1986年4月15日，国家体委颁布《关于体育体制改革的决定（草案）》，全国体育体制改革拉开序幕。为适应现代体育发展规律，山东省在训练体制上进行改革。20世纪80年代，山东省训练体制的改革主要有两条：（1）办省优秀运动队，采取省里直接办，委托市（地）办或资助市（地）办，以及鼓励市（地）、企业、高校自己办等多种形式。（2）走体育队伍院校化道路，建立专业训练与业余训练紧密衔接的一条龙训练体制。这种训练体制的高级训练阶段由省体育运动技术学校等单位承担，中级训练阶段由省体校、市（地）体校、体育中学等学校承担，初级训练阶段由普通业余体校、体育传统项目学校和普通中、小学承担。各级学校之间形成紧密联系的“宝塔形”训练体制。
但至20世纪80年代末，山东省体育总体比较落后，突出表现是竞技运动水平不高，尖子少而不尖。问题主要表现在：（1）改革起步晚、力度小、成效不大。第六届全运会后，管理、训练体制不尽合理，竞争、激励、约束机制不完善。运动队基本上实行的是队委会负责制，教练员聘任制流于形式，责、权、利不统一、不到位。（2）奥运战略不突出。在项目调整上，没有坚决贯彻缩短战线、突出重点、发挥优势，向全运、奥运战略靠拢的方针，所设置的36个项目中，有9个非奥运项目，战线过长，重点不重，投资效益不高。省、市、县三级没有真正围绕奥运战略形成思想一盘棋、组织一条龙、训练一贯制的局面，专业与业余训练网络上下衔接不紧，高水平体育后备人才缺乏。（3）教练员知识老化，缺乏科学先进的训练方法，缺少高水平教练员。省优秀运动队选招运动员制度不完备，对运动员缺乏严格管理。（4）训练设施不配套，体育场馆利用率低。
进入20世纪90年代，山东省从优化运动项目布局、改革体育管理体制、加强科学训练和理顺业余训练体制等方面进行了改革。
一、运动项目调整
20世纪80年代末，山东省运动队相对比较稳定。1987年，山东省有田径、游泳、体操、举重、武术、射箭、足球、篮球、排球、乒乓球、羽毛球、曲棍球、手球、射击、无线电测向、摩托车、跳伞、滑水、航空模型、航海模型、艺术体操、花样游泳、跳水、棋类、帆船、帆板、摩托艇、赛艇、皮划艇、摔跤、柔道、击剑、自行车、网球、垒球、蹼泳36个项目设立优秀运动队，有运动员792人。1988年，山东省增设现代五项，设立优秀运动队的项目37个，共有在队优秀运动员769人。1989年，山东省设立优秀运动队的运动项目增加滑翔，取消了垒球项目，共有优秀运动员893人。
20世纪90年代是山东体育事业发展的重要时期。1990年,省体育局从实际出发，调整运动项目布局。按照“突出重点、发挥优势、缩短战线、狠抓尖子”和向奥运会靠拢的指导思想，对山东省现有项目逐步进行调整。此次项目布局主要采取加强、压缩和调整3种形式。具有优势或潜力的重点项目，集中人、财、物重点保障，采取措施保尖子、上水平，努力向国家队输送更多队员。对训练耗资大、器材设备昂贵的项目或非奥运项目，又较少参加国际比赛的项目慎重调整。
1990年，山东省设立优秀运动队的项目有田径、游泳、花样游泳、跳水、举重、体操、艺术体操、射击、射箭、摔跤、柔道、自行车、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、现代五项、篮球、排球、足球、乒乓球、羽毛球、手球、曲棍球、武术、无线电测向、蹼泳、飞机跳伞、拳击、击剑、滑水、摩托车、航海模型、航空模型、摩托艇35项，在队优秀运动员945人。
1991年,山东省优化重点项目布局，集中人力、物力、财力优先发展重点项目，设有优秀运动队的项目有篮球、足球、现代五项等30多个，努力使3/5的项目达到全国先进水平，全省有优秀运动员969人。山东省优先发展田径项目，在威海体育训练基地组建省田径二队。同时充分发挥各市(地)、行业、企业、高校自办优秀运动队的积极性。
1994年3月，全省体育工作会议讨论通过《山东省体委关于体育改革的方案》，在训练体制改革中，突出5个战略重点项目和16个重点项目，项目设置向全运会、奥运会靠拢。在省优秀运动队普遍实行教练员聘任制和主教练负责制。省优秀运动队进行了项目设置和布局调整。在项目设置上，贯彻缩短战线、突出重点、发挥优势、调动各方面积极性的方针，依据运动项目发展方向，在奥运会、全运会上的成绩和教练员水平，兼顾项目影响、金牌多少、设施条件、社会基础等因素，对运动项目分类设置，在人、财、物、科研、政策等方面区别对待，确保重点，以形成拳头项目。省优秀运动队项目设置分5类32项：第一类为战略重点项目，包括田径、游泳、举重、国际式摔跤（男）、柔道；第二类为重点项目，包括跳水、体操、拳击、射击、射箭、自行车、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、足球、篮球、排球、乒乓球、羽毛球、武术；第三类为发展项目，包括艺术体操、手球、铁饼三项；第四类为计划发展项目，包括网球；第五类为保留项目，包括飞机跳伞、航空模型、航海模型、摩托车、摩托艇、蹼泳、滑水。