自20世纪80年代起，由于过度捕捞，自然渔业资源逐步衰退，捕捞业停滞不前。省政府提出：坚持以养殖为主，养殖、捕捞、加工并举，因地制宜，各有侧重的方针；以市场为导向，发展高效渔业，养殖重于捕捞，兴办第二、第三产业；以品牌渔业、高效渔业、生态渔业为核心，大力提高渔业产业化、标准化水平，集中发展水产增殖、健康养殖、精深加工、远洋渔业、休闲渔业五大支柱产业。
一、第一阶段（1985—1990年）
1985年，中共中央、国务院印发《关于放宽政策、加速发展水产业的指示》。根据山东省实际，省政府提出坚持以养殖为主，养殖、捕捞、加工并举，因地制宜，各有侧重的方针。在海水养殖方面，针对资金、能源、饵料严重不足的状况及市场的需求情况，提出稳定对虾、扇贝的养殖面积，大力发展贻贝、滩涂贝类养殖，认真抓好虾贝、虾鱼、贝藻、藻参的间养、混养、轮养，努力提高单产和效益。在坚持以养殖为主的基础上，重点抓浅海滩涂养殖，提出“以虾带贝，以贝促藻，以藻养珍，立体开发”的政策。在海洋捕捞方面，制定优惠政策，积极组织大马力渔船向外海和远洋进军；改进渔具渔法，开发近海新资源；抓好近海资源的增殖保护工作。淡水养殖及时调整生产布局，重点转到水源充足的沿黄地区，调整种类以缓解饵料不足，因地制宜发展草食性和滤食性鱼类养殖。同时严格执行禁渔期、休渔期制度，对浅海内陆水面进行确权发证，实行“谁开发，谁经营，谁受益”的政策，并在资金、物资、税收等方面对养殖业进行扶持，引导鼓励广大渔民积极发展海水、淡水养殖生产。
通过调整，全省渔业有较大发展，产量、产值均创历史最高水平。1990年，水产品总产量达到167.80万吨（其中捕捞106.42万吨，养殖61.38万吨），养殖产量增幅高于捕捞产量，渔业产值67亿元。
二、第二阶段（1991—1999年）
1991年，省委、省政府提出建设“海上山东”战略，拉开海洋开发新的序幕，全省渔业结构调整尤其是海水养殖业结构调整取得重大进展。这一时期，山东省出台以市场为导向，调整和优化渔业产业结构的政策，旨在发展高产优质高效渔业，是一次质量型的深度调整。产业结构调整上，在第一产业中，侧重于发展养殖业，捕捞、养殖的格局从有史以来的捕大于养，到1999年实现养大于捕。在第二、第三产业中，提出“以渔为主，以渔带工，以渔兴商”的方针，大力兴办第二、第三产业。全省水产品加工企业1615个，加工能力331万吨，产值138.3亿元。为加快渔业结构调整步伐，1997年11月7日，省政府办公厅下发《关于调整我省海水养殖布局结构的通知》，明确调整的原则：坚持发挥海区生态优势，搞好养殖区域布局和种类的合理配置，形成一个良性的生态平衡系统；适度规模发展，养殖规模和水域养殖容量相适应；降低生产成本，以较少的投入，较低的消耗，取得较高的经济效益。渔业结构调整的重点：调整海水养殖布局，适当控制养殖总量，改善海域生态环境，提高海域生产力水平。合理确定放养密度，疏散内区，拓展外海。如在筏式养殖扇贝海区，对养殖海区拓宽主流道，疏通支流道，扩大区间距、台间距、笼间距，减少笼层数，降低层粒数。调整海水养殖种类结构。根据海区的自然生态环境和养殖种类结构的生物习性，优化养殖种类结构。把水产种子工程作为全省各级种子工程的重点，加大科技和资金投入，加快养殖种类的更新换代。对养殖亲本进行选育，提纯复壮，培育抗病力、适应力强的良种。积极引进国外优质新品种。调整海水养殖模式。根据养殖种类的生物特性和生态互补性进行多元综合养殖，积极发展藻类养殖，推行藻类与贝类间养、轮养。提倡栉孔扇贝换季养殖，改春放秋收为秋放秋收，避开夏季高温期。采取隔区调整吊漂绳长度的方法，进行不同水层的梯度养殖。
