1991年9月，受卫生部委托，在泰安市举办全国射线防护器材展销会，300余人参加，40余家生产企业展示防护器材产品，卫生部卫生监督司、工业卫生实验所代表和辐射防护专家组成评审团，评审展出产品。
1994年，增设门诊部。1996年，获卫生部“放射防护评价资格证书”。1998年7月，放射医学学科被国务院学位委员会批准为硕士学位授予学科。
2002年4月，承担研制的国家职业卫生标准——《油（气）田测井用密封放射源卫生防护标准》由卫生部颁布，6月1日起实施。嗣后，参与制定国家和卫生部放射卫生标准、法规12项。
2003年7月，获省质量技术监督局“计量认证合格证”。2004年8月，在威海市承办中华预防医学会放射卫生专业全国学术会议，与会代表162人。
2005年4月，被卫生部、国家发展改革委员会定为二类A核辐射医疗救治基地。
2005年，有职工35人，其中高级职称22人，博士2人、硕士8人，硕士研究生导师8人。固定资产值347万元，仪器设备20余台（件），其中价值10万元以上9台（件）。1986—2005年，累计获科研成果奖17项，其中省部级科技进步奖10项；获国家专利3项，培养硕士研究生19名。
（九）山东省医学影像学研究所
建于1975年，始称山东省放射医学研究所，1984年更名为山东省医学影像学研究所。承担省立医院放射诊断和全省医学影像学会诊、保健干部会诊、教学科研等职能，隶属于省卫生厅。1986年，内设山东省医学影像设备技术服务站，与日本岛津株式会社合作成立岛津山东影像设备维修中心，为山东卫生系统首家中外合作企业。1987年7月，山东省医学影像学研究会成立。
1991年2月，成立山东——日本阿洛卡超声波诊断维修服务中心。11月，增设磁共振诊断研究室，引进国内首台1.5T超导磁共振。1994年，购入美国128/aP10c彩色B超1台、德国X线机4台及新型自动冲片机2台、芬兰乳腺专用X线机1台。1995年10月，在泰安承办全国第二届、山东省第六届医学影像学学术研讨会，200余人出席。12月，购入以色列产CT-twin1台，价值123万美元。1996年，购入荷兰产遥控胃肠诊断X线机、美国产骨密度仪、国产透视图像教学处理激光打印系统各1台。
1997年4月，4个专业被卫生部定为全国医学影像学继续教育基地。当年，启用省内首台计算机X线摄影(CR)。1998年，承办中欧磁共振学术会议。
2000年，承办亚洲及大洋洲放射学会专业学术交流会。山东省医学影像质量控制中心设于该所。2001年，受卫生部委托，负责起草全国临床医师专业职称晋升影像医学考试大纲、考试指南，承办首次全国卫生专业职称考试命题工作会议。
2002年5月，承办第七届全国神经影像学会会议，美国、德国、韩国及国内代表208人与会。6月，购入的东软公司CT3000启用。当年，牵头完成国家放射专业中级职称考试题库。
2004年5月，与《中华放射学杂志》编委会在济南联合主办全国首届医学影像山东论坛。10月，山东大学医学影像学教学基地设于该所。
2005年4月，举行第二届医学影像山东论坛暨建所30周年庆典，卫生部和山东省领导，国内外专家，31个省（区、市）代表800余人出席。当年，业务用房面积9200平方米，价值100万元以上大型诊疗设备44台（件），其中千万元以上10台（件），固定资产值近3亿元。职工235人，其中高级职称86人，博士生导师3人、硕士生导师30人，享受政府特殊津贴4人，省级拔尖人才1人。神经影像学、医学影像学为省医药卫生重点学科，神经放射学专业为“泰山学者岗位”。全国实用介入技术推广培训中心、省医学影像研究学会设于该所。1986—2005年，累计承担“国家科技支撑计划”“国家自然科学基金”等科研课题26项。获科技成果奖45项，其中国家级二等奖1项、三等奖2项，省级35项。培养硕士研究生60名、博士研究生9名。
