（一）设计施工一体化管理
1988年4月，山东煤炭工业管理局报煤炭部批准，煤炭部济南煤矿设计研究院成立中济设计工程承包公司，此后先后有鲍店煤矿洗煤厂、滕南矿区铁路、济宁二号井等项目委托给中济设计工程承包公司负责项目建设管理。
设计与工程施工的一体化管理是全国煤炭系统建设项目工程施工管理方法的试点，中国统配煤矿总公司委托山东煤炭工业管理局在管理过程中逐步制定针对承包公司使用的会计核算及财务管理办法，重点是工程结算、设备投资等与建设单位在日常拨款、投资列决等方面理顺关系。
1991年，山东煤炭工业管理局根据中国统配煤矿总公司关于“济宁三号井建设要作为煤矿基本建设改革的试点项目，管理上采用由设计工程公司总承包，建成后交钥匙的办法，用经济合同来管理”的要求，确定济宁三号井工程项目建设承包单位为中济设计工程承包公司，发包单位为兖州矿务局，双方签订承发包合同后，共同组建济宁三号井工程项目管理部进驻施工现场，实行以项目法人责任制为中心的招标承包制、合同管理制和建设监理制的建设管理体制。同年3月，山东煤炭工业管理局就济宁三号矿井建设工程实行设计为主体总承包工作，组织兖州矿务局、煤炭部济南煤矿设计研究院、中济设计工程承包公司拟订《济宁三号矿井包建合同》《济宁三号矿井建设工程承发包合同》和《济宁三号矿井工程建设监理合同》，报请中国统配煤矿总公司、国家能源投资公司审批。4月，中国统配煤矿总公司、国家能源投资公司同意兖州矿务局（建设单位）按总承包合同规定职责对矿井建设进行管理。7月1日起，中济设计工程承包公司承担济宁三号井建设管理工作，计划管理工作也由矿务局直接对接中济公司，不再直接对接施工单位。
《济宁三号矿井包建合同》发包单位为国家能源投资公司、中国统配煤矿总公司（甲方），承包单位为兖州矿务局（乙方）。
《济宁三号矿井建设工程承发包合同》发包单位为兖州矿务局（甲方），承包单位为中济设计工程承包公司（乙方）。兖州矿务局（建设单位）对国家能源投资公司、中国统配煤矿总公司承包的内容，发包给了中济设计工程承包公司。
《济宁三号矿井工程建设监理合同》发包单位是兖州矿务局（甲方），承包单位是济宁三号矿井监理处（乙方）。山东煤炭工业管理局确定济宁三号矿井建设监理处受兖州矿务局委托，在济宁三号矿井的建设过程中行使建设监督权。
（二）建设单位自营施工受理
1993年4月，山东煤炭工业管理局批准临沂矿务局由自营土建施工队伍承担古城矿井的土建工程施工任务，矿建工程按规定通过招标投标选择施工队伍。7月，国家能源投资公司批准同意龙口矿务局提出的柳海矿井风井井筒采用议标方式施工，依次给龙口矿务局工程处、淮北矿建公司选定施工单位。
1997年2月，淄博矿务局成立淄博矿务局济（宁）北矿区建设指挥部，直接管理许厂矿井筹建处、岱庄矿井筹建处、葛亭矿井筹建处。淄博矿务局所辖的济（宁）北矿区的建设，以自营方式进行工程施工。
1998年2月，山东煤炭工业管理局拟成立山东省煤炭建设项目招投标管理机构，统一归口管理各种资金渠道和建设性质的煤炭建设项目招投标。煤炭部建设项目招投标管理办公室同意成立山东省煤炭建设项目招投标管理领导小组和山东省煤炭建设项目招投标管理办公室。
二、施工管理
（一）设计施工一体化管理
1988年4月，山东煤炭工业管理局报煤炭部批准，煤炭部济南煤矿设计研究院成立中济设计工程承包公司，此后先后有鲍店煤矿洗煤厂、滕南矿区铁路、济宁二号井等项目委托给中济设计工程承包公司负责项目建设管理。
设计与工程施工的一体化管理是全国煤炭系统建设项目工程施工管理方法的试点，中国统配煤矿总公司委托山东煤炭工业管理局在管理过程中逐步制定针对承包公司使用的会计核算及财务管理办法，重点是工程结算、设备投资等与建设单位在日常拨款、投资列决等方面理顺关系。
1991年，山东煤炭工业管理局根据中国统配煤矿总公司关于“济宁三号井建设要作为煤矿基本建设改革的试点项目，管理上采用由设计工程公司总承包，建成后交钥匙的办法，用经济合同来管理”的要求，确定济宁三号井工程项目建设承包单位为中济设计工程承包公司，发包单位为兖州矿务局，双方签订承发包合同后，共同组建济宁三号井工程项目管理部进驻施工现场，实行以项目法人责任制为中心的招标承包制、合同管理制和建设监理制的建设管理体制。同年3月，山东煤炭工业管理局就济宁三号矿井建设工程实行设计为主体总承包工作，组织兖州矿务局、煤炭部济南煤矿设计研究院、中济设计工程承包公司拟订《济宁三号矿井包建合同》《济宁三号矿井建设工程承发包合同》和《济宁三号矿井工程建设监理合同》，报请中国统配煤矿总公司、国家能源投资公司审批。4月，中国统配煤矿总公司、国家能源投资公司同意兖州矿务局（建设单位）按总承包合同规定职责对矿井建设进行管理。7月1日起，中济设计工程承包公司承担济宁三号井建设管理工作，计划管理工作也由矿务局直接对接中济公司，不再直接对接施工单位。
《济宁三号矿井包建合同》发包单位为国家能源投资公司、中国统配煤矿总公司（甲方），承包单位为兖州矿务局（乙方）。
《济宁三号矿井建设工程承发包合同》发包单位为兖州矿务局（甲方），承包单位为中济设计工程承包公司（乙方）。兖州矿务局（建设单位）对国家能源投资公司、中国统配煤矿总公司承包的内容，发包给了中济设计工程承包公司。
《济宁三号矿井工程建设监理合同》发包单位是兖州矿务局（甲方），承包单位是济宁三号矿井监理处（乙方）。山东煤炭工业管理局确定济宁三号矿井建设监理处受兖州矿务局委托，在济宁三号矿井的建设过程中行使建设监督权。
（二）建设单位自营施工受理
1993年4月，山东煤炭工业管理局批准临沂矿务局由自营土建施工队伍承担古城矿井的土建工程施工任务，矿建工程按规定通过招标投标选择施工队伍。7月，国家能源投资公司批准同意龙口矿务局提出的柳海矿井风井井筒采用议标方式施工，依次给龙口矿务局工程处、淮北矿建公司选定施工单位。
1997年2月，淄博矿务局成立淄博矿务局济（宁）北矿区建设指挥部，直接管理许厂矿井筹建处、岱庄矿井筹建处、葛亭矿井筹建处。淄博矿务局所辖的济（宁）北矿区的建设，以自营方式进行工程施工。
1998年2月，山东煤炭工业管理局拟成立山东省煤炭建设项目招投标管理机构，统一归口管理各种资金渠道和建设性质的煤炭建设项目招投标。煤炭部建设项目招投标管理办公室同意成立山东省煤炭建设项目招投标管理领导小组和山东省煤炭建设项目招投标管理办公室。