一、棉花
20世纪80年代中期以后，山东棉区棉花枯萎病、黄萎病蔓延迅速，对棉花生产造成严重威胁。抗病品种选育成为棉花育种领域的首要任务。该阶段山东棉花品种选育的主攻方向是在高产、优质的基础上，增强抗病性、提高早熟性，以满足大面积病区以及棉麦两熟改制对抗病、早熟棉花品种的需求。20世纪90年代初，抗枯萎病、耐黄萎病品种鲁棉9号、鲁棉10号、鲁棉11号通过山东省审定。鲁棉9号、鲁棉10号分别是山东省审定的第一个春套棉和夏套棉品种，取代了不抗病品种鲁棉6号等，实现了全省棉花品种的第五次大更换。
1992年后，棉铃虫在全国黄淮流域棉区持续特大爆发，山东植棉面积迅速大幅下滑，从1992年的2233.5万亩锐减到1999年的549万亩。以山东棉花研究中心为主的山东棉花育种科研团队，及时调整育种方向，利用转BT基因抗虫棉种质材料进行转基因抗虫棉新品种选育攻关。2000年，山东省第一个国产转BT基因抗虫棉品种GK-12通过山东省农作物品种审定委员会审定；2001年，综合性状优良的转BT基因杂交抗虫棉鲁棉研15号和常规抗虫棉鲁棉研16号通过山东省农作物品种审定委员会审定，在全省迅速推广。随后，山东棉花研究中心在转BT基因育种研究领域取得突破性进展，至2005年，连续育成鲁棉研17号至鲁棉研25号常规抗虫棉、杂交抗虫棉、短季抗虫棉三大类型9个转基因抗虫棉品种，这些品种普遍具有长势强、产量潜力大，抗病性、稳产性较好，更适宜本地种植等特点，迅速取代美棉成为山东乃至黄河流域棉区的主栽品种。“鲁棉研”系列抗虫棉新品种一度覆盖山东棉田面积的70%以上，成为山东棉农抗虫棉品种的首选品牌。
1979—1983年，省农科院试验农场完成棉花新品种鲁棉6号的研究。该项目选育出的鲁棉6号由系统选种法育成，具有品质、产量较稳定的特点，是适宜纺织业和农业生产需求的优质、高产棉花新品种。1986年，鲁棉6号被定为省棉花品种区试对照种，是山东棉花生产的主要品种。1987年获省科技进步一等奖。
1981—1990年，省棉花研究所（1985年改为省棉花研究中心）完成麦套春棉新品种鲁棉9号的研究。该项目选育的新品种鲁棉9号是山东省审定的第一个麦套棉新品种，具有早熟、丰产、优质、纤维品质优良等特点，促进了全省麦棉两熟制的发展。1995年获省科技进步二等奖。
1983—1985年，省棉花研究所完成优质棉纤维新品种鲁棉2号的研究。
该项目选育的新品种鲁棉2号主要改进了纤维品质，产量、品质优于鲁棉1号。1986年获省科技进步二等奖。
二、花生
花生是山东省重要的出口创汇农产品之一，种植面积和产量均居全国首位，是农民增收的支柱产业。
1991—2005年，全省选育并审定丰花1-4号、丰花6号、潍花3号、潍花6-8号、鲁花11-15号、花育16-17号、花育19号、79266、8130、双纪2号等花生新品种。省花生研究所选育的花育37号、鲁花9号、鲁花14号、花育16号等花生新品种，在国内外相继突破亩产500公斤、700公斤纪录，达到国内外单产最高水平。
1979—1989年，省花生研究所完成辐射创造花生新的种质资源及其利用的研究。该项目利用辐射诱变的方法，在材料、剂量、方法等方面进行系统的研究，创造保存了226份在质量、抗性、熟性具有优异特性的新品种资源，利用突变体组合选育出三个新品系，并在生产上应用。1990年获省科技进步一等奖。
1978—1992年，省花生研究所完成早熟高产、优质、大花生新品种鲁花9号的选育及推广研究。该项目选育的鲁花9号于1990年被国家科委列入国家科技成果重点推广计划，定为国家级推广品种，表现为早熟、高产、优质、抗病、适应性广等特点。1993年获省科技进步一等奖。
