一、管理体系
山东省军粮供应管理工作由全省各级粮食局负责。20世纪80年代中后期，省粮食局具体管理军粮供应业务工作的业务部门是省粮油食品供应公司，公司设立特需科。市、县两级粮食部门，一般配1～2人管理军粮供应工作。
1992年11月，省粮食局整建制转为省粮油集团总公司后，军粮供应管理工作由省粮油食品供应公司划归省粮油集团总公司的粮油储备管理办公室负责。主要职责是：认真贯彻中共中央、国务院关于军粮供应工作的指示精神，积极组织粮源，搞好调拨运输，严格粮油质量，按部队定量标准保质保量地搞好供应。
1993年，全省军粮供应工作座谈会召开，要求各级粮食部门明确一名负责人分管军粮供应工作。地方机构改革，必须设立粮食机构和人员管理军粮供应工作。军粮供应任务大或部队集中的地方，要有专门机构和人员负责，确保军粮供应工作的正常进行。
1994年5月，省政府和济南军区明确要求，粮食价格和经营放开后，各级粮食部门仍是军粮供应工作的职能部门，粮食部门在各地开设的军粮供应点仍是军粮供应的主渠道。在机构改革中，各地要继续设立精干的军粮供应管理机构，保留必要的行政编制，配备骨干人员负责军粮供应管理工作。至1995年5月，全省军粮计划、财务和业务管理工作，省里由省粮食局储备管理办公室分管，市（地）、县（市、区）粮食局（总公司）由行业管理科（处、室、股）指定专人负责。
1996年4月，为了切实加强军粮供应管理工作，省粮食局成立山东省军粮供应中心。省军粮供应中心是处级事业单位，为新中国成立后第一个专事军粮供应管理工作的省级机构。
1997年，省政府和济南军区联合下发《关于深化军粮供应体制改革的通知》，要求粮食部门承担军粮供应的职能作用必须进一步加强。驻军集中的市地和县粮食部门，经同级机构编制部门批准，可设立专门的军粮供应管理机构；其他市地和县级粮食部门也要配备专人负责军粮供应管理工作。
4月，全省军粮供应工作会议召开，要求年供应军粮200万公斤以上的市（地）粮食部门、50万公斤以上的县级粮食部门，要设立专门的军粮供应管理机构，当年底，9市（地）和14个县（市、区）成立军粮供应管理机构。至1998年底，济南、青岛、淄博、日照、泰安、莱芜、菏泽等12市（地）成立军粮供应管理机构。
同年，省政府和济南军区建立全省军粮供应工作联席会议制度，协调全省的军粮供应工作。省粮食局1998年10月设立军粮供应办公室（与省军粮供应中心合署办公），具体负责协调全省军粮供应工作。
进入21世纪后，省里继续强调驻军集中的市和县级粮食部门要设立专门的军粮供应管理机构，军粮供应管理机构为事业单位的，将经费列入同级财政预算。至2005年底，全省17个市的军粮供应管理工作，除烟台、东营、临沂、德州4市由市粮食局的有关业务科室负责外，其余13个市都由专设的军粮供应管理机构承担。其中，青岛市为粮食局的行政处室（正处级），枣庄为企业，其余11个市为事业单位（济南市为正处级，淄博市为副处级，其他为科级）。
二、网点体系
1992年之前，全省有军粮供应网点378个（包括专供点13个），网点多，布局疏密不均，有的县（市）过于分散，有的县（市）网点超过20个。在粮价放开和企业转换经营机制的形势下，很多军供网点暴露出管理不力的问题，有的甚至不再以军队粮油供应为主。1993年7月，省粮食局本着“方便部队、便于供应、合理布局、相对集中”的原则，对军供网点进行集中和调整。明确军供任务大或部队集中的地方建立专供站；不能建立专供站的地方，尽可能与国家粮食储备库或粮油加工企业等基础条件较好的单位相结合，设立军供点。大、中城市可设立1～2个专供点，小城市和县设立1个军供点（任务大的可设2个）。各地粮食部门本着积极稳妥的原则进行了网点调整工作。1993年9月底，济南、青岛、临沂、莱芜、莱阳、莒南、牟平等市、县建立军粮专供网点。至1996年2月，全省军供网点集中和调整为263个，其中专供点51个，兼供站212个。调整后的网点与粮库结合的70个，与加工厂结合的5个，与粮管所结合的140个，与粮店结合的48个；独立核算的171个。
