20世纪80年代中期，山东的海水养殖业进入快速发展时期，特别是1991年省委、省政府提出实施“海上山东”建设战略后，发展步伐进一步加快。自2002年起，山东省海水养殖产量一直位居全国首位，2005年达到358万吨，产值达到215亿元。
1986年后，随着科技进步，山东省海水养殖种类逐步从单一种类向鱼、虾、贝、藻、参等多种类发展，主要种类有：牙鲆、大菱鲆、鲈鱼、中国对虾、南美白对虾、日本对虾、三疣梭子蟹、栉孔扇贝、海湾扇贝、虾夷扇贝、太平洋牡蛎、皱纹盘鲍、菲律宾蛤仔、文蛤、海带、紫菜、刺参等。养殖品种向名、特、优、珍、稀品种发展。1995年，全省重点为发展名优高效渔业，拨出专项资金500多万元，在全省建立10处名优高效渔业基地示范点，至2001年，海水养殖名优品种产量达到90451吨。山东养殖模式日趋科学化，逐步以养殖容量为依据向高效生态渔业发展，主要养殖模式有：池塘养殖、盐田养殖、筏式养殖、网箱养殖、工厂化养殖、底播养殖等。养殖空间逐步拓展，从潮间带、浅海向深水区（-50米）发展，空间利用方式也从原有的单纯的水体表层养殖发展到表层、中层、底层综合利用。
由于全省海水养殖生产规模过快膨胀，养殖密度无节制提高，导致海水养殖业病害不断发生。1993年，对虾养殖业受环境污染和暴发性虾病的影响，产量从1992年的45344吨锐减到1994年的14666吨。1998年，扇贝养殖业遭受病害影响，养殖扇贝大面积死亡，产量从1997年的833514吨下降到1998年的520242吨，直接经济损失约15亿元。1998年，山东省海洋渔业主管部门提出山东对虾、扇贝养殖二次创业，并采取得力措施防治病害，使养殖面积和产量逐年回升。至2005年，对虾养殖面积恢复到52742公顷，产量达到44121吨；扇贝养殖面积恢复到61480公顷，产量567362吨。
1986—2005年山东省海水养殖面积、产量、产值统计表
表3-16
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┃ 年份 │ 面积（公顷） │ 产量（吨） │ 产值（万元） ┃
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┃ 1986 │ 37800 │ 206710 │ ┃
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┃ 1987 │ 47246 │ 265531 │ ┃
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┃ 1988 │ 69513 │ 410588 │ ┃
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┃ 1989 │ 69162 │ 504058 │ ┃
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┃ 1990 │ 70006 │ 489400 │ ┃
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┃ 1991 │ 75024 │ 640778 │ ┃
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┃ 1992 │ 77260 │ 866809 │ 260246 ┃
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┃ 1993 │ 117600 │ 1340514 │ 390085 ┃
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┃ 1994 │ 131570 │ 1444934 │ 528199 ┃
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┃ 1995 │ 131870 │ 1655043 │ 773730 ┃
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┃ 1996 │ 161633 │ 2597385 │ 988219 ┃
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┃ 1997 │ 182695 │ 2384437 │ 924877 ┃
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┃ 1998 │ 188816 │ 2339648 │ 1115400 ┃
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┃ 1999 │ 224090 │ 2697852 │ 1213227 ┃
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┃ 2000 │ 280476 │ 2872690 │ 1371557 ┃
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┃ 2001 │ 289992 │ 3050657 │ 1578046 ┃
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┃ 2002 │ 292768 │ 3262069 │ 1807287 ┃
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┃ 2003 │ 358349 │ 3360712 │ 1671900 ┃
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┃ 2004 │ 398680 │ 3418840 │ 1915697 ┃
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┃ 2005 │ 407390 │ 3580294 │ 2150884 ┃
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