保留项目面向社会，发展方向为试办俱乐部，一边创收、一边训练参赛。其中滑水自1994年起停拨经费，第二年后按创收经费一定比例上缴；其他项目当年按编制拨给经费，第二年经费减半，第三年停拨经费（保留编制），第四年后按创收经费一定比例上缴。在项目布局上，贯彻有利于多强竞争和调动各方面积极性的原则，调整省优秀运动队项目布局。试办俱乐部，试点以单项运动协会为主的管理体制。在省项目形成一定规模的前提下，对具备高水平教练员，训练场地设施、经费、后勤和医务监督、训练科研、营养恢复等条件的市（地）、单位布局办省优秀运动队，与省办优秀运动队负有相同任务，享有同等待遇；各市（地）建立优秀运动队，以形成竞争之势，相互促进，共同提高。省体育运动技术学院13项：田径、游泳、举重、体操、国际式摔跤（男）、柔道、射箭、足球（女）、篮球、排球、乒乓球、武术、铁饼。省体育中心6项：田径、游泳、跳水、艺术体操、足球（男）、网球。省竞技体育学校6项：拳击、射击、自行车、飞机跳伞、航空模型、摩托车。省水上运动技术学校2项：赛艇、皮划艇。省青岛体育训练基地1项：射箭。省威海体育训练基地2项：田径、举重（女）。济南市1项：羽毛球。烟台市1项：手球（女）。青岛市航海运动学校5项：帆船、帆板、航海模型、摩托艇、滑水。烟台市航海运动学校2项：帆板、蹼泳。山东体育学院成立竞技体育班，布局部分战略重点项目。
1998年，本着一切有利于出人才、出成绩、出效益，一切有利于优秀运动队建设的原则，山东省对于迎战亚运会、奥运会、第九届全运会的项目设置和布局、保障条件、政策措施、任务目标进行充分的分析论证，并在此基础上制定实施了山东省迎战“三运会”的总体工作方案。当年，山东省在国际、国内比赛中取得较好成绩，省体委被国家体育总局授予“1998年为我国体育事业作出突出贡献单位”和“在第十三届亚运会上作出突出贡献单位”称号。
2002年，着眼于备战2004年、2008年奥运会和第十届全运会，按照“强化重点项目，巩固优势项目，发展集体项目，增设短缺项目的原则”，山东省调整优秀运动队项目设置、布局和编制配置。全运会项目设置：田径、游泳、举重、摔跤、柔道、跆拳道、体操（蹦床）、射击、自行车、拳击、射箭、击剑、羽毛球、手球、网球、武术套路、散手、跳水、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、足球、篮球、排球（沙排）、乒乓球，增加铁人三项。同时调整部分项目隶属关系：省体育中心田径项目划归省体育运动技术学院。羽毛球、网球项目划归新的管理单位前，省体育中心继续确保这两支项目队伍冬训正常的训练条件。重新组建山东省水上项目运动队，将帆船、帆板的管理体制进行调整，收回省里直接管理。将赛艇、皮划艇、帆船、帆板4个项目相对集中，形成集团优势。在省体育运动技术学院增设铁人三项项目，摔跤队增设女子摔跤项目。在青岛训练基地增设男子手球，田径短、跨和投掷项目。理顺水上项目管理体制，省水上运动学校（微山）的赛艇、皮划艇项目，青岛航海学校的帆船项目，烟台航海学校的帆板项目调整到日照，组成新的省水上运动学校。调整之后山东省运动项目布局是：省体育运动技术学院承担田径、游泳、举重、摔跤、柔道、跆拳道、体操（蹦床）、羽毛球、铁人三项（新增），省竞技体育学校承担射击、自行车，省武术院承担散手（含女子）、武术套路，省青岛训练基地承担射箭、拳击、击剑、男子手球、网球及拟增加的田径（短跑跨栏、投掷），省威海训练基地承担田径（中长跑、投掷）、女子举重、女子手球，省日照水上项目基地承担赛艇、皮划艇、帆船、帆板，省体育中心承担跳水，省足球管理中心承担足球，省篮球管理中心承担篮球，省排球管理中心承担排球（沙排），省乒乓球管理中心承担乒乓球。
二、管理体制改革
20世纪80年代，山东省体育管理体制的改革主要是纵向完善和横向扩展。纵向完善是强化省、市、县三级体委的纵向管理体制，强化体委“领导、协调、监督”3项职能。横向扩展是建立省有关部门、社会团体构成的横向管理体制，充分发挥各级体育总会、协会对体育领导工作的补充作用。管理体制的改革打破了体委独家办体育的局面，扩大了体育领导的范围、规模和投资渠道，形成一个以体委为主体，社会有关部门和团体为两翼，各级体育总会、协会为补充的体育管理网络。