（十）山东省医科院药物研究所
建于1983年12月，为综合性新药研发单位。设办公室、天然药化研究室、合成药物研究室、药理研究室、制剂研究室、抗衰老研究中心、省医科院中心实验室，科研办公楼面积2800平方米。
1991年4月，研制的抗癌新药卡铂及注射用卡铂获卫生部新药证书及生产批文，转让德州制药厂生产。
1992年7月，美国天然药物公司董事长李豫伟到访，双方签订“合作研究叶下珠抗病毒药品协议书”。12月，研制的“济南假单胞菌注射液”获卫生部新药证书及生产批文，转让齐鲁制药厂投产。
1993年，研制的“葛根素注射液”“银杏叶口服液”获卫生部新药证书及生产批文，分别转让烟台人民制药厂、临沂中药厂投产。1994年，被省科委评为一类科研院所。
1997年，编制60人。省科委批准，山东省天然药物研究重点实验室设于该所。省编委批复同意加挂山东省抗衰老研究中心牌子。天然药物化学专业被批准为省医药卫生重点学科。
1998年3月，南斯拉夫联盟科技代表团到访考察，双方签订“在南斯拉夫建立中国传统医药研究中心”合作意向书。10月9—13日，承办第六届全国肿瘤药理及化疗学术会议。1999年，研制的“瓦松栓”获新药证书及生产批文。
2000年6月，“一种抗病毒化合物八宝素制法”获国家发明专利。11月，化学药四类新药“葛根素葡萄糖注射液”获新药证书和生产批文。当年，药物化学专业被批准为硕士学位授权点。
2001年6月，“愈风宁心颗粒”获新药证书和生产批文。9月，与广东省大日生物化学药业公司签订“八宝素及注射用八宝素技术”转让合同，转让费800万元。
2002年4月，省医科院中心实验室整建制划入该所。12月，在省政府举办的2002年中国山东海外人才交流暨经贸技术合作洽谈会上，与美国阿斯顿大学药学院博士王永峰签订合作研究协议书。当年，“麦特好多糖抗血栓活性及其制剂研究与开发”被列为省科技厅重点项目。
2003年6月，“八宝素在制备抗病毒新药中的应用”获国家发明专利。7月，加挂山东省新技术制药研究所牌子。“八宝素及其制剂研究和开发”获国家863项目资助。
2004年12月，承办全国时间生物医学学术会议，国内外专家100余人与会。法国居里大学教授、副校长杜依杜到访，双方签订合作意向书。“人参根及茎叶代谢图谱分析研究”获国家自然科学基金项目资助。是年，“板栗花黄酮化合物及其提取方法”获国家发明专利，“银杏叶颗粒”获国家食品药品监督管理局新药证书和生产批文。
2005年3月，美国明尼苏达大学教授、美国时间生物医学及时间治疗学会主席Erhard Haus MD.PhD教授到访并洽谈合作项目，达成老年性疾病时间治疗与预防科研合作意向。7月，抗肿瘤新药“奈达铂”和“注射用奈达铂”获新药证书。11月，863项目“抗乙肝一类新药八宝素及其制剂研究与开发”通过验收。“霞草抗肿瘤活性成分研究”获国家自然科学基金项目资助。“一类新药异丙景糖苷治疗乙型肝炎的开发研究”被列为省重大招标项目。天然药物化学专业被评为院级重点学科，药理专业被定为硕士学位授权点。当年，有职工58人，其中专业技术人员57人，有高级职称33人，中级职称19人。留学回国8人，享受政府特殊津贴5人，国家新药评审专家库专家1人，省新药审评专家7人。大型试验仪器40余台（件），固定资产值1000余万元。
（十一）山东省眼科研究所
建于1991年，始称山东省医科院眼科研究所，挂靠青岛市第二人民医院。1993年1月，加挂省医科院眼科医院牌子。12月，被国务院学位委员会批准为眼科学硕士学位授权单位。1994年1月，解除与青岛市第二人民医院挂靠关系。2000年7月，更名为山东省眼科研究所。
