1996—2005年，山东学者对现代农业发展的研究涉及面广，既有对现代农业或农业现代化本身的研究，又有对现代农业的具体途径的研究，主要包括农业产业化、农民组织化、农业机械化、农业标准化等，还有对农业可持续发展、农田水利、粮食安全等方面的研究。
一、农业产业化问题研究1996年，秦庆武、刘荣勤《实现农业第二个飞跃的战略选择》（《人民日报》1996年12月12日）提出，农业产业化与农村合作制结合是实现中国农业第二次飞跃的必然选择。
1998年，靳相木、薛兴利《试论农业现代化过程中的产业组织创新》（《农业现代化研究》1998年第2期）论述了农业产业组织创新的制度含义、目标、起点及核心内容等。秦庆武著《农业产业化概论》（山东人民出版社）一书，该书较为系统地研究了农业产业化的概念、内涵、特征、发展模式及与农村合作经济结合问题，该书1999年获得山东省优秀图书奖。
1999年，秦庆武《论农业产业化与农村合作制的结合》（《中国农村经济》1999年第2期）分析了农业产业化与农村新型合作经济组织的结合对于中国农业和农村经济发展具有的重要意义。
2000年，刘惟洲、田维东《农业产业化经营中的利益分配问题》（《农业经济问题》2001年第8期）认为，农业产业化经营中的“平均利润说”只是一种理想化的假说，提出农业产业化经营中的利益分配原则。
2002年，秦庆武《培育农村合作经济组织推进农业产业化制度创新》（《理论学刊》2002年第5期）将中国的农业产业化经营模式分成外部导入型和内部生发型两种，分析这两种产业化经营模式发展的前景，并讨论了农村新型合作经济组织对农业产业化制度创新的重要作用。
其他成果还有：袁永新著《山东省农业产业化理论与实践》，张永森《山东农业产业化的理论与实践探索（上、中、下）》，陈光《正确处理产业化与承包制的辩证关系》，遥望《“莱阳试验”：用合作社推进农业一体化、产业化经营》，高洪波《农业产业化的成功之路对调整优化国民经济结构的几点启示》，郭春《农业产业化进程中的金融问题研究》，杨先芬等《农业产业化利益分配机制研究》，靳相木、胡继连《有中国特色的农业产业化理论》，于明《关于推进农业产业化的几点思考》，胡继连、西爱琴著《产业组织制度与中国农业发展研究》，毛爱华、刘贤赵《农业产业化地域模式研究的理论基础及其实践》，冯雷等《城市郊区农业产业化与城乡一体化联动发展研究》，胡继连著《果品产业化管理理论与实践》等。
除对农业产业化问题进行宏观研究外，还就农业产业化具体形式以及农业标准化等问题开展研究。主要研究成果有：高焕喜《农业科技示范园区的功能与机制》，史建民《提高农业订单履约率的法学分析》，张吉国、胡继连《WTO农业标准与中国农业标准化问题研究》，西爱琴等《农业科技园区存在的问题及对策分析》，周衍平等《山东省订单农业的发展状况与问题》，陈会英等《农业科技型企业簇群的经济学特性分析及其培育策略》，张少红、蔺栋华《县域绿色农产品标准化规模生产经营问题探讨》，王希凡、杨学成《试论中国农户企业化》，郭振宗、杨学成《农业企业化：必然性、模式选择及对策》，葛永波、周倬君《农业上市公司经营风险监控实证》等。
二、农民组织化问题研究2000年，秦庆武等《农村新型合作经济组织的基本形式与发展特点》（《山东经济战略研究》2000年第1期）分析了农村新型合作经济组织与中国20世纪五六十年代的“合作社”、人民公社的本质区别，以及新型合作经济组织发展的特点和作用。薛兴利等《农村新型合作经济组织的实证分析与政策措施》（《农业经济问题》2000年第10期）考察了山东省农村新型合作经济组织发展的情况、运行机制和绩效，并提出进一步发展、完善农村新型合作经济组织的政策建议。
2001年，秦庆武主编的《中国农村组织与制度的新变迁：农村新型合作经济发展探索》（中国城市出版社）一书，通过对中国农村合作化历史的经验总结，探讨改革开放以来中国农村新型合作经济出现的动因、主要类型及特点，深入研究农村新型合作经济的组织形式、产权结构与运行机制，提出中国农村合作经济发展的对策与建议。秦庆武《加快山东农村新型合作经济的发展步伐》（《理论学习》2001年第6期）提出发展农村新型合作经济值得注意的一些理论和现实问题。
