1988年，山东师范大学张怿慈改进幅密度变分法，首次精确计算了X+H2类反应碰撞体系。2000年获省科技进步一等奖。
1988年1月—1990年12月，山东大学谢去病、陈鄂生、刘希明开展高能正负电子反应中的夸克产生律与夸克组合律研究。高能粒子反应的理论研究是现代物理学的重大前沿课题。本研究提出高能正负电子反应的夸克产生律与夸克组合律，并解释了大批实验规律与现象，尤其是其他理论难以解释的重子产生规律。其图像简明、清晰、可调参数很少，得到国际上许多著名专家的好评，并被列为李政道主持的“现代物理若干重大前沿课题研究”的子课题。1992年获省科技进步一等奖。
1989年，山东师范大学王象泰开展离子存储和阱中电子云规律的实验研究，完成激光与金属原子的相互作用的研究。这是山东省首次开展原子与分子物理实验研究，之后，山东省在该领域的研究逐步深入。
1989年9月—1994年9月，山东师范大学张庆刚、全殿民等开展量子散射、量子群及计算方法研究，对当时国际上流行的离心突然近似（CS）、能量突然近似（ES）及无穷级突然近似（IOS）散射理论提出修正，建立起统一的GES和普遍绝热核GAN理论，并探讨量子群，首次运用李代数方法处理分子在固体表面的散射，改进绝热核（GAN）理论，扩展了过渡态理论与计算方法。1995年获省科技进步一等奖。
1990年1月—1992年12月，山东师范大学林圣路、张庆刚等开展原子与分子散射的理论研究，将CS近似应用于波包理论，形成CSWP含时近似理论，提出分子散射的RCSWP理论；首次用李代数法研究了He在LIF表面上的散射及H2、D2在固体表面的散射，得到了散射规律；采用经典轨迹法研究甲烷和氩的散射。1994年获省科技进步二等奖。
1993年，山东师范大学林圣路用半经典轨迹法成功计算了Ar-CH4碰撞激发截面和态—态跃迁几率，纠正了既往理论中的错误。通过优化甲烷分子的球陀螺对称性分类，可精确计算大分子甲烷的散射截面，得出与交叉束实验及量子密耦合计算相一致的结果，受到国内外学者关注。
1995年，山东师范大学林圣路与中科院理论物理研究院杜孟利合作开展强场中的原子动力学及离化原子谱的研究，探索强磁场下里得堡原子光吸收谱特性及相关的非线性现象，涉及对抗磁性、量子混沌等现象的认识，形成标度律、回归谱、能级统计学等有限分辨率下量子谱学新方法，为了解极端条件下的物理过程，如类星体、核聚变等研究提供了新思路。
1995年1月—2000年12月，山东师范大学张怿慈、屈连华完成原子—分子散射及结构的理论研究，通过研究原子—分子反应散射，对类锂原子体系进行高精度理论计算。有18篇论文被SCI收录。2000年获省科技进步一等奖。
1995年1月—2001年12月，山东师范大学王传奎、满宝元完成纳米体系和等离子体系光电性质的理论和实验研究，发现量子束缚态的存在和准一维电子体系低电子密度下电子自旋自发极化；设计出一种传递二元信息“1”“0”的新机制，即利用量子点间库仑作用传递信息；探讨了单分子器件的伏—安特性；率先制备了三种金属介电光子晶体、氧化铝棒组成的八边、十边和十二边准晶光子晶体，并得到与理论模拟相一致的带隙和缺陷模；解释了在一个大气压环境下缘何观察不到二价铝离子辐射信号。2003年获省自然科学二等奖。
1997年，山东师范大学满宝元开展激光与物质相互作用的实验研究，对铝、镁、硅等导航窗口材料的损伤阈值条件、表面激波形成和热量传递过程、等离子体中核素密度、局域平衡特性及温度分布等进行模拟和理论计算，分析了高功率密度下的激光在金属表面产生等离子体谱的时空特性，提出等离子激波新的传播模式，对激光淀积制备多层膜材料有重要指导意义1998年1月—2001年12月，中国石油大学（华东）于肇贤，聊城师范学院王继锁、冯健等开展介观量子系统的物理效应与量子群理论研究，系统研究了二分量玻色—爱因斯坦凝聚（BEC）的隧道效应和自我囚禁现象以及激光场与BEC的相互作用；集中研究了有关物理光学体系的非经典效应和辐射谱性质以及变形光场的非经典特性，建立有关变形量子群的表示理论。