进入20世纪90年代，体育管理体制改革在促进形式上由行政型向社会型转变，在实现政事分开、管办分离等方面采取了一系列措施，主要有：（1）建立各种层次、各种类型的体育俱乐部。1993年底，济南泰山足球俱乐部揭牌成立。1999年，乒乓球、女子足球、女子体操、篮球、排球等项目的俱乐部相继建成。这些体育俱乐部管理形式不尽相同，有的由体委（或其直属单位）与企业共同管理，有的实行董事会领导下的总经理负责制，有的由事业或企业自主管理。各个项目俱乐部的建立，使体育向社会化发展迈出了非常重要的一步。（2）体委进行内部机构改革调整。首先是一些部门由行政型向事业型转变，初步实现政事分开、管办分离。1994年8月，省编委批复同意撤销省体委外事处，成立山东省对外体育交流中心。在机构设置上，省体委撤销竞赛、训练、群体处，设立综合业务、竞技体育、学校业余训练处和社会体育处（与省体育总会秘书处合署办公），理顺了工作关系。1996年4月10日，省编委批复，同意山东省体育产业开发处更名为山东省体育彩票管理中心，为处级事业单位，主要职能是负责中国体育彩票在山东省内的发行组织和管理工作，并从事相关体育产业的开发业务；成立省体育彩票管理中心，把原来由省体委管理的这部分工作分离出来。其次是转变部分直属单位职能，将省体育中心、省武术院、青岛训练基地和威海训练基地的职能，由经营创收为主，转变为以负责优秀运动队训练、竞赛为主，进一步增强山东竞技体育的整体实力和发展后劲。（3）成立运动项目管理中心，逐步实现协会实体化。为实现运动项目管理方面的改革，推动足球运动的社会化发展，1996年1月，山东省足球管理中心成立。其主要职责是负责全省足球运动项目业务管理，指导足球俱乐部建设，开展与足球项目有关的经营服务活动，并承办省足球协会日常工作。省足球运动管理中心的建立和此后几年的工作，为运动项目管理的改革发挥了先导作用。把原由体委直接管理的一部分工作剥离出来，逐步实现项目管理的社会化和实体化，有利于行政部门把工作逐步转移到宏观调控上来。
进入21世纪，山东省从两个方面继续深化体育管理体制改革。体育行政管理体制改革方面，转变体育行政部门职能，逐步实现政事分开、管办分离，逐步实现由政府办事业向社会办产业的转变。明确政府和社会的事权划分，体育行政部门把工作重点转移到贯彻国家方针、政策，研究制定体育行业政策和发展规划，依法加强行业管理和提供服务上来，把不应由政府行使的职能转移给事业单位、社会团体和中介组织。积极推进体育工作运行机制的转换，加快体育制度创新，建立有利于竞争协作、灵活高效的运行机制。训练管理体制改革方面，逐步理顺单项运动协会、运动项目管理单位和体育俱乐部的关系。由各运动项目管理中心对相应运动项目的专业、业余训练及竞赛实施统一管理。提倡、鼓励多渠道、多层次办优秀运动队和业余训练。1999年3月至2000年10月，先后成立篮球、排球、乒乓球、小球、棋类5个运动项目管理中心。2003年根据事业发展需要，成立田径、游泳、举跆、摔柔、体操等运动项目管理中心。
三、科学训练
1990年，山东省集中力量做好迎接亚运会、城运会和第七届全运会工作。强调“科学技术是第一生产力”，提出要依靠科技进步，振兴山东体育。1991年是执行山东体育事业“八五”计划的第一年，山东省按照《中国体育发展与改革纲要》要求，研究体育发展和改革措施，部署20世纪90年代及当年的体育工作，强调进一步强化“科技兴体”意识，充分认识现代体育科技对培养尖子运动员和提高运动技术水平的重要作用，将体育工作的着重点转移到依靠体育科学技术进步和提高体育工作者素质的轨道上来。
1994年，省体委制定《关于体育改革的方案》，提出以实施“一二三战略”为核心的工作思路。山东省体育系统在训练、竞赛、体育科技等方面进行了一系列改革。按照缩短战线、突出重点，向奧运会、全运会靠拢的原则，实行训练体制改革，积极探索科学的训练方法和手段，在省优秀运动队，对运动员实行“24小时全方位科学安排”。实施金牌带动战略，对重点项目和尖子运动员，在训练、科技、服务、生活等方面给予重点倾斜。训练经费实行效益投资，保证重点，择优扶持，动态管理。对教练员实行聘任制，平等竞争，择优上岗。在运动队实行以主（总）教练负责制为主的多种管理形式，充分发挥教练员的主导作用。在深入贯彻“三从一大”训练原则的基础上，山东省结合实际进行训练创新，不断探索、创新科学的训练方法和手段，提出“多课次、高强度、大运动量”的训练方法。新的训练模式提出后，在运动训练竞赛实践中得到验证，山东省竞技体育取得突飞猛进的发展，在1997年第八届全运会上，山东省体育代表团获得26枚金牌、21枚银牌、25枚铜牌，总分1428分。金牌总数由第七届的第十一位上升到第三位，实现历史性突破。
1995年，山东省实施奥运争光计划，努力提高竞技体育水平，突出运动训练这一中心工作，重点抓优秀运动队各项管理制度的改革，制定《迎八运运动员、教练员训练津贴办法》《获得世界、亚洲和全国年度最高水平比赛冠军奖励办法》《省优秀运动队运动员、教练员到国家队集训和比赛经费补助办法》《迎八运尖子运动员伙食补助办法》等政策。