1996年，国务院、中央军委对兼供军粮的国有粮食企业提出要继续贯彻“先前方后后方、先军队后地方”的供应原则，切实将军粮供应与商业性经营分开，明确军粮供应网点不得实行承包、租赁经营。1997年，省政府、济南军区提出军供粮站的数量和布局按照“方便部队、确保供应、合理布局、利于管理、精简节约”的原则设置，各市（地）对驻军集中、供应量较大或购粮条件较差的地方，特别是边防、海岛、交通不便地区及其他不便购粮的地区，要设立市地粮食部门直属军粮专供点。根据中央和省政府的要求，各市（地）对军供网点再次进行调整和归并。至1997年11月底，全省军供网点数量由263个调整到了235个，其中专供点增加到114个。
1998年，省粮食局在莱州市和胶南市开展军粮供应代理制、配送制试点工作。在此基础上，全省继续对军供网点进行调整改造。调整基本上按照每个县（市、区)设立一个军粮专供站的原则进行。对县（市、区)内驻军分散、确需保留的供应点，通过委托粮管所、粮店代理、配送的方式确保供应。调整改造工作完成后，由省里统一组织检查验收、资格认证和命名挂牌。
2000年下半年，为加强军粮供应网络建设，保障供应，省粮食局印发《山东省军粮供应站资格审核认定及挂牌工作实施意见》，对全省军粮供应站的资格进行重新认定。认定本着地级市的城区和市（县）原则上只设置一个军粮供应站点的原则进行。年供应量在50万公斤以上的必须设立独立核算的军粮专供站；条件具备，年供应量在25～50万公斤的也可以设置军粮专供站。驻军分散，供应量少（年供应量不足25万公斤的）的地方，或部队执行紧急任务新驻地无军粮供应站的地方，由县级（含）以上粮食主管部门选择合适的粮食购销企业设立军粮兼供站，或按国家军粮供应政策委托代理供应，军粮财务实行独立核算或专账管理。边防、海岛和交通不便地区，据情可增设军供站点。
军粮专供站的认定条件：具有独立的法人资格；设立军粮财务专户，并实行独立核算；具有固定的营业、储存等基础设施，并按人均年供应量10万公斤实行严格的定岗、定员、定责；有完备的便军设施和健全的规章制度；供应队伍业务能力强，熟悉军粮供应政策，有事业心，中专以上文化程度的人员占60％以上；能严格执行国家军粮供应政策，履行上报各种报表，收取解缴军用粮票，管理军粮供应证、卡等义务；能严格执行军粮供应的有关保密规定。军粮兼供站的认定条件：由国有粮食购销企业承担；军粮财务实行独立核算；具有专门进行军粮供应的营业地点和库房及其他附属设施；指定专人负责军粮供应业务；能严格执行国家军粮供应政策，履行上报各种报表，收取解缴军用粮票，管理军粮供应证、卡等义务；能严格执行军粮供应的有关保密规定。
10月，省粮食局确定第一批通过资格认定的单位。12月，再次确定第二批通过资格认定的单位。
青岛市军队粮油供应站
随着粮食流通体制改革的不断深入和部队驻防的调整，原军供站的布局已不适应新的形势。2004年，为加强军粮供应网络建设，保障丰、歉、平、战不同情况下的军粮供应，省粮食局下发通知，再次调整军供网点布局，对全省军粮供应站资格进行重新认定。按照“抓大放小、抓大带小、择优扶持、合理布局、完善网络”的要求设立军粮供应站。如本市有多处年供应量50万公斤以上的单位，则均可设立军粮供应站；本市没有年供应量50万公斤以上的单位，则可选择一处供应量较大、驻军较集中的地方设立军粮供应站。军粮供应站认定除具备2000年认定时的条件之外，还要求营业、储存等基础设施必须是军供站的固定资产。
三、储备体系
山东省军粮储备体系建设始于20世纪90年代中后期。1997年，为保障军粮供应，支持部队的现代化建设，省粮食局投资建立省级储备稻谷，用于解决部队大米供应的粮源问题。
为加强省级军粮储备的管理，提高军粮供应的保障能力，做好新形势下的军粮供应工作，1998年11月，省粮食局批准成立山东省军粮储备库。省军粮储备库为具有独立法人资格的国有粮食企业，负责省级军供储备粮油的收储、轮换、加工和供应工作，接受省粮食局的委托筹措和调剂全省的军供粮源，是全省第一家专事军粮储备的粮库。从2001年下半年起，全省军供大米开始由省里统筹管理，省军粮储备库在全省军粮储备体系中的核心地位越发显现。2002年6月，原代储在临沂市粮食局以及莒南县、沂南县粮食局的省级储备稻谷调整到省军粮储备库储存与管理。下半年，新增小麦储备任务（由齐河国家粮食储备库代储）。
