1993年，青岛海关成为全国税收10亿以上的十大海关之一。全年罚没收入缴库16623万元，征收车辆购置附加费1.8亿元，上缴监管手续费3176万元，关务费498万元，规费收入留成300余万元，年底税费暂存资金1.89亿元。年内，青岛海关按海关总署要求报送减税、免税、保税货物监管手续费征管工作情况，青岛海关监管手续费由各业务现场计算并开出监管手续费缴纳证，货主持缴纳证和支票到指定银行缴纳，按户核算，各业务处凭回执联核销，财务处汇总、记账、报表，所征监管手续费无拖欠情况。
1994年，青岛海关在税收中充分发挥税费财务工作的会计监督作用，配合业务部门开展税收征管工作。同时，实行奖励制度，对完成税收任务好，上缴罚没收入、行政事业收费多的单位实行奖励，全年完成税收任务的115%。年内，青岛海关根据海关总署《关于清理欠税的紧急通知》要求，结合关区有关企业欠税的实际情况，区别对象采取不同措施进行催缴。对经济状况好，但纳税态度消极的企业，所欠税款商请银行扣缴；对经济状况不好的企业，在保证不影响企业生产的前提下，要求先缴纳部分税款；对属于地方政府已宣布破产的企业所欠税款，上报呆账处理。
1995年，青岛海关准确、及时地完成税款缴库和退库会计核算任务，从当年的5万余票税单中认真查找、核对税款，发现税款假入库情事13起，追缴税款14万余元，滞纳金1万元，完成税收任务的109%。年内，青岛海关严格按规定汇、缴、转各种税费收入，改进税收管理模式，采取财会部门与业务部门相互制约的方法，加强对税费的管理。逐项落实保证金各项管理，制定完善《青岛海关保证金收、转、退的管理办法》。科学设置税费账目，在“应缴税费收入”科目下，设置“分关上缴罚没收入”和“分关上缴规费收入”两个子科目，使税费核算更加直接反映全关区税费收入情况；在“规费”科目下，加设“滞报金”和“免税店监管手续费”两个子科目，以规范报表统计。
1996年，青岛海关建立税款核销专人负责制及定期核销、催缴入库制度，加强对税费核注和过录表数据的审核，加强对入库税单的核销，实施有效监管。年内，追回假入库税单3票，计82万元，其中追缴滞纳金5.4万元；完成税收任务的137%，罚没收入入库1.79亿元，汇缴中央财政海关行政收费收入3190万元，上缴监管手续费、退税关务费7477万元。7月1日起，根据海关总署决定，监管手续费等9项行政性收费收入全额上缴国库。
1997年，海关启用海关行政事业性收费统一票据、海关定额票据（分为1元、5元、10元3种面额）、海关行政事业性收费专用票据3类行政事业性收费票据。
1998年，海关免税商品监管手续费降至1.5%。12月31日，海关总署印发《海关缉私罚没收入缴库和缉毒办案费支出管理的实施办法》，对罚没代收机构、缴库比例、征补税款和罚没收入缴库手续等相关问题作出具体规定。
1999年，青岛海关准确统计税收数据，追缴虚假入库税单10票，涉税105.9万元，保证税款足额入库。及时上缴罚没收入，加强税费征缴，落实海关总署关于罚没收入收缴分离的缴库方式改革，年内，青岛海关入库罚没收入1.655亿元，连续7年过亿元。青岛关区共上缴行政性收费3191万元，同比增长22%；上缴监管手续费4058万元，同比下降7.9%；取得保证金存款利息收入1317万元。当年，海关总署决定对收取工本费的104种业务单证进行调整，取消收费60种，合并21种，保留收费23种且相应降低标准；海关报关单位注册登记手续费、海关区域外监管手续费、出口监管仓库货物监管手续费、验车费下调50%；货物行李物品保管费、进口商品退税（关）手续费、车辆超时占用验场费下调20%；文物、精密仪器、金银制品等贵重物品或需特殊保护物品，第一个月内和第二个月至第三个月期间分别降为按每日0.16%和0.32%收取；知识产权保护备案费，降为每件800元。
2000年，海关取消国际集装箱批准手续费、查单费。
2001年，船舶吨税作为中央预算收入，改缴中央国库。海关统计资料及数据开发费转为中介服务收费。
2002年，海关按规定收取的减税、免税和保税货物监管手续费，车辆超时占用验场费，报关员培训考试发证费，货物行李物品保管费，验车费5项收费收入上缴国库。海关各项行政性收费收入全部纳入国家财政预算管理。
2003年，青岛海关在电子政务公告栏发布经青岛市物价局核准的《青岛海关行政性收费公示》，实现行政性收费政务信息公开。
2004年，海关取消对进口减税、免税和保税货物征收海关监管手续费。
2005年，为使青岛关区保证金、抵押金和风险担保金的财务管理工作更加统一高效，做好保证金、抵押金和风险担保金的征收、流转和退还等工作，青岛海关制定《青岛海关保证金、抵押金和风险担保金财务管理操作规范》，使上述资金得到及时、有效清理。重新修订并完善有关罚没收入、行政性收费及保证金等税费资金的管理制度和操作规范。
2005年，海关取消报关单位注册登记手续费、免税商品海关监管手续费、出口监管仓库货物海关监管手续费、进口商品退税（关）手续费、车辆超时占用验场费、验车费6项行政审批收费。
