一、调度运行
引黄济青工程各级管理机构内，均设置调度部门，实行统一调度、分级负责。1990—2005年，引黄济青工程的调度运行实行以下原则和措施：为避开农业灌溉季节和含沙量大的汛期，引黄济青工程调度运行时间为每年11月11日至次年3月20日，扣除冰冻影响27天，可引水天数为70天，属带冰引水。引水期平均含沙量6.7千克/立方米。为减轻沉沙池清淤负担，延长使用寿命，黄河日均含沙量大于30千克/立方米时不引水；为保证黄河大堤安全，黄河流量大于5000立方米/秒时不引水；为保留一定的黄河生态流量和打渔张引黄闸设计最小引水流量，利津站流量小于60立方米/秒时不引水；为了增加引黄水量，确定渠首引黄闸的最小引水流量为10立方米/秒，对应黄河来水量最小为60立方米/秒。为保证冰凌期输水安全，由省引黄济青工程调度中心根据黄河水情、天气预报、输水分水计划和输水河现有水情，进行统一调度；稳定流量运行，避免输水河水位、流量波动，造成弃水或出现安全事故；泵站前池水位保持高于设计水位运行；倒虹吸、涵闸实时控制水位，避免气温骤降造成水位壅高、下泄量减少而影响过流和安全输水。实行计划调水，青岛市按签订的年度用水合同确定供水计划，沿途农业用水由县（市、区）水利局于每年运行前15日提出书面用水计划。
1990—2005年底，引黄济青工程累计从黄河引水24.37亿立方米，从峡山水库、大沽河引水7.20亿立方米，向青岛市供水10.8亿立方米。特别是1997年和2001年，山东省遭遇百年不遇的干旱，济南、烟台、威海等主要城市面临断水危机，而青岛市却用水无忧。工程还向沿途的农业区、滨海咸水区和高氟区群众提供用水，占工程供水量的60%。
1990—2005年引黄济青工程运行情况统计表
表8-1
┏━━┯━━━━━━━━┯━━━━━━━━━━┯━━━━━━━━┯━━━━━┯━━━━━━━━━━━━━━┓
┃年份│ 黄河引水量 │ 其他水源引水量 │ 向青岛供水量 │ 实交水费 │ 粮食增加总产量（吨） ┃
┃ │ （万立方米） │ （万立方米） │ （万立方米） │ （万元） │ ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1990│ 44065.92 │ 1070.34 │ 2987.60 │ 1737.62 │ ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1991│ 23647 │ │ 5053.44 │ 1924.82 │ 13515 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1992│ 33541.05 │ │ 5281.54 │ 2116.99 │ 34487 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1993│ 14540.01 │ 226 │ 4563 │ 3436.57 │ 21930 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1994│ 15891.74 │ 2517.13 │ 7924 │ 6455.30 │ 27146 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1995│ 13696.05 │ 2700 │ 7312 │ 6653.75 │ 27924 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1996│ 11874.41 │ 3020 │ 6273 │ 6878.92 │ 27924 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1997│ 9458.75 │ 4028 │ 6840 │ 6626.75 │ 27000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1998│ 11928.15 │ 5879 │ 5037 │ 5523 │ 27000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃1999│ 12763.64 │ 4249.57 │ 5834 │ 5650 │ 27000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2000│ 20697.39 │ 2338.98 │ 7006 │ 6678 │ ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2001│ 6832.03 │ 4712 │ 5503 │ │ 27000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2002│ 11856.16 │ 6426.08 │ 9000 │ 8000 │ ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2003│ 3384.36 │ 15304 │ 9560 │ 8212.5 │ 29000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2004│ 2710.10 │ 11651 │ 9559 │ 8212.5 │ 29000 ┃
┠──┼────────┼──────────┼────────┼─────┼──────────────┨
┃2005│ 6768.79 │ 7892.82 │ 10438 │ 9001 │ 29000 ┃
┗━━┷━━━━━━━━┷━━━━━━━━━━┷━━━━━━━━┷━━━━━┷━━━━━━━━━━━━━━┛
二、水价调整
1990—2005年，引黄济青工程由实行预购水票、凭票供水制度，发展为签订合同、按计划供水，实现水费收入87107.72万元。
1989年11月，省引黄济青工程管理局、省财政厅、省物价局联合印发《山东省引黄济青工程水费计收和管理办法》，为减轻青岛市负担，确定引黄济青工程最初水价只按供水成本收费，即水费标准为0.38元/立方米，生活用水年度内按1440万立方米低于供水成本计算，水费标准为0.087元/立方米；为保证工程必要的维修养护费，对青岛市供水实行基本水费和计量水费相结合的收费制度，在年度内不用水或用水量达不到3700万立方米时收取基本水费1400万元，用水量超过3700万立方米时，按计量水费办法收取水费；农业用水对水费标准实行分段计算，博兴县段0.03元/立方米，宋庄泵站以上寿光、广饶段0.04元/立方米，宋庄泵站以下王耨泵站以上段0.066元/立方米，王耨泵站以下亭口泵站以上段0.078元/立方米，亭口泵站以下棘洪滩泵站以上段0.087元/立方米；水费实行预售水票、凭票供水办法。
1990—1992年，平均供水量仅占设计供水量的37%，水费收入不足供水成本的1/3，工程严重亏本运行。1993年2月，省政府办公厅同意调整引黄济青供水价格，对青岛市供水价格定为0.89元/立方米，其水价调整3年内逐步到位，从1993年开始，将年基本水量调整为3700万立方米，年基本水费调整为3840万元，超过3700万立方米后，再用水量核定为0.47元/立方米。农业用水价格仍按泵站级次分段供水计收，博兴一干为0.05元/立方米，宋庄泵站以上为0.105元/立方米，王耨泵站以上为0.121元/立方米，亭口泵站以上为0.151元/立方米，入库泵站以上为0.185元/立方米，1993年按成本的60%计收。水费的收缴采取计划用水，预购水票、凭票供水的办法。此次水价，于1995年调整到位。
1994年3月，省政府物价部门核定1994年引黄济青工程供水价格，计量水价核定为0.645元/立方米。1995年7月25日，省政府物价部门确定计量水价为0.825元/立方米。
2001年9月，经省政府同意，省物价局决定从2001年1月1日起，调整引黄济青工程向青岛市供水基本水量和基本水费，基本水量由3700万立方米调整为9000万立方米，基本水费由3840万元调整为8212.5万元。
三、工程维护改造
1989年工程通水后，一般在非运行期的夏季从水费收入中列支资金，进行尾工建设和工程维护保养，特别是对威胁安全生产的设备、设施进行更新改造。同时，根据《山东省胶东地区引黄调水工程初步设计》，开展泵站增容改造。
（一）沉沙池清淤
引黄济青渠首工程建设期间，在泥沙池内布设6个控制测量断面，以便掌握沉积泥沙的沉积部位、沉积量和泥沙分选规律。沉沙池拦沙量占引进量的98.7%。至1993年6月，2号条渠沉沙量达530万立方米，自流沉沙功能全部丧失。1993—1995年，滨州分局用泥浆泵在沉沙条渠内清淤，弃土沿隔堤堆放在条渠内两侧，共清淤263.55万立方米。这种“以挖待沉、弃淤贴内坡”的方式开发了2号条渠的沉沙能力，为国家节约了大量资金，但沉沙面积减小30%，减少量为71.85万平方米。1996—1998年，用挖泥船和泥浆泵向3块外租弃淤场清淤346.2万立方米。1998年，沉沙池出水闸最大流量42立方米/秒。1999年春，3块堤外租用弃淤场29.04公顷按时还耕。1999—2002年，在堤外又租用3块弃淤场30.13公顷，根据排距远近分别采用挖泥船和泥浆泵作业，完成清淤285万立方米。