1981年5月—1997年11月，省花生研究所完成高产、优质、抗性强传统出口大花生新品种8130的选育与推广研究。该项目选育的新品种8130是一个将高产、优质、抗病、耐重茬和适应性广等融为一体，既符合中国传统出口大花生品种要求又适宜生产需要的优良品种，属传统出口大花生品种的首创。1998年获省科技进步二等奖。
1983年1月—2001年12月，省花生研究所完成早熟高产大花生新品种鲁花14号的选育与应用研究。该品种经复合杂交连续定向选择育成，具有高产、早熟、优质、矮壮、抗性强、适应性广的特点。通过系统研究其生育动态和高产栽培规律，实现了良种、良法配套，成为国内花生主要推广品种。1995年和1996年通过山东省和河北省农作物品种审定委员会审定命名，2000年通过国家审定。2002年获省科技进步一等奖。
1988—1992年，省花生研究所完成生物技术在花生种质创新中的应用研究。该项目是国内外首先应用外源DNA导入等生物技术创造出的一批珍贵的花生种质和品系，同时提出一套行之有效的花生育种新技术，丰富和发展了花生育种学，特别是利用果针离休培养技术克服了花生种间杂交胚败育的障碍，解决了国内外花生育种界长期未能解决的一大难题。1993年获省科技进步二等奖。
1988—1994年，莱阳农学院完成花生基因工程的研究。该项目首次利用野生型和改造型的Ti质粒为载体，成功地将目的基因转移到花生受体上，这一转化系统的建立为定向进行花生品种的遗传改良打下了基础。首次构建了优良花生品种徐州68-4的核基因文库，为保存和从分子水平上研究并加以开发利用花生的优良基因打下了基础，具有很重要的学术和应用价值。
1995年获省科技进步二等奖。
1991年8月—1995年12月，莱阳农学院完成高产优质花生新品种鲁花11号的研究。该项目育成的鲁花11号籽仁产量比高产型花生品种海花1号增产10%以上，是中国继海花1号之后新选育出的又一个突破性的高产优良品种，属亚油酸含量较低的优质高产新品种，解决了这一类型高产与高比值的矛盾，且综合性状优异，成为国内花生产区的主要推广品种。1998年获省科技进步一等奖。
三、蔬菜
山东省在蔬菜育种领域以“优质专用、提高抗性、类型多样”为育种方向，采取常规育种技术和生物技术相结合的育种方法，主攻大白菜、萝卜、马铃薯、西红柿、茄子、辣椒、黄瓜、甜瓜、大葱、菜豆等山东名产蔬菜品种和设施蔬菜专用品种选育，开展马铃薯、大蒜、草莓脱毒快繁技术、转基因蔬菜高新技术研究以及珍稀食用菌品种选育。
20世纪80年代起，省农科院蔬菜研究所通过对蔬菜种质资源的收集、评价、创新和利用，开展了大白菜、萝卜自交不亲和系、雄性不育系选育，大葱雄性不育系、保持系、自交系选育和配合力测定研究，大蒜辐射育种、有性杂交育种及大蒜杂交胚组织培养抢救技术及茎尖脱毒技术研究；利用多种优异种质，建立了大白菜小孢子培养、黄瓜大孢子培养、胚培养快速获得优良纯系等细胞工程技术体系；利用有性杂交结合幼胚拯救技术开展了重要蔬菜远缘杂交研究，获得了白菜与萝卜的属间杂种等多种新种质；成功克隆多个关键基因并进行了遗传转化；建立了大白菜、甜瓜、西红柿等主要蔬菜的再生体系和遗传转化体系，获得部分转基因工程植株。全省共育成大白菜、萝卜、黄瓜、马铃薯、大葱、大蒜等蔬菜新品种51个。
1963—1984年，青岛市农科所完成早熟西红柿“青岛早红”的选育与推广研究。该项目研究成果“青岛早红”西红柿属有限生长类型，植株矮小，适于密植；品种早熟、丰产、品质好、生育期短、坐果率高、果实大红、采收期集中；品种抗逆性较强，比较耐热、抗毒素病，成为青岛、哈尔滨、沈阳等地早春露地和保护地栽培的主要品种。1986年获省科技进步二等奖。
1976年8月—2002年9月，莱州市农科院蔬菜种苗研究所等单位完成大白菜自交不亲和系石特79-3和京90-1的选育与利用研究。该项目育成的石特79-3和京90-1大白菜不亲和系，抗病、丰产、适应性广，以其为骨干亲本系，先后育成推广了20多个F1品种。石特79-3是国内首次育成并广泛应用的黄籽大白菜不亲和系，该品种与配套栽培技术相结合，创造了国内大白菜良种推广的高速度，形成了全国大白菜F1品种育、繁、经营量最大的科技企业。2003年获省科技进步一等奖。
