2001—2002年，山东省农田水利基本建设以为农业产业结构调整服务、为农民增收服务为主题，投资规模大、重点工程多、水源工程多、节水工程多、吃水工程多。同时，民营水利进一步发展壮大，全省个体投资过百万的水利大户达到21个。2001年，淄博市临淄区皇城镇化工经营业主苗文滨“反租倒包”土地，配套现代化滴灌设施，投资千万元建设千亩特色蔬菜瓜果大棚，成为全省投资最多的个体水利大户。
2003—2005年，随着农村义务工、劳动积累工制度逐步取消和农村税费改革的实施等，农田水利基本建设的组织方式、投入机制发生重大变化。农田水利基本建设完成投资、投入工日等主要指标在2002—2003年度达到新高，之后逐年下降。
2000—2005年山东省农田水利基本建设主要指标一览表
表5-1
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┃ 年份 │ 完成投资 │ 完成土石方 │ 投入工日 │ 开工数 ┃
┃ │ （万元） │ （万立方米） │ （万个） │ （处） ┃
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┃ 20002001 │ 651649 │ 115866 │ 71353 │ 212354 ┃
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┃ 20012002 │ 769221 │ 111326 │ 71450 │ 193659 ┃
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┃ 20022003 │ 833609 │ 109349 │ 62206 │ 197011 ┃
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┃ 20032004 │ 767301 │ 91556 │ 49898 │ 149164 ┃
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┃ 20042005 │ 662661 │ 74296 │ 37230 │ 138392 ┃
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为充分发挥小型农村水利工程的效益，加强农业和农村水利基础设施建设，中央财政和省财政开始设立小型农田水利“民办公助”专项资金，扶持农户、协会、村组集体开展小型农田水利设施建设，同时出台政策，对农田水利基本建设实行“一事一议”“农民用水户协会参与管理”等新机制。2005年8月，省财政厅、省水利厅联合印发《小型农田水利工程设施建设“民办公助”专项资金管理暂行办法》。当年，山东省有92个小型农田水利项目获得中央财政补助，补助资金1058万元；308个小型农田水利项目获得省财政补助，补助资金3000万元，全省农田水利基本建设得以保持稳定。2005年10月，为提高和改善农村群众的生活用水条件，省政府下发《关于实施全省村村通自来水工程的意见》，决定从2005年起在全省农村实施村村通自来水工程，规划到2007年底，使全省80%以上的村庄用上安全卫生的自来水，自来水受益人口增加2440万人，达到5220万人。
2001—2005年，全省累计完成农田水利基本建设投入368亿元，建成各类工程56万项，新增和改善灌溉面积4300万亩，增加除涝面积1800万亩，改造中低产田1200万亩，发展节水灌溉面积3000万亩。