其他成果还有：曲国庆《日本农协与中国农村合作经济组织建设》，许锦英《推进农村新型合作经济应处理好几个关系》，李树超、夏美翠《稳定与发展农村微观经营体制的有效形式》，慕永太主编《合作社理论与实践》，刘雅静《我国农村合作经济组织的现状及发展对策》等。
三、农业现代化问题研究1998年，秦庆武《论工业化中期阶段的中国农业发展》（《齐鲁学刊》1998年第4期）分析中国进入工业化中期后，农业发展中遇到的突出问题，并提出相应的对策。王培志、轩辕桂银《制度因素对我国农业现代化影响的定量分析研究》（《生态农业研究》1998年第4期）认为中国农业发展效率低下的主要原因是制度结构诱发的技术结构失衡，并提出中国农业现代化进程中制度结构调整的目标取向。
1999年，许锦英《股份合作制与加速我国农业现代化进程》（《农业现代化研究》1999年第3期）从基本国情和现代化农业的要求出发，分析阐述股份合作制的产权制度特性及其对农业发展的作用。
其他成果还有：杨素群《投入结构合理化是农业现代化的关键》，靳相木、薛兴利《拓展农业外延：农业现代化的必由之路》，薛兴利等《农业现代化建设新阶段出现的问题及对策》，郭剑雄《现代农业的制度含义》，高焕喜《简论现代农业》，范爱军《中国农业现代化的关键一步：提高农业耕作规模》，孔庆峰《简论中国传统农业经济结构的特色及其局限性》，王学真等《农业现代化与国际化互动发展研究》等。
四、农业技术推广、创新问题研究现代农业是以现代科学技术和物质装备为支撑的产业体系。发展现代农业，必须加强农业技术推广体系建设，提高农业技术的自主创新能力。
2001年，王传仕《农业梯度技术的选择与转移》（《中国农村经济》2001年第7期）分析中国农业梯度技术转移存在的问题，并提出促进中国农业梯度技术转移的措施。周衍平、陈会英、胡继连《农业技术产权保护问题研究》（《农业经济问题》2001年第11期）剖析农业技术产权保护存在的问题及其成因，指出农业技术产权保护的重点和加强农业技术产权保护的策略。
2005年，许锦英《资源禀赋诱导技术变革理论述评》（《东岳论丛》2005年第3期）论述了资源诱导农业技术变革与资源替代理论本身及其对发展中国家发展实践解释力的局限，探讨该理论对认识和解决中国“三农”问题的意义。
农业技术创新研究。主要成果有：周衍平、陈会英《中国农户采用新技术内在需求机制的形成与培育》，郭振宗《我国农业制度创新对农业科技进步激励：原因及对策》，孙世民等《论我国农业高新技术及其发展战略》，胡继连等《山东农业新科技革命与农村经济体制改革》，郭剑雄、王学真《开放条件下的我国农业技术进步》，陈会英、周衍平《中国农业技术创新问题研究》，于永德、胡继连《农业科技进步的组织制度研究》等。
五、农业机械化问题研究对农机服务产业化的研究是农业机械化研究的重要内容。2000年，孙世民、迟淑筠《论农机服务产业化的发展》（《农机化研究》2000年第1期）阐述了农机服务产业化的内涵及基本特征，分析农机服务产业化的必然性，论述农机服务产业化的发展要点。
2002年，李汝莘、吕钊钦、许锦英《农机服务产业化效益分析》（《农机化研究》2002年第2期）从农机合理开发利用和增加农民收入的角度，对山东省各类农机经营形式的现状和效益进行分析。
2003年，许锦英《农机服务产业化：中国农业转型的帕累托最优制度安排》（山东人民出版社）系统论述了农机服务产业化是有效提高中国农业与农村经济整体素质和效益的低成本、高效率的制度安排。
