1986—1992年，山东大学张红卫与日本学者合作开展免疫系统的进化与分化研究。首次发现文昌鱼循环系统中存在一种血细胞———粒细胞，推翻了既往学界关于原索动物文昌鱼无血细胞的认识。关于鲨鱼造血组织、细胞表面抗原等研究得到国际学术界认可。
1989年，山东大学张云美完成中国根结线虫的种类、分布及其寄主植物名录研究。根结线虫是植物寄生线虫中分布极广，寄主范围很宽，对粮、棉、油、麻、茶、果、蔬菜、林木、中草药和花卉等植物危害十分严重的一类线虫。本研究系统报道了国内16种根结线虫及寄主植物286种（共67科、191属，分布于22个省、市、自治区）。
1990年，山东大学张云美开展山东植物线虫的种类与分布研究。此为山东省自然科学基金项目，张云美发现了多个植物线虫新种，在国内专业期刊上发表有关论文10余篇。
1990年，山东师范大学艾洪滨发表《大鼠浸水应激性胃粘膜损伤机制的研究》，在生理学领域影响较大，被收入《中国生理学史》。1993—2005年，艾洪滨对鲫鱼、蟾蜍、大壁虎、家鸽、小鼠、大鼠、家兔等脊椎动物的宽频带心电图和心电向量图进行比较研究，论文被SCI等收录。
1991—1996年，山东大学张红卫等开展关于病毒对淋巴细胞的影响及传染性法氏囊病综合防治方面的研究。本研究从理论上提出传染性法氏囊病的致病机理；研究出传染性法氏囊病高效疫苗、治疗药物、胚胎免疫程序；完成免疫增强剂粗提物的提取和动物实验，证明该免疫增强剂粗提物可促进家兔和鸡淋巴细胞的增殖与分化，促进幼鱼、虾苗生长和增强机体免疫力。
1992年1月—1995年12月，山东师范大学林育真、山东大学王裕文等开展直翅目昆虫足胫器功能形态学及区系、分类与生态学研究，以Spurr??s包埋法及“三维重建”技术，光镜研究直翅目昆虫足胫器；研究短翅鸣螽前足的听觉感受器形态功能、飞蝗类前中后足胫膝下器和远端器的形态学；采用发音器及雄性外生殖器的比较方法，确立新分类单元的综合依据，并准确区分近缘种。1996年获省科技进步二等奖。
1993—2005年，山东大学张红卫等开展利用文昌鱼进行系统的胚胎发育分子机制研究，成功构建国内首个青岛文昌鱼神经胚cDNA文库和两个差减文库；进行cDNA文库大规模测序，获得5000余个有效序列；首次克隆了青岛文昌鱼中数十个发育相关基因，构建了该基因家族的进化树；系统探讨上述基因在文昌鱼胚胎发育以及成体中的时空表达图式等。10篇论文被SCI等核心期刊收录，数十条文昌鱼基因序列被GeneBank（美国国家生物技术信息中心DNA序列数据库）收录。
1994年，山东大学王金星通过分析20多种海水和淡水鱼类的染色体核型和部分鱼类的带型，为鱼类育种提供了指导。
1997年，山东大学周才武和中国科学院海洋研究所成庆泰出版《山东鱼类志》（山东科学技术出版社出版）。该书全面记录山东海水和淡水鱼类，分类整理了山东境内采集的鱼类标本，记述115种（亚种）山东淡水鱼类的形态特征、分布和生态等，对山东省鱼类资源保护与开发有重要参考价值。1998 1 —2001 12 ， 、 、月 年 月 山东农业大学闫艳春 贾乐 孙中涛等开展转酯酶基因菌、藻及其降解农药的研究。首次将抗性库蚊酯酶基因分别克隆到质粒PRL-439和穿梭表达载体PDC-8中，获得可降解农药（有机氯、菊酯类）的工程菌和转基因藻。进行了工程菌的酶活分析、细胞固定化和固定化细胞对农药的降解，经检验固定化细胞在1小时之内可对有机氯、菊酯类两类农药降解90%以上；进行转基因藻脱毒功能的酶活分析；研制转基因菌、藻生物反应器。获国家发明专利1项，2003年获省自然科学三等奖。1998 ， 、 、 、 《山东大学周才武 卢浩泉 周光裕 郑亦津等撰写的 山东省生物志》由山东人民出版社出版，为山东省首部地方生物志书，是国内同类志书中较完整的一部。