有50篇论文被SCI收录，3篇论文被EI收录。2002年获省自然科学三等奖。1999 ， ，山东师范大学张庆刚与美国纽约大学张增辉合作 运用黄金规则对四原子的全六维反应碰撞体系完成了量子力学理论和计算方法研究。
2000年，山东师范大学王传奎开展分子材料、原子团簇和聚合物的非线性光学性质研究，首次利用自洽响应场方法详细探讨溶剂效应、分子的振动贡献，系统探讨分子官能团的功能，给出分子电荷转移态的电荷迁移方式，对表征分子、原子团簇和聚合物的非线性光学性质具有重要学术意义。
2001年，王传奎发展了弹性和非弹性散射的格林函数方法，研究分子的电输运性质，开发出计算软件（QCMV1.0），用于定量计算分子和金属的相互作用能参数，较好地解释了单分子理论模拟实验结果；通过系统研究电极维度对分子电输运性质的影响，计算了外场对分子几何结构和电子结构的影响，以及外场电势在分子内的分布；通过模拟不同结构和形状分子的伏—安特性，得到分子结构与分子电学性质的关系，为设计不同功能的分子器件打下基础。
2003年，山东师范大学孟庆田开展超快强场物理和化学的理论及实验研究，继承和发展了张怿慈等人处理原子与分子碰撞的含时波包动力学理论，并用于研究光和物质相互作用的超快动力学，通过对一些分子在飞秒激光场下共振增强多光子电离光电子能谱和光解吸收谱的理论模拟，分析出了光与分子相互作用的特点及强场效应，对处理强场下的大分子体系有借鉴意义。2004 ， 、山东大学梁作堂 王新年提出高能重离子碰撞中夸克胶子等离子体“整体极化”理论。2005年获国家杰出青年基金，是山东省物理学领域首次获得该基金资助。
第一节 原子分子物理
1988年，山东师范大学张怿慈改进幅密度变分法，首次精确计算了X+H2类反应碰撞体系。2000年获省科技进步一等奖。
1988年1月—1990年12月，山东大学谢去病、陈鄂生、刘希明开展高能正负电子反应中的夸克产生律与夸克组合律研究。高能粒子反应的理论研究是现代物理学的重大前沿课题。本研究提出高能正负电子反应的夸克产生律与夸克组合律，并解释了大批实验规律与现象，尤其是其他理论难以解释的重子产生规律。其图像简明、清晰、可调参数很少，得到国际上许多著名专家的好评，并被列为李政道主持的“现代物理若干重大前沿课题研究”的子课题。1992年获省科技进步一等奖。
1989年，山东师范大学王象泰开展离子存储和阱中电子云规律的实验研究，完成激光与金属原子的相互作用的研究。这是山东省首次开展原子与分子物理实验研究，之后，山东省在该领域的研究逐步深入。
1989年9月—1994年9月，山东师范大学张庆刚、全殿民等开展量子散射、量子群及计算方法研究，对当时国际上流行的离心突然近似（CS）、能量突然近似（ES）及无穷级突然近似（IOS）散射理论提出修正，建立起统一的GES和普遍绝热核GAN理论，并探讨量子群，首次运用李代数方法处理分子在固体表面的散射，改进绝热核（GAN）理论，扩展了过渡态理论与计算方法。1995年获省科技进步一等奖。
1990年1月—1992年12月，山东师范大学林圣路、张庆刚等开展原子与分子散射的理论研究，将CS近似应用于波包理论，形成CSWP含时近似理论，提出分子散射的RCSWP理论；首次用李代数法研究了He在LIF表面上的散射及H2、D2在固体表面的散射，得到了散射规律；采用经典轨迹法研究甲烷和氩的散射。1994年获省科技进步二等奖。