其他成果有：许锦英《关于农机产业化的几个基本问题》《农机服务产业化是稳定家庭承包责任制、发展农业生产力的重要途径》《发展农机服务产业，加速农业现代化进程》，李其才等《市场经济条件下的农机化运行机制研究》，许锦英、卢进《农机服务产业化与中国农业生产方式的变革》，苑来学、邵晓红《社会主义市场经济条件下农机化发展道路的思考》，许锦英、林维平《加入WTO对农业机械化发展的影响及对策研究》，许锦英《关于中国农业机械化发展制度与发展观的思考》，乔庆勇等《山东省农机化发展与农村劳动力转移问题初探》，林建华《山东省农机化发展特点、趋势与工作重点》等。
六、农业可持续发展问题研究1997年，陈希玉、傅汝仁、丁希滨、朱秀香、王淼等《山东农业可持续发展战略研究》（《中国农村经济》1997年第6期）分析了山东农业可持续发展面临的危机和挑战。
2000年，薛兴利、岳书铭、吴士健《农业现代化建设新阶段出现的问题及对策》（《农业现代化研究》2000年第6期）讨论了中国农业现代化建设进入新阶段后出现的问题，并提出解决这些问题的基本对策。
2001年，靳相木《试论可持续农业制度体系》（《农业现代化研究》2001年第1期）概括和总结了阻滞中国农业可持续发展的主要制度障碍，提出加快可持续农业制度体系建设的重点与任务。
2005年，王学真、高峰、王金田《农业现代化与国际化互动发展研究——胶东地区的实证分析》（《农业经济问题》2005年第5期）分析了农业现代化与国际化之间相互关系。孙曰瑶、杨友孝《我国农业与农村可持续发展的制度创新》（《中国人口·资源与环境》2005年第5期）认为，中国农业和农村可持续发展的关键是实现区域农业专业化和发展专业合作社。
其他成果还有：胡继连《政府职能与农业发展》，冯保初《我国农业可持续发展战略及选择》，张宗斌《也谈中国农业的出路问题》，袁永新《关于农业增长方式转变的两个问题》，山东省发达地区农业稳定发展对策研究课题组《山东省发达地区农业稳定发展的对策研究》，许锦英《现代化农业与可持续农业》，高云宪等《肥料施用技术与农业可持续发展》，靳相木《山东农业可持续发展问题研究》，郑新奇、范纯增《农业土地资源可持续利用水平评估研究》，山世英《山东农业可持续发展指标体系及其能力评价》，高强、王森林《中西部地区耕地潜力及承载力研究》等。
七、农业和农村经济结构调整研究1998年底，中央提出了对农业和农村经济结构进行战略性调整的方针，山东学术界对此展开深入探讨。2000年，陈建国《推进农业和农村经济结构的战略性调整》（《山东农业》2000年第4期）认为，推进农业和农村经济结构战略性调整是一项复杂的系统工程，应抓好加快农村市场体系建设等6个方面的工作。秦庆武、陈泽浦《论我国农村经济结构的战略性调整》（《中国农村经济》2000年第9期）分析了农业和农村经济结构演化的基本规律和特点，提出了农村经济结构调整的原则和思路。2001年，葛颜祥《农业结构调整中的风险防范》（《农业现代化研究》2001年第6期）讨论了农业结构调整过程中的各种风险，提出了风险控制应遵循的原则和可能的风险转移机制。2002年，郭剑雄、王学真《城市化与农业结构调整的相关性分析》（《财经问题研究》2002年第3期）认为城市化进程是农业结构有效转变不可或缺的条件，应当把两种发展有机结合起来。2003年，曹俊杰著《开放条件下区域农业结构调整与可持续发展》（中国财政经济出版社）一书，该书将中国区域农业结构调整与农业可持续发展放在开放环境下进行研究，揭示了农业结构调整与农业可持续发展的内在联系。
其他成果还有：魏学武《当前农业结构调整的几个问题》，高新军《论我国农村经济的产业结构调整》，刘命信《山东寿光实施农业结构调整的经验》，秦庆武等《对山东农村经济结构调整的实践与思考》，高焕喜《新阶段新思路新举措——关于农业结构调整的思考》，姜文华、王秀霞《论我国农业结构的目标选择》，李传健《解析我国农业结构调整中的比较优势》，王统志《农业结构调整的制约因素及思路探析》等。
八、农田水利问题研究山东学术界从水权市场、水利产业化等方面对农田水利问题进行了研究。
关于水利产业化问题的研究成果有：胡继连等《山东省农田水利产业化实践及理论分析》《小型农田水利产业组织问题研究》等。