2004年，省粮食局再次将存放在齐河国家粮食储备库的部分省级储备小麦划给省军粮储备库。
四、加工体系
20世纪80年代末90年代初，山东省军粮加工工作由国有粮食加工企业承担。
2001年起，为了稳定军供粮源，确保军粮质量，全省军供大米开始实行由省军粮供应中心集中筹措、定点加工、统一调拨的办法。为此，省军粮储备库建起日产100吨精洁米的加工车间，专门负责全省军供大米的加工配送工作。军供小麦粉仍从国家订购粮中优先安排，由省指定厂家、认定品牌、定点加工。当年，全省审核认定的军供小麦粉定点生产厂家名单如下：济南市：济南市军粮加工厂、长清粮油经贸中心、济阳县长健制粉有限公司、济南平阴面粉厂、山东民健面粉有限公司、章丘市面粉厂、济南市历城区第二面粉厂。青岛市：青岛维良食品有限公司、青岛第九面粉厂、青岛丰夏食品制粉有限公司、青岛制粉股份有限公司、青岛经济技术开发区开开制粉有限公司、青岛星华粮油食品有限公司。淄博市：淄博市面粉厂、沂源县宏运粮油营销有限公司、淄博市博山第二面粉厂、淄博市双歧面粉厂、桓台县面粉厂、高青县雪花制粉有限责任公司、淄博市临淄区双齐面粉厂、淄博市张店区面粉厂。枣庄市：枣庄内丰面粉集团公司、滕州市东谷面粉有限公司。东营市：垦利县面粉厂、山东半球面粉有限公司、东营市千乘粮油有限责任公司面粉厂、东营市面粉厂。烟台市：烟台市福山区面粉厂、山东牟平面粉厂、山东龙丰集团、莱阳市粮油供应公司面粉厂、莱州宝洋食品有限公司、蓬莱玉鹏面粉有限公司、招远市面粉厂、栖霞市面粉厂、海阳县华瀛面粉有限公司、长岛县粮油供应公司面粉厂、新烟食品有限公司。潍坊市：潍坊面粉厂、潍坊丰元面粉厂、潍坊鲁麦面粉有限公司、青州市面粉厂、安丘市第二面粉厂、寿光市欣达美制粉有限公司、潍坊第二面粉厂、高密市城关粮管所、诸城市粮油加工总厂。济宁市：济宁市第一面粉厂、兖州市第一面粉厂、曲阜市金曲面粉有限公司、泗水县粮食局面粉加工厂、邹城市雪源面粉有限公司、微山县面粉厂、鱼台面粉总厂、山东省华星面粉公司、嘉祥县鲁粮面粉总厂、山东云仙食品有限公司、梁山县面粉厂。泰安市：泰安市粮库面粉厂、新泰市第一面粉厂、宁阳县晶阴面粉有限公司、肥城市面粉厂、东平县面粉有限责任公司。威海市：威海市金谷面粉厂、荣成市食先面粉有限责任公司、乳山市面粉厂、文登港威制粉有限公司。日照市：日照市新瑞粮食工业有限公司、日照信中食品有限公司、日照安东工贸集团面粉厂、五莲县面粉厂。莱芜市：莱芜市面粉厂。德州市：德州市鲁德制粉有限公司、临邑县瑞丰面粉有限公司、宁津县天雁制粉有限公司、陵县面粉厂、庆云县面粉厂、齐河县粮食局面粉厂、乐陵市第二面粉厂、武城县天皓制粉有限公司、平原县面粉厂、禹城市面粉厂。聊城市：聊城市东昌府区粮食局第一面粉厂，临清市面粉厂、阳谷县面粉厂、莘县面粉厂、茌平县面粉厂、东阿县面粉厂、冠县粮食局面粉厂、高唐县粮食局面粉厂。临沂市：临沂市兰山区粮食局军供面粉厂、郯城县粮食加工厂、苍山县粮食加工厂、山东玉皇粮油食品有限公司、沂水县大仓制粉股份有限公司、蒙阴天丰粉业有限公司、平邑县康事达食品有限公司、费县华宇制粉有限责任公司、沂南县大良面粉有限公司。滨州市：滨州市第一面粉厂、惠民县面粉厂、阳信县面粉工业公司、雪塔制粉责任有限公司、沾化金月季面粉有限公司、博兴县面粉加工厂、邹平县面粉厂。菏泽市：菏泽华瑞食品公司、曹县粮食局第一面粉厂、东明县粮食局专用面粉厂、郓城县面粉厂、巨野县粮食局鑫龙粮油工贸有限公司、单县粮食局面粉厂、成武县天银面粉有限公司、定陶田丰制粉有限公司。
2003年，淄博市博山第二面粉厂、日照市新瑞粮食工业有限公司、五莲县面粉厂、齐河县粮食局面粉厂、茌平县面粉厂、临沂市兰山区粮食局军供面粉厂在全省军粮供应工作大检查中，因样品部分指标不符合国家规定的质量标准，被取消定点生产厂家资格。