1999年，中央提出把农（渔）业结构的战略性调整作为农（渔）村工作的主线，作为促进农（渔）业增效、农（渔）民增收的重大举措。12月21日，省海洋与水产厅下发《关于印发全省对虾、扇贝养殖二次创业意见的通知》，强调扇贝养殖要坚持以实现浅海养殖生态化，走可持续发展之路为目标；以渔业增效、渔民增收、渔区稳定为目的；以健康养殖为重点，依靠科技进步，进一步优化浅海养殖结构，发展各具特色的多元化、立体化综合增养殖，实现经济效益、社会效益和生态效益相统一。加大扇贝养殖结构调整力度，改革传统耕海方式，推广栉孔扇贝的“换季养殖”，强化扇贝养殖和苗种生产的规范化、科学化、法制化管理，发展扇贝精深加工业，提高扇贝养殖业的整体效益。
该轮渔业结构调整，与过去历次适应性调整相比，即从复制、放大的扩张性调整转向创新、升级的转型性调整，实现全省渔业由量变到质变的跨越式发展。1999年，全省水产品产量达695万吨（其中海、淡水养殖产量362.5万吨，海洋捕捞产量332.5万吨），比1991年198.12万吨（其中捕捞118.02万吨，海、淡水养殖80.10万吨）增加496.88万吨。全省渔民人均纯收入6050元，比1991年增加4453元；水产业产值达到636.7亿元，比1991年增长6倍多。
三、第三阶段（2000—2005年）
山东省对渔业结构进行深度调整，以提升渔业产业质量和水平，推动全省渔业经济持续、快速、健康发展。首先，控制近海捕捞，发展远洋渔业，加强和巩固养殖业的主导地位，养殖产量与捕捞产量的比例由2000年的1.2∶1上升为2005年的1.62∶1；其次，推动第二产业提档次、上水平，重点发展水产品的精深加工，提高产品的技术含量和附加值；第三，扩大第三产业膨胀规模，活跃市场流通，大力发展以渔为主的旅游业，并涵盖海洋运输、油料供应、港口服务等产业。通过调整，三次产业比例由2000年的48∶34∶18调整为2005年的37∶40∶23，第二、第三产业产值比重由52%提高到63%；渔业发展领域不断拓宽，众多水产企业在做大做强主业的同时，向旅游、海洋运输、油料供应、港口服务等其他领域拓展和渗透，取得良好的经济效益。渔业已从单纯满足饮食消费需求，向为人们提供休闲、旅游、观光等多功能方向转变，新兴的休闲渔业、都市渔业、观光渔业成为新的经济增长点。为加快渔业经济结构调整步伐，2003年6月，省政府办公厅下发《关于转发省海洋与渔业厅〈关于加快全省渔业经济结构调整的实施意见〉的通知》，结构调整的目标是：坚持结构、质量和生态效益相统一，形成渔业产业的组合优势，做到产业布局合理，三次产业结构优化，全面提升渔业经济发展质量，实现生态效益、经济效益和社会效益的协调发展。并于7月4—9日在烟台、威海两市召开渔业结构调整现场会进行部署。
渔业新的一轮结构调整，以品牌渔业、高效渔业、生态渔业为核心，大力提高渔业产业化、标准化、外向化水平，集中发展水产增殖业、健康养殖业、精深加工业、远洋渔业、休闲渔业五大支柱产业，突出建设山东半岛现代渔业经济区。坚持海陆结合，充分发挥渔业在沿海经济社会发展中的作用和优势，加快渔业多元化拓展和渗透融合，加快渔业对外开放步伐，优化产业布局，调整产业结构，整合涉渔资源，推进渔区、渔村工业化、城镇化进程。坚持科学布局，重点突破，协调并进，稳步发展。重点建设近海和内陆湖库自然生态渔业区、优势水产品生态工程养殖产业区、水产品加工产业区和渔港经济区。