1996年，针对山东省历来有大赛之前成绩好、而大赛之年成绩下降的现象，省体委分析梳理了5个主要原因：（1）尖子群体规模小，实力不突出。主要表现在强项不强，尖子不尖，体能不强，技术不细，科技意识不强，科技手段不利。（2）对竞技体育基本规律把握不准，主要体现在对训练阶段的划分把握不好，即对体能发展4个阶段（体能基础、体能积累、体能强化、体能突破）的划分和各阶段的主要训练任务把握不准。（3）对大赛前的训练安排把握不好。主要表现在教练思想保守，观念陈旧，总是在大赛前保得多、守得多、调整多、创新少。（4）运动员年龄结构不合理。（5）对运动员思想教育不够。为此，山东省提出在训练中要处理好系统训练与强度训练，系统训练与针对性训练，大强度、大运动量训练与营养恢复，运动训练与思想教育，运动训练与业务学习和业务研究5个方面关系，训练工作强调解决“科技兴体、先兴科技”和“科学训练、先训教练”这两大问题，抓好“三从一大”训练原则和“两严”方针的贯彻落实，深化、充实、完善训练模式，坚持以系统训练为基础，以强度训练为重点，以针对性训练为突破口；坚持练中赛，赛中练；坚持走出去，请进来；坚持合理营养、科学恢复与大强度、大运动量训练的有机结合。
1997年，山东省体育工作围绕提高尖子选手的竞技水平，进一步树立科学的训练指导思想，根据存在的薄弱环节和竞争对手的情况采取措施，重点强化运动员心理素质的训练，提高运动员在大赛中的心理承受能力。为适应建立社会主义市场经济体制的要求，山东省制定《山东省体育改革总体方案》，在训练、竞赛、管理等方面进行一系列改革。积极推进科技兴体，走“科训”一体化道路，制定并实施体育科技发展规划和奥运争光科技计划，使体育科研与运动训练紧密结合。省体育科研中心第一期工程的建成，提高了科技为训练服务的能力。
1999年，山东省在训练中强调严格科学的训练，提出把体育科技和运动实战紧密结合起来，实现“医、科、训”一体化。强调抓好体育应用科学技术的研究，吸收借鉴国内外先进体育科技成果，把科学技术尽快转化为现实的体育运动能力；培养和引进高水平体育科技人才，尽快形成自己的学科带头人；进一步加大体育科技投入，完善配套先进的科研仪器设备，增强科技为训练比赛服务的能力；动员和组织社会力量，对影响体育事业发展的关键课题，进行联合攻关。
2001年，省体育局在深入调查研究、多方科学论证的基础上，确定新周期全省体育工作的基本思路，即“一三六五工程”。在实施好全民健身计划的同时，把提高竞技体育水平，特别是把在奥运会、亚运会、第九届全运会上争创佳绩作为全省体育工作的重中之重，制定实施《山东省迎战奥运会、亚运会、九运会总体工作方案》。确立抓奥运、带亚运、促全运的指导思想，把主要精力集中到迎战奥运会、亚运会、第九届全运会上来。九运周期，山东省在训练工作中坚决贯彻“三从一大”训练原则和“两严”方针，积极推进“科、训、医、教”一体化建设，改革科技服务的管理方式，实行科技人员跟队服务制度，有效地促进了训练与科技的紧密结合。在积极探索适合自身特点的训练方法和手段的同时，注重运动员心理素质的训练，提升了运动员参加大赛的能力。
2002年，省体育局对十运周期的项目设置、布局进行调整，初步形成山东省竞技体育以六大训练基地为骨干、包括25个运动项目的基本框架结构。根据《山东省竞技体育十运周期总体工作方案》，制定《山东省优秀运动队十运周期项目设置、布局、编制配置和任务指标》等文件，以及《山东省备战第十四届亚运会工作方案》等配套政策，运动队的正规化建设得到进一步加强。上半年，全省优秀运动队共举办12个项目、约600人次的运动选材集训，举办了6个项目、约2000人次的教练员培训。
2004年，山东省加强备战“两运”68年周期规律的研究与探索。在研究把握运动员成才规律和大赛周期规律基础上，探索山东省备战奥运会、全运会6—8年的周期规律和工作机制，提出“抓一线、带二线、挂三线”的工作思路。进一步明确一线的任务是备战“两运会”，二线主要是备战下个周期的“两运会”；一线、二线建设由省队负责，三线队伍设在市体校，“挂三线”就是要求各训练单位及运动队必须抓好45个基层训练点；一线、二线、三线运动员的比例应达到1∶2∶20。
四、理顺业余训练体制
1994年1月，山东省决定在县级机构改革中，经济强县、全国体育先进县和百万人口以上的大县单设体育运动委员会，从而为县一级开展体育工作奠定了管理和组织基础，促进了全省体育事业发展。1995年，省体委、省教委联合印发《山东省县级体校办学规定》，第一次将县级体校列入九年制义务教育序列，不仅解决了县级体校的建制问题，也解决了长期困扰县级体校发展的人员编制、经费、教学设施等问题。此后，在中专体校招生制度上进行改革，打破地区界限，实行全省统招，严把新生质量关，不断提高教学、训练水平，并逐步向专业体校过渡。1999年，省体委制定《山东省业余训练工作改革方案》以及10个方面的配套措施，从基地建设、项目设置和布局、人才选拔和输送、运动员注册管理和交流等方面，对加快体育后备人才的培养进行了系统规划，使训练工作取得更快发展。
