1996—2005年，全省环境监测机构、队伍建设实现快速发展，监测机构和人员不断增加，专业技术人员素质和水平进一步提高。1996年，全省环境监测系统共有各级环境监测站115个，其中省级站1个、市级站17个、县级站97个，有95个监测站通过计量认证评审；全省环境监测人员2359人，专业技术人员比例为87.9%，高级工程师比例为6.2%，大专以上学历人员比例为54.6%。2000年，全省共有监测站143个，比“八五”末增加28个，通过计量认证的监测站为137个，增加42个；监测人员总数达到2443人，增加84人；专业技术人员比例为87.6%，高级工程师比例为8.4%，大专以上学历人员比例为71.3%。2005年，全省共有监测站151个，比“九五”末增加8个，监测站全部通过计量认证评审；监测人员总数达到2508人，比“九五”末增加65人；专业技术人员比例为88.7%，高级工程师比例为13.6%，大专以上学历人员比例为83.5%，监测人员素质和技术水平较“八五”末有了大幅度提升。
一、省级环境监测机构
山东省环境监测中心站（简称省监测站）隶属省环保局，业务上受中国环境监测总站指导，为国家环境监测网一级站。
“九五”初期，省监测站有职工70人，其中专业技术人员56人，高级工程师22人；至“十五”末，有职工76人，其中专业技术人员66人，高级工程师28人。“十五”时期，为适应环境监测领域扩大的需要，省监测站内设机构调整为监测管理科、综合评价室、水监测室、气监测室、生态监测室、自动监测室、设备管理科、质量管理科等11个科（室）。设立国家环保总局有机食品发展中心山东分中心、省有机食品协会、省环保产品检验中心、省环境保护计量站、省室内环境质量检测中心和省环保仪器试剂供应站6个机构。
省监测站是全省环境监测网络的技术中心、网络中心、数据中心、质控中心和培训中心，为全省环境管理与环境执法提供技术支持、技术监督和技术服务。主要职能是：负责制订全省环境监测工作规划和年度监测计划；负责全省环境监测监控网和自动监测网的建设与管理；负责组织实施全省环境质量监测。按照监测计划对全省城市空气、降水（酸雨）、地表水、饮用水源地、重点流域河流断面、城市区域噪声和道路交通噪声、近岸海域等定期进行监测；负责组织对全省污染源进行监督监测，及时掌握重点工业污染源、污水处理厂、市政排污口等污染源的污染物排放达标情况；负责汇总、审核、管理全省环境质量监测和污染源监测数据资料，编报山东省环境质量报告书、山东省环境状况公报、山东省环境质量通报、山东省跨界河流断面水质报告、山东省污染物总量控制水质监测公报、山东省近岸海域水环境质量报告等综合性及专项环境质量报告；组织开展全省生态环境监测，编制山东省生态环境遥感监测与评价报告书；定期向社会发布全省17市空气质量日报、预报、周报，重点流域水质监测月报、海水浴场水质监测周报等环境信息；承担全省环境统计工作，编制山东省环境统计年报和环境统计年鉴；负责全省环境应急监测网络的建立、运行和管理，对全省环境监测站应急监测工作进行指导，组织开展重大环境污染事故的应急监测；负责全省各级环境监测站质量管理和质量保证、质量控制，对全省监测人员进行岗位培训和实验员合格证考核；根据省政府要求和省环保局行政授权查处环境违法行为；承担建设项目竣工环境保护验收监测；承担省、市长环境保护目标责任制考核、全省污染物排放总量控制、城市环境综合整治定量考核、创建国家环境保护模范城市、污染物排污申报登记等技术审核工作；承担全省综合性环境调查和环境污染事故、污染纠纷、环境信访调查监测。
1996—2005年，省监测站组织完成全省环境质量例行监测，获取监测数据1710余万个，其中“九五”时期510万个、“十五”时期1200万个，采用书面和多媒体方式全面反映全省环境质量状况，在新闻媒体和互联网上公开发布全省17市空气质量日报、预报和重点流域水质监测月报等。污染源监测进一步加强，“九五”时期以“一控双达标”为重点开展污染源监测，开展限期治理和验收监测1410项；“十五”时期以“总量控制”为重点加强污染源监督监测，完成验收监测项目3500余项。监测领域进一步拓展，“九五”时期实现环境质量监测为主向环境质量监测与污染源监测并重的过渡，环境监测逐步为环境管理提供技术支持；“十五”时期，省监测站组织各级监测站逐步开展生态监测、饮用水源地监测、室内空气监测、环保产品检验和有机食品工作。
这一时期，省监测站环境监测能力的投入大幅度增加，环境监测仪器配置水平明显提升，监测能力不断增强；自动监测手段开始得到应用，城市环境空气和重点流域水质等环境质量监测手段逐步实现自动监测。1996年，省监测站监测仪器设备98台（套），价值285万元。至2005年底，各类监测仪器设备560台（套），价值2000余万元。在实验室监测分析方面，配备电感耦合等离子体质谱仪、气相色谱/质谱联用仪、全自动化学分析仪、气相色谱仪、原子吸收分光光度计、总有机碳测定仪、离子色谱仪、原子荧光光谱仪、液相色谱仪、BOD分析仪、生物发光测量仪、大气采样及处理系统等专用监测仪器设备；在现场监测方面，配备便携式气相色谱仪、便携式傅立叶红外多组分气体分析仪、手持式颗粒物测试仪、便携式光离子化检测仪、声学多普勒测流仪、便携式综合烟气分析仪、水质多功能测定仪等专用监测仪器设备；在应急监测方面，配备水、气应急监测车。能够开展有机物、重金属、生物等常规和复杂监测指标的监测分析工作，监测领域扩展到了环境质量监测、污染源监测、应急监测等。
1996—2005年，省监测站先后承担完成国家、省科委和省环保局下达的科研课题20多项，其中，《环境空气质量标准》获1998年国家环保总局科技进步三等奖，《山东省环境监测仪器设备计量检定动态数据库及微机化管理研究》获2001年山东省计算机应用优秀成果三等奖，《山东危险废物处置战略和技术经济政策研究》获2003年山东省环境保护科技进步二等奖，《山东省环境空气监测多因子无动力采样优化布点的研究》获2003年省科技进步二等奖，《区域有机食品发展规划方法研究及应用》获2005年省科技进步三等奖。
1996—2005年山东省环境监测中心站承担监测科研课题一览表
表5-1
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┃立项年份 │项目 ┃
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┃1996 │城市污水处理微生物菌种的分离筛选与工业化生产技术的研究 ┃
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┃1996 │山东酸沉降物污染状况成因及其环境影响的研究 ┃
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┃1997 │环境空气质量标准 ┃
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┃1997 │山东省环境监测仪器设备计量检定动态数据库及微机化管理研究 ┃