2005年7月，省海洋与渔业厅在烟台市召开“大力发展品牌渔业高效渔业生态渔业建设山东半岛现代渔业经济区”现场会，再次要求进一步深化渔业结构调整，积极实施渔业产业化、标准化、外向化战略，突出培植优势主导产业，大力发展优质高效渔业；提出水产增养殖向名优、健康、生态方向发展，水产品加工向园区化、品牌化、外向化方向发展，海洋捕捞向稳定、适度、远洋方向发展，海洋与渔业管理向法制化、科学化、规范化方向发展。
新一轮结构调整有效转变了全省渔业经济增长方式，提高了发展质量。海洋近海捕捞连续负增长，渔船数量和捕捞强度得到控制，2000—2005年，全省报废渔船2120艘，培训渔民11082人，渔民转产转业11000人。2005年，全省近海捕捞产量268.1万吨，比2000年减少39.7万吨；远洋渔业得到发展，远洋渔船达到325艘，总产量25.8万吨，分别比2000年增加143艘和2.7万吨；优质高效养殖业迅速崛起，高效养殖种类70余种，比2000年多40余种，产量万吨以上的种类26个，产值10亿元以上的种类10多个；水产品加工业发展势头迅猛，2005年有企业1855家，加工能力583.8万吨，分别比2000年增加292家和268.8万吨；休闲渔业快速发展，全省休闲渔业场点3000多家，从业人员10万多人，创造增加值30亿元；产业结构得到明显优化，全年水产品产量736.1万吨，渔业总产值1286.5亿元，分别比2000年增加37.9万吨和576.0亿元；水产养殖面积6890平方千米，比2000年增加1630平方千米；渔民人均收入7200元，比2000年增加1020元；水产品对外贸易总量215.3万吨，进出口总额46.5亿元，分别比2000年增加100.4万吨和30.5亿元。全省渔业产业增加值实现525亿元，年均增长9.9%，全省渔业一、二、三产业比重为40∶33∶27。
第四节 渔业结构调整战略
自20世纪80年代起，由于过度捕捞，自然渔业资源逐步衰退，捕捞业停滞不前。省政府提出：坚持以养殖为主，养殖、捕捞、加工并举，因地制宜，各有侧重的方针；以市场为导向，发展高效渔业，养殖重于捕捞，兴办第二、第三产业；以品牌渔业、高效渔业、生态渔业为核心，大力提高渔业产业化、标准化水平，集中发展水产增殖、健康养殖、精深加工、远洋渔业、休闲渔业五大支柱产业。
一、第一阶段（1985—1990年）
1985年，中共中央、国务院印发《关于放宽政策、加速发展水产业的指示》。根据山东省实际，省政府提出坚持以养殖为主，养殖、捕捞、加工并举，因地制宜，各有侧重的方针。在海水养殖方面，针对资金、能源、饵料严重不足的状况及市场的需求情况，提出稳定对虾、扇贝的养殖面积，大力发展贻贝、滩涂贝类养殖，认真抓好虾贝、虾鱼、贝藻、藻参的间养、混养、轮养，努力提高单产和效益。在坚持以养殖为主的基础上，重点抓浅海滩涂养殖，提出“以虾带贝，以贝促藻，以藻养珍，立体开发”的政策。在海洋捕捞方面，制定优惠政策，积极组织大马力渔船向外海和远洋进军；改进渔具渔法，开发近海新资源；抓好近海资源的增殖保护工作。淡水养殖及时调整生产布局，重点转到水源充足的沿黄地区，调整种类以缓解饵料不足，因地制宜发展草食性和滤食性鱼类养殖。同时严格执行禁渔期、休渔期制度，对浅海内陆水面进行确权发证，实行“谁开发，谁经营，谁受益”的政策，并在资金、物资、税收等方面对养殖业进行扶持，引导鼓励广大渔民积极发展海水、淡水养殖生产。
通过调整，全省渔业有较大发展，产量、产值均创历史最高水平。1990年，水产品总产量达到167.80万吨（其中捕捞106.42万吨，养殖61.38万吨），养殖产量增幅高于捕捞产量，渔业产值67亿元。