1995年12月，与北京医科大学第二临床学院签订“联合培养眼科学博士研究生协议书”。1996年，门诊3.54万人次，住院病人2179人次。
1997年，所属烟台白内障治疗中心开业。1998年，在专业组基础上成立白内障、角膜病、眼底病、视光学4个专业科室。
1999年，改革内部分配制度，实行绩效工资制，竞争选聘护士长。9月，主办青岛国际眼表疾病研讨会，40余位国内外眼科专家出席。当年，获省科技进步二等奖1项。
2000年3月，承办2000年青岛国际眼科学术研讨会，国内外近百位眼科专家出席。当年，门诊5.32万人次，住院病人2911人次。
2001年，主办青岛国际眼科学术研讨会。12月，谢立信当选中国工程院院士。
2003年9月，在济南开设临时服务场所。
2004年2月，实行“病房门诊一条龙”运行模式，临床医师如无手术均到门诊接诊。10月，研制的“CTAH-眼用制剂”“长效肝素眼内缓释系统”获发明专利。
2005年6月，与中国科学院化学研究所共同研制的“长效环孢素眼内释药体系”获发明专利。11月，省医科院与青岛大学联办的青岛大学眼科学院成立。当年，建筑面积3.5万平方米，固定资产值3.5亿元，拥有山东省眼科学重点实验室、青岛大学眼科学院、青岛眼科医院、山东省眼科医院（济南）和眼科验光配镜中心，设角膜病、白内障、眼底病等12个临床科室和8个管理部门，职工300人，其中高级职称9人。门诊9万余人次，住院病人4万余人次。
（十二）山东省医药生物技术研究中心
建于1994年，始称山东省医科院生物技术中心，实验室面积1700平方米。当年，该中心达到生物中试标准。开展PCR技术检测肝炎、结核等基因诊断项目。获省自然科学基金课题和省科委课题各1项。
1995年9月，开展省科委科研课题3项、自然科学基金课题1项，获研究经费72万元。10月，经省科委批准，增设山东省PCR技术研究开发推广中心、医药生物工程技术研究中心。12月，与加拿大YES生物技术有限公司合作开展抗体试剂类研究。当年，职工10人，获省科技进步二等奖1项。
1996年，获“基因工程重组人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子（hGM-CSF）中试”研究经费100万元。承担国家“95攻关计划课题”1项，研究经费20万元。
1997年，更名为山东省医药生物技术研究中心，编制25人。3月，与山东滨州华城公司、香港宏润公司合资成立滨州华宏生物工程公司，合作开发生产hGM-CSF。8月，hGM-CSF被列为省十大高新技术产品研究开发工程项目之一。9月，省科委、省财政厅批准，生物技术科研中试基地为第一批省级科研中试基地。1998年，“慢性粒细胞白血病反义基因治疗药物合成及实验研究”获省卫生科技进步一等奖。被批准为微生物与生化药学专业硕士研究生培养点、山东省医学分子生物学重点实验室，获科研经费74万元。
1999年3月，省医科院电子显微镜室并入。11月，hGM-CSF获国家药品监督管理局国家二类新药证书。
2000年7月，承担的“新型基因芯片研制”被列入2000年省重大科技攻关项目。10—11月，研制的“新型生物芯片”“新型艾滋病、丙肝联检试剂盒”获国家发明专利。12月，与山东大学联合培养生物化学与分子生物学专业博士研究生。
2001年1月，承担省科技重大项目2项、省部门课题3项。12月，与以色列希伯来大学医学院合作研究的“白血病患者药敏试验方法的建立及制备”入选山东省年度十佳国际合作项目。
2002年1月，承担国家863项目和基金项目各1项、省科技攻关项目和自然科学基金项目各1项、省部门级课题2项。2月，卫生部生物技术药物重点实验室设于该中心。8月，“新型艾滋病、丙肝联检试剂盒”技术转让深圳华美公司，获20%股份作为实验开发经费。12月，医学病毒实验室被批准为山东省重点实验室。