1983—1994年，省农科院蔬菜研究所完成耐热、抗病、丰产黄瓜新品种鲁黄瓜2号和鲁秋1号的研究。该项目育成的鲁黄瓜2号、鲁秋1号黄瓜新品种耐热、抗病、丰产，成为山东省夏秋黄瓜的主栽品种之一。1995年获省科技进步二等奖。
1991年1月—1998年10月，山东农业大学完成大蒜品种资源研究及其利用的研究。该项目选育出的早苔蒜2号大蒜品种适合于早熟蒜薹生产。该项目建立了大蒜系统分类和生态型分类体系，明确了大蒜主栽品种的生理特性，形成了完整的大蒜花药培养体系，为利用大蒜花药培养产生新种质奠定了基础。1999年获省科技进步二等奖。
1993年1月—1995年12月，山东师范大学完成山东野生蔬菜资源调查及开发利用研究。该项目在调查研究的基础上，对荠菜、苋菜、山莴苣等主要种类在海阳、高青、沂南、昌乐等地进行了引种驯化栽培试验，总结了一套成熟的栽培技术和经验。1997年获省科技进步二等奖。
1995年9月—1999年12月，省芦笋研究开发推广中心完成全雄芦笋新品种的培育研究。该研究将全雄育种技术成功地运用到芦笋育种中，研究出的配套技术措施，解决了育种上的技术难题，育成了全雄芦笋新品系97-2，对促进国内芦笋育种研究的发展及全雄新品种的选育具有十分重要的意义。
2001年获省科技进步二等奖。
1996年1月—2004年12月，潍坊市农科院完成潍白系列大白菜新品种的选育与推广研究。该项目是潍坊市农业良种产业化项目，采用先进的杂交育种技术，探索出了一套行之有效的大白菜育种手段，并选育出了一批具有不同价值的新种质资源。育成了春大白菜新品种潍春白2号、夏大白菜新品种潍白45、早秋大白菜新品种潍白6号。2005年获省科技进步二等奖。
第二节 经济作物选育技术
一、棉花
20世纪80年代中期以后，山东棉区棉花枯萎病、黄萎病蔓延迅速，对棉花生产造成严重威胁。抗病品种选育成为棉花育种领域的首要任务。该阶段山东棉花品种选育的主攻方向是在高产、优质的基础上，增强抗病性、提高早熟性，以满足大面积病区以及棉麦两熟改制对抗病、早熟棉花品种的需求。20世纪90年代初，抗枯萎病、耐黄萎病品种鲁棉9号、鲁棉10号、鲁棉11号通过山东省审定。鲁棉9号、鲁棉10号分别是山东省审定的第一个春套棉和夏套棉品种，取代了不抗病品种鲁棉6号等，实现了全省棉花品种的第五次大更换。
1992年后，棉铃虫在全国黄淮流域棉区持续特大爆发，山东植棉面积迅速大幅下滑，从1992年的2233.5万亩锐减到1999年的549万亩。以山东棉花研究中心为主的山东棉花育种科研团队，及时调整育种方向，利用转BT基因抗虫棉种质材料进行转基因抗虫棉新品种选育攻关。2000年，山东省第一个国产转BT基因抗虫棉品种GK-12通过山东省农作物品种审定委员会审定；2001年，综合性状优良的转BT基因杂交抗虫棉鲁棉研15号和常规抗虫棉鲁棉研16号通过山东省农作物品种审定委员会审定，在全省迅速推广。随后，山东棉花研究中心在转BT基因育种研究领域取得突破性进展，至2005年，连续育成鲁棉研17号至鲁棉研25号常规抗虫棉、杂交抗虫棉、短季抗虫棉三大类型9个转基因抗虫棉品种，这些品种普遍具有长势强、产量潜力大，抗病性、稳产性较好，更适宜本地种植等特点，迅速取代美棉成为山东乃至黄河流域棉区的主栽品种。“鲁棉研”系列抗虫棉新品种一度覆盖山东棉田面积的70%以上，成为山东棉农抗虫棉品种的首选品牌。
1979—1983年，省农科院试验农场完成棉花新品种鲁棉6号的研究。该项目选育出的鲁棉6号由系统选种法育成，具有品质、产量较稳定的特点，是适宜纺织业和农业生产需求的优质、高产棉花新品种。1986年，鲁棉6号被定为省棉花品种区试对照种，是山东棉花生产的主要品种。1987年获省科技进步一等奖。
