1899年7月1日，胶澳海关成立，设专职医官，兼港口卫生及动物检疫。
1904年，设胶澳海关检疫所，此为山东卫生检疫和动物检疫之始。
1914年11月，日本侵占青岛，设立兽疫检查所，强行检验输入日本的牲畜产品。1922年，兽疫检查所改称兽疫调查所，业务未变。
1929年7月6日，民国工商部青岛商品检验局成立，动植物检疫工作在商品检验中实施。
中华人民共和国成立后，中央人民政府农业部下设畜牧兽医局和病虫害防治局，负责国内的动植物检疫和防治工作。对外动植物检疫工作，由中央政府贸易部国外贸易司商品检疫处负责（活畜的检疫工作仍由农业部门负责）。山东各口岸进出口的动植物及其产品，均由商检机构检验检疫。
1961年，中国开始大批进口粮食、食糖、动植物油脂等动植物产品。为防止动植物疫病、害虫、杂草籽等传入、传播，保障农牧业生产安全，1965年4月，农业部批准在全国27个口岸设立动植物检疫机构。同年10月，青岛动植物检疫所开始筹建。
1966年1月10日，青岛动植物检疫所成立，青岛商检局将动植物检疫工作移交该所。1971年2月，动植物检疫工作复回青岛商检局管理。1976年8月，恢复青岛动植物检疫所建制，独立承担动植物检疫工作，由农业部和山东省农业厅双重领导。
1980年11月25日，国务院批转农业部《关于改变口岸动植物检疫所管理体制的报告》，将全国36个口岸动植物检疫所全部改为农业部直属单位。1981年9月，国务院批准农业部成立动植物检疫总所。同月，青岛动植物检疫所划归农业部动植物检疫总所领导。
1983年7月6日，日照市石臼港对外开放，农业部批准设立石臼动植物检疫所，隶属青岛动植物检疫所。1989年5月31日，日照市岚山港经国务院批准为二类开放口岸，随后设立岚山动植物检疫所，由石臼动植物检疫所管理。
1990年9月26日，经农业部批准青岛动植物检疫所设立流亭机场办事处。
1991年4月23日，农业部批准青岛动植物检疫所升格为副厅级单位，编制80人，陈忠国任所长。1992年4月，农业部决定将全国口岸动植物检疫所统一改称动植物检疫局，青岛动植物检疫所更名为青岛动植物检疫局。同年5月，烟台、威海、龙口、石岛、石臼、岚山动植物检疫所更名为动植物检疫局。
1994年6月20日，农业部决定全国动植物检疫局实行划片管理，山东片以青岛动植物检疫局为中心局，烟台、威海、龙口、石岛、石臼、岚山动植物检疫局划归青岛动植物检疫局领导。
1994年8月，经国务院批准，动植物检疫总所更名为动植物检疫局,对内称农业部动植物检疫局。同月，农业部批准在黄岛前湾港区设立黄岛动植物检疫局。
1996—1997年，经农业部批准，成立东营、菏泽、莱州、潍坊、临沂、济宁动植物检疫局，均为青岛动植物检疫局的分支机构。
至1999年11月，青岛动植物检疫局内设机构为：办公室、人事处、综合业务处、动检处、植检处、财务处,在职人员121人。
1965—1999年青岛动植物检疫局（所）历任主要负责人一览表
表5-2
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┃ 姓名 │ 职务 │ 任职时间 ┃
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┃ 张洪信 │ 青岛动植物检疫所所长 │ 1965.10-1976.08 ┃
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┃ 逄伯祥 │ 青岛动植物检疫所所长 │ 1976.08-1988.01 ┃
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┃ 陈忠国 │ 青岛动植物检疫所所长 │ 1988.01-1992.04 ┃
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┃ │ 青岛动植物检疫局局长、党组书记 │ 1992.04-1998.01 ┃
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┃ 高安 │ 青岛动植物检疫局局长、党组书记 │ 1998.01-1999.11 ┃
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