关于水权市场问题的成果有：胡继连等《水权市场的基本构造与建设方法》《水权市场与农用水资源配置研究：兼论水利设施产权及农田灌溉的组织制度》，张维、胡继连《水权市场的构建与运作体系研究》，葛颜祥等《黄河水权市场的建设及其作用研究》，邱金荣《水权、水市场理论在黄河下游水资源配置中的应用探讨》，胡继连、葛颜祥《黄河水资源的分配模式与协调机制——兼论黄河水权市场的建设与管理》等。
九、特色农业、优势产业带问题研究发展特色经济、打造优势产业带、实施农业名牌战略等也是发展现代农业的重要途径。张永森等《一个正在崛起的新的经济增长点》（《农业经济问题》2000年第1期）对山东省专业户、专业村、专业乡、专业合作经济组织、专业批发市场“五位一体”增长方式进行了调查。其他成果还有：王世农等《实施农业名牌战略，带动区域经济发展》，王海燕、张永森《建设特色专业乡镇促进农村经济发展——山东省的实践与启示》，高焕喜《营造优势产业带，加快我国农业发展》《山东农业：加快营造优势产业带》《优化区域布局，发展特色农业》，郭振宗《发展特色专业乡镇促进农民持续增收》。
全省林业经济持续发展，促进了林业经济研究。张建锋等《由“承包”到“拍卖”——山东农田林网经营方式的转变》（《林业经济问题》1999年第5期）探讨了山东农田林网经营方式的转变。张维、胡继连《农村林业产权制度改革研究》（《林业经济问题》2003年第2期）提出了实行村委会政社分开、让利取义和林业产权共有的林业股份联合经营的论点。其他成果还有：张吉国、胡继连《中国林纸产品国际竞争力实证研究》《信息不对称对林产品市场的影响及对策》，“山东速生丰产林发展的实证分析与对策研究”课题组《山东省速生丰产林发展的实证分析》，葛颜祥等《基于期权的林木产权评估方法》，薛兴利等《菏泽市速生丰产林发展状况的调查与思考》等。
十、粮食生产、流通和粮食安全问题研究1996年，郭京堂、乔美华《关于中国粮食发展的几个战略性问题》（《中国农村观察》1996年第1期）提出保障中国粮食生产的战略措施。
2000年，王学真、郭剑雄《产业结构升级中粮食安全问题的思考》（《农业经济问题》2000年第4期）从理论上分析了产业结构升级与粮食安全协调的可能性，并提出产业结构升级与粮食安全协调的现实选择。
2002年，胡继连等《山东的小麦供求关系及生产安排方案研究》（《农业技术经济》2002年第2期）分析预测了山东省的小麦供求关系，提出山东省小麦生产安排的方案。秦庆武《加入WTO对山东省粮食生产的影响与对策》（《山东农业（农村经济版）》2002年第3期）分析了加入WTO对山东省粮食生产的影响，并提出对农业发展进行扶持和保护的对策建议。
2005年，葛颜祥等《山东省粮食生产发展态势研究》（《山东农业大学学报（社会科学版）》2005年第4期）分析了山东省粮食生产的主要影响因素，同时对“藏粮于仓”与“藏粮于地”问题进行了讨论。
其他成果还有：张永森《全面认识准确把握积极开拓农产品的买方市场》，葛颜祥《山东省粮食生产现状及其发展战略探讨》等。
十一、其他方面的研究农业利用外资问题研究。主要成果有：史建民、孙文军《农业外资项目引进、实施、运营的经济分析》，李苏《建立和完善农业信息系统》，岳书铭《试论中国农业保护政策的目标》，柏宝春《我国农业利用外资现状与对策分析》，张志慧《中国农业信息化问题初探》，乔翠霞、李劲华《山东省的农业支持与保护》等。
现代农业发展研究。主要成果有：胡继连、赵瑞莹《我国工农业间的不完全竞争及其校正》，高焕喜、王策之《论效益农业》，“山东省发达地区农业稳定发展对策研究”课题组《山东省发达地区农业稳定发展的对策研究》，秦庆武、李超群《澳大利亚的农业生产与经营》，赵海成《加入WTO对中国农业的负面影响及对策》，赵瑞莹、杨学成《农业预警系统研究》，王学真等《蔬菜从山东寿光生产者到北京最终消费者流通费用的调查与思考》，高焕喜《关于农业国际化的认识、调查与建议》等。