二、第二阶段（1991—1999年）
1991年，省委、省政府提出建设“海上山东”战略，拉开海洋开发新的序幕，全省渔业结构调整尤其是海水养殖业结构调整取得重大进展。这一时期，山东省出台以市场为导向，调整和优化渔业产业结构的政策，旨在发展高产优质高效渔业，是一次质量型的深度调整。产业结构调整上，在第一产业中，侧重于发展养殖业，捕捞、养殖的格局从有史以来的捕大于养，到1999年实现养大于捕。在第二、第三产业中，提出“以渔为主，以渔带工，以渔兴商”的方针，大力兴办第二、第三产业。全省水产品加工企业1615个，加工能力331万吨，产值138.3亿元。为加快渔业结构调整步伐，1997年11月7日，省政府办公厅下发《关于调整我省海水养殖布局结构的通知》，明确调整的原则：坚持发挥海区生态优势，搞好养殖区域布局和种类的合理配置，形成一个良性的生态平衡系统；适度规模发展，养殖规模和水域养殖容量相适应；降低生产成本，以较少的投入，较低的消耗，取得较高的经济效益。渔业结构调整的重点：调整海水养殖布局，适当控制养殖总量，改善海域生态环境，提高海域生产力水平。合理确定放养密度，疏散内区，拓展外海。如在筏式养殖扇贝海区，对养殖海区拓宽主流道，疏通支流道，扩大区间距、台间距、笼间距，减少笼层数，降低层粒数。调整海水养殖种类结构。根据海区的自然生态环境和养殖种类结构的生物习性，优化养殖种类结构。把水产种子工程作为全省各级种子工程的重点，加大科技和资金投入，加快养殖种类的更新换代。对养殖亲本进行选育，提纯复壮，培育抗病力、适应力强的良种。积极引进国外优质新品种。调整海水养殖模式。根据养殖种类的生物特性和生态互补性进行多元综合养殖，积极发展藻类养殖，推行藻类与贝类间养、轮养。提倡栉孔扇贝换季养殖，改春放秋收为秋放秋收，避开夏季高温期。采取隔区调整吊漂绳长度的方法，进行不同水层的梯度养殖。
1999年，中央提出把农（渔）业结构的战略性调整作为农（渔）村工作的主线，作为促进农（渔）业增效、农（渔）民增收的重大举措。12月21日，省海洋与水产厅下发《关于印发全省对虾、扇贝养殖二次创业意见的通知》，强调扇贝养殖要坚持以实现浅海养殖生态化，走可持续发展之路为目标；以渔业增效、渔民增收、渔区稳定为目的；以健康养殖为重点，依靠科技进步，进一步优化浅海养殖结构，发展各具特色的多元化、立体化综合增养殖，实现经济效益、社会效益和生态效益相统一。加大扇贝养殖结构调整力度，改革传统耕海方式，推广栉孔扇贝的“换季养殖”，强化扇贝养殖和苗种生产的规范化、科学化、法制化管理，发展扇贝精深加工业，提高扇贝养殖业的整体效益。
该轮渔业结构调整，与过去历次适应性调整相比，即从复制、放大的扩张性调整转向创新、升级的转型性调整，实现全省渔业由量变到质变的跨越式发展。1999年，全省水产品产量达695万吨（其中海、淡水养殖产量362.5万吨，海洋捕捞产量332.5万吨），比1991年198.12万吨（其中捕捞118.02万吨，海、淡水养殖80.10万吨）增加496.88万吨。全省渔民人均纯收入6050元，比1991年增加4453元；水产业产值达到636.7亿元，比1991年增长6倍多。
三、第三阶段（2000—2005年）