第二节 训练体制改革
1986年4月15日，国家体委颁布《关于体育体制改革的决定（草案）》，全国体育体制改革拉开序幕。为适应现代体育发展规律，山东省在训练体制上进行改革。20世纪80年代，山东省训练体制的改革主要有两条：（1）办省优秀运动队，采取省里直接办，委托市（地）办或资助市（地）办，以及鼓励市（地）、企业、高校自己办等多种形式。（2）走体育队伍院校化道路，建立专业训练与业余训练紧密衔接的一条龙训练体制。这种训练体制的高级训练阶段由省体育运动技术学校等单位承担，中级训练阶段由省体校、市（地）体校、体育中学等学校承担，初级训练阶段由普通业余体校、体育传统项目学校和普通中、小学承担。各级学校之间形成紧密联系的“宝塔形”训练体制。
但至20世纪80年代末，山东省体育总体比较落后，突出表现是竞技运动水平不高，尖子少而不尖。问题主要表现在：（1）改革起步晚、力度小、成效不大。第六届全运会后，管理、训练体制不尽合理，竞争、激励、约束机制不完善。运动队基本上实行的是队委会负责制，教练员聘任制流于形式，责、权、利不统一、不到位。（2）奥运战略不突出。在项目调整上，没有坚决贯彻缩短战线、突出重点、发挥优势，向全运、奥运战略靠拢的方针，所设置的36个项目中，有9个非奥运项目，战线过长，重点不重，投资效益不高。省、市、县三级没有真正围绕奥运战略形成思想一盘棋、组织一条龙、训练一贯制的局面，专业与业余训练网络上下衔接不紧，高水平体育后备人才缺乏。（3）教练员知识老化，缺乏科学先进的训练方法，缺少高水平教练员。省优秀运动队选招运动员制度不完备，对运动员缺乏严格管理。（4）训练设施不配套，体育场馆利用率低。
进入20世纪90年代，山东省从优化运动项目布局、改革体育管理体制、加强科学训练和理顺业余训练体制等方面进行了改革。
一、运动项目调整
20世纪80年代末，山东省运动队相对比较稳定。1987年，山东省有田径、游泳、体操、举重、武术、射箭、足球、篮球、排球、乒乓球、羽毛球、曲棍球、手球、射击、无线电测向、摩托车、跳伞、滑水、航空模型、航海模型、艺术体操、花样游泳、跳水、棋类、帆船、帆板、摩托艇、赛艇、皮划艇、摔跤、柔道、击剑、自行车、网球、垒球、蹼泳36个项目设立优秀运动队，有运动员792人。1988年，山东省增设现代五项，设立优秀运动队的项目37个，共有在队优秀运动员769人。1989年，山东省设立优秀运动队的运动项目增加滑翔，取消了垒球项目，共有优秀运动员893人。
20世纪90年代是山东体育事业发展的重要时期。1990年,省体育局从实际出发，调整运动项目布局。按照“突出重点、发挥优势、缩短战线、狠抓尖子”和向奥运会靠拢的指导思想，对山东省现有项目逐步进行调整。此次项目布局主要采取加强、压缩和调整3种形式。具有优势或潜力的重点项目，集中人、财、物重点保障，采取措施保尖子、上水平，努力向国家队输送更多队员。对训练耗资大、器材设备昂贵的项目或非奥运项目，又较少参加国际比赛的项目慎重调整。
1990年，山东省设立优秀运动队的项目有田径、游泳、花样游泳、跳水、举重、体操、艺术体操、射击、射箭、摔跤、柔道、自行车、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、现代五项、篮球、排球、足球、乒乓球、羽毛球、手球、曲棍球、武术、无线电测向、蹼泳、飞机跳伞、拳击、击剑、滑水、摩托车、航海模型、航空模型、摩托艇35项，在队优秀运动员945人。
1991年,山东省优化重点项目布局，集中人力、物力、财力优先发展重点项目，设有优秀运动队的项目有篮球、足球、现代五项等30多个，努力使3/5的项目达到全国先进水平，全省有优秀运动员969人。山东省优先发展田径项目，在威海体育训练基地组建省田径二队。同时充分发挥各市(地)、行业、企业、高校自办优秀运动队的积极性。
1994年3月，全省体育工作会议讨论通过《山东省体委关于体育改革的方案》，在训练体制改革中，突出5个战略重点项目和16个重点项目，项目设置向全运会、奥运会靠拢。在省优秀运动队普遍实行教练员聘任制和主教练负责制。省优秀运动队进行了项目设置和布局调整。在项目设置上，贯彻缩短战线、突出重点、发挥优势、调动各方面积极性的方针，依据运动项目发展方向，在奥运会、全运会上的成绩和教练员水平，兼顾项目影响、金牌多少、设施条件、社会基础等因素，对运动项目分类设置，在人、财、物、科研、政策等方面区别对待，确保重点，以形成拳头项目。省优秀运动队项目设置分5类32项：第一类为战略重点项目，包括田径、游泳、举重、国际式摔跤（男）、柔道；第二类为重点项目，包括跳水、体操、拳击、射击、射箭、自行车、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、足球、篮球、排球、乒乓球、羽毛球、武术；第三类为发展项目，包括艺术体操、手球、铁饼三项；第四类为计划发展项目，包括网球；第五类为保留项目，包括飞机跳伞、航空模型、航海模型、摩托车、摩托艇、蹼泳、滑水。