1996—2005年，山东宋元明清史研究成果数量明显增加，成果质量不断提升。
著作方面，江晓涛、李晓《中国政治通史（宋辽金卷）》（泰山出版社2003年版）系统介绍了辽宋金元时代、真宗时期内外政策的调整、金朝崛起与辽北宋的相继灭亡、南宋的建立与偏安政局的形成、南宋的灭亡等过程。其他成果还有：陈尚胜《“怀夷”与“抑商”：明代海洋力量兴衰研究》《朝鲜王朝（1392—1910）对华观的演变》，郭学信《宋代士大夫文化品格与心态》《嬗变与定型：宋代社会文化形态研究》，朱亚非《明清史论稿》《中国政治通史·明代卷》《齐鲁文化通史·明清卷》，晁中辰《崇祯传》《中国改革通史·明代卷》《李自成大传》《明代海禁与海外贸易》，李晓《宋代工商业经济与政府干预研究》，李绍强《明清工商业形态研究》，张友臣《中华名人轶事·宋元卷》，李云泉《朝贡制度史论——中国古代对外关系体制研究》，马斗成《宋代眉山苏氏家族研究》等。
论文方面，学者转换研究视角，拓展思路，推出一批学术水准较高的成果。
（1）政治、军事史研究。主要成果有：赵文坦《元代刑法轻重考辨》（《中国史研究》1999年第2期）通过细致对比唐、宋、元朝的律条，考证出元朝刑法不仅轻于宋代刑法，而且轻于唐代刑法，并分析了元朝实行轻刑政策的原因。其他成果还有：江心力《明朝内阁官僚群体形成因素析论》，刘广新《清代济宁“河道总督衙门”》，李晓《西夏的和亲政策》《论均输法》，赵文坦《忽必烈早期与汉族士人关系考察》《元武宗改皇储事件发微》，林永光《张居正改革新论》，白品海《论明代监察制度对皇权与相权的制约》，周祚绍《〈恰克图条约〉谈判中的清朝使臣》，孟天运《王安石变法中的失误原因探析》，范学辉《论北宋的封桩缺额禁军钱制度》《北宋三衙的地位、待遇及其政治作用》《论北宋制衡三衙的相关措施》《募兵制度与北宋的“百年无事”》《北宋三衙管军素质状况的动态考察》《宋太祖朝的翰林学士》，晁中辰《崇祯帝“君非甚暗”透析》《明末大饥荒实因人祸考》《雍正朝的密折制度》《“仁宣之治”还是“永宣之治”》《论建文新政》《明初政策的消极倾向》《明朝皇帝的崇道之风》，傅礼白《北宋审官院与宰相的人事权》《康雍乾时期的奏折制度》《宋代枢密院的失势与军事决策权的转移》《宋朝的章奏制度与政治决策》，陈长征《北宋中央控驭地方的派出机构——路》，王世农《台谏、舆论与北宋改革的命运》，崔明德《辽朝和亲初探》，林威《金末契丹人附蒙反金现象初探》，张松梅《试论明初的军饷供应》，陈元锋《宋代馆职的名实与职任》，郑军《明清鼎革与中国古代科学近代化进程的中断》，杨昆《宋真宗与北宋兴衰》。
（2）经济、社会、外交史研究。主要成果有：陈尚胜《论明朝月港开放的局限性》《明朝初期与朝鲜海上交通考》《明清时代的朝鲜使节与中国记闻——兼论〈朝天录〉和〈燕行录〉的资料价值》《“闭关”或“开放”类型分析的局限性——近20年清朝前期海外贸易政策研究述评》《明与清前期海外贸易政策比较——从万明〈中国融入世界的步履〉一书谈起》《郑和下西洋与东南亚华夷秩序的构建——兼论明朝是否向东南亚扩张问题》，朱亚非、刘文涛《东西方经济文化交流的枢纽与门户——论16—18世纪澳门的历史地位》，丁煜《明末的饥荒》，陈尚胜《中国传统文化与郑和下西洋》，孙竞昊《明清江南商品经济与分配结构关系探析》《明清江南商人资本市场结构与功能初探──兼析该地区货币财富形态的品性》，张熙惟《宋代商品经营资本的发展及其历史地位》，赵华宇《山东青州的赛典赤·赡思丁后裔》，李绍强的《试论明代盐商中的囤户》《论明清时期的铁业政策》《论明代官私工商业经济的演变》，乔幼梅《金代的畜牧业》，于云汉《略论北宋时代的城市分布》《北宋城市密度分析》，郭济生《一段被遗忘的中朝交往关系史》，仝鲁闽《北宋熙丰变法时期货币政策探微》《宋元时期有关货币本质问题的认识及其深化》，赵文坦《〈元史·刘黑马传〉“七万户”蠡测》，何成、王育济《宋代王审琦家族兴盛原因述论》，刘菊湘《西夏都城迁移的地理因素》《明代宁夏镇生态恶化》，何成《明清新城王氏家族兴盛原因述论》，张其凤《刘墉