一、美术考古研究美术考古是考古学的三级学科，以田野考古调查和发掘所获得的美术遗迹和遗物为研究对象。1996年，山东大学成立国内第一家美术考古研究所。刘凤君《美术考古学导论》（山东大学出版社1995年版），该书上卷为总论，概括叙述西方与中国美术考古学的发生与发展，以期从历史发展中明确美术考古的对象、目的与任务；下卷为分论，分章论述雕塑、佛教造像、画像与石像砖、绘画、建筑、陶瓷、玉器、铜器、石碑和墓志，以及工艺美术的发现与研究的历史和内容、形式、技法等，并对其历史价值和美学价值作出评述。蒋英炬、吴文琪《汉代武氏墓群石刻研究》（山东美术出版社1995年版）对嘉祥县武宅山遗存的汉代武氏祠汉画像石进行了较为系统的整理和研究，对零散的各个祠堂画像石做了建筑配置和研究，并使各个祠堂得到了基本的建筑复原，为研究汉代建筑的结构增添了新的资料。
其他成果还有：李宗山《海岱地区史前彩陶与彩绘陶初论》，贾振国《淄博古代瓷窑综论》，吴绪刚《鲁西白佛山石窟造像》，吴绍田《源远流长的东莱文明：平度历代碑刻研究》等。
二、环境考古研究1996—2005年，环境考古学作为一门新兴的交叉学科在山东地区引起学术界的广泛关注。2002年，第三届中国环境考古学大会在济南召开。环境考古专业委员会、山东省文物考古研究所等编辑出版《环境考古研究（第三辑）》（北京大学出版社2006年版），收录此次大会学术报告30多篇论文。全书共分综合研究、区域古环境与文化、专题与方法研究三个部分。其他成果还有：袁靖《胶东半岛北岸贝丘遗址环境考古学研究》《胶东半岛南岸贝丘遗址环境考古学研究》，何德亮《山东史前时期自然环境的考古学观察》《山东新石器时代环境考古学研究》，何德亮、毛晓平《山东新石器时代的自然环境》，高广仁、胡秉华《山东新石器时代环境考古信息及其与文化的关系》，王青《大汶口文化环境考古初论》《环境考古学的几个基本理论问题》，王青、黄爱华、袁庆华《山东寿光市北部沿海环境考古报告》。
三、科技考古研究1996—2005年，随着科技考古的推进，研究成果不断丰富。主要成果有：陆巍《北辛文化和山东龙山文化陶器成分的聚类分析》，刘凤君《山东古代烧瓷窑炉结构和装烧技术发展序列初探》，韩康信、松下孝幸《山东临淄周—汉代人骨体质特征研究及与西日本弥生时代人骨比较概报》，王克林、吴加安《尉迟寺遗址硅酸体分析——兼论尉迟寺遗址史前农业经济特点》，孔昭宸、刘长江、何德亮《山东滕州市庄里西遗址植物遗存及其在环境考古学上的意义》，靳桂云《山东临淄田旺龙山文化遗址植物硅酸体研究》《山东日照市两城镇遗址土壤样品植硅体研究》，齐乌云《山东乳山市翁家埠遗址孢粉分析研究》《从胶东半岛贝丘遗址的孢粉分析看当时的人地关系》，王增林、梁中合、袁靖、田伟之、倪邦发、王平生《山东地区龙山文化陶器的中子活化分析与研究》，凯利·克劳福德、赵志军、栾丰实、于海广、方辉、蔡凤书、文德安、李炅娥、加里·费曼、琳达·尼古拉斯《山东日照市两城镇遗址龙山文化植物遗存的初步分析》，靳桂云、刘延常、栾丰实《水稻植硅体定量研究与农业考古新突破》，麦戈文、方辉、栾丰实、于海广、文德安、王辰珊、蔡凤书、格里辛·霍尔、加里·费曼、赵志军《山东日照市两城镇遗址龙山文化酒遗存的化学分析——兼谈酒在史前时期的文化意义》，范黛华、栾丰实、方辉、于海广、蔡凤书、文德安《山东日照市两城镇龙山文化陶器的初步研究》等。
这一阶段，山东考古工作者利用遥感技术对临淄战国及两汉齐墓进行了研究，促进了中国考古学新技术方法的应用。省文物考古研究所同德国波鸿鲁尔大学合作，运用计算机技术对临淄地区不同时代航片资料进行数字化正射影像图制、多时相影像分析及航片解读，并结合田野查证和多源考古信息的复合，建立了临淄地区文物考古信息系统，编辑出版了中国第一部航空摄影考古研究报告《中国临淄文物考古遥感影像图集》（山东省地图出版社2000年版）。该方面的成果还有李传荣、吴双成《遥感考古技术在山东的首次应用及其意义》（《中国文物保护技术协会第二届学术年会论文集》2002年）。
