1985—2005年，山东省农药工业依托本省化工和农业大省优势，推进科技进步，加快结构调整，逐步形成从科技开发、原药生产、制剂加工到原料中间体配套的较为完整的农药工业体系，成为全省化学工业重要行业之一。其发展大体经历两个阶段。
一、稳定发展阶段（1985—1995年）
这一阶段全省农药行业发展的重点是提高产量、满足市场需要。1985年后，由于进口农药增多，农药市场受到冲击，部分企业一度停产或半停产。为改变这种状况，国家开始控制农药进口，山东省人民政府也采取调控措施，重点发展久效磷、氧化乐果等有机磷农药品种，农药产量逐渐恢复并有所增长。至1989年底，全行业计划内生产企业15家，其中原药生产企业12家，固定资产原值2.01亿元，净值1.38亿元，职工9873人，年生产能力2.39万吨，生产品种36个，年产量11767吨，比1988年的10953吨增长7.43％，居全国第五位。“七五”期间，全行业承担了克线磷、绿磺隆、784-1、甲氰菊酯4项国家技术攻关项目，1000吨/年涕灭威工业性试验项目1项；计划内企业产品出厂合格率及社会抽检合格率均保持在100％，产品获国家银牌2个，部优质产品2个，省优质产品15个，优质产品产量占全省农药总产量的80％以上；可加工9种剂型，制剂品种51种。至1990年底，全省农药产量达到1.45万吨。
在提高产量的同时，为进一步解决农药残留问题、加强农药管理，国家和省相继出台农药登记以及生产许可证、准产证管理制度。1985年，国家开始对部分农药品种发放生产许可证。1989年，国务院决定对所有农药生产品种（包括原药、加工、复配和分装）实行严格的生产许可证、准产证制度。1990年，化学工业部下发《关于做好农药登记与生产许可证（或准产证）发放衔接工作的通知》。1992年3月，省石油化学工业厅转发化学工业部《关于贯彻〈国务院办公厅关于加强农药、兽药管理的通知〉的实施意见》，并就全省农药管理工作提出具体贯彻意见，主要有：凡是1993年6月底前未办理农药品种登记的产品，到期一律停止生产并收回生产许可证或生产准产证；凡是农药项目，不论是新建、扩建、对外合作，还是新产品开发研究，都必须经当地化工局（公司）归口报省石油化学工业厅批准后方可实施；严禁国家决定淘汰的六六六、滴滴涕、氟乙酰胺、敌枯双、二溴氯丙烷、杀虫脒6种农药和与其有关的复配生产及加工；严格按国家计划组织生产，增强商品经济意识，认真做好销售工作，全面完成国家计划等。
随着农药管理的加强，山东省农药工业得到长足发展，企业数量和产能产量、经济效益都明显提升。至1993年底，山东省共有农药生产企业143家，其中原药生产企业28家、生物农药生产企业19家、农药加工企业96家；拥有固定资产原值4.6亿元，职工3万余人；可生产农药品种59个（居全国第二位），年生产能力3.9万吨，年产量2.1万吨（居全国第四位），年产值15亿元，利税1亿元。优质产品产量占农药总产量的85％以上，9种产品居国内领先水平，4种产品达到国际标准。
“七五”时期，由于企业效益、技术素质、管理及宏观政策方面等原因，原先基础比较薄弱的山东省农药工业虽然有了较大发展，但仍然不能满足农业发展的需要。突出表现在生产工艺和设备较为落后，加工技术、产品质量、中间体配套能力与国内外先进水平还有较大差距，农药生产企业经济效益不高等。进入“八五”时期，全省农药工业坚持以改革总揽全局，立足省内，面向国内、国外两个市场，采取新品种开发与老品种技改扩建并举的发展思路，在老品种方面立足既有基础进一步提高质量、节能降耗，在新品种方面重点抓好杀虫剂、杀螨剂替代品种的开发与生产，适当发展其他农药新品种，推动了山东省农药生产的品种、结构、原料配套协调发展。1994年，京蓬农药厂投资1500万元，开工新建扑虱蚜原药车间，成为全国第一家生产吡虫啉的企业，年生产能力50万吨，填补了吡虫啉农药市场国内多项空白。同年，青岛农药厂与汽巴嘉基公司合资建设久效磷项目。1995年8月25日，宁阳农药厂l000吨/年涕灭威工业性试验项目建设通过由国家计委、化学工业部组织的鉴定和验收，该装置和产品填补了国内空白，使中国成为世界上第二个批量生产涕灭威的国家。
1995年8月，宁阳农药厂涕灭威工业性试验项目通过鉴定验收，该装置为亚洲第一套涕灭威生产装置
至1995年底，山东省农药年产量达到2.57万吨，为1985年的3.28倍。由于有机磷农药深受欢迎、产销两旺，全省农药生产相应形成了以有机磷类农药为主、以氨基甲酸酯类和拟除虫菊酯类农药为辅的产品结构，有机磷类农药约占全省农药总产量的70％，处于生产主导地位。甲胺磷、久效磷、甲基1605、乙酰甲胺磷等11种产品打入国际市场，年出口量2000吨左右，创汇800万美元。
二、迅速壮大阶段（1995—2005年）