保留项目面向社会，发展方向为试办俱乐部，一边创收、一边训练参赛。其中滑水自1994年起停拨经费，第二年后按创收经费一定比例上缴；其他项目当年按编制拨给经费，第二年经费减半，第三年停拨经费（保留编制），第四年后按创收经费一定比例上缴。在项目布局上，贯彻有利于多强竞争和调动各方面积极性的原则，调整省优秀运动队项目布局。试办俱乐部，试点以单项运动协会为主的管理体制。在省项目形成一定规模的前提下，对具备高水平教练员，训练场地设施、经费、后勤和医务监督、训练科研、营养恢复等条件的市（地）、单位布局办省优秀运动队，与省办优秀运动队负有相同任务，享有同等待遇；各市（地）建立优秀运动队，以形成竞争之势，相互促进，共同提高。省体育运动技术学院13项：田径、游泳、举重、体操、国际式摔跤（男）、柔道、射箭、足球（女）、篮球、排球、乒乓球、武术、铁饼。省体育中心6项：田径、游泳、跳水、艺术体操、足球（男）、网球。省竞技体育学校6项：拳击、射击、自行车、飞机跳伞、航空模型、摩托车。省水上运动技术学校2项：赛艇、皮划艇。省青岛体育训练基地1项：射箭。省威海体育训练基地2项：田径、举重（女）。济南市1项：羽毛球。烟台市1项：手球（女）。青岛市航海运动学校5项：帆船、帆板、航海模型、摩托艇、滑水。烟台市航海运动学校2项：帆板、蹼泳。山东体育学院成立竞技体育班，布局部分战略重点项目。
1998年，本着一切有利于出人才、出成绩、出效益，一切有利于优秀运动队建设的原则，山东省对于迎战亚运会、奥运会、第九届全运会的项目设置和布局、保障条件、政策措施、任务目标进行充分的分析论证，并在此基础上制定实施了山东省迎战“三运会”的总体工作方案。当年，山东省在国际、国内比赛中取得较好成绩，省体委被国家体育总局授予“1998年为我国体育事业作出突出贡献单位”和“在第十三届亚运会上作出突出贡献单位”称号。
2002年，着眼于备战2004年、2008年奥运会和第十届全运会，按照“强化重点项目，巩固优势项目，发展集体项目，增设短缺项目的原则”，山东省调整优秀运动队项目设置、布局和编制配置。全运会项目设置：田径、游泳、举重、摔跤、柔道、跆拳道、体操（蹦床）、射击、自行车、拳击、射箭、击剑、羽毛球、手球、网球、武术套路、散手、跳水、赛艇、皮划艇、帆船、帆板、足球、篮球、排球（沙排）、乒乓球，增加铁人三项。同时调整部分项目隶属关系：省体育中心田径项目划归省体育运动技术学院。羽毛球、网球项目划归新的管理单位前，省体育中心继续确保这两支项目队伍冬训正常的训练条件。重新组建山东省水上项目运动队，将帆船、帆板的管理体制进行调整，收回省里直接管理。将赛艇、皮划艇、帆船、帆板4个项目相对集中，形成集团优势。在省体育运动技术学院增设铁人三项项目，摔跤队增设女子摔跤项目。在青岛训练基地增设男子手球，田径短、跨和投掷项目。理顺水上项目管理体制，省水上运动学校（微山）的赛艇、皮划艇项目，青岛航海学校的帆船项目，烟台航海学校的帆板项目调整到日照，组成新的省水上运动学校。调整之后山东省运动项目布局是：省体育运动技术学院承担田径、游泳、举重、摔跤、柔道、跆拳道、体操（蹦床）、羽毛球、铁人三项（新增），省竞技体育学校承担射击、自行车，省武术院承担散手（含女子）、武术套路，省青岛训练基地承担射箭、拳击、击剑、男子手球、网球及拟增加的田径（短跑跨栏、投掷），省威海训练基地承担田径（中长跑、投掷）、女子举重、女子手球，省日照水上项目基地承担赛艇、皮划艇、帆船、帆板，省体育中心承担跳水，省足球管理中心承担足球，省篮球管理中心承担篮球，省排球管理中心承担排球（沙排），省乒乓球管理中心承担乒乓球。
二、管理体制改革
20世纪80年代，山东省体育管理体制的改革主要是纵向完善和横向扩展。纵向完善是强化省、市、县三级体委的纵向管理体制，强化体委“领导、协调、监督”3项职能。横向扩展是建立省有关部门、社会团体构成的横向管理体制，充分发挥各级体育总会、协会对体育领导工作的补充作用。管理体制的改革打破了体委独家办体育的局面，扩大了体育领导的范围、规模和投资渠道，形成一个以体委为主体，社会有关部门和团体为两翼，各级体育总会、协会为补充的体育管理网络。