1999年，山东大学赵小凡等开展鳞翅目昆虫卵蛋白酶研究。从蓖麻蚕、柞蚕、棉铃虫卵纯化到多种半胱氨酸蛋白酶，研究蛋白酶性质、组织分布及功能，特别是从棉铃虫卵内鉴定并纯化出半胱氨酸蛋白酶，可作为研制新型杀虫剂的靶标。本研究在经济昆虫繁殖、滞育卵处理、农业害虫控制、开发杀卵剂或胚胎发育抑制剂等方面有重要价值，在国内外学界产生较大影响。
1999年，山东师范大学李云龙等开展猪卵巢内卵母细胞发育的超威结构演化规律研究，涉及卵细胞质成熟，受精，合子胞质变化，猪的体外受精，小鼠胚胎体外培养，牛、羊、鹿的胚胎移植与胚胎冻存，鱼的基因工程，畜禽疫病防治及动物基因工程苗的研制等方面。
2000年1月—2003年6月，山东师范大学李云龙、孙青原，美国马里兰州NIH病理学实验室刘春巧等撰写完成《动物发育生物学》。此为国内动物发育生物学首部学术专著，对教学和学科发展有积极意义。出版后引起学术界关注，成为山东师范大学动物学博士点、细胞生物学博士点和硕士点必读书目。2005年获省自然科学三等奖。
2004年9月，山东师范大学安利国撰写的《细胞生物学实验教程》由科学出版社出版。从基础性实验、综合性实验和研究性实验三个层面设置实验项目，突出创新能力培养。基础性实验包括细胞形态与结构的观察技术、细胞化学、细胞膜生理、细胞增殖与染色体制备技术和细胞培养等内容，共20个代表本学科特点的实验方法；综合性实验包括细胞器的分离与观察、人微量外周血淋巴细胞培养及其染色体标本的制备、细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、细胞信号转导和细胞融合等7个实验，是多层次的综合性实验；提供了7个研究性实验题目供学生们开展创新性实验参考。
2004年，山东大学赵小凡等开展棉铃虫蜕皮级联反应功能基因表达研究。建立了微量水解凝胶中蛋白质，用于肽指纹图谱分析方法；鉴定到30种蜕皮差异表达的蛋白，其中大多数蛋白质为首次报道；筛选到一系列蜕皮时期上调表达的功能基因，证明其中11个基因是蜕皮变态差异表达的基因，并进行基因克隆和重组表达；阐明一系列基因的功能和激素调控模式；建立了棉铃虫蜕皮调节功能基因表达的细胞系和筛选环境友好杀虫剂的分子模型；阐明棉铃虫蜕皮调节转录因子HHR3的功能；构建了基因重组核多角体病毒，可干扰棉铃虫生长和蜕皮该病毒。
2005年1月，山东师范大学安利国主编的《细胞工程》由科学出版社出版。内容涉及动物细胞工程和植物细胞工程，共三篇。第一篇介绍细胞工程的基本技术基础，包括细胞培养的基本设施、基本条件、基本方法、基本技术等；第二篇介绍动物细胞工程，包括细胞培养、细胞融合与单克隆抗体、胚胎工程、干细胞与组织工程、核移植技术与动物克隆、转基因动物与动物生物反应器、动物染色体工程等内容；第三篇介绍植物细胞工程，包括植物组织培养、植物的快速繁殖与植物脱毒、体外单倍体诱导与单倍体育种、植物胚胎培养、体细胞胚胎发生和人工种子、原生质体融合、植物染色体工程、植物转基因技术等。
2005年5月，山东师范大学李云龙主编的专著《细胞生物学》由山东科学技术出版社出版。全书分胚胎发育概论、发育模式动物、发育理论和动物生殖工程等五部分，内容翔实，注重从细胞、亚细胞、分子水平等方面阐述发育机理等方面。
2005年6月，山东师范大学赛道建撰写的专著《动物学野外实习教程》由科学出版社出版。全书共5章，介绍动物标本采集、鉴定、保存等基本知识；按海滨、淡水湿地和陆地三种环境类型介绍动物的形态特征及其分类、生态分布；介绍实习过程中的基本生态学研究方法，实习论文的撰写和要求。通过实践，使学生掌握动物标本的采集、鉴定分类方法，引导学生建立撰写科研论文的基本思想、认识。
2005年，山东师范大学赛道建撰写完成专著《普通动物学》。全书共11章，内容包括生命的分子进化、动物细胞基本特征、繁殖发育，动物类群的结构、功能的比较、演化与调控，动物的自然、人文环境和进化等知识模块。以动物演化为主线，系统介绍动物学的基本理论、学科发展的前沿成果与动态。