第一节 税费管理
1993年，青岛海关成为全国税收10亿以上的十大海关之一。全年罚没收入缴库16623万元，征收车辆购置附加费1.8亿元，上缴监管手续费3176万元，关务费498万元，规费收入留成300余万元，年底税费暂存资金1.89亿元。年内，青岛海关按海关总署要求报送减税、免税、保税货物监管手续费征管工作情况，青岛海关监管手续费由各业务现场计算并开出监管手续费缴纳证，货主持缴纳证和支票到指定银行缴纳，按户核算，各业务处凭回执联核销，财务处汇总、记账、报表，所征监管手续费无拖欠情况。
1994年，青岛海关在税收中充分发挥税费财务工作的会计监督作用，配合业务部门开展税收征管工作。同时，实行奖励制度，对完成税收任务好，上缴罚没收入、行政事业收费多的单位实行奖励，全年完成税收任务的115%。年内，青岛海关根据海关总署《关于清理欠税的紧急通知》要求，结合关区有关企业欠税的实际情况，区别对象采取不同措施进行催缴。对经济状况好，但纳税态度消极的企业，所欠税款商请银行扣缴；对经济状况不好的企业，在保证不影响企业生产的前提下，要求先缴纳部分税款；对属于地方政府已宣布破产的企业所欠税款，上报呆账处理。
1995年，青岛海关准确、及时地完成税款缴库和退库会计核算任务，从当年的5万余票税单中认真查找、核对税款，发现税款假入库情事13起，追缴税款14万余元，滞纳金1万元，完成税收任务的109%。年内，青岛海关严格按规定汇、缴、转各种税费收入，改进税收管理模式，采取财会部门与业务部门相互制约的方法，加强对税费的管理。逐项落实保证金各项管理，制定完善《青岛海关保证金收、转、退的管理办法》。科学设置税费账目，在“应缴税费收入”科目下，设置“分关上缴罚没收入”和“分关上缴规费收入”两个子科目，使税费核算更加直接反映全关区税费收入情况；在“规费”科目下，加设“滞报金”和“免税店监管手续费”两个子科目，以规范报表统计。
1996年，青岛海关建立税款核销专人负责制及定期核销、催缴入库制度，加强对税费核注和过录表数据的审核，加强对入库税单的核销，实施有效监管。年内，追回假入库税单3票，计82万元，其中追缴滞纳金5.4万元；完成税收任务的137%，罚没收入入库1.79亿元，汇缴中央财政海关行政收费收入3190万元，上缴监管手续费、退税关务费7477万元。7月1日起，根据海关总署决定，监管手续费等9项行政性收费收入全额上缴国库。
1997年，海关启用海关行政事业性收费统一票据、海关定额票据（分为1元、5元、10元3种面额）、海关行政事业性收费专用票据3类行政事业性收费票据。
1998年，海关免税商品监管手续费降至1.5%。12月31日，海关总署印发《海关缉私罚没收入缴库和缉毒办案费支出管理的实施办法》，对罚没代收机构、缴库比例、征补税款和罚没收入缴库手续等相关问题作出具体规定。
1999年，青岛海关准确统计税收数据，追缴虚假入库税单10票，涉税105.9万元，保证税款足额入库。及时上缴罚没收入，加强税费征缴，落实海关总署关于罚没收入收缴分离的缴库方式改革，年内，青岛海关入库罚没收入1.655亿元，连续7年过亿元。青岛关区共上缴行政性收费3191万元，同比增长22%；上缴监管手续费4058万元，同比下降7.9%；取得保证金存款利息收入1317万元。当年，海关总署决定对收取工本费的104种业务单证进行调整，取消收费60种，合并21种，保留收费23种且相应降低标准；海关报关单位注册登记手续费、海关区域外监管手续费、出口监管仓库货物监管手续费、验车费下调50%；货物行李物品保管费、进口商品退税（关）手续费、车辆超时占用验场费下调20%；文物、精密仪器、金银制品等贵重物品或需特殊保护物品，第一个月内和第二个月至第三个月期间分别降为按每日0.16%和0.32%收取；知识产权保护备案费，降为每件800元。
2000年，海关取消国际集装箱批准手续费、查单费。
2001年，船舶吨税作为中央预算收入，改缴中央国库。海关统计资料及数据开发费转为中介服务收费。
2002年，海关按规定收取的减税、免税和保税货物监管手续费，车辆超时占用验场费，报关员培训考试发证费，货物行李物品保管费，验车费5项收费收入上缴国库。海关各项行政性收费收入全部纳入国家财政预算管理。
2003年，青岛海关在电子政务公告栏发布经青岛市物价局核准的《青岛海关行政性收费公示》，实现行政性收费政务信息公开。
2004年，海关取消对进口减税、免税和保税货物征收海关监管手续费。
2005年，为使青岛关区保证金、抵押金和风险担保金的财务管理工作更加统一高效，做好保证金、抵押金和风险担保金的征收、流转和退还等工作，青岛海关制定《青岛海关保证金、抵押金和风险担保金财务管理操作规范》，使上述资金得到及时、有效清理。重新修订并完善有关罚没收入、行政性收费及保证金等税费资金的管理制度和操作规范。
2005年，海关取消报关单位注册登记手续费、免税商品海关监管手续费、出口监管仓库货物海关监管手续费、进口商品退税（关）手续费、车辆超时占用验场费、验车费6项行政审批收费。