第二节 农业产业化与农业现代化发展研究
1996—2005年，山东学者对现代农业发展的研究涉及面广，既有对现代农业或农业现代化本身的研究，又有对现代农业的具体途径的研究，主要包括农业产业化、农民组织化、农业机械化、农业标准化等，还有对农业可持续发展、农田水利、粮食安全等方面的研究。
一、农业产业化问题研究1996年，秦庆武、刘荣勤《实现农业第二个飞跃的战略选择》（《人民日报》1996年12月12日）提出，农业产业化与农村合作制结合是实现中国农业第二次飞跃的必然选择。
1998年，靳相木、薛兴利《试论农业现代化过程中的产业组织创新》（《农业现代化研究》1998年第2期）论述了农业产业组织创新的制度含义、目标、起点及核心内容等。秦庆武著《农业产业化概论》（山东人民出版社）一书，该书较为系统地研究了农业产业化的概念、内涵、特征、发展模式及与农村合作经济结合问题，该书1999年获得山东省优秀图书奖。
1999年，秦庆武《论农业产业化与农村合作制的结合》（《中国农村经济》1999年第2期）分析了农业产业化与农村新型合作经济组织的结合对于中国农业和农村经济发展具有的重要意义。
2000年，刘惟洲、田维东《农业产业化经营中的利益分配问题》（《农业经济问题》2001年第8期）认为，农业产业化经营中的“平均利润说”只是一种理想化的假说，提出农业产业化经营中的利益分配原则。
2002年，秦庆武《培育农村合作经济组织推进农业产业化制度创新》（《理论学刊》2002年第5期）将中国的农业产业化经营模式分成外部导入型和内部生发型两种，分析这两种产业化经营模式发展的前景，并讨论了农村新型合作经济组织对农业产业化制度创新的重要作用。
其他成果还有：袁永新著《山东省农业产业化理论与实践》，张永森《山东农业产业化的理论与实践探索（上、中、下）》，陈光《正确处理产业化与承包制的辩证关系》，遥望《“莱阳试验”：用合作社推进农业一体化、产业化经营》，高洪波《农业产业化的成功之路对调整优化国民经济结构的几点启示》，郭春《农业产业化进程中的金融问题研究》，杨先芬等《农业产业化利益分配机制研究》，靳相木、胡继连《有中国特色的农业产业化理论》，于明《关于推进农业产业化的几点思考》，胡继连、西爱琴著《产业组织制度与中国农业发展研究》，毛爱华、刘贤赵《农业产业化地域模式研究的理论基础及其实践》，冯雷等《城市郊区农业产业化与城乡一体化联动发展研究》，胡继连著《果品产业化管理理论与实践》等。
除对农业产业化问题进行宏观研究外，还就农业产业化具体形式以及农业标准化等问题开展研究。主要研究成果有：高焕喜《农业科技示范园区的功能与机制》，史建民《提高农业订单履约率的法学分析》，张吉国、胡继连《WTO农业标准与中国农业标准化问题研究》，西爱琴等《农业科技园区存在的问题及对策分析》，周衍平等《山东省订单农业的发展状况与问题》，陈会英等《农业科技型企业簇群的经济学特性分析及其培育策略》，张少红、蔺栋华《县域绿色农产品标准化规模生产经营问题探讨》，王希凡、杨学成《试论中国农户企业化》，郭振宗、杨学成《农业企业化：必然性、模式选择及对策》，葛永波、周倬君《农业上市公司经营风险监控实证》等。
二、农民组织化问题研究2000年，秦庆武等《农村新型合作经济组织的基本形式与发展特点》（《山东经济战略研究》2000年第1期）分析了农村新型合作经济组织与中国20世纪五六十年代的“合作社”、人民公社的本质区别，以及新型合作经济组织发展的特点和作用。薛兴利等《农村新型合作经济组织的实证分析与政策措施》（《农业经济问题》2000年第10期）考察了山东省农村新型合作经济组织发展的情况、运行机制和绩效，并提出进一步发展、完善农村新型合作经济组织的政策建议。
2001年，秦庆武主编的《中国农村组织与制度的新变迁：农村新型合作经济发展探索》（中国城市出版社）一书，通过对中国农村合作化历史的经验总结，探讨改革开放以来中国农村新型合作经济出现的动因、主要类型及特点，深入研究农村新型合作经济的组织形式、产权结构与运行机制，提出中国农村合作经济发展的对策与建议。秦庆武《加快山东农村新型合作经济的发展步伐》（《理论学习》2001年第6期）提出发展农村新型合作经济值得注意的一些理论和现实问题。