山东省对渔业结构进行深度调整，以提升渔业产业质量和水平，推动全省渔业经济持续、快速、健康发展。首先，控制近海捕捞，发展远洋渔业，加强和巩固养殖业的主导地位，养殖产量与捕捞产量的比例由2000年的1.2∶1上升为2005年的1.62∶1；其次，推动第二产业提档次、上水平，重点发展水产品的精深加工，提高产品的技术含量和附加值；第三，扩大第三产业膨胀规模，活跃市场流通，大力发展以渔为主的旅游业，并涵盖海洋运输、油料供应、港口服务等产业。通过调整，三次产业比例由2000年的48∶34∶18调整为2005年的37∶40∶23，第二、第三产业产值比重由52%提高到63%；渔业发展领域不断拓宽，众多水产企业在做大做强主业的同时，向旅游、海洋运输、油料供应、港口服务等其他领域拓展和渗透，取得良好的经济效益。渔业已从单纯满足饮食消费需求，向为人们提供休闲、旅游、观光等多功能方向转变，新兴的休闲渔业、都市渔业、观光渔业成为新的经济增长点。为加快渔业经济结构调整步伐，2003年6月，省政府办公厅下发《关于转发省海洋与渔业厅〈关于加快全省渔业经济结构调整的实施意见〉的通知》，结构调整的目标是：坚持结构、质量和生态效益相统一，形成渔业产业的组合优势，做到产业布局合理，三次产业结构优化，全面提升渔业经济发展质量，实现生态效益、经济效益和社会效益的协调发展。并于7月4—9日在烟台、威海两市召开渔业结构调整现场会进行部署。
渔业新的一轮结构调整，以品牌渔业、高效渔业、生态渔业为核心，大力提高渔业产业化、标准化、外向化水平，集中发展水产增殖业、健康养殖业、精深加工业、远洋渔业、休闲渔业五大支柱产业，突出建设山东半岛现代渔业经济区。坚持海陆结合，充分发挥渔业在沿海经济社会发展中的作用和优势，加快渔业多元化拓展和渗透融合，加快渔业对外开放步伐，优化产业布局，调整产业结构，整合涉渔资源，推进渔区、渔村工业化、城镇化进程。坚持科学布局，重点突破，协调并进，稳步发展。重点建设近海和内陆湖库自然生态渔业区、优势水产品生态工程养殖产业区、水产品加工产业区和渔港经济区。
2005年7月，省海洋与渔业厅在烟台市召开“大力发展品牌渔业高效渔业生态渔业建设山东半岛现代渔业经济区”现场会，再次要求进一步深化渔业结构调整，积极实施渔业产业化、标准化、外向化战略，突出培植优势主导产业，大力发展优质高效渔业；提出水产增养殖向名优、健康、生态方向发展，水产品加工向园区化、品牌化、外向化方向发展，海洋捕捞向稳定、适度、远洋方向发展，海洋与渔业管理向法制化、科学化、规范化方向发展。
新一轮结构调整有效转变了全省渔业经济增长方式，提高了发展质量。海洋近海捕捞连续负增长，渔船数量和捕捞强度得到控制，2000—2005年，全省报废渔船2120艘，培训渔民11082人，渔民转产转业11000人。2005年，全省近海捕捞产量268.1万吨，比2000年减少39.7万吨；远洋渔业得到发展，远洋渔船达到325艘，总产量25.8万吨，分别比2000年增加143艘和2.7万吨；优质高效养殖业迅速崛起，高效养殖种类70余种，比2000年多40余种，产量万吨以上的种类26个，产值10亿元以上的种类10多个；水产品加工业发展势头迅猛，2005年有企业1855家，加工能力583.8万吨，分别比2000年增加292家和268.8万吨；休闲渔业快速发展，全省休闲渔业场点3000多家，从业人员10万多人，创造增加值30亿元；产业结构得到明显优化，全年水产品产量736.1万吨，渔业总产值1286.5亿元，分别比2000年增加37.9万吨和576.0亿元；水产养殖面积6890平方千米，比2000年增加1630平方千米；渔民人均收入7200元，比2000年增加1020元；水产品对外贸易总量215.3万吨，进出口总额46.5亿元，分别比2000年增加100.4万吨和30.5亿元。全省渔业产业增加值实现525亿元，年均增长9.9%，全省渔业一、二、三产业比重为40∶33∶27。