20世纪90年代，全省供销社系统审计工作有序开展，每年审计单位余个，审计覆盖率80％以上。进入21世纪，由于社属企业改革改制，一些困难企业破产歇业，审计单位和审计项目逐步下降，审计覆盖率仍在80％左右。
1991—2005年全省供销社系统内部审计情况一览表
表2－14
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┃年份 │审计单位（个） │审计覆盖率（％) │审计项目（项次） ┃
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┃1991 │3250 │98 │30915 ┃
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┃1992 │3400 │93 │31120 ┃
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┃1993 │3217 │84 │25332 ┃
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┃1994 │3350 │87 │19487 ┃
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┃1995 │3437 │81 │12643 ┃
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┃1996 │3459 │92 │22213 ┃
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┃1997 │3444 │89 │13273 ┃
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┃1998 │3350 │85 │15201 ┃
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┃1999 │3256 │83 │13842 ┃
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┃2000 │3283 │83 │11430 ┃
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┃2001 │3319 │87 │10409 ┃
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┃2002 │2684 │73 │9033 ┃
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┃2003 │2461 │81 │7416 ┃
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┃2004 │2180 │80 │5625 ┃
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┃2005 │1817 │80 │4710 ┃
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一、工作实践
1991年，全省各级供销社围绕全省供销社审计工作会议提出的“突出服务、强化管理、提高效益”工作中心，以经济效益审计和经济责任审计为重点，开展审计工作。1991年初，各级供销社针对第一轮承包到期的实际，组织开展第一轮承包终结审计，检查承包企业对承包合同的履行情况，审计的重点是企业资产、盈亏真实性和资金使用。7月，省供销社组织多名审计人员，对聊城、菏泽两个地区100多个棉花加工厂的管理及效益情况逐厂进行审计调查。当年全省系统共审计单位3520个，审计覆盖率97.8％；完成审计项目30915项次；通过审计，促进增收节支约5107万元，清理收回悬账悬案资金8448万元，纠正违纪违规6332万元，查出损失浪费5195万元，帮促120个亏损单位扭亏增盈815万元。
1992年，为摸清企业内控制度的建立、执行情况及存在的问题，全省供销社共组织300多名审计人员，分成100多个审计组，选择有代表性的39个县公司、37处基层社、41个大中型商场、5处棉厂、4处棉站，采取查阅制度、与有关人员座谈、审查企业的账表与凭证相结合的方法，对企业现行制度进行评审。评审结果显示全省供销社系统有20％的企业建立健全了内控制度，且能够执行；75％的企业建立了内控制度但执行较差；5％的企业没有制度或虽有制度但不落实。在调查基础上，省供销社提出各级供销社要采取措施，修订和完善现行制度，建立、健全内控制度执行情况的监督、检查和考核，强化内部审计监督等。当年，全省系统共审计单位3400个，审计单位覆盖率92.5％，完成审计项目31120项，被采纳审计建议10404条，促进增收节支3368.4万元，清理收回悬案资金8537.3万元，纠正违规违纪5283.7万元，查出损失浪费3897万元，帮促836个亏损单位扭亏增盈463.8万元。各级供销社及所属企业按照“不经审计，不得离任”的原则，分清经济责任，对发现的问题及时提出处理意见，使绝大部分问题解决在干部离任之前，改变了干部离任后开始审计，审出的问题后任不理，遗留问题年年有的现象。