家族与赵翼交游考》，时晓红《明代的中日勘合贸易与倭寇》，朱帮全、赵文坦《蒙古国时汉人世侯与蒙廷、燕京行台、达鲁花赤的关系》，郭学信《试论商品经济对宋代社会风气的影响》，刘慧、陶莉《关于宋代的泰山香会》，王继训《清代学田个案研究：广东学田》，贾海彦《明代资本主义萌芽的新制度经济学解释》，杨泽忠、周海银《利玛窦与坤舆万国全图》，李晓、姜雪燕《宋朝政府购买预算的基本形式》《宋朝政府购买资金的调拨方式》，刘新利《对耕者有其田与耕者有其权的新探讨——清康雍乾山东与德国巴伐里亚农村土地状况的比较》，刘平《明清“邪教”传教手段剖析》，王静芳《浅析康熙朝晚期禁海的原因》，蒋秀丽《析吴铤的均田论》。
（3）思想文化史研究。主要成果有：刘宗贤《宋初学术的文化整合倾向》，郑杰文《〈战国策〉在北宋时期的整理和流传》，郭学信《时代迁易与宋代士大夫的观念转变》，常大群《元初东平府学的兴盛及其原因》，吴士英《论清代中朝文化交流的特点》，马斗成《宋代眉山苏氏家法试探》，孙之梅《归有光与明清之际的学风转变》，于瑞桓《乾嘉朴学的缘起及启蒙意义》，李为香《明末民间宗教发展原因探析》《论乾嘉学者与藏书家、书院及江南学风之间的关系》，曲金良《戚继光与中国海洋历史文化遗产——兼及历史文化遗产的开发与保护》，成积春《从“皇天眷佑”到“天命靡常”——论努尔哈赤与皇太极天命思想的演变》，马学强、赵树廷《清代山东书院的发展研究》，杨泽忠《徐光启为什么不续译〈几何原本〉后九卷》等。（4）关于人物、书评、考证研究。主要成果有：周祚绍《论于谦之死》，江华《论岳飞、文天祥的人生悲剧》，刘国宾《渤海亡国年月辨正——辽初王权斗争驳论之三兼与金正善商榷》，贺宜《马国翰与〈玉函山房藏书簿录〉》，陈尚胜《读吴仁安〈明清江南望族与社会经济文化〉》，葛焕礼《士建中生平及思想考述》，王德朋《论刘祁〈归潜志〉的史料价值》，陈汝洁《李森文〈赵执信年谱〉补遗》，马斗成《三苏与诸葛亮》，谭世宝《对伯希和“Macao说”误译误批之解析》。
第三节 宋元明清史研究
1996—2005年，山东宋元明清史研究成果数量明显增加，成果质量不断提升。
著作方面，江晓涛、李晓《中国政治通史（宋辽金卷）》（泰山出版社2003年版）系统介绍了辽宋金元时代、真宗时期内外政策的调整、金朝崛起与辽北宋的相继灭亡、南宋的建立与偏安政局的形成、南宋的灭亡等过程。其他成果还有：陈尚胜《“怀夷”与“抑商”：明代海洋力量兴衰研究》《朝鲜王朝（1392—1910）对华观的演变》，郭学信《宋代士大夫文化品格与心态》《嬗变与定型：宋代社会文化形态研究》，朱亚非《明清史论稿》《中国政治通史·明代卷》《齐鲁文化通史·明清卷》，晁中辰《崇祯传》《中国改革通史·明代卷》《李自成大传》《明代海禁与海外贸易》，李晓《宋代工商业经济与政府干预研究》，李绍强《明清工商业形态研究》，张友臣《中华名人轶事·宋元卷》，李云泉《朝贡制度史论——中国古代对外关系体制研究》，马斗成《宋代眉山苏氏家族研究》等。
论文方面，学者转换研究视角，拓展思路，推出一批学术水准较高的成果。
（1）政治、军事史研究。主要成果有：赵文坦《元代刑法轻重考辨》（《中国史研究》1999年第2期）通过细致对比唐、宋、元朝的律条，考证出元朝刑法不仅轻于宋代刑法，而且轻于唐代刑法，并分析了元朝实行轻刑政策的原因。其他成果还有：江心力《明朝内阁官僚群体形成因素析论》，刘广新《清代济宁“河道总督衙门”》，李晓《西夏的和亲政策》《论均输法》，赵文坦《忽必烈早期与汉族士人关系考察》《元武宗改皇储事件发微》，林永光《张居正改革新论》，白品海《论明代监察制度对皇权与相权的制约》，周祚绍《〈恰克图条约〉谈判中的清朝使臣》，孟天运《王安石变法中的失误原因探析》，范学辉《论北宋的封桩缺额禁军钱制度》《北宋三衙的地位、待遇及其政治作用》《论北宋制衡三衙的相关措施》《募兵制度与北宋的“百年无事”》《北宋三衙管军素质状况的动态考察》《宋太祖朝的翰林学士》，晁中辰《崇祯帝“君非甚暗”透析》《明末大饥荒实因人祸考》《雍正朝的密折制度》《“仁宣之治”还是“永宣之治”》《论建文新政》《明初政策的消极倾向》《明朝皇帝的崇道之风》，傅礼白《北宋审官院与宰相的人事权》《康雍乾时期的奏折制度》《宋代枢密院的失势与军事决策权的转移》《宋朝的章奏制度与政治决策》，陈长征《北宋中央控驭地方的派出机构——路》，王世农《台谏、舆论与北宋改革的命运》，崔明德《辽朝和亲初探》，林威《金末契丹人附蒙反金现象初探》，张松梅《试论明初的军饷供应》，陈元锋《宋代馆职的名实与职任》，郑军《明清鼎革与中国古代科学近代化进程的中断》，杨昆《宋真宗与北宋兴衰》。