其他成果还有：曲国庆《日本农协与中国农村合作经济组织建设》，许锦英《推进农村新型合作经济应处理好几个关系》，李树超、夏美翠《稳定与发展农村微观经营体制的有效形式》，慕永太主编《合作社理论与实践》，刘雅静《我国农村合作经济组织的现状及发展对策》等。
三、农业现代化问题研究1998年，秦庆武《论工业化中期阶段的中国农业发展》（《齐鲁学刊》1998年第4期）分析中国进入工业化中期后，农业发展中遇到的突出问题，并提出相应的对策。王培志、轩辕桂银《制度因素对我国农业现代化影响的定量分析研究》（《生态农业研究》1998年第4期）认为中国农业发展效率低下的主要原因是制度结构诱发的技术结构失衡，并提出中国农业现代化进程中制度结构调整的目标取向。
1999年，许锦英《股份合作制与加速我国农业现代化进程》（《农业现代化研究》1999年第3期）从基本国情和现代化农业的要求出发，分析阐述股份合作制的产权制度特性及其对农业发展的作用。
其他成果还有：杨素群《投入结构合理化是农业现代化的关键》，靳相木、薛兴利《拓展农业外延：农业现代化的必由之路》，薛兴利等《农业现代化建设新阶段出现的问题及对策》，郭剑雄《现代农业的制度含义》，高焕喜《简论现代农业》，范爱军《中国农业现代化的关键一步：提高农业耕作规模》，孔庆峰《简论中国传统农业经济结构的特色及其局限性》，王学真等《农业现代化与国际化互动发展研究》等。
四、农业技术推广、创新问题研究现代农业是以现代科学技术和物质装备为支撑的产业体系。发展现代农业，必须加强农业技术推广体系建设，提高农业技术的自主创新能力。
2001年，王传仕《农业梯度技术的选择与转移》（《中国农村经济》2001年第7期）分析中国农业梯度技术转移存在的问题，并提出促进中国农业梯度技术转移的措施。周衍平、陈会英、胡继连《农业技术产权保护问题研究》（《农业经济问题》2001年第11期）剖析农业技术产权保护存在的问题及其成因，指出农业技术产权保护的重点和加强农业技术产权保护的策略。
2005年，许锦英《资源禀赋诱导技术变革理论述评》（《东岳论丛》2005年第3期）论述了资源诱导农业技术变革与资源替代理论本身及其对发展中国家发展实践解释力的局限，探讨该理论对认识和解决中国“三农”问题的意义。
农业技术创新研究。主要成果有：周衍平、陈会英《中国农户采用新技术内在需求机制的形成与培育》，郭振宗《我国农业制度创新对农业科技进步激励：原因及对策》，孙世民等《论我国农业高新技术及其发展战略》，胡继连等《山东农业新科技革命与农村经济体制改革》，郭剑雄、王学真《开放条件下的我国农业技术进步》，陈会英、周衍平《中国农业技术创新问题研究》，于永德、胡继连《农业科技进步的组织制度研究》等。
五、农业机械化问题研究对农机服务产业化的研究是农业机械化研究的重要内容。2000年，孙世民、迟淑筠《论农机服务产业化的发展》（《农机化研究》2000年第1期）阐述了农机服务产业化的内涵及基本特征，分析农机服务产业化的必然性，论述农机服务产业化的发展要点。
2002年，李汝莘、吕钊钦、许锦英《农机服务产业化效益分析》（《农机化研究》2002年第2期）从农机合理开发利用和增加农民收入的角度，对山东省各类农机经营形式的现状和效益进行分析。
2003年，许锦英《农机服务产业化：中国农业转型的帕累托最优制度安排》（山东人民出版社）系统论述了农机服务产业化是有效提高中国农业与农村经济整体素质和效益的低成本、高效率的制度安排。