第一节 动物学
1986—1992年，山东大学张红卫与日本学者合作开展免疫系统的进化与分化研究。首次发现文昌鱼循环系统中存在一种血细胞———粒细胞，推翻了既往学界关于原索动物文昌鱼无血细胞的认识。关于鲨鱼造血组织、细胞表面抗原等研究得到国际学术界认可。
1989年，山东大学张云美完成中国根结线虫的种类、分布及其寄主植物名录研究。根结线虫是植物寄生线虫中分布极广，寄主范围很宽，对粮、棉、油、麻、茶、果、蔬菜、林木、中草药和花卉等植物危害十分严重的一类线虫。本研究系统报道了国内16种根结线虫及寄主植物286种（共67科、191属，分布于22个省、市、自治区）。
1990年，山东大学张云美开展山东植物线虫的种类与分布研究。此为山东省自然科学基金项目，张云美发现了多个植物线虫新种，在国内专业期刊上发表有关论文10余篇。
1990年，山东师范大学艾洪滨发表《大鼠浸水应激性胃粘膜损伤机制的研究》，在生理学领域影响较大，被收入《中国生理学史》。1993—2005年，艾洪滨对鲫鱼、蟾蜍、大壁虎、家鸽、小鼠、大鼠、家兔等脊椎动物的宽频带心电图和心电向量图进行比较研究，论文被SCI等收录。
1991—1996年，山东大学张红卫等开展关于病毒对淋巴细胞的影响及传染性法氏囊病综合防治方面的研究。本研究从理论上提出传染性法氏囊病的致病机理；研究出传染性法氏囊病高效疫苗、治疗药物、胚胎免疫程序；完成免疫增强剂粗提物的提取和动物实验，证明该免疫增强剂粗提物可促进家兔和鸡淋巴细胞的增殖与分化，促进幼鱼、虾苗生长和增强机体免疫力。
1992年1月—1995年12月，山东师范大学林育真、山东大学王裕文等开展直翅目昆虫足胫器功能形态学及区系、分类与生态学研究，以Spurr??s包埋法及“三维重建”技术，光镜研究直翅目昆虫足胫器；研究短翅鸣螽前足的听觉感受器形态功能、飞蝗类前中后足胫膝下器和远端器的形态学；采用发音器及雄性外生殖器的比较方法，确立新分类单元的综合依据，并准确区分近缘种。1996年获省科技进步二等奖。
1993—2005年，山东大学张红卫等开展利用文昌鱼进行系统的胚胎发育分子机制研究，成功构建国内首个青岛文昌鱼神经胚cDNA文库和两个差减文库；进行cDNA文库大规模测序，获得5000余个有效序列；首次克隆了青岛文昌鱼中数十个发育相关基因，构建了该基因家族的进化树；系统探讨上述基因在文昌鱼胚胎发育以及成体中的时空表达图式等。10篇论文被SCI等核心期刊收录，数十条文昌鱼基因序列被GeneBank（美国国家生物技术信息中心DNA序列数据库）收录。
1994年，山东大学王金星通过分析20多种海水和淡水鱼类的染色体核型和部分鱼类的带型，为鱼类育种提供了指导。
1997年，山东大学周才武和中国科学院海洋研究所成庆泰出版《山东鱼类志》（山东科学技术出版社出版）。该书全面记录山东海水和淡水鱼类，分类整理了山东境内采集的鱼类标本，记述115种（亚种）山东淡水鱼类的形态特征、分布和生态等，对山东省鱼类资源保护与开发有重要参考价值。1998 1 —2001 12 ， 、 、月 年 月 山东农业大学闫艳春 贾乐 孙中涛等开展转酯酶基因菌、藻及其降解农药的研究。首次将抗性库蚊酯酶基因分别克隆到质粒PRL-439和穿梭表达载体PDC-8中，获得可降解农药（有机氯、菊酯类）的工程菌和转基因藻。进行了工程菌的酶活分析、细胞固定化和固定化细胞对农药的降解，经检验固定化细胞在1小时之内可对有机氯、菊酯类两类农药降解90%以上；进行转基因藻脱毒功能的酶活分析；研制转基因菌、藻生物反应器。获国家发明专利1项，2003年获省自然科学三等奖。1998 ， 、 、 、 《山东大学周才武 卢浩泉 周光裕 郑亦津等撰写的 山东省生物志》由山东人民出版社出版，为山东省首部地方生物志书，是国内同类志书中较完整的一部。
