1990—2005年，山东省水土保持监督管理实行先试点再规范的路子，全省首先在79个县（市、区）开展了水土保持监督执法试点，之后在4个市（地）和51个县（市、区）开展了水土保持监督管理规范化建设试点，推动全省水土保持监督管理工作实现新突破，在监督体系、方案报批、“两费”（水土流失防治费、水土保持设施补偿费）收取、违法案件查处等方面取得很大进展。1997年开始进行城市水土保持试点，至2005年底，青岛市、烟台市、东营市先后被水利部命名为全国水土保持生态环境建设示范城市。
一、监督执法试点
1990—1998年，为扭转边治理水土流失、边人为破坏的状况，山东省在79个县（市、区）分批开展水土保持监督执法试点。各试点县（市、区）成立了由政府分管领导为组长的试点工作领导小组，以政府名义制定公布了试点方案，建立健全水土保持监督管理机构，充实了监督执法人员，出台了一系列与水土保持法律、法规相配套的规范性文件，对人为造成的水土流失和监督对象进行普查摸底，建立档案，划定重点监督区和预防保护区，编制预防监督规划，开展水土保持方案审批、收费和案件查处工作。
试点工作中，重点研究与探讨了水土保持监督体系的结构及其任务，对不同类型区及大中小型开发建设项目应采取的不同措施，水土保持费收缴原则、标准及管理使用办法，查处破坏水土保持案件的程序，水土保持监督管理与土地、矿产、环保、农林、水利、畜牧等有关自然资源部门管理的关系，与公安、检察、法院、司法行政、工商、物价、财政、银行等部门的协调，各级水土保持监督员的任免、管理、职责权限以及岗位责任制、考核奖惩制度等。
试点过程中，79个县（市、区）共培训上岗人员4504人，审批开发建设项目水土保持方案5926个，收缴水土保持设施补偿费和水土流失防治费1765.6万元，查处水土保持案件188件，促使开发生产建设单位自行投入治理水土流失资金10573.7万元，完成土石方5374万立方米，采取生物防治措施2034.6公顷。先后有3个市（地）、5个县（市、区）、13人受到水利部表彰。试点县（市、区）为水土保持监督管理和行政执法探索出了成功之路，有力地推动了全省水土流失的防治工作。
1990—2005年山东省水土保持监督执法试点县（市、区）一览表
表6-6
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┃市（地）│第一批（9） │ 第二批（29） │第三批（17）│ 第四批（24） ┃
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┃ 济 南 │ 章丘 │ 历城 │ 平阴 │ 长清 ┃
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┃ 青 岛 │ 黄岛 │ 胶南 │ 平度 │ 即墨 ┃
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┃ 淄 博 │ 沂源 │ 博山 淄川 张店 │ 临淄 │ 周村 ┃
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┃ 枣 庄 │ │ 滕州 │ 薛城 │ 峄城 ┃
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┃ 东 营 │ │ 垦利 │ 广饶 │ 东营 ┃
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┃ 烟 台 │ 芝罘 招远 │ 蓬莱 栖霞 福山 莱阳 牟平 │ 海阳 │ 长岛 莱山 ┃
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┃ 潍 坊 │ 临朐 │ 青州 诸城 昌乐 │ 安丘 │ 寿光 高密 ┃
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┃ 济 宁 │ │ 曲阜 嘉祥 │ 泗水 │ 邹城 ┃
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┃ 泰 安 │ │ 泰安郊区 │ 新泰 │ 肥城 ┃
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┃ 威 海 │ │ 乳山 │ 文登 │ 荣成 ┃
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┃ 日 照 │ │ 莒县 │ 五莲 │ 东港 ┃
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┃ 莱 芜 │ │ 莱芜 │ 莱城 │ 钢城 ┃
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┃ 临 沂 │ 平邑 费县 │ 沂水 苍山 蒙阴 │ 莒南 │ 临沭 郯城 ┃
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┃ 德 州 │ 夏津 │ 武城 │ 平原 │ 德城 禹城 ┃
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┃ 聊 城 │ │ 莘县 高唐 │ 临清 │ 茌平 冠县 东阿 ┃
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┃ 滨 州 │ │ 惠民 │ 邹平 │ 滨州 ┃
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┃ 菏 泽 │ │ 定陶 │ 成武 │ 菏泽 东明 ┃
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2000年9月，自行开展试点的聊城市阳谷县、东昌府区通过省水利厅的达标验收。
二、监督管理规范化建设
1999年9月，水利部公布青岛市、临沂市、莱芜市、东营市、泰安市被列为全国水土保持生态环境建设监督管理规范化建设试点市，费县等51个县（市、区）被列为全国水土保持生态环境建设监督管理规范化建设县（市、区），并明确了规范化建设的主要内容和验收标准。由此，山东省水土保持生态环境建设监督管理规范化建设正式启动。山东省规范化建设县（市、区），根据当时有无国家重点资助项目，划分为国家重点和非重点水土流失防治县（市、区）。
1999年全国水土保持生态环境建设监督管理规范化县（市、区）一览表
表6-7
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┃ 市（地） │ 非重点防治县（市、区） │ 国家重点防治县（市、区） ┃
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┃ 济南 │ 平阴 长清 │ ┃
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┃ 青岛 │ 即墨 城阳 │ ┃
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┃ 淄博 │ 张店 │ 沂源 博山 ┃