其他成果有：许锦英《关于农机产业化的几个基本问题》《农机服务产业化是稳定家庭承包责任制、发展农业生产力的重要途径》《发展农机服务产业，加速农业现代化进程》，李其才等《市场经济条件下的农机化运行机制研究》，许锦英、卢进《农机服务产业化与中国农业生产方式的变革》，苑来学、邵晓红《社会主义市场经济条件下农机化发展道路的思考》，许锦英、林维平《加入WTO对农业机械化发展的影响及对策研究》，许锦英《关于中国农业机械化发展制度与发展观的思考》，乔庆勇等《山东省农机化发展与农村劳动力转移问题初探》，林建华《山东省农机化发展特点、趋势与工作重点》等。
六、农业可持续发展问题研究1997年，陈希玉、傅汝仁、丁希滨、朱秀香、王淼等《山东农业可持续发展战略研究》（《中国农村经济》1997年第6期）分析了山东农业可持续发展面临的危机和挑战。
2000年，薛兴利、岳书铭、吴士健《农业现代化建设新阶段出现的问题及对策》（《农业现代化研究》2000年第6期）讨论了中国农业现代化建设进入新阶段后出现的问题，并提出解决这些问题的基本对策。
2001年，靳相木《试论可持续农业制度体系》（《农业现代化研究》2001年第1期）概括和总结了阻滞中国农业可持续发展的主要制度障碍，提出加快可持续农业制度体系建设的重点与任务。
2005年，王学真、高峰、王金田《农业现代化与国际化互动发展研究——胶东地区的实证分析》（《农业经济问题》2005年第5期）分析了农业现代化与国际化之间相互关系。孙曰瑶、杨友孝《我国农业与农村可持续发展的制度创新》（《中国人口·资源与环境》2005年第5期）认为，中国农业和农村可持续发展的关键是实现区域农业专业化和发展专业合作社。
其他成果还有：胡继连《政府职能与农业发展》，冯保初《我国农业可持续发展战略及选择》，张宗斌《也谈中国农业的出路问题》，袁永新《关于农业增长方式转变的两个问题》，山东省发达地区农业稳定发展对策研究课题组《山东省发达地区农业稳定发展的对策研究》，许锦英《现代化农业与可持续农业》，高云宪等《肥料施用技术与农业可持续发展》，靳相木《山东农业可持续发展问题研究》，郑新奇、范纯增《农业土地资源可持续利用水平评估研究》，山世英《山东农业可持续发展指标体系及其能力评价》，高强、王森林《中西部地区耕地潜力及承载力研究》等。
七、农业和农村经济结构调整研究1998年底，中央提出了对农业和农村经济结构进行战略性调整的方针，山东学术界对此展开深入探讨。2000年，陈建国《推进农业和农村经济结构的战略性调整》（《山东农业》2000年第4期）认为，推进农业和农村经济结构战略性调整是一项复杂的系统工程，应抓好加快农村市场体系建设等6个方面的工作。秦庆武、陈泽浦《论我国农村经济结构的战略性调整》（《中国农村经济》2000年第9期）分析了农业和农村经济结构演化的基本规律和特点，提出了农村经济结构调整的原则和思路。2001年，葛颜祥《农业结构调整中的风险防范》（《农业现代化研究》2001年第6期）讨论了农业结构调整过程中的各种风险，提出了风险控制应遵循的原则和可能的风险转移机制。2002年，郭剑雄、王学真《城市化与农业结构调整的相关性分析》（《财经问题研究》2002年第3期）认为城市化进程是农业结构有效转变不可或缺的条件，应当把两种发展有机结合起来。2003年，曹俊杰著《开放条件下区域农业结构调整与可持续发展》（中国财政经济出版社）一书，该书将中国区域农业结构调整与农业可持续发展放在开放环境下进行研究，揭示了农业结构调整与农业可持续发展的内在联系。
其他成果还有：魏学武《当前农业结构调整的几个问题》，高新军《论我国农村经济的产业结构调整》，刘命信《山东寿光实施农业结构调整的经验》，秦庆武等《对山东农村经济结构调整的实践与思考》，高焕喜《新阶段新思路新举措——关于农业结构调整的思考》，姜文华、王秀霞《论我国农业结构的目标选择》，李传健《解析我国农业结构调整中的比较优势》，王统志《农业结构调整的制约因素及思路探析》等。
八、农田水利问题研究山东学术界从水权市场、水利产业化等方面对农田水利问题进行了研究。
关于水利产业化问题的研究成果有：胡继连等《山东省农田水利产业化实践及理论分析》《小型农田水利产业组织问题研究》等。