1999年，山东大学赵小凡等开展鳞翅目昆虫卵蛋白酶研究。从蓖麻蚕、柞蚕、棉铃虫卵纯化到多种半胱氨酸蛋白酶，研究蛋白酶性质、组织分布及功能，特别是从棉铃虫卵内鉴定并纯化出半胱氨酸蛋白酶，可作为研制新型杀虫剂的靶标。本研究在经济昆虫繁殖、滞育卵处理、农业害虫控制、开发杀卵剂或胚胎发育抑制剂等方面有重要价值，在国内外学界产生较大影响。
1999年，山东师范大学李云龙等开展猪卵巢内卵母细胞发育的超威结构演化规律研究，涉及卵细胞质成熟，受精，合子胞质变化，猪的体外受精，小鼠胚胎体外培养，牛、羊、鹿的胚胎移植与胚胎冻存，鱼的基因工程，畜禽疫病防治及动物基因工程苗的研制等方面。
2000年1月—2003年6月，山东师范大学李云龙、孙青原，美国马里兰州NIH病理学实验室刘春巧等撰写完成《动物发育生物学》。此为国内动物发育生物学首部学术专著，对教学和学科发展有积极意义。出版后引起学术界关注，成为山东师范大学动物学博士点、细胞生物学博士点和硕士点必读书目。2005年获省自然科学三等奖。
2004年9月，山东师范大学安利国撰写的《细胞生物学实验教程》由科学出版社出版。从基础性实验、综合性实验和研究性实验三个层面设置实验项目，突出创新能力培养。基础性实验包括细胞形态与结构的观察技术、细胞化学、细胞膜生理、细胞增殖与染色体制备技术和细胞培养等内容，共20个代表本学科特点的实验方法；综合性实验包括细胞器的分离与观察、人微量外周血淋巴细胞培养及其染色体标本的制备、细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、细胞信号转导和细胞融合等7个实验，是多层次的综合性实验；提供了7个研究性实验题目供学生们开展创新性实验参考。
2004年，山东大学赵小凡等开展棉铃虫蜕皮级联反应功能基因表达研究。建立了微量水解凝胶中蛋白质，用于肽指纹图谱分析方法；鉴定到30种蜕皮差异表达的蛋白，其中大多数蛋白质为首次报道；筛选到一系列蜕皮时期上调表达的功能基因，证明其中11个基因是蜕皮变态差异表达的基因，并进行基因克隆和重组表达；阐明一系列基因的功能和激素调控模式；建立了棉铃虫蜕皮调节功能基因表达的细胞系和筛选环境友好杀虫剂的分子模型；阐明棉铃虫蜕皮调节转录因子HHR3的功能；构建了基因重组核多角体病毒，可干扰棉铃虫生长和蜕皮该病毒。
2005年1月，山东师范大学安利国主编的《细胞工程》由科学出版社出版。内容涉及动物细胞工程和植物细胞工程，共三篇。第一篇介绍细胞工程的基本技术基础，包括细胞培养的基本设施、基本条件、基本方法、基本技术等；第二篇介绍动物细胞工程，包括细胞培养、细胞融合与单克隆抗体、胚胎工程、干细胞与组织工程、核移植技术与动物克隆、转基因动物与动物生物反应器、动物染色体工程等内容；第三篇介绍植物细胞工程，包括植物组织培养、植物的快速繁殖与植物脱毒、体外单倍体诱导与单倍体育种、植物胚胎培养、体细胞胚胎发生和人工种子、原生质体融合、植物染色体工程、植物转基因技术等。
2005年5月，山东师范大学李云龙主编的专著《细胞生物学》由山东科学技术出版社出版。全书分胚胎发育概论、发育模式动物、发育理论和动物生殖工程等五部分，内容翔实，注重从细胞、亚细胞、分子水平等方面阐述发育机理等方面。
2005年6月，山东师范大学赛道建撰写的专著《动物学野外实习教程》由科学出版社出版。全书共5章，介绍动物标本采集、鉴定、保存等基本知识；按海滨、淡水湿地和陆地三种环境类型介绍动物的形态特征及其分类、生态分布；介绍实习过程中的基本生态学研究方法，实习论文的撰写和要求。通过实践，使学生掌握动物标本的采集、鉴定分类方法，引导学生建立撰写科研论文的基本思想、认识。
2005年，山东师范大学赛道建撰写完成专著《普通动物学》。全书共11章，内容包括生命的分子进化、动物细胞基本特征、繁殖发育，动物类群的结构、功能的比较、演化与调控，动物的自然、人文环境和进化等知识模块。以动物演化为主线，系统介绍动物学的基本理论、学科发展的前沿成果与动态。