1981—1990年，省棉花研究所（1985年改为省棉花研究中心）完成麦套春棉新品种鲁棉9号的研究。该项目选育的新品种鲁棉9号是山东省审定的第一个麦套棉新品种，具有早熟、丰产、优质、纤维品质优良等特点，促进了全省麦棉两熟制的发展。1995年获省科技进步二等奖。
1983—1985年，省棉花研究所完成优质棉纤维新品种鲁棉2号的研究。
该项目选育的新品种鲁棉2号主要改进了纤维品质，产量、品质优于鲁棉1号。1986年获省科技进步二等奖。
二、花生
花生是山东省重要的出口创汇农产品之一，种植面积和产量均居全国首位，是农民增收的支柱产业。
1991—2005年，全省选育并审定丰花1-4号、丰花6号、潍花3号、潍花6-8号、鲁花11-15号、花育16-17号、花育19号、79266、8130、双纪2号等花生新品种。省花生研究所选育的花育37号、鲁花9号、鲁花14号、花育16号等花生新品种，在国内外相继突破亩产500公斤、700公斤纪录，达到国内外单产最高水平。
1979—1989年，省花生研究所完成辐射创造花生新的种质资源及其利用的研究。该项目利用辐射诱变的方法，在材料、剂量、方法等方面进行系统的研究，创造保存了226份在质量、抗性、熟性具有优异特性的新品种资源，利用突变体组合选育出三个新品系，并在生产上应用。1990年获省科技进步一等奖。
1978—1992年，省花生研究所完成早熟高产、优质、大花生新品种鲁花9号的选育及推广研究。该项目选育的鲁花9号于1990年被国家科委列入国家科技成果重点推广计划，定为国家级推广品种，表现为早熟、高产、优质、抗病、适应性广等特点。1993年获省科技进步一等奖。
1981年5月—1997年11月，省花生研究所完成高产、优质、抗性强传统出口大花生新品种8130的选育与推广研究。该项目选育的新品种8130是一个将高产、优质、抗病、耐重茬和适应性广等融为一体，既符合中国传统出口大花生品种要求又适宜生产需要的优良品种，属传统出口大花生品种的首创。1998年获省科技进步二等奖。
1983年1月—2001年12月，省花生研究所完成早熟高产大花生新品种鲁花14号的选育与应用研究。该品种经复合杂交连续定向选择育成，具有高产、早熟、优质、矮壮、抗性强、适应性广的特点。通过系统研究其生育动态和高产栽培规律，实现了良种、良法配套，成为国内花生主要推广品种。1995年和1996年通过山东省和河北省农作物品种审定委员会审定命名，2000年通过国家审定。2002年获省科技进步一等奖。
1988—1992年，省花生研究所完成生物技术在花生种质创新中的应用研究。该项目是国内外首先应用外源DNA导入等生物技术创造出的一批珍贵的花生种质和品系，同时提出一套行之有效的花生育种新技术，丰富和发展了花生育种学，特别是利用果针离休培养技术克服了花生种间杂交胚败育的障碍，解决了国内外花生育种界长期未能解决的一大难题。1993年获省科技进步二等奖。
1988—1994年，莱阳农学院完成花生基因工程的研究。该项目首次利用野生型和改造型的Ti质粒为载体，成功地将目的基因转移到花生受体上，这一转化系统的建立为定向进行花生品种的遗传改良打下了基础。首次构建了优良花生品种徐州68-4的核基因文库，为保存和从分子水平上研究并加以开发利用花生的优良基因打下了基础，具有很重要的学术和应用价值。
1995年获省科技进步二等奖。
1991年8月—1995年12月，莱阳农学院完成高产优质花生新品种鲁花11号的研究。该项目育成的鲁花11号籽仁产量比高产型花生品种海花1号增产10%以上，是中国继海花1号之后新选育出的又一个突破性的高产优良品种，属亚油酸含量较低的优质高产新品种，解决了这一类型高产与高比值的矛盾，且综合性状优异，成为国内花生产区的主要推广品种。1998年获省科技进步一等奖。