2003年4月，承担的“重组人成骨蛋白1（OP-1）中试及临床前研究”被列入国家863计划博士基金。6月，研制出检测SARS病毒试剂盒，送省疾控中心试用。当年，“人类免疫缺陷病毒抗体、丙肝病毒抗体联检试剂”获国家一类新药证书。承担省科技攻关项目、自然科学基金项目、省部门级项目各1项。
2004年1月，承担省科技攻关项目和自然科学基金项目各1项、省部门级课题4项。9月，承担国家自然科学基金项目2项，研究经费23万元。当年，获省科技进步二等奖1项，三等奖1项。
2005年1月，承担的“系列生物芯片的研制”项目获省科技进步一等奖。承担国家自然科学基金项目2项、省部门级课题6项。5月，开展的“胰腺癌蛋白质组学研究与开发”项目在省重大专项课题招标中中标。当年，设有基因工程实验室、分子生物学实验室、基因诊断实验室、免疫诊断实验室、电子显微镜室及山东华翔生化工程开发中心。卫生部生物技术药物重点实验室、山东省病毒学研究所和病毒学重点实验室挂靠该中心。职工27人，其中高级职称9人，博士研究生导师1人，固定资产1100万元。1998—2005年，累计完成科研课题28项。
（十三）山东省实验动物中心
1990年2月，省编委批复同意，在省医科院实验动物室基础上成立山东省实验动物中心，为科级事业单位，编制25人。设行政、业务、监测、科技开发办公室等科室，隶属省医科院。
1992年5月，省政府27号令颁布《山东省实施<实验动物管理条例>办法》，规定该中心承担全省实验动物工作日常管理和监督检测。
1993年5月，主持拟定的山东省《实验动物暂行标准》《“八五”期间实验动物工作发展规划》由省科委颁布实施。6月，启动全省实验动物检测及发证工作。
1994年10月，增设理化、真菌、遗传检测室。
1996年10月，在泰安市承办华东地区第四届实验动物科学学术交流会，邀请美国、日本和中国台湾的7名专家及国内知名专家作学术报告。
1998年2月，升格为处级事业单位，编制增至30人，配主任1人、副主任2人。省编委批复同意加挂省实验动物监测中心牌子。9月，省民政厅批复同意，牵头成立山东省实验动物学会。1999年5月，在济南召开山东省实验动物学会成立大会。
2000年9月，10万级交货级别检测实验室和万级交货级别动物实验室启用。11月，通过国家实验动物质量检测中心技术审查。
2002年12月，起草的山东省《实验动物生产许可证验收标准》《实验动物使用许可证验收标准》《实验动物饲料生产许可证验收标准》由省科技厅印发实施。组织培训实验动物专业及管理人员270人次，发放上岗证260人份。
2003年3月，召开全省贯彻实施实验动物许可证管理办法会议，各行业近200人参加。12月，获消毒产品、卫生用品检验资质。
2005年，实验、办公综合楼面积1800平方米，固定资产227万元。价值万元以上仪器设备37台（件）。职工29人，其中高级职称11人，有博士2人，硕士5人。先后承担或协作完成国家级、省级、厅局级研究课题16项，获科技成果奖12项。
（十四）山东省内分泌与代谢病研究所（医院）
2001年5月成立。始与省医科院附院为一个机构。研究所设糖尿病及并发症、甲状腺、骨质疏松和钙磷代谢、肥胖与脂代谢4个研究室和1个“专管共用”的中心实验室。医院设临床部、门诊部、护理部、科教部、药械部、特检部、检验部、财务部、营养科和综合办公室。
2002年11月，从省医科院附院独立出来。在编职工8人，聘用职工23人，床位30张，拥有全身双能量骨密度测量仪、电化学发光分析仪等价值万元以上设备15台（件）。当年，获准立项科研课题5项。