关于水权市场问题的成果有：胡继连等《水权市场的基本构造与建设方法》《水权市场与农用水资源配置研究：兼论水利设施产权及农田灌溉的组织制度》，张维、胡继连《水权市场的构建与运作体系研究》，葛颜祥等《黄河水权市场的建设及其作用研究》，邱金荣《水权、水市场理论在黄河下游水资源配置中的应用探讨》，胡继连、葛颜祥《黄河水资源的分配模式与协调机制——兼论黄河水权市场的建设与管理》等。
九、特色农业、优势产业带问题研究发展特色经济、打造优势产业带、实施农业名牌战略等也是发展现代农业的重要途径。张永森等《一个正在崛起的新的经济增长点》（《农业经济问题》2000年第1期）对山东省专业户、专业村、专业乡、专业合作经济组织、专业批发市场“五位一体”增长方式进行了调查。其他成果还有：王世农等《实施农业名牌战略，带动区域经济发展》，王海燕、张永森《建设特色专业乡镇促进农村经济发展——山东省的实践与启示》，高焕喜《营造优势产业带，加快我国农业发展》《山东农业：加快营造优势产业带》《优化区域布局，发展特色农业》，郭振宗《发展特色专业乡镇促进农民持续增收》。
全省林业经济持续发展，促进了林业经济研究。张建锋等《由“承包”到“拍卖”——山东农田林网经营方式的转变》（《林业经济问题》1999年第5期）探讨了山东农田林网经营方式的转变。张维、胡继连《农村林业产权制度改革研究》（《林业经济问题》2003年第2期）提出了实行村委会政社分开、让利取义和林业产权共有的林业股份联合经营的论点。其他成果还有：张吉国、胡继连《中国林纸产品国际竞争力实证研究》《信息不对称对林产品市场的影响及对策》，“山东速生丰产林发展的实证分析与对策研究”课题组《山东省速生丰产林发展的实证分析》，葛颜祥等《基于期权的林木产权评估方法》，薛兴利等《菏泽市速生丰产林发展状况的调查与思考》等。
十、粮食生产、流通和粮食安全问题研究1996年，郭京堂、乔美华《关于中国粮食发展的几个战略性问题》（《中国农村观察》1996年第1期）提出保障中国粮食生产的战略措施。
2000年，王学真、郭剑雄《产业结构升级中粮食安全问题的思考》（《农业经济问题》2000年第4期）从理论上分析了产业结构升级与粮食安全协调的可能性，并提出产业结构升级与粮食安全协调的现实选择。
2002年，胡继连等《山东的小麦供求关系及生产安排方案研究》（《农业技术经济》2002年第2期）分析预测了山东省的小麦供求关系，提出山东省小麦生产安排的方案。秦庆武《加入WTO对山东省粮食生产的影响与对策》（《山东农业（农村经济版）》2002年第3期）分析了加入WTO对山东省粮食生产的影响，并提出对农业发展进行扶持和保护的对策建议。
2005年，葛颜祥等《山东省粮食生产发展态势研究》（《山东农业大学学报（社会科学版）》2005年第4期）分析了山东省粮食生产的主要影响因素，同时对“藏粮于仓”与“藏粮于地”问题进行了讨论。
其他成果还有：张永森《全面认识准确把握积极开拓农产品的买方市场》，葛颜祥《山东省粮食生产现状及其发展战略探讨》等。
十一、其他方面的研究农业利用外资问题研究。主要成果有：史建民、孙文军《农业外资项目引进、实施、运营的经济分析》，李苏《建立和完善农业信息系统》，岳书铭《试论中国农业保护政策的目标》，柏宝春《我国农业利用外资现状与对策分析》，张志慧《中国农业信息化问题初探》，乔翠霞、李劲华《山东省的农业支持与保护》等。
现代农业发展研究。主要成果有：胡继连、赵瑞莹《我国工农业间的不完全竞争及其校正》，高焕喜、王策之《论效益农业》，“山东省发达地区农业稳定发展对策研究”课题组《山东省发达地区农业稳定发展的对策研究》，秦庆武、李超群《澳大利亚的农业生产与经营》，赵海成《加入WTO对中国农业的负面影响及对策》，赵瑞莹、杨学成《农业预警系统研究》，王学真等《蔬菜从山东寿光生产者到北京最终消费者流通费用的调查与思考》，高焕喜《关于农业国际化的认识、调查与建议》等。