三、蔬菜
山东省在蔬菜育种领域以“优质专用、提高抗性、类型多样”为育种方向，采取常规育种技术和生物技术相结合的育种方法，主攻大白菜、萝卜、马铃薯、西红柿、茄子、辣椒、黄瓜、甜瓜、大葱、菜豆等山东名产蔬菜品种和设施蔬菜专用品种选育，开展马铃薯、大蒜、草莓脱毒快繁技术、转基因蔬菜高新技术研究以及珍稀食用菌品种选育。
20世纪80年代起，省农科院蔬菜研究所通过对蔬菜种质资源的收集、评价、创新和利用，开展了大白菜、萝卜自交不亲和系、雄性不育系选育，大葱雄性不育系、保持系、自交系选育和配合力测定研究，大蒜辐射育种、有性杂交育种及大蒜杂交胚组织培养抢救技术及茎尖脱毒技术研究；利用多种优异种质，建立了大白菜小孢子培养、黄瓜大孢子培养、胚培养快速获得优良纯系等细胞工程技术体系；利用有性杂交结合幼胚拯救技术开展了重要蔬菜远缘杂交研究，获得了白菜与萝卜的属间杂种等多种新种质；成功克隆多个关键基因并进行了遗传转化；建立了大白菜、甜瓜、西红柿等主要蔬菜的再生体系和遗传转化体系，获得部分转基因工程植株。全省共育成大白菜、萝卜、黄瓜、马铃薯、大葱、大蒜等蔬菜新品种51个。
1963—1984年，青岛市农科所完成早熟西红柿“青岛早红”的选育与推广研究。该项目研究成果“青岛早红”西红柿属有限生长类型，植株矮小，适于密植；品种早熟、丰产、品质好、生育期短、坐果率高、果实大红、采收期集中；品种抗逆性较强，比较耐热、抗毒素病，成为青岛、哈尔滨、沈阳等地早春露地和保护地栽培的主要品种。1986年获省科技进步二等奖。
1976年8月—2002年9月，莱州市农科院蔬菜种苗研究所等单位完成大白菜自交不亲和系石特79-3和京90-1的选育与利用研究。该项目育成的石特79-3和京90-1大白菜不亲和系，抗病、丰产、适应性广，以其为骨干亲本系，先后育成推广了20多个F1品种。石特79-3是国内首次育成并广泛应用的黄籽大白菜不亲和系，该品种与配套栽培技术相结合，创造了国内大白菜良种推广的高速度，形成了全国大白菜F1品种育、繁、经营量最大的科技企业。2003年获省科技进步一等奖。
1983—1994年，省农科院蔬菜研究所完成耐热、抗病、丰产黄瓜新品种鲁黄瓜2号和鲁秋1号的研究。该项目育成的鲁黄瓜2号、鲁秋1号黄瓜新品种耐热、抗病、丰产，成为山东省夏秋黄瓜的主栽品种之一。1995年获省科技进步二等奖。
1991年1月—1998年10月，山东农业大学完成大蒜品种资源研究及其利用的研究。该项目选育出的早苔蒜2号大蒜品种适合于早熟蒜薹生产。该项目建立了大蒜系统分类和生态型分类体系，明确了大蒜主栽品种的生理特性，形成了完整的大蒜花药培养体系，为利用大蒜花药培养产生新种质奠定了基础。1999年获省科技进步二等奖。
1993年1月—1995年12月，山东师范大学完成山东野生蔬菜资源调查及开发利用研究。该项目在调查研究的基础上，对荠菜、苋菜、山莴苣等主要种类在海阳、高青、沂南、昌乐等地进行了引种驯化栽培试验，总结了一套成熟的栽培技术和经验。1997年获省科技进步二等奖。
1995年9月—1999年12月，省芦笋研究开发推广中心完成全雄芦笋新品种的培育研究。该研究将全雄育种技术成功地运用到芦笋育种中，研究出的配套技术措施，解决了育种上的技术难题，育成了全雄芦笋新品系97-2，对促进国内芦笋育种研究的发展及全雄新品种的选育具有十分重要的意义。
2001年获省科技进步二等奖。
1996年1月—2004年12月，潍坊市农科院完成潍白系列大白菜新品种的选育与推广研究。该项目是潍坊市农业良种产业化项目，采用先进的杂交育种技术，探索出了一套行之有效的大白菜育种手段，并选育出了一批具有不同价值的新种质资源。育成了春大白菜新品种潍春白2号、夏大白菜新品种潍白45、早秋大白菜新品种潍白6号。2005年获省科技进步二等奖。