2005年，增设医保医政办公室、病案室。开展胰岛素泵强化治疗、静脉微量泵应用等新技术。内分泌糖尿病专科被评为省医科院特色专科。当年，在编职工9人，聘用34人。有高级职称9人，博士生导师1人、硕士生导师3人。床位50张，固定资产值668万元。价值万元以上设备39台（件），其中30万元以上8台（件）。累计招收硕士研究生24人、博士研究生3人。承担省级和省医科院科研课题7项，完成3项。门诊5216人次，住院病人614人次，医疗收入804万元。
（十五）山东省耳鼻咽喉科学研究所
1976年3月成立，隶属于山东医科大学。1985年，有职工35人，兼职人员占50%。设病床、人工喉工艺实验车间、食管发音语音康复研究室，在上海、沈阳、广州设有语音康复中心。
1990年，语音康复系列成果参加全国医药卫生科技成果展览会，获6项证书，作为中国科技成果，被遴选参加联邦德国第22届国际诊断治疗技术展览会。
1992—2000年，改进中国人工喉型号，完善发音训练方法，含食管发音讲话训练法、喉——气管狭窄自调扩张、胃代食管发音法。研制出新型电子人工喉、电子助讲器语音康复工具。
2005年，设诊疗室、病房和测听室、病理室、解剖室、资料室、照相室、人工喉训练室、食管发音讲话训练室、生产工艺车间、发音膜研制生产室，病床35张。
（十六）山东省医科院附属医院
处级事业单位。1985年，为省肿瘤医院市区门诊部，承担肿瘤疾病防治任务，并作为省医科院对外窗口，开展医疗服务。设临时病床10张。
1988年，拓展临床教学、科研和社会查体业务。山东省心理卫生协会、山东省疼痛研究会癌痛专业委员会挂靠该院。
1992年，经省编委批准，改为省医科院临床部（后更名为科苑医院），编制40人。开展儿科、内科、外科、肿瘤科、妇科等医疗服务，病床增至30张。
1995年，与山东医科大学附院签订临床合作协议，收治神经内科、普外科、骨外科、肿瘤科病人，病床增至90张。
2000年6月，更名为山东省医科院附属医院。2001年4月，加挂山东省内分泌代谢病医院牌子，收治糖尿病、中医正骨、肿瘤、心血管病患者，对外开展健康查体服务。2002年，省医科院附院、省内分泌与代谢病研究所、省内分泌代谢病医院分设，各自成为独立核算单位。
2004年，被评定为“三级乙等医院”。
2005年，有固定资产值1200万余元。设办公室、医务部和内科、骨外科、肿瘤科、妇科、介入科、疼痛科、正骨科、影像、特检、药剂等临床医技科室。职工48人，其中高级职称24人、中级职称15人，硕士7人。有美国C型臂X线机、高频50kw遥控X线机等先进设备50余台（件）。内科学为硕士研究生授权学科，培养硕士生5人。先后获省部级科技进步三等奖2项、自然科学进步奖1项、医药卫生科技进步奖2项。门诊6000余人次，住院病人425人次，健康查体7000余人次。
（十七）山东省医科院研究生教育中心
前身为省医科院业务处研究生办公室，位于省医科院院内。
1986年，国务院学位委员会批准研究生办公室为硕士学位授权单位，负责省医科院硕士研究生招生、录取、教学管理、学位授予、学位学科建设和导师遴选工作。
1997年，有硕士学位授权学科8个，均为二级学科，累计招收研究生150人。
2002年4月，省编委批准在研究生办公室基础上成立山东省医科院研究生教育中心，为处级事业单位。职工7人，其中高级职称4人，中级职称1人。教学区有多媒体教室3间，语音室1间，微机室1间，多媒体教学设备4套，微机47台，58座语音教学设备1套。当年，省医科院被国务院学位委员会批准为“开展以研究生毕业同等学力申请硕士学位”授权单位。