进入20世纪90年代，体育管理体制改革在促进形式上由行政型向社会型转变，在实现政事分开、管办分离等方面采取了一系列措施，主要有：（1）建立各种层次、各种类型的体育俱乐部。1993年底，济南泰山足球俱乐部揭牌成立。1999年，乒乓球、女子足球、女子体操、篮球、排球等项目的俱乐部相继建成。这些体育俱乐部管理形式不尽相同，有的由体委（或其直属单位）与企业共同管理，有的实行董事会领导下的总经理负责制，有的由事业或企业自主管理。各个项目俱乐部的建立，使体育向社会化发展迈出了非常重要的一步。（2）体委进行内部机构改革调整。首先是一些部门由行政型向事业型转变，初步实现政事分开、管办分离。1994年8月，省编委批复同意撤销省体委外事处，成立山东省对外体育交流中心。在机构设置上，省体委撤销竞赛、训练、群体处，设立综合业务、竞技体育、学校业余训练处和社会体育处（与省体育总会秘书处合署办公），理顺了工作关系。1996年4月10日，省编委批复，同意山东省体育产业开发处更名为山东省体育彩票管理中心，为处级事业单位，主要职能是负责中国体育彩票在山东省内的发行组织和管理工作，并从事相关体育产业的开发业务；成立省体育彩票管理中心，把原来由省体委管理的这部分工作分离出来。其次是转变部分直属单位职能，将省体育中心、省武术院、青岛训练基地和威海训练基地的职能，由经营创收为主，转变为以负责优秀运动队训练、竞赛为主，进一步增强山东竞技体育的整体实力和发展后劲。（3）成立运动项目管理中心，逐步实现协会实体化。为实现运动项目管理方面的改革，推动足球运动的社会化发展，1996年1月，山东省足球管理中心成立。其主要职责是负责全省足球运动项目业务管理，指导足球俱乐部建设，开展与足球项目有关的经营服务活动，并承办省足球协会日常工作。省足球运动管理中心的建立和此后几年的工作，为运动项目管理的改革发挥了先导作用。把原由体委直接管理的一部分工作剥离出来，逐步实现项目管理的社会化和实体化，有利于行政部门把工作逐步转移到宏观调控上来。
进入21世纪，山东省从两个方面继续深化体育管理体制改革。体育行政管理体制改革方面，转变体育行政部门职能，逐步实现政事分开、管办分离，逐步实现由政府办事业向社会办产业的转变。明确政府和社会的事权划分，体育行政部门把工作重点转移到贯彻国家方针、政策，研究制定体育行业政策和发展规划，依法加强行业管理和提供服务上来，把不应由政府行使的职能转移给事业单位、社会团体和中介组织。积极推进体育工作运行机制的转换，加快体育制度创新，建立有利于竞争协作、灵活高效的运行机制。训练管理体制改革方面，逐步理顺单项运动协会、运动项目管理单位和体育俱乐部的关系。由各运动项目管理中心对相应运动项目的专业、业余训练及竞赛实施统一管理。提倡、鼓励多渠道、多层次办优秀运动队和业余训练。1999年3月至2000年10月，先后成立篮球、排球、乒乓球、小球、棋类5个运动项目管理中心。2003年根据事业发展需要，成立田径、游泳、举跆、摔柔、体操等运动项目管理中心。
三、科学训练
1990年，山东省集中力量做好迎接亚运会、城运会和第七届全运会工作。强调“科学技术是第一生产力”，提出要依靠科技进步，振兴山东体育。1991年是执行山东体育事业“八五”计划的第一年，山东省按照《中国体育发展与改革纲要》要求，研究体育发展和改革措施，部署20世纪90年代及当年的体育工作，强调进一步强化“科技兴体”意识，充分认识现代体育科技对培养尖子运动员和提高运动技术水平的重要作用，将体育工作的着重点转移到依靠体育科学技术进步和提高体育工作者素质的轨道上来。
1994年，省体委制定《关于体育改革的方案》，提出以实施“一二三战略”为核心的工作思路。山东省体育系统在训练、竞赛、体育科技等方面进行了一系列改革。按照缩短战线、突出重点，向奧运会、全运会靠拢的原则，实行训练体制改革，积极探索科学的训练方法和手段，在省优秀运动队，对运动员实行“24小时全方位科学安排”。实施金牌带动战略，对重点项目和尖子运动员，在训练、科技、服务、生活等方面给予重点倾斜。训练经费实行效益投资，保证重点，择优扶持，动态管理。对教练员实行聘任制，平等竞争，择优上岗。在运动队实行以主（总）教练负责制为主的多种管理形式，充分发挥教练员的主导作用。在深入贯彻“三从一大”训练原则的基础上，山东省结合实际进行训练创新，不断探索、创新科学的训练方法和手段，提出“多课次、高强度、大运动量”的训练方法。新的训练模式提出后，在运动训练竞赛实践中得到验证，山东省竞技体育取得突飞猛进的发展，在1997年第八届全运会上，山东省体育代表团获得26枚金牌、21枚银牌、25枚铜牌，总分1428分。金牌总数由第七届的第十一位上升到第三位，实现历史性突破。
1995年，山东省实施奥运争光计划，努力提高竞技体育水平，突出运动训练这一中心工作，重点抓优秀运动队各项管理制度的改革，制定《迎八运运动员、教练员训练津贴办法》《获得世界、亚洲和全国年度最高水平比赛冠军奖励办法》《省优秀运动队运动员、教练员到国家队集训和比赛经费补助办法》《迎八运尖子运动员伙食补助办法》等政策。