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┃ 枣庄 │ 滕州 峄城 │ 山亭 ┃
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┃ 东营 │ 垦利 东营 广饶 │ ┃
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┃ 烟台 │ 招远 长岛 福山 栖霞 │ ┃
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┃ 潍坊 │ 昌乐 诸城 寿光 │ 临朐 青州 ┃
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┃ 济宁 │ 嘉祥 │ 泗水 ┃
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┃ 泰安 │ 肥城 宁阳 │ 新泰 泰安郊区 ┃
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┃ 威海 │ 乳山 文登 │ ┃
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┃ 日照 │ │ 莒县 五莲 ┃
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┃ 莱芜 │ │ 莱城 钢城 ┃
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┃ 临沂 │ 郯城 │ 费县 沂水 蒙阴 平邑 莒南 沂南 ┃
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┃ 德州 │ 禹城 平原 德城 │ ┃
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┃ 聊城 │ 莘县 高唐 茌平 │ ┃
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┃ 滨州 │ 邹平 惠民 │ ┃
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┃ 菏泽 │ 定陶 单县 │ ┃
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11月，省水利厅明确了规范化建设的指导思想、主要内容、进度安排和目标，有关市（地）、县（市、区）相继制定提出具体实施意见。通过规范化建设，山东省水土保持监督管理在监督体系、队伍建设、执法装备、宣传培训、方案报批、“两费”收取、返还治理与水土保持方案实施示范工程、案件查处等方面，均取得了很大进展，基本达到了水利部提出的规范化标准。2000年12月至2001年5月，由流域机构、省水利厅和有关市水利局组成验收组，对照全国水土保持生态环境建设监督管理规范化验收标准，采取实地考察水土保持“返还治理工程”“三同时工程”及办公场地、查看水土保持执法装备、档案材料、听取汇报的方式，对山东省水土保持规范化建设试点市、县（市、区）分三批进行了验收，全部合格。
1997—2005年，省水利厅进行编制开发建设项目水土保持方案资格认证，省水利科学研究院、省水利勘测设计院取得甲级资格证书，24个单位取得乙级资格证书，47个单位取得丙级资格证书。
三、城市水土保持试点
1996年，山东省开展了48个县级以上城市的调查统计工作，对城市水土流失情况进行调查，探讨了实施城市水土保持工作的对策。
1997年9月，为预防和治理城市化进程中的水土流失问题及其所带来的各种不良后果，水利部在10个城市开展全国城市水土保持试点工作，青岛市位列其中。1998年6月，省水利厅将烟台市、淄博市和曲阜市列入山东省水土保持试点城市，并制定《山东省城市水土保持试点工作意见》。1999年2月，水利部、财政部将10个全国城市水土保持试点列入全国水土保持生态环境建设示范城市。2000年11月，水利部确定泰安市、烟台市为全国第二批水土保持试点城市。试点期限3年。试点城市将水土保持与城市水系整治、观光景点和休闲园区建设相结合，既有效防治了水土流失，又改善了生态环境。
2000—2005年，青岛市、烟台市、东营市被水利部命名为全国水土保持生态环境建设示范城市，滨州市创建全国水土保持生态环境建设示范城市通过水利部复验，淄博市、曲阜市通过省水利厅验收。泰安市在实施城市水土保持规划、城区开发建设水土保持监督管理等方面存在不足，未通过省水利厅初验。
四、落实水土保持“三权”
1991年《中华人民共和国水土保持法》颁布后，国家及地方与之相配套规范性文件相继出台，山东省逐步落实水土保持“三权”，即水行政主管部门监督权、审批权和收费权。
1995年5月，省物价局、省财政厅、省水利厅联合印发文件，明确规定水土保持设施补偿费和水土流失防治费的收取范围、标准和管理使用办法。当年，全省以此为依据审批自然资源开发、生产建设单位的水土保持方案3669项，查处各类水保违法案件134起，收取水土保持设施补偿费、水土流失防治费811.28万元。
各市（地）、县（市、区）也逐步推动“三权”落实。1996年，烟台市各县（市、区）的规范性文件全部出台，方案审批、“两费”收取基本覆盖全市所有开发建设项目。1998年，招远、蒙阴、泗水、莒南、曲阜、周村、平邑、郯城等县（市、区）新上开发建设项目，没有水行政主管部门同意的水土保持方案，环境保护行政主管部门不予批准环境影响报告书，计划部门不予立项，地质矿产部门不予办理采矿批准手续。
省属以上开发建设项目水土保持监督管理。伴随经济社会和城市建设的快速发展，大量开发建设项目不断造成新的水土流失。1999年《山东省实施〈水保法〉办法（修正案）》出台后，山东省把重点建设项目水土保持方案的编报作为落实“三权”的突破口，先后向10个大型开发建设项目建设单位下达行政处罚决定书，责令限期编报水土保持方案。2000年，铁路、公路、电厂建设项目首次实现水土保持方案编报、审查、发证和水土保持设施补偿费征收到位。2001年，对损坏植被、梯田等水土保持设施，造成严重水土流失的省属以上开发建设项目单位，依法下达水土保持设施补偿费缴纳通知书，在其拒不履行其法定义务的情况下，申请人民法院强制执行。从2002年开始，省水利厅每年在全省范围内开展省属以上开发建设项目水土保持违法案件集中查处活动。对重大案件，由省水利厅牵头把关，具体市、县（市、区）承办；对中小案件，以市、县（市、区）查处为主，省水利厅做好法律咨询、释义。电力、公路、铁路、煤炭、油气等重点行业开发建设项目，依法编制水土保持方案、缴纳水土保持设施补偿费和水土流失防治费、投资建设水土流失防治工程的比例逐步提高。2002年，胜利油田拿出1亿元专项用于水土流失防治和水土保持生态建设。2004年2月，山东省大莱龙铁路、青岛市升平路一小区被水利部命名为全国开发建设项目水土保持示范工程。
2001—2005年，全省共审批水土保持方案11631项，收取水土保持补偿费和水土流失防治费1.81亿元，督促开发建设单位投入水土流失防治资金11.2亿元，查处水土保持违法案件1597起。