2005年，管理范围内有硕士生导师113人，博士生导师7人。在读研究生614人，其中全日制236人，同等学力申请硕士学位人员378人。设一级学科1个（基础医学），二级学科20个。硕士学位授权点17个，含免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、放射医学、眼科学、内科学、皮肤病与性病学、肿瘤学、劳动卫生与环境卫生学、微生物与生化药学、药物化学、中西医结合基础、流行病与卫生统计学、影像医学与核医学、外科学、药理学、情报学。有6个学科与高校联合培养博士研究生，含生物化学与分子生物学、免疫学、流行病与卫生统计学、眼科学、肿瘤学、内科学。
（十八）山东省中医药研究所
1958年成立，编制110人，隶属于省卫生厅。1979年，划归山东中医学院代管。1986年，编制扩至140人。因缺少自主运营的临床基地，发展受到一定限制。1990年，重归省卫生厅管理。1995年起，陆续增设业务科室。1998年，设中药化学研究室、中药炮制研究室、中药资源开发研究室、中药制剂研究一室、中药制剂研究二室、中药制剂研究三室、中药药理研究室、中药药理研究一室、中药药理研究二室、中心实验室、中试研究室、病理研究室、药物载体工程重点实验室、制剂车间、临床部、情报资料研究室。先后牵头完成男用节育药棉酚研究，承担青蒿素及次甲基青蒿素提取方法研究，主持完成麝香酮合成及人工麝香研究等重大科研项目。2002年，与省针灸科学研究所合并成立山东省中医药研究院。
（十九）山东省针灸科学研究所
1989年1月，经科技部批准建立，省编委核定编制40人。初期，借驻省中医药研究所两层楼约600平方米办公，借用山东医科大学针灸教研室进行科研活动。1992年12月，迁至济南市经十东路217号，占地16亩。为便于科研，在针灸科学研究所门诊部基础上，设山东省针灸医院，与针灸科学研究所一个实体、两个牌子，编制床位100张，人员增至60人。1996年，设临床部、内科、妇科、外科、药房、护理部、中心实验室，开展针灸治疗常见病、多发病、疑难病临床研究和针灸治病原理基础研究，获多项研究成果。2002年，并入山东省中医药研究院。
（二十）山东省中医药研究院
2002年6月，省编委批准，省中医药研究所、省针灸科学研究所合并成立山东省中医药研究院，为处级事业单位，编制170人，隶属省卫生厅。
2003年1月，成立研究院首届学术委员会。5月，承办第二届中医药抗病毒技术国际培训班。10月，附属医院成立，设于山东电力中心医院，所属山东省针灸医院开诊。12月，获“全省中医工作先进集体”称号。
2004年5月，成立查体中心。9月，重点实验室通过评审验收。
2005年，设中药制剂、中药炮制、中药药理、中药化学等12个专业科室和7个职能科室，10万元以上大型设备10台（件），其中30万元以上6台（件）。有省医药卫生重点学科2个、国家中医药科研三级实验室2个、省医药卫生重点实验室2个。为省中药研发中试基地、省药物载体工程重点实验室。职工142人，其中高级职称56人。有厅级拔尖人才2人，国家新药审评委员2人，享受政府特殊津贴10人。先后获国家科技进步三等奖1项，部委科研成果奖9项，省科技进步奖32项。
二、市（地）医学科研机构
20世纪80年代初，全省13市（地）均设有独立医学科研机构。此后，因人员、经费和设备不适应科研需要等原因，多数被撤销或合并。1985年，尚存济南市、淄博市医学科学研究所和烟台医学科技情报研究所，每处15～25人。1986年10月，青岛老年病研究所成立，专事老年人心脑血管、内分泌、呼吸、多器官衰竭等疾病救治研究和中西医结合防治老年病研究。1987年，青岛市临床医学研究所成立，隶属青岛市卫生局，挂靠市立医院，设生化、遗传、药学基础实验室和血液病、放射医学影像临床研究室。
