一、登机检疫
入境的航空器到达后，检疫医师首先登机。机长或者授权的代理人，向卫生检疫机关提交总申报单、旅客名单、货物仓单和有效的灭蚊证书，以及其他有关检疫证件；检疫医师询问航空器上卫生状况，机长或其授权的代理人如实回答。在检疫结束之前，除卫生检疫机关许可外，任何人不得上下航空器，不准装卸行李、货物、邮包等物品。入境航空器查验后，对没有染疫的，检疫医师签发入境检疫证；如果该航空器有受卫生处理或限制的事项，检疫医师在入境检疫证上签注，由机长或授权代理人负责执行；对染疫或有染疫嫌疑的，除通知航空站外，对航空器发给卫生处理通知单，卫生处理完毕后，再发给入境检疫证。对出境航空器查验完毕后，如无染疫，检疫医师随即签发出境检疫证或在必要的卫生处理完毕后，发给出境检疫证。
1937年3月，中国航空公司和中央航空公司3架民航飞机拟在青岛军用机场临时降落。3月26日，青岛海港检疫所向两家公司发出通知，对临时停降的航班实施检疫，并要求事先向检疫所通报飞机起飞和降落时间、旅客人数、货物种类和数量，以便实施航空器检疫。此为山东航空卫生检疫之始。
1948年12月21日，国民政府卫生部指令青岛海港检疫所采用上海海港检疫所制定的《飞机除虫实施办法》，对来自国外港埠的入境飞机实施除虫。
1982年8月5日，经国务院、中央军委批准，青岛民航站使用海军流亭机场重新建站复航。1986年6月27日，青岛—香港定期包机航线开通。由此，山东航空器卫生检疫进入新的历史阶段。
1990年8月，国务院批准开通烟台—上海—香港空中航线。1991年3月29日，第一个国际航班首飞，结束烟台航空口岸无国际航班的历史。烟台卫生检疫局空港卫生检疫查验工作正式开始。
1991年9月17日，济南机场首发济南—香港航班（由东方航空公司执飞），济南空港卫生检疫工作随之开始。当年，检疫出境飞机62架次。
1992年8月10日，国务院印发《关于同意开放烟台航空货运口岸的批复》，批准烟台空港货运口岸对外开放。1993年3月，烟台至日本名古屋的货运包机航线开通。1994年6月30日，国务院批准烟台航空客运口岸正式对外开放。
1994年9月4日，国务院、中央军委批复山东省人民政府开放青岛、济南空中口岸请示，准予接受外国籍飞机。山东开始开展对外航空器的卫生检疫工作，结束了山东省无对外航空口岸的历史。
1994年9月7日，青岛机场开辟青岛—大阪航线。1995年12月24日，烟台国际机场开通沈阳—烟台—澳门航线并首次航行。1996年1月22日，烟台国际机场开通烟台—韩国汉城客运包机航线；10月2日，开通烟台—香港直接客运包机航线。同年8月起，烟台卫生检疫局开始独立执行航空器检疫查验。1997年12月26日，山东航空公司开通烟台至汉城的货运包机航线，此为国家批准的第一家执飞国际航线的地方航空公司。
1996年8月，济南机场开通济南—莫斯科货运航线。
1997年1月20日，国务院批准山东烟台航空口岸对外国籍飞机开放。同时，烟台机场被列为国家一类航空口岸。1998年5月8日，烟台至韩国汉城国际定期航班开通，烟台市成为山东省第二个拥有国际定期航班的城市。5月10日，韩国亚细亚航空公司的一架波音737飞机降落莱山机场，结束烟台航空口岸没有外籍飞机入境的历史。
2000年1月1日，烟台检验检疫局机场办事处正式挂牌，负责烟台机场国际航班出入境飞机、旅客及货物检验检疫和卫生监督工作。
2003年6月2日，青岛检验检疫局接到北京SOS救援中心紧急通知，一名英国籍病人在青岛因外伤需紧急转运香港，包租金鹿航空公司公务机，请求迅速办理检疫手续。考虑到病人因脑外伤需要担架护送，同时不能颠簸，决定特事特办，允许机组成员及旅客先登机然后进行健康申明表的填写和体温检测，未发现异常，准许出境。
2005年，青岛检验检疫局实施行政处罚3起，港龙航空公司（2月4日）、韩亚航空公司（3月7日）和日本航空公司（6月19日）的航班出境时未向检验检疫机关申报，未经检疫擅自离境，依据规定，对上述三家航空公司处以罚款。3月27日，中国威海—韩国首尔空中航线开通，威海大水泊机场首发国际航班，中国国际航空公司CA147执飞，威海空港口岸出入境检验检疫工作正式开始。首航后，由中国国际航空公司、山东航空公司、大韩航空公司、韩亚航空公司执飞威海—首尔航线，每周12个国际航班。当年，威海检验检疫局检疫出入境飞机897架次。
5月，海关总署与国家质检总局签署《关于建立关检合作机制备忘录》。青岛、济南、烟台检验检疫局分别与当地海关协商并签订合作协议，决定自7月1日起，调整航空口岸入境旅客申明卡，将现行入境健康检疫申明卡中行李物品的申报内容调整到海关进境旅客行李物品申报单，入境旅客入境检疫申明卡仍向检验检疫机关申报。此项改革，进一步完善了口岸入境物品申报制度，加快了旅客通关速度。
二、电讯检疫
2002年起，山东检验检疫局对入境航空器实施电讯检疫进入准备阶段。青岛、济南、烟台检验检疫局经过编写飞机电讯检疫程序、对飞机的卫生状况检查考核、颁发卫生证书等程序，做好各项有关准备工作，经山东检验检疫局评审考核，验收后正式运行。
2003年非典防控期间，青岛检验检疫局青岛机场办事处、济南检验检疫局济南机场办事处先后启动电讯检疫，要求各航空公司在航空器到达前10分钟，通过航站指挥中心的服务频道或本航空公司的签派，向检验检疫机关报告机组人员和旅客健康状况及航空器卫生状况，检验检疫机关做好记录，对来自非疫区且卫生状况正常的航空器，允许旅客直接下机。3月起，烟台检验检疫局机场办事处根据上级安排，准备国际航空器入境电讯检疫工作，经过编写飞机电讯检疫程序、对飞机进行卫生检查评分、颁发交通工具卫生证书等程序，电讯检疫工作就绪，试运行良好。9月，通过山东检验检疫局专家组评审，考核验收后正式运行。8月20日，山东检验检疫局对电讯检疫工作准备情况进行检查，对济南检验检疫局工作给予充分肯定。
至2005年底，山东检验检疫局完善出入境交通工具电子检疫系统，对来自非疫区取得船舶卫生证书的入境船舶全部实施电讯检疫。
三、军机、外交礼遇人员检疫
2004年6月20日，亚洲合作对话第三次外长会议（ACD）在青岛召开。青岛市政府专门成立ACD会议礼宾部。山东检验检疫局、青岛检验检疫局精心准备，开设专供ACD会议使用的绿色通道。会议代表航班抵达时，检验检疫人员对代表团成员免测体温，只收入境健康检疫申明卡，对其携带的行李物品给予外交礼遇。会议期间，共接送ACD会议有关国际航班29班，给予外交礼遇130多人。
