1985年9月—2004年11月，莱阳农学院刘润进、郭绍霞，中国科学院李敏等开展中国丛枝菌根研究，对国内AM真菌进行系统研究，从各生态系统中共分离到AM真菌6属98种；首次分析龙脑香科植物对其根围AM真菌种属分布和物种多样性的影响；证实了AM真菌能提高落叶果树的抗旱性；在国际上首次发现AM真菌丛枝发育数量与其提高棉花的抗病性呈正相关关系；提出AM真菌诱导植物抗病性的理论；建立新的快速测定AM真菌接种势和侵染势的计算公式。2005年获省自然科学一等奖。
1985—1989年，山东师范大学严芝学等开展山东昆虫病毒资源与调查研究，共采集、分离、鉴定30余种昆虫病毒，数量居全国首位。1986年，严芝学出版《中国昆虫病毒图谱》（中国科学技术出版社出版），报道了银纹夜蛾、褐边青刺蛾、红缘灯蛾三种核型多角体病毒资料。1990年，发表论文《山东林果害虫病毒研究初报》，报道了10种病毒，其中有6种是国内外首次报道。
1985—1990年，山东大学高培基、曲音波、王祖农等开展纤维素酶系酶解机制和活力测定方法研究。采用最先进的实验手段，对微生物纤维素酶进行全面系统的分离、纯化，获得3种纯化酶；进行酶促反应动力学及酶组分的协同作用研究，首创了定量分析纤维素酶各组分协同效应的研究方法。
1991年获省科技进步二等奖。
1990年，山东大学江伯英等开展耐温抗盐黄原胶研制，通过菌种诱变得到一株耐高温的黄原胶菌株，并采用PS环流反应器技术，在30吨罐上进行生产，产品主要性能———耐温抗盐性达到国际领先水平。
1996年，山东师范大学张长铠等在蒙山采得一簇虫草子座，鉴定为瘤座虫草，并小试栽培成功。瘤座虫草生产周期约为冬虫夏草的1/3~1/4，价格约为冬虫夏草的1/5~1/6。这是国内外首次报道虫草属真菌回接天然宿主（豆虫）成功，其主要活性成分与虫草基本相当，虫草素含量略高于冬虫夏草。
1996年，山东大学在国内率先开展粘细菌研究，获得各类粘细菌200余株；测定各类群粘细菌的16SrRNA基因序列；提出关于溶纤维素粘细菌的新分类体系；建立筛选抗肿瘤药物的肿瘤细胞模型和微管模型，并获得能产生与紫衫醇具有相同功效（阻碍细胞骨架功能）的Epothilones类化合物纤维堆囊菌菌株（堆囊菌产生的埃博霉素是已知唯一由微生物产生的，与紫杉醇作用相似，具有促微管聚合活性的霉素），获4项国家发明专利。
1999年1月—2001年12月，山东农业大学柴同杰、赵云玲、常维山等开展鸡舍环境微生物气溶胶及其发生与传播模式的研究。确认了鸡舍内环境微生物气溶胶向舍外环境传播、粪便为舍内环境微生物气溶胶向舍外环境传播；创造性地建立了气源性传染病病原体的发生和传播方式；提出牧场生物安全体系和动物保健的具体功能。2002年获省自然科学三等奖。
2000年，山东大学卢雪梅等从自然界筛选到一株新型生物制浆菌种，其生物预处理周期较传统自腐菌的2~4周缩短为5天。用该菌株预处理麦草原料生产的麦草生物化制浆，裂断长可达4000米~5000米，可漂性有所改善，全无氯漂白后白度可达65%~70%ISO，突破了未经生物处理麦草化机浆白度难以达到60%ISO的极点；提出麦草大规模生物发酵的工艺条件，开发出真菌的液体培养产孢子和固体“垛式”培养技术，为大规模放大培养创造了条件。
第三节 微生物学
1985年9月—2004年11月，莱阳农学院刘润进、郭绍霞，中国科学院李敏等开展中国丛枝菌根研究，对国内AM真菌进行系统研究，从各生态系统中共分离到AM真菌6属98种；首次分析龙脑香科植物对其根围AM真菌种属分布和物种多样性的影响；证实了AM真菌能提高落叶果树的抗旱性；在国际上首次发现AM真菌丛枝发育数量与其提高棉花的抗病性呈正相关关系；提出AM真菌诱导植物抗病性的理论；建立新的快速测定AM真菌接种势和侵染势的计算公式。2005年获省自然科学一等奖。
1985—1989年，山东师范大学严芝学等开展山东昆虫病毒资源与调查研究，共采集、分离、鉴定30余种昆虫病毒，数量居全国首位。1986年，严芝学出版《中国昆虫病毒图谱》（中国科学技术出版社出版），报道了银纹夜蛾、褐边青刺蛾、红缘灯蛾三种核型多角体病毒资料。1990年，发表论文《山东林果害虫病毒研究初报》，报道了10种病毒，其中有6种是国内外首次报道。
1985—1990年，山东大学高培基、曲音波、王祖农等开展纤维素酶系酶解机制和活力测定方法研究。采用最先进的实验手段，对微生物纤维素酶进行全面系统的分离、纯化，获得3种纯化酶；进行酶促反应动力学及酶组分的协同作用研究，首创了定量分析纤维素酶各组分协同效应的研究方法。
1991年获省科技进步二等奖。
1990年，山东大学江伯英等开展耐温抗盐黄原胶研制，通过菌种诱变得到一株耐高温的黄原胶菌株，并采用PS环流反应器技术，在30吨罐上进行生产，产品主要性能———耐温抗盐性达到国际领先水平。
1996年，山东师范大学张长铠等在蒙山采得一簇虫草子座，鉴定为瘤座虫草，并小试栽培成功。瘤座虫草生产周期约为冬虫夏草的1/3~1/4，价格约为冬虫夏草的1/5~1/6。这是国内外首次报道虫草属真菌回接天然宿主（豆虫）成功，其主要活性成分与虫草基本相当，虫草素含量略高于冬虫夏草。
1996年，山东大学在国内率先开展粘细菌研究，获得各类粘细菌200余株；测定各类群粘细菌的16SrRNA基因序列；提出关于溶纤维素粘细菌的新分类体系；建立筛选抗肿瘤药物的肿瘤细胞模型和微管模型，并获得能产生与紫衫醇具有相同功效（阻碍细胞骨架功能）的Epothilones类化合物纤维堆囊菌菌株（堆囊菌产生的埃博霉素是已知唯一由微生物产生的，与紫杉醇作用相似，具有促微管聚合活性的霉素），获4项国家发明专利。
1999年1月—2001年12月，山东农业大学柴同杰、赵云玲、常维山等开展鸡舍环境微生物气溶胶及其发生与传播模式的研究。确认了鸡舍内环境微生物气溶胶向舍外环境传播、粪便为舍内环境微生物气溶胶向舍外环境传播；创造性地建立了气源性传染病病原体的发生和传播方式；提出牧场生物安全体系和动物保健的具体功能。2002年获省自然科学三等奖。
2000年，山东大学卢雪梅等从自然界筛选到一株新型生物制浆菌种，其生物预处理周期较传统自腐菌的2~4周缩短为5天。用该菌株预处理麦草原料生产的麦草生物化制浆，裂断长可达4000米~5000米，可漂性有所改善，全无氯漂白后白度可达65%~70%ISO，突破了未经生物处理麦草化机浆白度难以达到60%ISO的极点；提出麦草大规模生物发酵的工艺条件，开发出真菌的液体培养产孢子和固体“垛式”培养技术，为大规模放大培养创造了条件。