1988年，青岛市中医研究所成立，挂靠市中医院。
1990年11月，淄博市医学科学研究所迁入山东侨联医院，院所合署。承担常见病、多发病防治研究，承办《淄博医药》杂志，兼理医学信息。
1992年，烟台市医学科技情报研究所更名为烟台市医学科学技术研究所，职能由医学科研和医疗服务转为管理全市医学科研工作。
1995年，枣庄市中医药研究所成立，挂靠市中医院。
2003年1月，济南市脊柱外科研究所成立，职工18人，其中高级职称5人，被评为省重点特色专业、济南市医学重点专业。累计培养硕士研究生14人、博士研究生2人。承担各级科研课题11项，获科技成果奖8项。
2005年，全省共有市级医学科研机构8所。其中，淄博市医学科学研究所有职工15人；青岛老年病研究所，职工21人，有高级职称16人，为市医药卫生重点学科，共培养硕士研究生10人、博士研究生2人，获科技成果奖26项；青岛市临床医学研究所，职工41人，其中高级职称9人，培养硕士研究生21人、博士研究生5人，获科技成果奖11项；济南市医学科学研究所更名为济南市卫生科技交流服务中心，职工48人，高级职称13人，先后获科技成果奖16项；烟台市医学科学技术研究所，职工27人，高级职称14人，先后获科技成果奖8项。
三、附属科研机构
附属医学科研机构指附设在医学院校、医院和企业的科研所（室），为山东医药科研体系的重要组成部分。
1986年，全省附属医学科研机构20余处，多为医学院校的研究室，每处5～10人，多者15人以上，结合临床、教学开展科研活动。当年，文登骨伤研究所成立，隶属于山东省文登整骨医院，设组织工程、细胞、药物、显微外科、生物力学、微循环实验室。
1987年，山东医科大学附院低温医学研究室成立，科研人员6人，内设3个工作单位，配有程控降温仪、液氮储存系统、零下135度冰箱、基因扩增仪等设备。
1990年，泰山医学院脑微循环实验室、骨科研究所成立。
1991年，青岛医学院心血管病研究所成立，科研人员52人，其中高级职称8人。设心血管基础研究部、临床部，病床64张。潍坊医学院免疫学研究室被评为山东省高校重点实验室。当年起，山东中医药大学先后设天然药物实验室、中医基础理论研究室、针灸基础研究室、中药质量分析实验室、细胞生物学实验室、医药经典理论实验室，并在附院设中药药剂实验室，多被国家有关部门、省确定为重点实验室或重点学科。
1993年，青岛大学医学院脑血管病研究所成立，专事脑血管病、癫痫病防治研究，设神经生理学、神经病理学、神经免疫学、分子神经生物学研究室。潍坊医学院天然药物研究所成立，从事心血管、神经内分泌和抗炎免疫药理研究。
1994年，潍坊医学院眼科研究所、整形外科研究所成立。免疫学研究室改称分子免疫学研究所，被批准为免疫学硕士学位授权学科。潍坊市肿瘤病防治研究中心、肝病防治研究中心成立，均设于市人民医院。泰山医学院皮肤病性病研究所成立，科研人员16人，病床15张，设皮肤病治疗室、性病治疗室、物理治疗室及美容门诊。济南市大肠肛门病研究所成立，挂靠济南市槐荫区人民医院，建筑面积320平方米，设流行病学、临床医学、药物和信息资料研究室。
1996年，山东省立医院中心实验室成立，开展细胞免疫学、生殖遗传学、疾病基因组学、分子内分泌学、内分泌药理学研究，科研人员15人，其中高级职称8人。潍坊市医学生物遗传工程研究所成立，设于市人民医院，科研人员7人，其中高级职称3人。诸城市中医肝病研究所、骨伤研究所成立，各有科研人员10人，均挂靠市中医院。
1997年，青岛大学医学院儿科研究所、临床药理研究所成立，前者有高级职称19人；后者有科研人员30人，其中教授8人。