2001年，于海广、方辉申请的教育部项目“山东大学考古数字化博物馆”获得立项，在中央财政专项资助下，山东大学计算机科学与技术学院、考古系、博物馆合作，采用网络、人机交互、虚拟现实、数字水印等众多计算机技术，研发了文物信息管理系统、网站数据采集系统、虚拟博物馆协同设计与漫游系统等系列软件，实现1万余件文物的数字化，生成文字、图像、音频、视频以及三维模型和场景等多媒体内容，建立了“山东大学考古数字博物馆”。
四、盐业考古研究盐业考古是1996—2005年山东地区考古学研究的热点之一。2001年山东大学考古系等单位对寿光市大荒北央西周遗址进行发掘，由此发现了西周制盐遗存。2003—2004年，省文物考古研究所为配合南水北调东线双王城水库工程建设，多次对水库工程范围内及周围进行了考古调查、勘探和试掘工作，共发现西周早期制盐遗址39处。
方辉《商周时期鲁北地区海盐业的考古学研究》（《考古》2004年第4期），指出鲁北地区所出的盔形器过去被认为是周代煮海为盐的器具。新的研究成果表明，盔形器用于海盐生产和运输至少可追溯到商代晚期。这类器物具有标准化的特征，可能曾用作量器。鲁北地区的商代考古学文化态势及有关文字资料显示，商末对东方的战争可能与商王朝谋求控制海盐资源有关。其他成果还有：曹元启《试论西周至战国时代的盔形器》，李水城、兰玉富、王辉、胡明明《莱州湾地区古代盐业考古调查》，王青《山东沿海商周时期盐业考古的新进展》《〈管子〉所载海盐生产的考古学新证》，朱继平、王青、燕生东、秦颖、常叙政、佟佩华、王昌燧《鲁北地区商周时期的海盐业》。
五、农业考古研究栾丰实《海岱地区史前时期稻作农业的产生、发展和扩散》（《文史哲》2005年第6期）认为，地处黄淮下游的海岱地区，新石器时代偏早时期是以种植粟类作物为主的旱作农业区。随着与南方地区文化交流的增强，至迟在北辛文化时期，稻作农业已传入海岱地区，然后循着东、西两路由南向北不断地扩散和发展。到龙山文化时期，海岱地区的南部和东部沿海一带，已经形成了一定规模的稻作农业经济。以东部沿海地区为基点，稻作农业还渡海传播，扩散到了辽东半岛和朝鲜半岛地区，并进一步向日本列岛扩散和发展。其他成果有：李锦山《考古资料反映的农业气象及雷雨诸神崇拜——兼论古代的祈雨巫术》，林正同《从画像砖、石看汉代农业经济特点》，石敬东《山东枣庄出土的铁农具》，靳桂云《海岱地区史前稻作农业研究的回顾与展望》，李春华《山东史前农业考古研究的几个问题》，何德亮《山东新石器时代农业试论》。
六、聚落考古研究区域系统调查（RegionalSystematicSurvey），又称为“全覆盖式调查”（Full-CoverageSurvey），是以聚落形态研究为目的的考古调查方法。最早出现于20世纪40年代的美洲，随后在世界范围内推广开来。受其影响，中国学者于20世纪90年代初期开始在小范围尝试这一调查方法，并取得一定成功。20世纪90年代中期后，中国高校和研究机构通过与外国同行合作，先后在山东日照、河南巩义等地开展了规模大小不一的区域系统调查，发表了阶段性成果，初步显示了这种调查方法在中国考古实践中所具有的发展潜力。
主要成果有：栾丰实《关于聚落考古学研究中的共时性问题》，王建华《聚落考古综述》，方辉《山东日照地区系统考古调查的新收获》《对区域系统调查方法的认识与思考》《日照地区聚落考古：人口问题》等。