2005年8月，中国与俄罗斯在山东半岛举行代号为“和平使命—2005”的联合军事演习。山东检验检疫局积极组织前期各项准备工作：制定中俄联合军事演习检验检疫实施方案；抽调骨干力量组成6个工作组，分别负责出入境飞机和人员检验检疫，出入境货物、食品和饮用水卫生监督，卫生除害处理、后勤服务。对于此次中俄军事演习的检验检疫工作，国防部有关领导给予高度评价。
1988—2005年山东空港口岸航空器检疫查验情况统计表
表2-3
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┃ 年份 │ 飞机 │乘务员工 (万人│ 年份 │ 飞机 │乘务员工 (万人┃
┃ │ (架次） │次） │ │ (架次） │次） ┃
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┃ 1988 │ 31 │ 0.03 │ 1997 │ 3624 │ 3.24 ┃
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┃ 1989 │ 65 │ 0.06 │ 1998 │ 4070 │ 4.03 ┃
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┃ 1990 │ 142 │ 0.14 │ 1999 │ 4362 │ 4.37 ┃
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┃ 1991 │ 261 │ 0.29 │ 2000 │ 5101 │ 3.83 ┃
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┃ 1992 │ 473 │ 0.408 │ 2001 │ 5445 │ 4.90 ┃
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┃ 1993 │ 609 │ 0.54 │ 2002 │ 6543 │ 5.98 ┃
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┃ 1994 │ 755 │ 0.71 │ 2003 │ 6818 │ 6.60 ┃
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┃ 1995 │ 2126 │ 1.79 │ 2004 │ 9881 │ 8.17 ┃
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┃ 1996 │ 2923 │ 2.70 │ 2005 │ 12312 │ 9.37 ┃
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1988—2005年山东空港口岸航空器检疫情况统计表
表2-4 单位：架次
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┃ 年份 │ 青岛 │ 济南 │ 烟台 │ 威海 ┃
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┃ 1988 │ 31 │ │ │ ┃
┠────────┼────────┼────────┼───────┼────────┨
┃ 1989 │ 65 │ │ │ ┃
┠────────┼────────┼────────┼───────┼────────┨
┃ 1990 │ 142 │ │ │ ┃
┠────────┼────────┼────────┼───────┼────────┨
┃ 1991 │ 229 │ 32 │ │ ┃
┠────────┼────────┼────────┼───────┼────────┨
┃ 1992 │ 338 │ 135 │ │ ┃
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┃ 1993 │ 447 │ 162 │ │ ┃
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┃ 1994 │ 582 │ 173 │ │ ┃
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┃ 1995 │ 1711 │ 371 │ 44 │ ┃
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┃ 1996 │ 2440 │ 409 │ 74 │ ┃
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┃ 1997 │ 2938 │ 402 │ 284 │ ┃
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┃ 1998 │ 3577 │ 215 │ 278 │ ┃
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┃ 1999 │ 3748 │ 168 │ 446 │ ┃
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┃ 2000 │ 4359 │ 233 │ 1110 │ ┃
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┃ 2001 │ 4466 │ 284 │ 1390 │ ┃
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┃ 2002 │ 5311 │ 354 │ 1756 │ ┃
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┃ 2003 │ 5787 │ 331 │ 1733 │ ┃
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┃ 2004 │ 8251 │ 513 │ 2221 │ ┃
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┃ 2005 │ 9713 │ 732 │ 2370 │ 897 ┃
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