山东省被列入世界遗产的有齐长城（1987年12月作为长城的重要组成部分列入世界文化遗产）、泰山（1987年12月列入世界文化与自然遗产）、曲阜孔府、孔庙、孔林（1994年12月列入世界文化遗产）。
一、保护法规与规划
1991—2005年，省及各遗产地除认真履行《世界遗产公约》，贯彻执行2002年文化部、国家文物局等9部委局联合发布的《关于加强和改善世界遗产保护管理工作的意见》和2004年国务院办公厅批转文化部、国家文物局等部门《关于加强我国世界文化遗产保护管理工作的意见》等文件外，也开始着手地方立法工作。为了加强对泰山的保护，1991年9月19日，泰安市第十一届人大常委会第二十五次会议通过《关于加强泰山风景名胜区管理保护工作的决议》；1994年6月1日泰安市第十二届人大常委会第八次会议通过《泰山风景名胜区管理办法》；2000年10月26日省第九届人大常委会第十七次会议审议通过《泰山风景名胜区保护管理条例》。为加强曲阜“三孔”保护，1991年，曲阜市人民政府印发《关于在孔林等古墓葬区内实行殡葬改革的暂行规定》；1995年9月，曲阜市人民政府印发《曲阜市文物保护管理办法》，同年下发《关于清理“三孔”及文物重点保护单位外围环境的通知》，1997年下发《禁止在古建筑群、古林地等文物保护区燃放烟花爆竹的通知》。2003年6月，省文化厅、省公安厅、省国土资源厅、省建设厅、省环境保护局、省旅游局联合下发《关于进一步加强齐长城保护管理工作的通知》。
规划编制工作同步展开。泰安市自1987年着手泰山风景名胜区的总体规划编制工作，1998年，再次委托清华大学进行修编，发布《泰山风景名胜区总体规划（2000—2020）》。规划核心区面积156平方千米，缓冲区面积约40平方千米。总体规划分为总体布局、道路系统、保护、旅游业发展设想等14个专题，专项规划分为文物保护、绿化、环境保护、给水排水、供电配电、电信、环境容量7个专题。2005年，曲阜市聘请大学及科研机构完成对“三孔”的全面测绘，总体保护规划的编制工作初步完成。
二、监测与安全
为加强遗产地管理，泰山和曲阜“三孔”都加强了管理机构建设。
泰山的管理体制多次变更，2004年进行重大调整改革，授权泰山景区党工委、管委会对泰山景区范围内的经济、行政、社会事务实行统一领导和管理，行使市委、市政府及市直有关部门赋予或委托的管理权，并承担相应的行政和法律责任。泰山管委文物局下设文物管理处、文物考古研究所、古建维修队。泰山盘路、古建筑分属各泰山管理区管辖，泰山沿途各庙宇及唐摩崖、经石峪分设16个文物管理所，同时泰山管委成立行政执法局，附属5个执法大队、9个执法中队。
曲阜市自中华人民共和国成立后一直设有稳定、独立的文物管理机构。2001年6月，曲阜市文物管理委员会设立“三孔”世界遗产监测办公室，专职负责“三孔”世界遗产监测工作，并在孔庙、孔府、孔林各设立一个文物管理处。齐长城地跨18个县（市、区），均由当地文管所负责管理。另外，1997年10月，泰山景区管理委员会为庆祝泰山列为世界遗产10周年，举行盛大纪念活动；投资3000万元的泰山人文与自然咨询中心正式投入运行。泰山、曲阜“三孔”按照国际公约规定，建立了科学档案资料和社会咨询陈列。1998年5月，建设部、国家文物局、联合国教科文组织中国委员会授予曲阜市文物局“中国世界遗产保护管理先进单位”称号。