1993年7月，全省供销社系统审计工作会议召开。会上传达了国务院总理李鹏关于强化审计监督的指示和全省审计工作会议精神，讨论了在改革开放新形势下如何进一步加强内部审计，内审工作在指导思想、审计内容和方法上如何适应企业转换经营机制的需要，如何为社会主义市场经济服务等问题，并进行工作经验交流。
1994年7月，全省供销社系统审计工作会议召开。会议强调要进一步提高对新形势下搞好审计工作重要性的认识，围绕供销社的工作重点积极开展审计工作，加强审计队伍建设，努力提高审计人员的素质，进一步加强对审计工作的领导。会上传达了国务委员李贵鲜在全国审计工作会议上的讲话，分组讨论了《山东省供销社内部审计工作实施办法》，淄博、烟台、济宁、日照、莱芜、菏泽等市（地）供销社，邹城县、禹城市、新泰市、东阿县、广饶县、博兴县、桓台县、平度市、安丘市、平阴县、烟台市牟平区、鄄城县、枣庄市峄城区、五莲县等县级供销社在会上进行了典型经验交流。这次会议进一步提高了各级供销社对审计工作重要性的认识。根据各地的反馈意见，省供销社对内部审计工作实施办法进行修改，后定稿为《山东省供销社系统内部审计工作实施办法》并印发各地执行。
1995年5月，省供销社组织对省属企业1994年底资产负债情况进行全面审计。在各单位进行自查自审的前提下，省供销社统一抽调人员按照分工分赴各企业对以下内容进行审计：（1）资金财产的真实性、完整性，账实是否相符，库存结构是否合理，核实有问题商品的数量、金额及潜在损失；对固定资产中该报废尚未报废的以及有账无物或有物无账的要逐笔登记。（2）债权债务是否真实合规。各种应收款项和长期投资要逐一核实，对长期挂账且收回有难度或无望的应收款项要逐笔落实，查清有问题资金形成的时间、原因及预计损失；对长期投资中无效益且收不回的账目要查明原因，逐笔落实，分清责任；待摊费用是否合理，对该摊未摊的要逐项落实数额、原因，核对各种应付款项是否真实、合理，对应付未付和潜亏挂账及潜在损失应查明原因，逐笔核实。通过这次审计，基本摸清省属企业1994年底的资产、负债、所有者权益的真实状况。同年，为及时了解基层情况，指导系统审计工作开展，省供销社实行审计联系点制度，即各市级供销社和有二级站的省公司选择审计工作开展较好的几个县级供销社或企业，不定期上报审计工作开展情况，交流工作经验，研讨当前工作，推动审计工作发展。
1995年，全省共审计单位3437个，完成审计项目12643项次，审计覆盖率91.4％，提出审计建议8010条，被采纳6614条，促进增收节支3654万元，清理回收悬账悬案资金10573万元，查出损失浪费金额3764万元，查出违规违纪金额5079万元，其中，已上缴财税部门54万元，增加留利295万元。开展效益审计2866项，承包审计2922项，其中，由1240人组成的361个审计小组通过对2473个单位的年终审计，帮促企业增收节支1766万元，清收悬账悬案资金4705万元，纠正违纪3000万元，核增利润6239万元，核减利润13387万元，补缴税金15万元，中止合同29个，挽回损失29万元；开展离任审计544项；开展法纪审计91项，财务收支审计1029个，内部控制制度审计365个，股份制审计137项，其他审计4689项；查出其他有问题金额18611万元；纠正账务差错5889笔，金额5138万元；通过扭亏审计促进93个单位扭亏增盈721万元，75个单位减亏352万元；通过审计总支出9946万元的251个基建项目，核减金额1580万元；通过688人对804个单位进行的480次审计调查，提出审计建议1035条，促进企业增收节支467万元，清理收回资金2099万元，纠正违纪531万元；审签1530个单位的会计报表、纳税申报表及贷款申请书20341份，审减贷款866万元，审增税额60万元，审减税额28万元，纠正违规违纪218笔，金额178万元，纠正账务差错1341笔，金额804万元，被采纳审计建议758条，促进增收节支402万元；通过对11014个门店的审计，补缴金额1180万元，弥补缺货短款98万元，审查门店合同3560份，已经完善3040个，重新修订100份，中止合同401个；通过对1273个单位经济包袱的审计，促进列入当年损益1475万元，挽回损失132万元；审查承包合同1163份，修订完善845份，重新签订131份；查出贪污盗窃贿赂案33起，金额416万元。