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┃1999 │山东省有机蔬菜种植加工技术规范研究 ┃
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┃1999 │山东省环境空气监测多因子无动力采样优化布点的研究 ┃
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┃2000 │山东省环境监测基础能力建设的研究 ┃
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┃2000 │山东危险废物处置战略和技术经济政策研究 ┃
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┃2001 │南四湖水环境优先控制污染物的分析研究 ┃
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┃2003 │山东省水环境质量监测网优化布点的研究 ┃
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┃2003 │有机食品监测技术规范 ┃
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┃2003 │山东省突发性环境污染事故应急监控快速反应系统 ┃
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┃2003 │山东省肥城市有机食品发展规划 ┃
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┃2003 │山东省饮食业油烟排放标准 ┃
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┃2003 │COD在线自动检测仪器检定规程 ┃
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┃2003 │山东省有机蔬菜种植、加工技术规范研究 ┃
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┃2003 │发展有机食品与生态保护政策相关性研究 ┃
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┃2004 │城镇水环境污染综合防治技术研究 ┃
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┃2004 │山东省区域土壤环境背景值调查与评估 ┃
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┃2004 │山东省污水排放TOC与COD相关关系研究 ┃
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┃2004 │山东省生态环境监测指标体系研究 ┃
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┃2005 │纳米材料在COD快速测定仪中的应用研究 ┃
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┃2005 │区域有机食品发展规划方法研究及应用 ┃
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┃2005 │章丘市区域有机食品发展规划 ┃
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二、市、县级环境监测机构
至2005年，全省17市均设有环境监测站。“十五”时期，大部分市级站升格为副处级。17个市级监测站有工作人员800余人，其中专业技术人员700余人，高级工程师近300人。
“九五”初期，全省141个县（市、区）设有县级环境监测站97个，人员总数1485人，其中专业技术人员1267人，高级工程师38人。至“十五”末期，有133个县级环境监测站，人员总数1640人，其中专业技术人员1404人，高级工程师61人。
市级监测站承担的主要职能是：开展环境质量监测、污染源监督性监测和突发环境污染事件应急监测；承担环境监测网建设和运行，收集、管理环境监测数据，开展环境状况调查和评价，编制环境监测报告；负责环境监测人员的技术培训；开展环境监测领域科学研究，承担环境监测技术规范、方法研究以及国际合作和交流；承担环境保护部门委托的其他环境监测技术支持工作。县级监测站是全省环境监测网络的基础和重要组成部分，主要承担辖区内环境质量监测、污染源监督监测和一般环境突发污染事故的应急监测工作。
1996—2005年，全省高度重视环境监测能力建设，特别是自2002年国家大力推进环境监测站标准化建设以来，各级政府加大对环境监测能力的投入，各级环境监测站仪器装备水平得到大幅度提升。市县级监测站共配有各类监测仪器1061台（套），价值2640万元，其中，市级监测站765台（套）、价值1830万元，县级监测站296台（套）、价值810万元。市级监测站配备的主要仪器设备有气相色谱、极谱仪、原子吸收仪、测汞仪、紫外分光光度计、离子色谱、BOD5、化学需氧量监测仪、微机和监测车等，县级监测站配备的主要仪器设备有测汞仪、紫外分光光度计、溶解氧测定仪、噪声监测仪等。截至2005年底，全省市、县级环境监测站共配有环境监测仪器设备7126台（套），价值1.37亿元，比“九五”初期分别增加572%和419%。其中，市级监测站配有环境监测仪器设备2666台（套）、价值7148万元，县级监测站配有环境监测仪器设备4460台（套）、价值6552万元。
监测能力方面，部分市级监测站与国家建设标准要求有较大差距，基本监测仪器设备缺项较多，具备辖区内环境质量和污染源的常规监测能力，对突发性环境污染事故应急监测和有机污染物、重金属污染物的监测能力比较薄弱。全部县级监测站具备环境质量监测、污染源监督监测的能力，并能够开展部分特征污染物的监测，能够基本满足辖区内环境监督管理的一般要求。约70%的县级监测站监测仪器配置水平仍有不足，与县级监测站建设标准有较大差距，监测能力仅具备对环境质量常规指标的监测，对污染源监督监测、应急监测、专项监测能力较差。
市级监测站和少数县级监测站在承担大量环境监测工作的同时，积极开展监测科研工作。其间，共承担完成各类科研课题343项，发表专业技术论文920余篇。与“九五”时期相比，“十五”时期，监测科研工作逐步受到重视，落实科研经费1328万元，获得省、部级科技奖励29项，其中获二等奖7项，三等奖22项。环境监测科研工作的逐步深入开展，解决了环境监测工作中的难点问题，推动了全省环境监测技术水平进一步提升。