至2005年底，沉沙条渠平均淤高2.5米，引水能力、沉沙效果显著降低。与设计运行初期相比，在设计水位时，引水流量减少了70%。特别是1997年冬至1998年春引水期间，黄河流量过小，出现了无水可引，被迫停机3次的困难局面，用3个月时间才艰难完成年度引水4000万立方米的计划指标，相当于正常引水时间的3倍，是1990—2005年输水时间最长、停水次数最多、遇到困难最大的一年。
（二）小清河子槽工程管理
1989年试通水运行中，小清河子槽分洪道下游段渗漏严重。1990年，对6千米内坡进行混凝土板衬砌处理。为保证工程完整和通水安全，在运行通水前封堵所有建筑物和沟渠，通水运行时严格控制水位在4.5米左右。
（三）泵站维护改造
工程通水后,经多年运行，泵站机电设备锈蚀严重，机组运行效率明显降低。根据测算，棘洪滩泵站主机组运行效率，1996年为56.08%，2003年为48%。
胶东地区引黄调水工程前半段利用引黄济青工程，经过宋庄和王耨两级泵站提水，因南水北调工程未建成，先引用黄河水。2001—2005年，为增大工程输水流量，对宋庄泵站进行了增容改造，包括4台主水泵的改型改造、7台主机励磁系统更换，站内高低压开关柜更换、保护系统更换，新增加自动化控制系统和视频监控系统。改造后，宋庄泵站的过流能力提高了8立方米/秒，缓解了供水压力。2005年，王耨泵站进行电气改造，安装视频监控装置，实现了泵站运行参数的自动采集、处理、控制和远距离传输功能。
（四）棘洪滩水库
1989—2005年，水库每年向青岛市供水2759～9006万立方米，运水位在9.38～12.58米之间，水质始终处于地面水二级以上良好状态，大坝渗漏、位移等参数均在设计规范要求内，大坝运行稳定正常。
1995年，完成放水闸机房维修改造，共改造启闭机13台，全部消除噪声件及隐患。1996年，对溢洪闸房及机电设备进行改造，实现闸门启闭灵活，运行可靠目标。1997年4—8月，在大坝东南与西北方向，对历年水位变幅范围内破坏严重部分进行加固，完成混凝土内坡加固长度6.8千米，坡长10.8米；2000年，完成内坡加固1.8千米。大坝外坡通过苜蓿播种、草皮移植、环库保护区绿化等措施，坝后绿化带形成规模，彻底改良了土壤，保护了工程及水质。
引黄济青工程原设计只为青岛市内4区供水，但实际供水量只占设计供水量的50%～60%。为充分发挥工程效益，增加向水库周边市区供水功能。2004年，向黄岛区供水工程建成，当年供水121万立方米，2005年供水902万立方米，超过300万立方米的合同指标。2005年8月，省引黄济青工程管理局总投资3600多万元，建成棘洪滩水库水厂，设计日供水能力4万吨，并实现向城阳区西部棘洪滩、上马、红岛街道供水169万立方米。至2005年底，棘洪滩水库库存水量1.39亿立方米，水位12.87米。
（五）工程自动化建设
1997—2001年，工程实施自动化建设，实现了4座泵站、31座闸站调度运行参数在调度中心的集中控制；实现了在省局调度中心对输水河闸的自动控制；建立了动态、静态水体计算模型，提供动态、静态水体及数据查寻；建立了引黄济青系统Internet网站，开发了包括公文、人事、档案管理、办公管理及工程信息査询等几大模块的Web OA 系统，建立了Web服务器，实现了系统内信息管理、查询计算机网络化；建立了引黄济青图像传输系统，实现了济南调度中心与棘洪滩泵站图像实时传输。
（六）工程绿化
工程建成初期，输水河内肩外坡裸露，严重影响工程的安全运行。1994—1996年，沿线群众和工程管理单位干部职工在工程沿线开展大规模植树造林活动，栽植各类树木90余万株、灌木300万墩、绿篱250千米、草皮80万平方米。截至2005年底，工程沿线绿化土地近1000公顷，成为长达295千米的绿色林带，对有效防止土壤沙化、减少土壤流失、保护工程安全、改良两岸地下水质起到了积极作用，极大改善了周边地区生态环境。
四、水质管理
1989年，省政府发布《关于加强引黄济青工程管理的布告》《山东省引黄济青工程管理试行办法》，为引黄济青工程管理提供法律依据。1990年，经省编委和省公安厅批准，工程沿线8个工程管理处成立了水利公安派出所。1998年4月，省政府对《山东省引黄济青工程管理试行办法》进行修正，其中对工程沿线的水质保护、水污染防治作出明确规定。引水期间，对引水水源、渠道、水库水质全面监测。