“九五”时期，科研工作重点是抓好5个方面的科技攻关：综采放顶煤技术上取得新突破，力求在所有适用放顶煤的厚煤层都推广这一新工艺；引进、消化和推广锚杆支护技术，实现矿井支护革命；开发和研制防治瓦斯、煤尘、水灾事故的可靠技术和设备；抓好高产高效矿井的综合配套技术；发展洁净煤技术，着重发展选煤技术、型煤技术、水煤浆技术、地下汽化技术、环保技术等。
1996年，山东煤炭工业管理局科学技术发展计划共130个项目，包括1995年结转的90个项目和1996年新上的40个项目，新上项目重点安排了综采放顶煤技术、煤巷锚杆支护技术、软岩支护技术、煤矿安全技术等。1997年5月，山东煤炭工业管理局新上项目39项，包括煤炭部批准项目6项、省经贸委批准项目5项、山东煤炭工业管理局新立项研究开发项目28项。1998年，山东煤炭工业管理局新上项目41项，其中山东煤炭工业管理局新项目29项，1997年山东煤矿技术难题招标中标新上项目12项。省经贸委1998技术创新重点项目计划中含煤炭系统3项。1999年，山东煤炭工业管理局就技术改造贴息工作组织各煤炭企业申报项目，选出淄博矿务局发酵生产长链二元酸技改工程、泰安煤机厂国产化选煤设备替代进口技改工程、新矿集团协庄选煤厂扩大出口技改工程、枣矿集团高灰水煤浆制备及综合利用发电技改工程、龙口矿务局海域扩大区海下采煤技改工程5个重点技改项目提报国家经济贸易委员会，总投资约14.7亿元，其中申请财政贴息贷款12.2亿元、自筹2.5亿元。
煤炭开采技术 厚煤层开采。1996年10月，兖矿集团缓倾斜特厚煤层高产高效综放开采成套装备与工艺研究项目被列为煤炭部“九五”时期的攻关项目。1999年4—6月，在兴隆庄煤矿5318综放工作面进行3个月工业性试验，最高月产40.04万吨，最高日产20169吨，工作面单产达年产426万吨水平并具备年产500万吨生产能力。11月，600万吨综放工作面设备配套技术与技术研究项目列入国家技术创新项目。2000年11月，该课题通过国家煤炭工业局规划发展司验收，总体水平达到国际领先水平，获2002年度山东省科技进步一等奖。1999年，龙矿集团在北皂煤矿极典型“三软”地层情况下使用综合机械化放顶煤技术，通过论证实现合理的巷道布置和巷道支护、合理的扩刷安装方法、合理的综合防治水等一系列克服“三软”地层措施，总结出“船型”开采、一采一放好煤、两采一放次煤及煤、次煤、矸石分流与“一通三防”等工艺内容，实现了龙口矿区极典型“三软”地层条件下的综合机械化放顶煤开采，并为类似地层实现综放开采提供了经验，该项目获2000年度山东省科技进步三等奖。
“三下”开采。1997年11月，山东煤炭工业管理局召开古城矿井首采区建筑物下采煤方法评审会，临沂矿务局提出古城矿首采区上方建筑物保护原则为：以上定下，采后房屋绝大部分不受损害、少部分允许出现轻微损坏、矿方适当赔偿。评审认为《临沂矿务局古城矿井盲采区建筑物下采煤方法论证》所提条带开采-700米水平以上采50米留80米和-700米水平以下采60米留90米及其条带布置方式是适宜的，通过实践取得明显的经济效益与社会效益，该项目获山东省煤炭科技进步二等奖。1999年，淄博矿务局济（宁）北矿区岱庄煤矿村庄群下宽带开采高产高效技术获山东省煤炭科技进步一等奖，岱庄煤矿条带工作面宽度65米～78米，实现村庄不搬迁开采，保证回采后地表水平变形值不超过2.0毫米/米，地面建筑物破坏程度控制在Ⅰ级以内，工作面单产达到10万吨/月、100万吨/年的条带开采水平，矿井采用国产轻型配套综采设备在村庄群下开采中厚煤层实现高产高效目标。
新井建设技术 1996年6月，淄博矿务局济（宁）北矿区许厂煤矿矿井设计按照“一矿一区一面”原则，对井下开拓布局和地面工程进行设计合理优化，实现辅助性生产和生活服务社会化，创大型矿井建设速度国内外新水平，节约矿井建设直接投资3.07亿元。1999年，许厂矿井大型矿井快速建井综合技术获山东省煤炭科技进步特等奖、山东省科技进步二等奖，2000年该项目又获得国家煤炭工业局科技进步二等奖。2000年12月，兖矿集团年产500万吨的济宁三号煤矿投产，标志济东矿区南部年产900万吨矿区建成，该矿2001年实现投产即达产。
净洁煤技术 1999年7月，新矿集团协庄煤矿选煤厂煤泥干燥、分选应用LPS技术，将含水率30%左右、粒度0.5毫米以下煤泥以每小时50吨能力干燥为含水率10%左右，并分选回收约60%的精煤细粒。此项技术为国内首创，创出“大协煤”“新煤一号”等高附加值产品。
煤化工技术 1997年4月，兖矿集团煤化公司新型水煤浆汽化喷嘴技术通过化工部技术鉴定，并于1998年获得上海市科技进步一等奖；2000年10月，兖矿集团煤化公司新型（多喷嘴对置）水煤浆汽化炉开发中试研究通过国家石油和化学工业局组织的鉴定和验收，填补国内空白，具有国际技术领先水平。新型水煤浆汽化技术是2002年国家“863”计划项目，2005年10月工业化示范项目投入运行，2006年5月通过国家科技部验收。