1996年6月，省供销社在威海市召开全省供销社系统管理效益年暨财会审计工作会议。会议强调要加强审计工作，促进供销合作事业发展。会上传达了全国供销社系统审计工作会议精神，德州市农资公司刘立清、昌邑市供销社王栋就如何做好内部审计工作作个人典型发言，烟台、济宁市供销社就经济效益审计和基建审计作典型发言，平度、寿光、鄄城、临清4个市（县）供销社就扭亏审计作典型发言。
1997年5月，省供销社在日照市召开全省供销社系统管理效益年暨财会审计工作会议。会议对审计工作提出四个方面要求：（1）继续抓好效益审计。（2）强化任期目标及离任经济责任审计。（3）积极配合审计机关对棉麻系统行业的审计。（4）积极开展社有资产审计，加强财务收支审计、三项审签、内控制度评审等专项审计，搞好审计调查。济宁市、日照市供销社，荣成市、平原县、烟台市福山区、济南市历城区、郯城县、安丘市、东明县供销社，日照市工业品批发公司，邹平县位桥棉纺织厂和文登市宋村供销社在会上作了有关强化审计工作、帮促企业加强管理提高效益的典型经验交流。
按照省委、省政府关于在整个“九五”时期都要开展管理效益年活动的总体部署，全省供销社系统1997年继续开展管理效益年活动，建立健全审计机构，充实审计队伍，加强企业内部审计工作，完善内部约束机制和监督机制，严格遵章办事，杜绝跑、冒、滴、漏。
1997年，为加强社员股金管理，各地探索社员股金审计，主要从管理制度建立情况、股金使用情况、红息兑付情况、备付金制度执行情况等方面入手。通过审计提出四条建议：（1）提高认识，加强管理，把发展社员股金作为一项重要工作来抓。（2）加强对股金管理人员的业务培训，建章立制，进行规范化管理。（3）社员股金红息的兑付必须及时、足额。（4）发展社员股金必须与企业的生产经营活动相结合。
1999年5月，根据全国供销总社《关于对供销社系统对外投资进行审计调查的通知》，省供销社组织各级供销社对社属企业对外投资情况进行审计调查，主要内容包括：（1）对外投资的投向，投资的可行性研究。（2）投资双方签订合同或协议情况。（3）对外投资的产权管理形式和具体措施。（4）对外投资的效益和资产流失情况。（5）对外投资是否引起纠纷。（6）对外投资管理好的经验做法及存在的问题。为搞好调查，各地供销社成立调查组，在部署企业自查的基础上，对所属典型企业进行重点抽查，7月下旬调查工作基本结束。
2000年8月，省供销社决定对省棉麻公司济南、兖州、济宁、淄博、泰安、小营、高密、青岛、德州、平原、禹城、晏城12个采购供应站和所属各经济实体及联营、合资、合作单位，省农业生产资料公司济南、枣庄、临沂、聊城、菏泽、济宁、德州、淄博、滨州、潍坊、烟台11个分公司和所属各经济实体及联营、合资、合作单位的资产、负债、所有者权益情况进行全面审计并对资产进行评估，为二级站改革改制做准备。省供销社成立由省供销社副主任任组长的领导小组，省公司和二级站（分公司）分别成立由单位负责人任组长，审计、财务、业务等有关人员参加的审计及评估工作领导小组，具体组织、配合、协调本单位的审计评估工作，省供销社、省棉麻公司、省农资公司审计人员加强对社会审计机构审计、评估业务的监督、检查、协调。为彻底查清商品的真实情况，审计人员专门设计代存商品证明、库存商品盘点表，印发《关于审计评估过程中有关问题的处理意见》《关于搞好农资、棉麻二级站审计评估的补充通知》《关于事务所在审计评估工作中提出问题的答复》等文件，对评估基准日与结账日之间的业务调整、审计评估的范围、存货盘点、潜亏潜盈、往来账项的核对、坏账的确认、账外资产的处理、房改宿舍损失的处理、土地问题等，一一作了较为详细的规定和要求，确保评估结果的客观公正。审计评估结束后，审计人员及时将各公司审计评估情况汇总整理，配合领导进行改制方案涉及有关资产扣除算账及确认工作，如土地出让金、有问题资金预计损失等。
2000年，全省供销社系统对3283个单位进行审计，审计覆盖率达83％，共完成审计项目11430个，被采纳审计建议4151条，促进增收节支57577万元，清理收回问题资金76017万元，查出损失浪费52954万元，查出贪污盗窃贿赂案4起，受党纪政纪处分17人，移交司法机关处理6人。
开展承包经营审计1775项（次），对2658个承包经营单位中的1217个单位进行了年度预审，组织666名审计人员组成224个审计小组对2162个单位进行了年终审计，审计覆盖率81％。通过审计，核增利润20063万元，核减利润26876万元，促进增收节支2651万元，清理收回悬账悬案资金5323万元，纠正违纪违规金额5288万元。共组织275人开展审计调查133项（次），提交审计调查报告151篇，被采纳建议504条，促进增收节支445万元，清理收回资金684万元，纠正违纪金额150万元，各地审计人员还参加了当地供销社社属企业改革改制工作。
