1993年11月，国务院发布《中华人民共和国增值税暂行条例》，自1994年1月1日起施行。根据国务院税制改革方案，青岛海关对进口货物由代征产品税、增值税、工商统一税、盐税和特别消费税，改为代征增值税和消费税。青岛海关根据《中华人民共和国增值税管理暂行条例》征收进口环节增值税。新的增值税名称未变，税率和计征方法均发生变化。
增值税共设两档税率，基本税率为17%，低税率为13%。纳税人（包括内资和外资企业）进口货物，按照组成计税价格和规定的税率计算应纳税额：增值税应纳税额=组成计税价格×增值税税率，组成计税价格=关税完税价格+关税+消费税。1994—2005年，增值税税目税率几经调整，17%和13%的两档税率未变。
1993年12月，国务院发布《中华人民共和国消费税暂行条例》，自1994年1月1日起施行。根据《暂行条例》规定，青岛海关代征关区内进口环节消费税。纳税人不分内资和外资企业，凡进口应税消费品的收货人为消费税的纳税人；课税范围包括烟、酒及酒精、化妆品、护肤护发品、贵重首饰及各种金银珠宝玉石、鞭炮焰火、汽油、柴油、汽车轮胎、摩托车、小汽车等商品；税率以从价定率为主，从3%至45%不等，黄酒、啤酒、汽油和柴油采用定额税率，分别为240元/吨、220元/吨、0.2元/升、0.1元/升；进口货物按照组成计税价格和规定的税率计算应纳税额：组成计税价格=(关税完税价格+关税）÷（1-消费税税率），应纳税额=组成计税价格×消费税税率。实行从量定额办法的应税消费品的应纳税额的计算公式为：应纳税额=应税消费品数量×消费税单位税额。
1994年5月6日起，农产品进口环节增值税税率由17%调整为13%。
1995年3月1日起，原木进口环节增值税税率由17%调整为13%。4月1日起，金、银首饰，以金、银为基底的包镀其他贵金属的首饰，以及上述首饰的镶嵌首饰，免征进口环节消费税。农用柴油机进口环节增值税税率由17%调整为13%，供残疾人专用的假肢、轮椅、矫形器免征进口环节增值税。
1996年1月1日至1997年12月31日，摩托车轮胎消费税暂减按5%的税率征收。
1998年7月1日起，卷烟消费税税率由40%调整为：一类卷烟（含进口卷烟）50%，二、三类卷烟40%，四、五类卷烟和雪茄烟25%。当年，根据财政部《关于继续对进口种子（苗）、种畜（禽）、鱼种（苗）和非营利性种用野生动植物种源实行税收优惠政策的通知》精神，海关总署规定在2000年底前，继续对进口种子（苗）、种畜（禽）、鱼种（苗）和非营利性种用野生动植物种源免征进口环节增值税。青岛海关对山东省水产企业集团总公司在1998年底前进口的渔船免征进口环节增值税，进口关税照章征收。
1999年1月1日起，含铅汽油消费税税率由0.2元／升提高到0.28元／升，无铅汽油税率不变；香皂以外的护肤护发品的消费税率统一由17%降为8%，香皂仍按5%征收。
2001年起，国家对香皂停止征收消费税；对汽车子午线轮胎免征消费税；对粮食白酒和薯类白酒，由单一的从价定率征收调整为从价定率和从量定额复合征收。
2003年1月1日起，根据海关总署《关于对进口黄金和黄金矿砂免征进口环节增值税有关问题的通知》，青岛海关对进口黄金（含标准黄金）和黄金矿砂（含伴生矿）免征进口环节增值税。
2004年3月1日起，国家调整进口卷烟消费税税率，对进口卷烟同时征收消费税定额税和从价税。
1993—2005年青岛海关征收税款一览表
表2-3 单位：亿元
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┃ 年份 │ 关税 │ 代征税 ┃
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┃ 1993 │ 7.8 │ 7.8 ┃
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┃ 1994 │ 8.2 │ 15.3 ┃
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┃ 1995 │ 8.0 │ 16.9 ┃
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┃ 1996 │ 11.2 │ 22.5 ┃
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┃ 1997 │ 14.2 │ 33.2 ┃
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┃ 1998 │ 13.7 │ 31.9 ┃
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┃ 1999 │ 23.0 │ 51.7 ┃
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┃ 2000 │ 28.3 │ 100.3 ┃
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┃ 2001 │ 33.3 │ 108.3 ┃
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┃ 2002 │ 27.5 │ 117.7 ┃
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┃ 2003 │ 38.2 │ 179.3 ┃
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┃ 2004 │ 44.9 │ 273.5 ┃
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┃ 2005 │ 52.1 │ 326.0 ┃
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