遗产地的监测工作逐步规范化、制度化。监测内容包括文物本体保存状况、安全与减灾、核心区和缓冲区内的自然、人为变化、周边地区开发对文物本体的影响、游客承载量等。2003年，泰山按照世界遗产组织监测标准，建成综合运用图、文、声、像等多种形式的数据库。数据库分为文化遗产库、自然遗产库、监测库三大部分。其中，文化遗产库包括泰山石刻、纪念物、古建筑、古遗址等方面的资料，自然遗产库包括泰山地质地貌、十大自然景观、十大自然奇观及古树名木等方面的资料，监测库包括遗产地调查资料汇编、泰山图片库及石刻、古建筑、自然景观、动物等9个部分的详细情况。曲阜市自1997年对文物的图、文、声、像信息进行三维存储和科学管理，持续探索文物本体及环境监测预警由以人力为主的不确定性向依靠科技的科学化、精细化发展的新途径。1998年2月，省文化厅按照世界遗产管理保护国际通则，向国家文物局呈报了曲阜“三孔”的第一份《保护状态定期监测报告》。
安全与减灾是世界遗产保护工作的重中之重。截至2005年底，泰山已连续17年无火灾。除实行严格的责任制外，始终保持机具完好率达到98%，确保通信24小时畅通。2004年投资900余万元建成泰山森林防火视频监控系统，1个总控指挥中心和12个分控中心通过网络与覆盖泰山景区的28处高倍率、高清晰度摄像机相连，实现了森林、景点的24小时全天候监控。曲阜市文物局建立和完善了“四大安全系统”，即气体灭火防盗报警和电视监控等装置的报警系统、有线无线通信系统、安全地缆供电系统、消防给水灭火系统。成立专兼职消防安全队伍，每年的安防、消防演练已形成制度，同时实行严格的岗位责任制度、巡逻值班制度、文物安全检查制度等一系列安全制度，形成集“人防、物防、技防”为一体的文物安全防范体系。齐长城主要采取专兼职结合的巡查管理办法，各地聘请林场或当地村民逐步建立起一支业余文物保护队伍，其中仅济南一地即聘请齐长城保护员47名，每个保护员均明确看护段落，颁发聘书，配发服装。
三、文化遗产保护
20世纪90年代起，泰山启动了历史上最大规模的修缮和整治工程，迁移拆除景区内民房1万余平方米，主要古建筑和经石峪、唐摩崖等重要石刻都得到了维修和保护。其中，中路盘道维修工程是近百年内最大规模的修缮工程。泰山中路古盘道始建于秦始皇泰山封禅，此后的汉、隋、唐历代都有维修、增补和加宽，形成今日规模，是泰山的石刻走廊和寺庙宫观等人文景观集中的精华地段。维修工程分两个阶段进行，先从中天门至玉皇顶开始，2004年完成红门至中天门盘道，仅石砌盘道就修缮了6660级。岱庙的保护修缮工程具有时代意义。因岱庙长期被多个单位占用，自20世纪90年代起，泰安市先后清理了正阳门外遥参亭两侧影响岱庙景观、不利于文物保护的建筑，拆除岱庙内与古建筑风格迥异、有碍岱庙整体风貌的现代建筑，清理了延禧殿遗址，修复了部分西城墙。2001年11月，泰安市人民政府作出“市政府搬迁，归还岱庙部分要尽快修复、完善，恢复岱庙原貌”的决定，市政府让出占用岱庙基址的30多亩土地、两栋办公楼和附属设施，归还岱庙用于文物管理保护。2003年7月1日，历时一年多的岱庙西城墙修复工程完工，残缺半个多世纪的“岱庙方城”恢复原貌。在西华门的考古发掘中还发现宋、元、明、清各代的建筑遗迹等，进一步佐证了岱庙的始建年代。北、东城墙和四个角楼、天贶殿等都进行了大修。
曲阜市有一支富有历史传统且配置稳定的文物修缮专业队伍，并始终坚持大修、小修和日常保养相结合。孔庙进行的主要工程有东庑揭瓦维修，围墙工程，圣迹殿及两侧门、角楼、大成殿龙柱维修等；孔府进行的主要工程有新建文物档案馆，围墙工程，二门、大堂、前上房维修，西路建筑恢复及复原陈列，西仓院复建并建成汉魏碑刻陈列馆，东路九如堂院复建等；孔林进行的主要工程有围墙大修、神道拓宽等。另外，曲阜市加大对孔庙周围环境的整治，搬迁孔庙东侧阙里街商业网点280个。全面整治了孔庙、孔府、孔林的排水系统，维修并开放孔子故居，对1.7万株古树实施建档管理。