第五节 专题考古研究
一、美术考古研究美术考古是考古学的三级学科，以田野考古调查和发掘所获得的美术遗迹和遗物为研究对象。1996年，山东大学成立国内第一家美术考古研究所。刘凤君《美术考古学导论》（山东大学出版社1995年版），该书上卷为总论，概括叙述西方与中国美术考古学的发生与发展，以期从历史发展中明确美术考古的对象、目的与任务；下卷为分论，分章论述雕塑、佛教造像、画像与石像砖、绘画、建筑、陶瓷、玉器、铜器、石碑和墓志，以及工艺美术的发现与研究的历史和内容、形式、技法等，并对其历史价值和美学价值作出评述。蒋英炬、吴文琪《汉代武氏墓群石刻研究》（山东美术出版社1995年版）对嘉祥县武宅山遗存的汉代武氏祠汉画像石进行了较为系统的整理和研究，对零散的各个祠堂画像石做了建筑配置和研究，并使各个祠堂得到了基本的建筑复原，为研究汉代建筑的结构增添了新的资料。
其他成果还有：李宗山《海岱地区史前彩陶与彩绘陶初论》，贾振国《淄博古代瓷窑综论》，吴绪刚《鲁西白佛山石窟造像》，吴绍田《源远流长的东莱文明：平度历代碑刻研究》等。
二、环境考古研究1996—2005年，环境考古学作为一门新兴的交叉学科在山东地区引起学术界的广泛关注。2002年，第三届中国环境考古学大会在济南召开。环境考古专业委员会、山东省文物考古研究所等编辑出版《环境考古研究（第三辑）》（北京大学出版社2006年版），收录此次大会学术报告30多篇论文。全书共分综合研究、区域古环境与文化、专题与方法研究三个部分。其他成果还有：袁靖《胶东半岛北岸贝丘遗址环境考古学研究》《胶东半岛南岸贝丘遗址环境考古学研究》，何德亮《山东史前时期自然环境的考古学观察》《山东新石器时代环境考古学研究》，何德亮、毛晓平《山东新石器时代的自然环境》，高广仁、胡秉华《山东新石器时代环境考古信息及其与文化的关系》，王青《大汶口文化环境考古初论》《环境考古学的几个基本理论问题》，王青、黄爱华、袁庆华《山东寿光市北部沿海环境考古报告》。
三、科技考古研究1996—2005年，随着科技考古的推进，研究成果不断丰富。主要成果有：陆巍《北辛文化和山东龙山文化陶器成分的聚类分析》，刘凤君《山东古代烧瓷窑炉结构和装烧技术发展序列初探》，韩康信、松下孝幸《山东临淄周—汉代人骨体质特征研究及与西日本弥生时代人骨比较概报》，王克林、吴加安《尉迟寺遗址硅酸体分析——兼论尉迟寺遗址史前农业经济特点》，孔昭宸、刘长江、何德亮《山东滕州市庄里西遗址植物遗存及其在环境考古学上的意义》，靳桂云《山东临淄田旺龙山文化遗址植物硅酸体研究》《山东日照市两城镇遗址土壤样品植硅体研究》，齐乌云《山东乳山市翁家埠遗址孢粉分析研究》《从胶东半岛贝丘遗址的孢粉分析看当时的人地关系》，王增林、梁中合、袁靖、田伟之、倪邦发、王平生《山东地区龙山文化陶器的中子活化分析与研究》，凯利·克劳福德、赵志军、栾丰实、于海广、方辉、蔡凤书、文德安、李炅娥、加里·费曼、琳达·尼古拉斯《山东日照市两城镇遗址龙山文化植物遗存的初步分析》，靳桂云、刘延常、栾丰实《水稻植硅体定量研究与农业考古新突破》，麦戈文、方辉、栾丰实、于海广、文德安、王辰珊、蔡凤书、格里辛·霍尔、加里·费曼、赵志军《山东日照市两城镇遗址龙山文化酒遗存的化学分析——兼谈酒在史前时期的文化意义》，范黛华、栾丰实、方辉、于海广、蔡凤书、文德安《山东日照市两城镇龙山文化陶器的初步研究》等。