1996年，针对山东省历来有大赛之前成绩好、而大赛之年成绩下降的现象，省体委分析梳理了5个主要原因：（1）尖子群体规模小，实力不突出。主要表现在强项不强，尖子不尖，体能不强，技术不细，科技意识不强，科技手段不利。（2）对竞技体育基本规律把握不准，主要体现在对训练阶段的划分把握不好，即对体能发展4个阶段（体能基础、体能积累、体能强化、体能突破）的划分和各阶段的主要训练任务把握不准。（3）对大赛前的训练安排把握不好。主要表现在教练思想保守，观念陈旧，总是在大赛前保得多、守得多、调整多、创新少。（4）运动员年龄结构不合理。（5）对运动员思想教育不够。为此，山东省提出在训练中要处理好系统训练与强度训练，系统训练与针对性训练，大强度、大运动量训练与营养恢复，运动训练与思想教育，运动训练与业务学习和业务研究5个方面关系，训练工作强调解决“科技兴体、先兴科技”和“科学训练、先训教练”这两大问题，抓好“三从一大”训练原则和“两严”方针的贯彻落实，深化、充实、完善训练模式，坚持以系统训练为基础，以强度训练为重点，以针对性训练为突破口；坚持练中赛，赛中练；坚持走出去，请进来；坚持合理营养、科学恢复与大强度、大运动量训练的有机结合。
1997年，山东省体育工作围绕提高尖子选手的竞技水平，进一步树立科学的训练指导思想，根据存在的薄弱环节和竞争对手的情况采取措施，重点强化运动员心理素质的训练，提高运动员在大赛中的心理承受能力。为适应建立社会主义市场经济体制的要求，山东省制定《山东省体育改革总体方案》，在训练、竞赛、管理等方面进行一系列改革。积极推进科技兴体，走“科训”一体化道路，制定并实施体育科技发展规划和奥运争光科技计划，使体育科研与运动训练紧密结合。省体育科研中心第一期工程的建成，提高了科技为训练服务的能力。
1999年，山东省在训练中强调严格科学的训练，提出把体育科技和运动实战紧密结合起来，实现“医、科、训”一体化。强调抓好体育应用科学技术的研究，吸收借鉴国内外先进体育科技成果，把科学技术尽快转化为现实的体育运动能力；培养和引进高水平体育科技人才，尽快形成自己的学科带头人；进一步加大体育科技投入，完善配套先进的科研仪器设备，增强科技为训练比赛服务的能力；动员和组织社会力量，对影响体育事业发展的关键课题，进行联合攻关。
2001年，省体育局在深入调查研究、多方科学论证的基础上，确定新周期全省体育工作的基本思路，即“一三六五工程”。在实施好全民健身计划的同时，把提高竞技体育水平，特别是把在奥运会、亚运会、第九届全运会上争创佳绩作为全省体育工作的重中之重，制定实施《山东省迎战奥运会、亚运会、九运会总体工作方案》。确立抓奥运、带亚运、促全运的指导思想，把主要精力集中到迎战奥运会、亚运会、第九届全运会上来。九运周期，山东省在训练工作中坚决贯彻“三从一大”训练原则和“两严”方针，积极推进“科、训、医、教”一体化建设，改革科技服务的管理方式，实行科技人员跟队服务制度，有效地促进了训练与科技的紧密结合。在积极探索适合自身特点的训练方法和手段的同时，注重运动员心理素质的训练，提升了运动员参加大赛的能力。
2002年，省体育局对十运周期的项目设置、布局进行调整，初步形成山东省竞技体育以六大训练基地为骨干、包括25个运动项目的基本框架结构。根据《山东省竞技体育十运周期总体工作方案》，制定《山东省优秀运动队十运周期项目设置、布局、编制配置和任务指标》等文件，以及《山东省备战第十四届亚运会工作方案》等配套政策，运动队的正规化建设得到进一步加强。上半年，全省优秀运动队共举办12个项目、约600人次的运动选材集训，举办了6个项目、约2000人次的教练员培训。
2004年，山东省加强备战“两运”68年周期规律的研究与探索。在研究把握运动员成才规律和大赛周期规律基础上，探索山东省备战奥运会、全运会6—8年的周期规律和工作机制，提出“抓一线、带二线、挂三线”的工作思路。进一步明确一线的任务是备战“两运会”，二线主要是备战下个周期的“两运会”；一线、二线建设由省队负责，三线队伍设在市体校，“挂三线”就是要求各训练单位及运动队必须抓好45个基层训练点；一线、二线、三线运动员的比例应达到1∶2∶20。
四、理顺业余训练体制
1994年1月，山东省决定在县级机构改革中，经济强县、全国体育先进县和百万人口以上的大县单设体育运动委员会，从而为县一级开展体育工作奠定了管理和组织基础，促进了全省体育事业发展。1995年，省体委、省教委联合印发《山东省县级体校办学规定》，第一次将县级体校列入九年制义务教育序列，不仅解决了县级体校的建制问题，也解决了长期困扰县级体校发展的人员编制、经费、教学设施等问题。此后，在中专体校招生制度上进行改革，打破地区界限，实行全省统招，严把新生质量关，不断提高教学、训练水平，并逐步向专业体校过渡。1999年，省体委制定《山东省业余训练工作改革方案》以及10个方面的配套措施，从基地建设、项目设置和布局、人才选拔和输送、运动员注册管理和交流等方面，对加快体育后备人才的培养进行了系统规划，使训练工作取得更快发展。