齐长城由于历史的变迁，人为和自然的损害都十分严重，特别是改革开放后穿越齐长城的南北交通以及局部的风景区建设，使保护与建设之间的矛盾更加突出。沿线各地在推进保护范围划定工作的同时，保护工作主要是协调建设、制止破坏。由于技术和环境原因，仅济南和莱芜进行了零星的保护修缮工程，资源调查与研究逐步展开。1997年，莱芜市对境内齐长城进行了细致的调查，共调查出大关4个、小关13个，丈量境内齐长城长64160米。完成齐长城的勘界工作。2001年9月，山东省勘界工作领导小组印发《关于确定章丘莱城线齐长城段边界走向及有关问题的处理意见》，其边界走向以两地的土地详查线作为两地齐长城的行政区域界线。2002年，为配合同三高速公路工程，省文物考古研究所、胶南市博物馆对胶南市铁山镇苗家河20余公里的东周时期的长城进行调查发掘，摸清该段长城的走向、入海路线、墙体夯筑材料与现存状况，并对工程占压部分进行发掘，确定建造时代为东周。这一时期对齐长城最系统的调查由5人自发组织进行。1996年，泰安市路宗元等5人组成考察队，历时367天，行程万余公里，跨越2000余座山峰，对齐长城进行了徒步考察。主要收获有：（1）提出新的建制年代考证。（2）测量了齐长城的准确长度。实测长度（包括3条复线在内）618893米，仍可观察到遗址者占总长度的64.3%。（3）考证了起止点。（4）发现了与主线并行的3条复线。（5）了解了城墙的基本构筑形式和结构特点。这些考察成果解开了部分历史疑案，矫正了个别古籍记载的谬误。考察结束后，省委宣传部、省文化厅在济南举行齐长城考察新闻发布会，对考察队进行了表彰奖励。中国东方文化研究会和中国文物学会联合举办了中国齐长城文化学术研讨会，来自全国各地的60多位专家学者对5人徒步考察齐长城的做法以及所取得的成果予以高度评价。
第四节 世界遗产保护管理
山东省被列入世界遗产的有齐长城（1987年12月作为长城的重要组成部分列入世界文化遗产）、泰山（1987年12月列入世界文化与自然遗产）、曲阜孔府、孔庙、孔林（1994年12月列入世界文化遗产）。
一、保护法规与规划
1991—2005年，省及各遗产地除认真履行《世界遗产公约》，贯彻执行2002年文化部、国家文物局等9部委局联合发布的《关于加强和改善世界遗产保护管理工作的意见》和2004年国务院办公厅批转文化部、国家文物局等部门《关于加强我国世界文化遗产保护管理工作的意见》等文件外，也开始着手地方立法工作。为了加强对泰山的保护，1991年9月19日，泰安市第十一届人大常委会第二十五次会议通过《关于加强泰山风景名胜区管理保护工作的决议》；1994年6月1日泰安市第十二届人大常委会第八次会议通过《泰山风景名胜区管理办法》；2000年10月26日省第九届人大常委会第十七次会议审议通过《泰山风景名胜区保护管理条例》。为加强曲阜“三孔”保护，1991年，曲阜市人民政府印发《关于在孔林等古墓葬区内实行殡葬改革的暂行规定》；1995年9月，曲阜市人民政府印发《曲阜市文物保护管理办法》，同年下发《关于清理“三孔”及文物重点保护单位外围环境的通知》，1997年下发《禁止在古建筑群、古林地等文物保护区燃放烟花爆竹的通知》。2003年6月，省文化厅、省公安厅、省国土资源厅、省建设厅、省环境保护局、省旅游局联合下发《关于进一步加强齐长城保护管理工作的通知》。
规划编制工作同步展开。泰安市自1987年着手泰山风景名胜区的总体规划编制工作，1998年，再次委托清华大学进行修编，发布《泰山风景名胜区总体规划（2000—2020）》。规划核心区面积156平方千米，缓冲区面积约40平方千米。总体规划分为总体布局、道路系统、保护、旅游业发展设想等14个专题，专项规划分为文物保护、绿化、环境保护、给水排水、供电配电、电信、环境容量7个专题。2005年，曲阜市聘请大学及科研机构完成对“三孔”的全面测绘，总体保护规划的编制工作初步完成。