这一阶段全省农药行业的重点是扩大产能、兼顾提高综合效益。在计划经济体制下，农药作为重要物资实行国家统购统销。1994年8月，国务院印发《关于改革化肥等农业生产资料流通体制的通知》，随着经济体制改革的推进，农药市场进一步活跃，生产企业开始增加，农药产能逐步放大，但产品结构仍然不尽合理。进入“九五”时期，山东省农药工业按照中央和省关于实现“两个根本性转变”的要求，重点调整产品结构，增加高效、低毒、经济的新品种，在重点发展杀虫剂新品种的同时，加快发展除草剂、杀菌剂及生物农药新品种和中间体。全行业着力提高农药科研开发能力，逐步实现由仿创并举、以仿为主向以创为主的转变。1996年，全省农药行业实现销售收入14.76亿元、利税0.74亿元，分别占全国的12.8％、15％，均居全国第三位，杀虫剂、杀菌剂、除草剂分别占全省农药年产量的86％、8％、2％。
1997年5月，国务院发布实施《农药管理条例》，旨在加强对农药生产、经营和使用的监督管理。2001年6月，省政府颁布施行《山东省农药管理办法》，规定省农业行政主管部门负责全省农药监督管理工作，省化学工业行政管理部门具体负责全省农药生产监督管理工作，县级以上人民政府其他有关部门在各自的职责范围内负责有关农药监督管理工作。山东省农药管理的法制化进程进一步加快。通过依法管理，全省农药行业生产经营秩序得到规范，为行业企业持续快速发展提供了重要保障。
此后，随着经济社会发展特别是环境保护基本国策的深入推行，对农药生产提出更高要求，山东省农药工业在继续提高产能保障供给的同时，将发展重点转向调整农药产品结构，提高高效低毒、无毒农药产品比重。一批以除草剂为主导产品的农药企业，在市场重新洗牌中脱颖而出，成为农药科技型企业的主流，尤其是在农药出口方面业绩骄人，引导山东省农药行业向高效、高附加值方向发展。2002年，全省30家原药生产企业实现销售收入22.56亿元，约占全省农药销售额的70％；出口创汇1860万美元；生产原药近6万吨，约占全国总产量的15％，居全国第三位，其中杀虫剂、除草剂、杀菌剂分别占62.7％、30.8％、6.4％，农药产品结构调整成效初步显现。同时，全行业科技研发不断深入，加工技术实现突破性发展，山东省农药工业整体水平有了较大提高，加快迈上可持续发展道路。
随着全省农药行业稳步发展和壮大，全省农药企业体制改革不断深化。1985年，全省农药生产主要集中在13家国营企业。1986年，企业承包经营责任制开始推行，进一步调动了生产经营积极性。有的企业按照省政府统一部署，在地方政府具体指导下，进一步探索深化改革的新路子。1988年12月，山东农药厂改制为山东农药工业股份有限公司，成为全国89家、山东省9家股份制试点企业之一，为山东农药企业和社会企业进行公司制改革提供了经验。1995年后，山东省农药企业普遍推行以产权为核心的体制改革，开始建立现代企业制度。1995年12月，“山东农药”在上海证券交易所挂牌上市，成为全国农药行业第二家、山东省化工企业第一家上市公司以及沪市第一支支农题材股。2002年10月，山东华阳科技股份有限公司在上海证券交易所成功发行股票。数家农药企业通过重组，进入山东胜利股份有限公司、青岛碱业股份有限公司、山东鲁抗医药股份有限公司3个上市公司。同时，侨昌化学、先达化工、京博农化、京蓬生物、滨农科技等一批重点民营农药企业迅速崛起，成为山东省农药行业的新生力量。截至2005年底，山东省20多家国有农药原药企业全部进行股份制改造，民营农药企业数量占全省农药登记企业总数的90％。经过体制改革，山东省农药工业形成上市公司为核心、重点股份制企业为主体、民营加工企业为基础的梯次发展格局，企业管理水平得到提高，现代企业制度不断完善。
至2005年底，全省共有农药企业203家，生产农药原药9.86万吨（居全国第三位），实现销售收入63.85亿元（居全国第二位）、利润2.2亿元、利税3.13亿元，销售过亿元企业达到16家，9家企业进入中国化学农药百强企业。全年新登记农药产品1076个，占同期全国新登记总数的23.74％；农药产品总数达到3837个，占全国总数的17.21％；形成20万吨年产能力，列全国第二位。乙草胺等酰胺类除草剂、百草枯分别占全国总产量的40％，杀虫剂中的敌百虫、敌敌畏、磷化铝、磷化锌占全国总产量的30％，辛硫磷占全国总产量的70％。全省农药行业有20家出口企业，拥有45个出口品种，年出口总量14580吨，创汇33600万美元，产品销往80多个国家和地区。
1985—2005年山东省主要年份农药产量统计表
表2-5 单位：万吨
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┃年份 │1985 │1990 │1995 │2000 │2001 │2003 │2004 │2005 ┃
┃产量 │ │ │ │ │ │ │ │ ┃
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┃农药（100％） │0.85 │1.44 │2.57 │4.22 │7.37 │7.71 │10.03 │11.34 ┃
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