1998年，青岛大学医学院医学营养研究所成立，专事基础营养、应用营养和营养资源研究，教学、科研人员25人。泰山医学院骨科研究所被批准为硕士学位授权学科，病床64张，教学、科研人员24人。山东省创伤骨科研究所成立，设于青岛大学医学院附院。青岛市立医院国家药物临床试验机构（基地）成立，科研人员70人，其中高级职称24人。临沂医学专科学校附属眼科医院暨眼科研究所成立，设白内障、青光眼、眼底病、角膜病专业学组及化验室、眼库等配套科室10个，病床120张，职工100人，其中高级职称12人。济南铁路局眼科研究所成立，科研人员36人，其中高级职称14人。设中心实验室和白内障与青光眼、屈光与角膜病、玻璃体与视网膜病、小儿眼病与斜视弱视、信息5个研究室，为铁道部重点学科。先后承担研究课题19项，获省部级科研成果奖7项。
2000年，山东省神经科学研究中心成立，挂靠青岛大学医学院，有科研人员19人，其中高级职称13人。潍坊市内分泌研究所成立，设于市人民医院，科研人员10人，其中高级职称6人，先后获省级科技成果奖2项，市级科技成果奖13项，培养硕士研究生20人。
2001年，泰山医学院基础医学研究所成立，设脑微循环、分子生物学、细胞及信号转导、神经超微结构、放射免疫、神经生理、分析化学7个实验室，科研人员8人，其中高级职称2人。
当年，泰山医学院脑微循环实验室被批准为山东省强化重点建设实验室，参与国家级课题2项，承担省部级课题10项，获解放军科技进步三等奖1项、省科技进步奖和自然科学三等奖6项。山东省创伤骨科研究所被批准为省医药卫生重点实验室，先后承担研究课题40项，获各种成果奖30项。
2002年，教育部和卫生部心血管重构与功能研究重点实验室成立，设在山东大学齐鲁医院，有科研人员51人，其中中国工程院院士1人，泰山学者1人，高级职称23人；设分子生物学、心电生理、介入性诊断与治疗、细胞移植等二级实验室15个；获国家科技进步二等奖1项，省部级及省部门成果奖25项。山东大学齐鲁医院临床基础医学研究所成立，设基因组学、基因工程技术、临床蛋白质组学、生物信息与数据分析等研究室11个，科研人员13人；承担国家自然科学基金课题10项，获各类科技成果奖7项。山东大学泌尿外科研究所成立，科研人员44人，其中高级职称11人，培养硕士研究生8人、博士研究生11人，获各类成果奖8项。青岛市医药生物技术重点实验室成立，挂靠青岛大学医学院，有高级职称18人；为省分子病毒学重点实验室，拥有硕士学位授权学科4个、博士学位授权学科2个。
2003年，潍坊市心血管病介入诊疗研究所成立，设在益都中心医院，科研人员20人。潍坊市安康心理卫生研究所成立，挂靠市精神卫生中心，科研人员50人。泰山医学院流行病学研究所成立，专职科研人员14人。泰山医学院运动医学研究所成立，专事运动创伤、运动康复和运动营养研究，专兼职科研人员31人。两者均被批准为硕士学位授予学科。文登骨伤研究所组织工程实验室被国家中医药管理局定为中医药科研三级实验室。青岛市立医院国家药物临床试验机构（基地）培养硕士研究生8人，获省部级科研成果奖7项。潍坊市医学生物遗传工程研究所获省、市科技成果奖23项，培养硕士研究生10人。
2005年，山东省立医院中心实验室承担各级研究课题10余项。其中，国家自然科学基金课题6项，独立培养博士研究生5人，联合培养60人；独立培养硕士研究生13人，联合培养240人。青岛大学医学院脑血管病研究所先后承担市、厅级课题17项，参加国家科技攻关项目4项；医学营养研究所承担科研课题27项，培养硕士研究生50人。
当年，全省附属医学科研机构38所，专兼职科研人员1052人。其中医学院校和省、市医院附属科研机构仪器设备值200万元～800万元，多者1000万元以上，多为硕士研究生培养点，有的为博士研究生培养点，累计获省部级以上科技成果奖130余项。