二、监测与安全
为加强遗产地管理，泰山和曲阜“三孔”都加强了管理机构建设。
泰山的管理体制多次变更，2004年进行重大调整改革，授权泰山景区党工委、管委会对泰山景区范围内的经济、行政、社会事务实行统一领导和管理，行使市委、市政府及市直有关部门赋予或委托的管理权，并承担相应的行政和法律责任。泰山管委文物局下设文物管理处、文物考古研究所、古建维修队。泰山盘路、古建筑分属各泰山管理区管辖，泰山沿途各庙宇及唐摩崖、经石峪分设16个文物管理所，同时泰山管委成立行政执法局，附属5个执法大队、9个执法中队。
曲阜市自中华人民共和国成立后一直设有稳定、独立的文物管理机构。2001年6月，曲阜市文物管理委员会设立“三孔”世界遗产监测办公室，专职负责“三孔”世界遗产监测工作，并在孔庙、孔府、孔林各设立一个文物管理处。齐长城地跨18个县（市、区），均由当地文管所负责管理。另外，1997年10月，泰山景区管理委员会为庆祝泰山列为世界遗产10周年，举行盛大纪念活动；投资3000万元的泰山人文与自然咨询中心正式投入运行。泰山、曲阜“三孔”按照国际公约规定，建立了科学档案资料和社会咨询陈列。1998年5月，建设部、国家文物局、联合国教科文组织中国委员会授予曲阜市文物局“中国世界遗产保护管理先进单位”称号。
遗产地的监测工作逐步规范化、制度化。监测内容包括文物本体保存状况、安全与减灾、核心区和缓冲区内的自然、人为变化、周边地区开发对文物本体的影响、游客承载量等。2003年，泰山按照世界遗产组织监测标准，建成综合运用图、文、声、像等多种形式的数据库。数据库分为文化遗产库、自然遗产库、监测库三大部分。其中，文化遗产库包括泰山石刻、纪念物、古建筑、古遗址等方面的资料，自然遗产库包括泰山地质地貌、十大自然景观、十大自然奇观及古树名木等方面的资料，监测库包括遗产地调查资料汇编、泰山图片库及石刻、古建筑、自然景观、动物等9个部分的详细情况。曲阜市自1997年对文物的图、文、声、像信息进行三维存储和科学管理，持续探索文物本体及环境监测预警由以人力为主的不确定性向依靠科技的科学化、精细化发展的新途径。1998年2月，省文化厅按照世界遗产管理保护国际通则，向国家文物局呈报了曲阜“三孔”的第一份《保护状态定期监测报告》。
安全与减灾是世界遗产保护工作的重中之重。截至2005年底，泰山已连续17年无火灾。除实行严格的责任制外，始终保持机具完好率达到98%，确保通信24小时畅通。2004年投资900余万元建成泰山森林防火视频监控系统，1个总控指挥中心和12个分控中心通过网络与覆盖泰山景区的28处高倍率、高清晰度摄像机相连，实现了森林、景点的24小时全天候监控。曲阜市文物局建立和完善了“四大安全系统”，即气体灭火防盗报警和电视监控等装置的报警系统、有线无线通信系统、安全地缆供电系统、消防给水灭火系统。成立专兼职消防安全队伍，每年的安防、消防演练已形成制度，同时实行严格的岗位责任制度、巡逻值班制度、文物安全检查制度等一系列安全制度，形成集“人防、物防、技防”为一体的文物安全防范体系。齐长城主要采取专兼职结合的巡查管理办法，各地聘请林场或当地村民逐步建立起一支业余文物保护队伍，其中仅济南一地即聘请齐长城保护员47名，每个保护员均明确看护段落，颁发聘书，配发服装。
三、文化遗产保护