三、“九五”时期科研工作
“九五”时期，科研工作重点是抓好5个方面的科技攻关：综采放顶煤技术上取得新突破，力求在所有适用放顶煤的厚煤层都推广这一新工艺；引进、消化和推广锚杆支护技术，实现矿井支护革命；开发和研制防治瓦斯、煤尘、水灾事故的可靠技术和设备；抓好高产高效矿井的综合配套技术；发展洁净煤技术，着重发展选煤技术、型煤技术、水煤浆技术、地下汽化技术、环保技术等。
1996年，山东煤炭工业管理局科学技术发展计划共130个项目，包括1995年结转的90个项目和1996年新上的40个项目，新上项目重点安排了综采放顶煤技术、煤巷锚杆支护技术、软岩支护技术、煤矿安全技术等。1997年5月，山东煤炭工业管理局新上项目39项，包括煤炭部批准项目6项、省经贸委批准项目5项、山东煤炭工业管理局新立项研究开发项目28项。1998年，山东煤炭工业管理局新上项目41项，其中山东煤炭工业管理局新项目29项，1997年山东煤矿技术难题招标中标新上项目12项。省经贸委1998技术创新重点项目计划中含煤炭系统3项。1999年，山东煤炭工业管理局就技术改造贴息工作组织各煤炭企业申报项目，选出淄博矿务局发酵生产长链二元酸技改工程、泰安煤机厂国产化选煤设备替代进口技改工程、新矿集团协庄选煤厂扩大出口技改工程、枣矿集团高灰水煤浆制备及综合利用发电技改工程、龙口矿务局海域扩大区海下采煤技改工程5个重点技改项目提报国家经济贸易委员会，总投资约14.7亿元，其中申请财政贴息贷款12.2亿元、自筹2.5亿元。
煤炭开采技术 厚煤层开采。1996年10月，兖矿集团缓倾斜特厚煤层高产高效综放开采成套装备与工艺研究项目被列为煤炭部“九五”时期的攻关项目。1999年4—6月，在兴隆庄煤矿5318综放工作面进行3个月工业性试验，最高月产40.04万吨，最高日产20169吨，工作面单产达年产426万吨水平并具备年产500万吨生产能力。11月，600万吨综放工作面设备配套技术与技术研究项目列入国家技术创新项目。2000年11月，该课题通过国家煤炭工业局规划发展司验收，总体水平达到国际领先水平，获2002年度山东省科技进步一等奖。1999年，龙矿集团在北皂煤矿极典型“三软”地层情况下使用综合机械化放顶煤技术，通过论证实现合理的巷道布置和巷道支护、合理的扩刷安装方法、合理的综合防治水等一系列克服“三软”地层措施，总结出“船型”开采、一采一放好煤、两采一放次煤及煤、次煤、矸石分流与“一通三防”等工艺内容，实现了龙口矿区极典型“三软”地层条件下的综合机械化放顶煤开采，并为类似地层实现综放开采提供了经验，该项目获2000年度山东省科技进步三等奖。
“三下”开采。1997年11月，山东煤炭工业管理局召开古城矿井首采区建筑物下采煤方法评审会，临沂矿务局提出古城矿首采区上方建筑物保护原则为：以上定下，采后房屋绝大部分不受损害、少部分允许出现轻微损坏、矿方适当赔偿。评审认为《临沂矿务局古城矿井盲采区建筑物下采煤方法论证》所提条带开采-700米水平以上采50米留80米和-700米水平以下采60米留90米及其条带布置方式是适宜的，通过实践取得明显的经济效益与社会效益，该项目获山东省煤炭科技进步二等奖。1999年，淄博矿务局济（宁）北矿区岱庄煤矿村庄群下宽带开采高产高效技术获山东省煤炭科技进步一等奖，岱庄煤矿条带工作面宽度65米～78米，实现村庄不搬迁开采，保证回采后地表水平变形值不超过2.0毫米/米，地面建筑物破坏程度控制在Ⅰ级以内，工作面单产达到10万吨/月、100万吨/年的条带开采水平，矿井采用国产轻型配套综采设备在村庄群下开采中厚煤层实现高产高效目标。
新井建设技术 1996年6月，淄博矿务局济（宁）北矿区许厂煤矿矿井设计按照“一矿一区一面”原则，对井下开拓布局和地面工程进行设计合理优化，实现辅助性生产和生活服务社会化，创大型矿井建设速度国内外新水平，节约矿井建设直接投资3.07亿元。1999年，许厂矿井大型矿井快速建井综合技术获山东省煤炭科技进步特等奖、山东省科技进步二等奖，2000年该项目又获得国家煤炭工业局科技进步二等奖。2000年12月，兖矿集团年产500万吨的济宁三号煤矿投产，标志济东矿区南部年产900万吨矿区建成，该矿2001年实现投产即达产。
净洁煤技术 1999年7月，新矿集团协庄煤矿选煤厂煤泥干燥、分选应用LPS技术，将含水率30%左右、粒度0.5毫米以下煤泥以每小时50吨能力干燥为含水率10%左右，并分选回收约60%的精煤细粒。此项技术为国内首创，创出“大协煤”“新煤一号”等高附加值产品。
煤化工技术 1997年4月，兖矿集团煤化公司新型水煤浆汽化喷嘴技术通过化工部技术鉴定，并于1998年获得上海市科技进步一等奖；2000年10月，兖矿集团煤化公司新型（多喷嘴对置）水煤浆汽化炉开发中试研究通过国家石油和化学工业局组织的鉴定和验收，填补国内空白，具有国际技术领先水平。新型水煤浆汽化技术是2002年国家“863”计划项目，2005年10月工业化示范项目投入运行，2006年5月通过国家科技部验收。