1996年4月，枣庄第十棉纺厂进口美国棉花999.5吨，经检验，发现短重26.6吨，品级降级率36.4%，长度降长率3.9%，货中有污黑色点状物。枣庄商检局出具商检索赔证书，成功索赔17.2万美元。9月，山东临沂新光纺织公司从澳大利亚进口棉花825包、148吨，经临沂商检局检验，品级降级率98.8%，成功索赔16.7万美元。
1997年，山东口岸进口棉花数量创历史新高，但这一年也是到货质量最差的一年。上半年，进口棉花405批，检验不合格品383批，多是品级和重量问题。同年3月，全省进口棉花91批，品级均不合格，索赔181.13万美元。4月，滨州某企业进口美国棉花500吨，品级符合率仅32.32%，短重达10.55%。11月，中国台湾地区某合资企业进口印度棉498吨，因长度短于合同要求，降级率100%，短重14.77%，均全部索赔。
1998年，山东商检局检验进口棉花数量减少，为保证质量，山东商检局采取措施，全部实行自验。共检出不合格品324批，占总批次的87.57%，总索赔额达到238.72万美元。同年7月，国家商检局派专家组对山东某厂进口的300吨美国棉花进行复验，山东商检局积极配合，复验结果与出具的检验证书基本一致，得到了国家商检局专家组的肯定。
1998年，山东商检局制定发布《山东进出口棉花检验监管工作规范》。2000年，经修订后重新发布，完善了工作程序，细化了检验步骤，增加了国际通行的检验标准。
2000年，国家检验检疫局印发《进口棉花检验依据、掌握幅度及出证办法》，规定进口棉花的检验依据及掌握幅度，首先以购货合同为依据，如购货合同未约定，按照《进出口棉花检验规程》掌握；原国家商检局有关进口棉花的历次会议纪要、小结、总结等文件中的规定同时废止；进口棉花由国家检验检疫局指定的检验出证局负责品质检验和对外出证工作。青岛检验检疫局被国家检验检疫局指定为山东进口棉花检验出证局。
2000—2001年，山东口岸受国家宏观调控政策和国际棉花市场价格高的影响，进口量明显减少。
2002年，山东口岸进口棉花数量比2001年同比大幅度增长，重量增长873.6％，货值增长712.9％，约占全国进口量的50％。但进口棉花质量问题较突出，主要表现为品级降级高、降级幅度大、短重严重，夹杂劣质棉花，棉包破损、棉花被污染等。当年3月，山东某企业进口一批美国棉花，重量95.9吨，货值9.94万美元，经青岛检验检疫局检验，棉花品级不合格率42.86%，细度不合格率95.24%，短重率4.89%，出证成功索赔1.5198万美元。
2003年2月，国家质检总局下发《关于进一步加强进口棉花检验检疫工作有关问题的通知》。3月，下发《关于重申加强棉花检验检疫工作有关问题的通知》。同月，山东检验检疫局为加强进口棉花检验检疫工作，下发《关于加强进口棉花检验检疫工作的通知》，结合全省实际，贯彻国家质检总局提出的具体要求。11月25日，青岛检验检疫局纺织实验室（包括棉花检测室）通过CNAL实验室考核。
魏桥创业集团是滨州地区最大的纺织企业，也是进口棉花的主要用户，自2003年6月起，滨州检验检疫局开始接受进口棉花报检，品质检验委托青岛检验检疫局检验，滨州检验检疫局出具品质、重量证书。滨州地区进口棉花数量占全省进口量的50％。2004年，滨州检验检疫局共接受进口棉花报检523批、40.66万吨，货值6.73亿美元。经检验发现，在品质和重量方面存在问题的360批，共出具索赔证书730份，对外索赔810万美元。
2005年，山东检验检疫局严格进口棉花的工作程序和检验标准，加强检测仪器设备的配置，切实把好质量关。1—10月，全省检验进口棉花1421批、53万吨，货值6.63亿美元，检出品质、重量等不合格棉花1273批、50万吨，涉及货值6.28亿美元，出证对外成功索赔1244万美元，有效维护了国内企业的经济利益。
2005年，山东口岸进口棉花同比批次增加26.01％、重量下降1.61％、货值下降22.73％。进口棉花总体质量水平呈下降趋势，经检验，不合格品有1793批、671400吨，货值89591.44万美元，共对外索赔1695.07万美元。山东口岸进口棉花主要来源于美国、埃及、澳大利亚、巴拉圭、贝宁、布基纳法索、马里等国家，以美国棉花为主。进口棉花以高等级棉花为主，SM、M等级为进口棉花的主体等级，占进口总量的29.26％。贸易方式以进料加工贸易为主。山东口岸进口棉花的地区有：青岛、滨州、济宁、枣庄、泰安等。当年，青岛口岸进口棉花经青岛、黄岛检验检疫局检验2001批、72.69万吨，货值95188.52万美元；滨州地区进口棉花经滨州检验检疫局检验500批、40.36万吨，货值52666.36万美元。
1996—2005年山东口岸进口棉花检验情况统计表
表1-20
┏━━━━━━━━━━┯━━━━━━━━━━┯━━━━━━━━━━┯━━━━━━━━━━┓
┃ 年份 │ 批次 │ 数重量（吨） │ 货值（万美元） ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 1996 │ 571 │ 199414 │ 36690.4 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 1997 │ 788 │ 229744 │ 41635.87 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 1998 │ 399 │ 72400 │ 12759.34 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 1999 │ 439 │ 79640 │ 14035.27 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2000 │ 92 │ 16689.57 │ 2890.50 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2001 │ 71 │ 8492.12 │ 2168.80 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2002 │ 217 │ 95057.29 │ 10974.00 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2003 │ 1286 │ 352948.75 │ 96969.63 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2004 │ 2202 │ 415041.73 │ 196644.11 ┃
┠──────────┼──────────┼──────────┼──────────┨
┃ 2005 │ 2631 │ 419589.33 │ 164420.78 ┃
┗━━━━━━━━━━┷━━━━━━━━━━┷━━━━━━━━━━┷━━━━━━━━━━┛