20世纪90年代起，泰山启动了历史上最大规模的修缮和整治工程，迁移拆除景区内民房1万余平方米，主要古建筑和经石峪、唐摩崖等重要石刻都得到了维修和保护。其中，中路盘道维修工程是近百年内最大规模的修缮工程。泰山中路古盘道始建于秦始皇泰山封禅，此后的汉、隋、唐历代都有维修、增补和加宽，形成今日规模，是泰山的石刻走廊和寺庙宫观等人文景观集中的精华地段。维修工程分两个阶段进行，先从中天门至玉皇顶开始，2004年完成红门至中天门盘道，仅石砌盘道就修缮了6660级。岱庙的保护修缮工程具有时代意义。因岱庙长期被多个单位占用，自20世纪90年代起，泰安市先后清理了正阳门外遥参亭两侧影响岱庙景观、不利于文物保护的建筑，拆除岱庙内与古建筑风格迥异、有碍岱庙整体风貌的现代建筑，清理了延禧殿遗址，修复了部分西城墙。2001年11月，泰安市人民政府作出“市政府搬迁，归还岱庙部分要尽快修复、完善，恢复岱庙原貌”的决定，市政府让出占用岱庙基址的30多亩土地、两栋办公楼和附属设施，归还岱庙用于文物管理保护。2003年7月1日，历时一年多的岱庙西城墙修复工程完工，残缺半个多世纪的“岱庙方城”恢复原貌。在西华门的考古发掘中还发现宋、元、明、清各代的建筑遗迹等，进一步佐证了岱庙的始建年代。北、东城墙和四个角楼、天贶殿等都进行了大修。
曲阜市有一支富有历史传统且配置稳定的文物修缮专业队伍，并始终坚持大修、小修和日常保养相结合。孔庙进行的主要工程有东庑揭瓦维修，围墙工程，圣迹殿及两侧门、角楼、大成殿龙柱维修等；孔府进行的主要工程有新建文物档案馆，围墙工程，二门、大堂、前上房维修，西路建筑恢复及复原陈列，西仓院复建并建成汉魏碑刻陈列馆，东路九如堂院复建等；孔林进行的主要工程有围墙大修、神道拓宽等。另外，曲阜市加大对孔庙周围环境的整治，搬迁孔庙东侧阙里街商业网点280个。全面整治了孔庙、孔府、孔林的排水系统，维修并开放孔子故居，对1.7万株古树实施建档管理。
齐长城由于历史的变迁，人为和自然的损害都十分严重，特别是改革开放后穿越齐长城的南北交通以及局部的风景区建设，使保护与建设之间的矛盾更加突出。沿线各地在推进保护范围划定工作的同时，保护工作主要是协调建设、制止破坏。由于技术和环境原因，仅济南和莱芜进行了零星的保护修缮工程，资源调查与研究逐步展开。1997年，莱芜市对境内齐长城进行了细致的调查，共调查出大关4个、小关13个，丈量境内齐长城长64160米。完成齐长城的勘界工作。2001年9月，山东省勘界工作领导小组印发《关于确定章丘莱城线齐长城段边界走向及有关问题的处理意见》，其边界走向以两地的土地详查线作为两地齐长城的行政区域界线。2002年，为配合同三高速公路工程，省文物考古研究所、胶南市博物馆对胶南市铁山镇苗家河20余公里的东周时期的长城进行调查发掘，摸清该段长城的走向、入海路线、墙体夯筑材料与现存状况，并对工程占压部分进行发掘，确定建造时代为东周。这一时期对齐长城最系统的调查由5人自发组织进行。1996年，泰安市路宗元等5人组成考察队，历时367天，行程万余公里，跨越2000余座山峰，对齐长城进行了徒步考察。主要收获有：（1）提出新的建制年代考证。（2）测量了齐长城的准确长度。实测长度（包括3条复线在内）618893米，仍可观察到遗址者占总长度的64.3%。（3）考证了起止点。（4）发现了与主线并行的3条复线。（5）了解了城墙的基本构筑形式和结构特点。这些考察成果解开了部分历史疑案，矫正了个别古籍记载的谬误。考察结束后，省委宣传部、省文化厅在济南举行齐长城考察新闻发布会，对考察队进行了表彰奖励。中国东方文化研究会和中国文物学会联合举办了中国齐长城文化学术研讨会，来自全国各地的60多位专家学者对5人徒步考察齐长城的做法以及所取得的成果予以高度评价。