这一阶段，山东考古工作者利用遥感技术对临淄战国及两汉齐墓进行了研究，促进了中国考古学新技术方法的应用。省文物考古研究所同德国波鸿鲁尔大学合作，运用计算机技术对临淄地区不同时代航片资料进行数字化正射影像图制、多时相影像分析及航片解读，并结合田野查证和多源考古信息的复合，建立了临淄地区文物考古信息系统，编辑出版了中国第一部航空摄影考古研究报告《中国临淄文物考古遥感影像图集》（山东省地图出版社2000年版）。该方面的成果还有李传荣、吴双成《遥感考古技术在山东的首次应用及其意义》（《中国文物保护技术协会第二届学术年会论文集》2002年）。
2001年，于海广、方辉申请的教育部项目“山东大学考古数字化博物馆”获得立项，在中央财政专项资助下，山东大学计算机科学与技术学院、考古系、博物馆合作，采用网络、人机交互、虚拟现实、数字水印等众多计算机技术，研发了文物信息管理系统、网站数据采集系统、虚拟博物馆协同设计与漫游系统等系列软件，实现1万余件文物的数字化，生成文字、图像、音频、视频以及三维模型和场景等多媒体内容，建立了“山东大学考古数字博物馆”。
四、盐业考古研究盐业考古是1996—2005年山东地区考古学研究的热点之一。2001年山东大学考古系等单位对寿光市大荒北央西周遗址进行发掘，由此发现了西周制盐遗存。2003—2004年，省文物考古研究所为配合南水北调东线双王城水库工程建设，多次对水库工程范围内及周围进行了考古调查、勘探和试掘工作，共发现西周早期制盐遗址39处。
方辉《商周时期鲁北地区海盐业的考古学研究》（《考古》2004年第4期），指出鲁北地区所出的盔形器过去被认为是周代煮海为盐的器具。新的研究成果表明，盔形器用于海盐生产和运输至少可追溯到商代晚期。这类器物具有标准化的特征，可能曾用作量器。鲁北地区的商代考古学文化态势及有关文字资料显示，商末对东方的战争可能与商王朝谋求控制海盐资源有关。其他成果还有：曹元启《试论西周至战国时代的盔形器》，李水城、兰玉富、王辉、胡明明《莱州湾地区古代盐业考古调查》，王青《山东沿海商周时期盐业考古的新进展》《〈管子〉所载海盐生产的考古学新证》，朱继平、王青、燕生东、秦颖、常叙政、佟佩华、王昌燧《鲁北地区商周时期的海盐业》。
五、农业考古研究栾丰实《海岱地区史前时期稻作农业的产生、发展和扩散》（《文史哲》2005年第6期）认为，地处黄淮下游的海岱地区，新石器时代偏早时期是以种植粟类作物为主的旱作农业区。随着与南方地区文化交流的增强，至迟在北辛文化时期，稻作农业已传入海岱地区，然后循着东、西两路由南向北不断地扩散和发展。到龙山文化时期，海岱地区的南部和东部沿海一带，已经形成了一定规模的稻作农业经济。以东部沿海地区为基点，稻作农业还渡海传播，扩散到了辽东半岛和朝鲜半岛地区，并进一步向日本列岛扩散和发展。其他成果有：李锦山《考古资料反映的农业气象及雷雨诸神崇拜——兼论古代的祈雨巫术》，林正同《从画像砖、石看汉代农业经济特点》，石敬东《山东枣庄出土的铁农具》，靳桂云《海岱地区史前稻作农业研究的回顾与展望》，李春华《山东史前农业考古研究的几个问题》，何德亮《山东新石器时代农业试论》。
六、聚落考古研究区域系统调查（RegionalSystematicSurvey），又称为“全覆盖式调查”（Full-CoverageSurvey），是以聚落形态研究为目的的考古调查方法。最早出现于20世纪40年代的美洲，随后在世界范围内推广开来。受其影响，中国学者于20世纪90年代初期开始在小范围尝试这一调查方法，并取得一定成功。20世纪90年代中期后，中国高校和研究机构通过与外国同行合作，先后在山东日照、河南巩义等地开展了规模大小不一的区域系统调查，发表了阶段性成果，初步显示了这种调查方法在中国考古实践中所具有的发展潜力。
主要成果有：栾丰实《关于聚落考古学研究中的共时性问题》，王建华《聚落考古综述》，方辉《山东日照地区系统考古调查的新收获》《对区域系统调查方法的认识与思考》《日照地区聚落考古：人口问题》等。