1993年，山东师范大学林圣路用半经典轨迹法成功计算了Ar-CH4碰撞激发截面和态—态跃迁几率，纠正了既往理论中的错误。通过优化甲烷分子的球陀螺对称性分类，可精确计算大分子甲烷的散射截面，得出与交叉束实验及量子密耦合计算相一致的结果，受到国内外学者关注。
1995年，山东师范大学林圣路与中科院理论物理研究院杜孟利合作开展强场中的原子动力学及离化原子谱的研究，探索强磁场下里得堡原子光吸收谱特性及相关的非线性现象，涉及对抗磁性、量子混沌等现象的认识，形成标度律、回归谱、能级统计学等有限分辨率下量子谱学新方法，为了解极端条件下的物理过程，如类星体、核聚变等研究提供了新思路。
1995年1月—2000年12月，山东师范大学张怿慈、屈连华完成原子—分子散射及结构的理论研究，通过研究原子—分子反应散射，对类锂原子体系进行高精度理论计算。有18篇论文被SCI收录。2000年获省科技进步一等奖。
1995年1月—2001年12月，山东师范大学王传奎、满宝元完成纳米体系和等离子体系光电性质的理论和实验研究，发现量子束缚态的存在和准一维电子体系低电子密度下电子自旋自发极化；设计出一种传递二元信息“1”“0”的新机制，即利用量子点间库仑作用传递信息；探讨了单分子器件的伏—安特性；率先制备了三种金属介电光子晶体、氧化铝棒组成的八边、十边和十二边准晶光子晶体，并得到与理论模拟相一致的带隙和缺陷模；解释了在一个大气压环境下缘何观察不到二价铝离子辐射信号。2003年获省自然科学二等奖。
1997年，山东师范大学满宝元开展激光与物质相互作用的实验研究，对铝、镁、硅等导航窗口材料的损伤阈值条件、表面激波形成和热量传递过程、等离子体中核素密度、局域平衡特性及温度分布等进行模拟和理论计算，分析了高功率密度下的激光在金属表面产生等离子体谱的时空特性，提出等离子激波新的传播模式，对激光淀积制备多层膜材料有重要指导意义1998年1月—2001年12月，中国石油大学（华东）于肇贤，聊城师范学院王继锁、冯健等开展介观量子系统的物理效应与量子群理论研究，系统研究了二分量玻色—爱因斯坦凝聚（BEC）的隧道效应和自我囚禁现象以及激光场与BEC的相互作用；集中研究了有关物理光学体系的非经典效应和辐射谱性质以及变形光场的非经典特性，建立有关变形量子群的表示理论。
有50篇论文被SCI收录，3篇论文被EI收录。2002年获省自然科学三等奖。1999 ， ，山东师范大学张庆刚与美国纽约大学张增辉合作 运用黄金规则对四原子的全六维反应碰撞体系完成了量子力学理论和计算方法研究。
2000年，山东师范大学王传奎开展分子材料、原子团簇和聚合物的非线性光学性质研究，首次利用自洽响应场方法详细探讨溶剂效应、分子的振动贡献，系统探讨分子官能团的功能，给出分子电荷转移态的电荷迁移方式，对表征分子、原子团簇和聚合物的非线性光学性质具有重要学术意义。
2001年，王传奎发展了弹性和非弹性散射的格林函数方法，研究分子的电输运性质，开发出计算软件（QCMV1.0），用于定量计算分子和金属的相互作用能参数，较好地解释了单分子理论模拟实验结果；通过系统研究电极维度对分子电输运性质的影响，计算了外场对分子几何结构和电子结构的影响，以及外场电势在分子内的分布；通过模拟不同结构和形状分子的伏—安特性，得到分子结构与分子电学性质的关系，为设计不同功能的分子器件打下基础。
2003年，山东师范大学孟庆田开展超快强场物理和化学的理论及实验研究，继承和发展了张怿慈等人处理原子与分子碰撞的含时波包动力学理论，并用于研究光和物质相互作用的超快动力学，通过对一些分子在飞秒激光场下共振增强多光子电离光电子能谱和光解吸收谱的理论模拟，分析出了光与分子相互作用的特点及强场效应，对处理强场下的大分子体系有借鉴意义。2004 ， 、山东大学梁作堂 王新年提出高能重离子碰撞中夸克胶子等离子体“整体极化”理论。2005年获国家杰出青年基金，是山东省物理学领域首次获得该基金资助。