（2）经济、社会、外交史研究。主要成果有：陈尚胜《论明朝月港开放的局限性》《明朝初期与朝鲜海上交通考》《明清时代的朝鲜使节与中国记闻——兼论〈朝天录〉和〈燕行录〉的资料价值》《“闭关”或“开放”类型分析的局限性——近20年清朝前期海外贸易政策研究述评》《明与清前期海外贸易政策比较——从万明〈中国融入世界的步履〉一书谈起》《郑和下西洋与东南亚华夷秩序的构建——兼论明朝是否向东南亚扩张问题》，朱亚非、刘文涛《东西方经济文化交流的枢纽与门户——论16—18世纪澳门的历史地位》，丁煜《明末的饥荒》，陈尚胜《中国传统文化与郑和下西洋》，孙竞昊《明清江南商品经济与分配结构关系探析》《明清江南商人资本市场结构与功能初探──兼析该地区货币财富形态的品性》，张熙惟《宋代商品经营资本的发展及其历史地位》，赵华宇《山东青州的赛典赤·赡思丁后裔》，李绍强的《试论明代盐商中的囤户》《论明清时期的铁业政策》《论明代官私工商业经济的演变》，乔幼梅《金代的畜牧业》，于云汉《略论北宋时代的城市分布》《北宋城市密度分析》，郭济生《一段被遗忘的中朝交往关系史》，仝鲁闽《北宋熙丰变法时期货币政策探微》《宋元时期有关货币本质问题的认识及其深化》，赵文坦《〈元史·刘黑马传〉“七万户”蠡测》，何成、王育济《宋代王审琦家族兴盛原因述论》，刘菊湘《西夏都城迁移的地理因素》《明代宁夏镇生态恶化》，何成《明清新城王氏家族兴盛原因述论》，张其凤《刘墉家族与赵翼交游考》，时晓红《明代的中日勘合贸易与倭寇》，朱帮全、赵文坦《蒙古国时汉人世侯与蒙廷、燕京行台、达鲁花赤的关系》，郭学信《试论商品经济对宋代社会风气的影响》，刘慧、陶莉《关于宋代的泰山香会》，王继训《清代学田个案研究：广东学田》，贾海彦《明代资本主义萌芽的新制度经济学解释》，杨泽忠、周海银《利玛窦与坤舆万国全图》，李晓、姜雪燕《宋朝政府购买预算的基本形式》《宋朝政府购买资金的调拨方式》，刘新利《对耕者有其田与耕者有其权的新探讨——清康雍乾山东与德国巴伐里亚农村土地状况的比较》，刘平《明清“邪教”传教手段剖析》，王静芳《浅析康熙朝晚期禁海的原因》，蒋秀丽《析吴铤的均田论》。
（3）思想文化史研究。主要成果有：刘宗贤《宋初学术的文化整合倾向》，郑杰文《〈战国策〉在北宋时期的整理和流传》，郭学信《时代迁易与宋代士大夫的观念转变》，常大群《元初东平府学的兴盛及其原因》，吴士英《论清代中朝文化交流的特点》，马斗成《宋代眉山苏氏家法试探》，孙之梅《归有光与明清之际的学风转变》，于瑞桓《乾嘉朴学的缘起及启蒙意义》，李为香《明末民间宗教发展原因探析》《论乾嘉学者与藏书家、书院及江南学风之间的关系》，曲金良《戚继光与中国海洋历史文化遗产——兼及历史文化遗产的开发与保护》，成积春《从“皇天眷佑”到“天命靡常”——论努尔哈赤与皇太极天命思想的演变》，马学强、赵树廷《清代山东书院的发展研究》，杨泽忠《徐光启为什么不续译〈几何原本〉后九卷》等。（4）关于人物、书评、考证研究。主要成果有：周祚绍《论于谦之死》，江华《论岳飞、文天祥的人生悲剧》，刘国宾《渤海亡国年月辨正——辽初王权斗争驳论之三兼与金正善商榷》，贺宜《马国翰与〈玉函山房藏书簿录〉》，陈尚胜《读吴仁安〈明清江南望族与社会经济文化〉》，葛焕礼《士建中生平及思想考述》，王德朋《论刘祁〈归潜志〉的史料价值》，陈汝洁《李森文〈赵执信年谱〉补遗》，马斗成《三苏与诸葛亮》，谭世宝《对伯希和“Macao说”误译误批之解析》。