2001年6月，按照《山东省供销社联合社关于深化直属企业改革改制试行意见》要求，省供销社组织部分审计财会人员成立3个组，对山东省再生资源公司、山东省供销社对外经济贸易公司、山东省供销社基建储运公司、山东省供销社宫宵宾馆、山东省供销社集团华兴公司、山东省供销社工业品公司、山东省果品公司以及上述公司所属各经济实体及联营、合资、合作单位2001年5月31日的资产、负债、所有者权益情况进行全面审计。经过审计，彻底摸清公司基本情况，为公司改革改制提供了详细全面的资料。
2001年，全省供销社系统围绕审计工作重点，开展任期目标奖惩兑现审计、离任经济责任审计；按照省供销社印发的《山东省供销社联合社跟踪审计试行办法》有关规定，抓好经济合同、进货责任、外欠资金等大宗业务的跟踪审计，防止体外循环；配合各级供销社抓好直属企业的产权制度改革，搞好直属企业的审计和资产评估，加大对中介机构在审计评估过程中的监督力度，防止社有资产流失和不良资产流入，发现问题及时解决，以经济效益为中心，审计重点企业，帮助盈利企业继续扩大增盈成果，促进亏损大户减亏扭亏。当年，全省供销社系统共审计单位3319个，覆盖率87％，审计项目10409项（次），其中，开展经济效益审计1939项；任期目标审计1499项，其中由626人组成的218个小组进行的年终审计，促进增收节支2337万元，清理悬账悬案3931万元，纠正违纪6153万元，核增利润12170万元，核减利润19360万元，补缴税金41万元，中止合同16个，挽回损失31万元；开展离任审计388项。通过审签会计报表、纳税申报表、贷款申请书7638份，纠正违规违纪273笔，金额586万元，纠正账务差错864笔1330万元，被采纳建议530条，促进增收节支733万元；审查任期目标合同1474份，修订完善1039份，重新签订184份。
2005年，全省供销社系统共审计单位1817个，完成审计项目4710个，提出审计建议3039条，被采纳2718条；促进增收节支3645万元，清理收回有问题资金3665万元，查出损失浪费金额261万元，查处并纠正违纪违规金额3125万元。当年，全省供销社系统组织137人进行审计调查64项，审计单位196个，提交审计报告86篇，被采纳建议214条，开展财务收支审计1045次，资产管理审计387次，基建工程审计42次，法纪审计54次，社员股金审计58次，股份制审计4次，其他审计1147次。
二、工作成果
1991—2005年，为以点带面、全面推动内部审计工作开展，省供销社按照《山东省供销社系统内部审计工作评比办法》，年年开展全省系统内部审计工作评比，对评选出的先进单位和先进个人通报表彰，对成绩突出或工作方法有所创新的个人或单位的经验及时推广，取得较好效果。山东省供销社在国内贸易部、全国供销总社和山东省内审学会的评比中多次被评为先进单位。
1992年，省供销社根据《山东省供销社系统内部审计工作评比办法》有关规定，对全省内审工作开展情况进行评比，平阴县供销社等50个单位被评为全省内审工作先进单位，济南市供销社曲方功等65人被评为全省内审工作先进工作者。同年，商业部印发《关于表彰商业部系统审计工作先进集体和先进工作者的决定》，省供销社审计处、济宁市供销社审计科和青岛市供销社审计处3个单位被评为先进集体；省供销社刘竹人、武城县供销社朱庆华、莱州市供销社嵇境珍、昌邑县供销社傅新宝、博兴县供销社张东城、莒南县供销社陈贵祥、平阴县供销社任光训7位个人被评为先进工作者。1996年6月，省供销社重新修订《山东省供销社系统内部审计工作评比办法》，对评比的范围、内容、标准等进行细化和补充，进一步增强了操作性、实用性和可行性，调动了广大审计人员的积极性。
1997年，根据《山东省供销社内部审计工作评比办法》，省供销社对全省17个市（地）供销社和省供销社直属公司1996年度内部审计工作进行逐项打分评比，济南、烟台、潍坊、济宁、日照、临沂、德州、聊城、滨州、菏泽10个供销社和省棉麻公司、省农资公司两个省公司被评为审计工作先进集体。此外，1997年，全省各级供销社积极参加省内审学会举办的“联大杯”论文评选活动，共上交论文18篇，4篇获奖。
1998年，经过打分评比，淄博、东营、烟台、潍坊、济宁、泰安、临沂、聊城、滨州9个市（地）供销社，省棉麻公司、省农资公司两个省公司被评为1998年山东省供销社联合社内部审计工作先进集体。
2002年，审计署、省审计厅对1999—2002年全省内部审计工作进行评比，省供销社杨志萍被评为全国内部审计先进工作者，威海市供销社曲凤玲、金乡县供销社宋庆军、山东梁山水泊商场刘智军被评为全省供销社系统内部审计先进工作者。
2004年，在省审计厅举办的2002—2004年内部审计工作评比中，省供销社获先进单位称号。
2005年，各级供销社在开展审计工作的同时，还积极进行审计理论探讨，促进内部审计工作开展。其中威海市供销社报送市内审协会的2篇论文，分别获得二等奖和三等奖。