1994—2005年，全省各级工会组织在建立或换届时，按照同时考察、同时报批、同时选举产生的“三同时”原则，在产生工会委员会的同时，选举产生同级工会的经费审查委员会。
1994年1月，省总工会经费审查委员会下发《关于加快工会经审组织建设的通知》，要求全省各级工会按照《工会法》规定，加快经费审查组织建设步伐，并抓好督促检查。年底，全省工会经费审查组织组建率上升到87.3%，比1993年提高4.7%，济南、济宁、泰安、枣庄等市总工会配置专职经费审查主任或经费审查干部。
1997年12月，全省17个市（地）、139个县（市、区）工会全部建立经费审查组织。基层工会经费审查组织组建率达到90%。有9个市（地）总工会相继配置同级工会副职级别的领导兼职经费审查委员会主任，济宁等7个市（地）总工会确定专、兼职驻会经费审查岗位和人员，莱芜钢铁集团公司工会增设经费审查办公室并配备专职办公室主任。
1998年，随着全省工会经济实力的壮大，工会经费审查组织的监督职能和工作发展越来越重要，省总工会依据相关规定和做法，报请省编制委员会同意，增设省总工会经费审查委员会专职主任，职务配置等同同级工会副职，同时设立经费审查委员会办公室，编制5名，负责省总工会经费审查委员会闭会期间的日常工作。
2002年10月，省总工会转发全国总工会《关于加强工会经费审查监督工作的意见》，强调加强工会经费审查组织建设的重要性和必要性，提出：1.凡为一级财务管理的工会组织，在组建工会或换届选举时，经费审查委员会与同级工会委员会应同时考察、同时报批、同时选举产生；经费审查委员会的组成人员应有代表性，县级以上经费审查委员会委员人数应不少于同级工会委员会委员人数的20%，县级经费审查委员会委员人数应不少于5人；省（区、市）和独立管理经费的全国产业工会经费审查委员会应设常务委员会，经济发达、职工人数较多的省辖市总工会经费审查委员会视工作需要可设常务委员会；经费审查委员会主任应按同级工会副职级配备，纳入同级工会领导干部序列；提出经费审查委员会主任候选人或报批经费审查委员会主任人事变动，应事先征求上级经费审查委员会的意见。2.本着精干、高效、与所承担的工作任务相适应的原则，设立经费审查委员会办公室。经费审查委员会办公室是经费审查委员会的工作机构，应列入同级工会机关部门编制；经费审查委员会办公室主任、副主任应列入同级工会机关部门正、副职级领导职位，其职务任免应事先征求同级经费审查委员会主任的意见；省（区、市）和省辖市总工会经费审查委员会办公室根据工作需要配齐专职经费审查干部，县（市、区）总工会经费审查委员会应配驻会主任和专职或兼职经费审查干部；各级工会领导机关都应加强经费审查委员会办公室力量，充实审计专业人员。3.依据《工会法》和《中国工会章程》规定，建立工会预算、决算和经费审查监督制度，实行统一领导、分级管理、分级负责的体制。同月，省总工会下发《关于贯彻全国工会经费审查工作会议精神，进一步加强工会经费审查监督工作的通知》，对全省各级工会经费审查组织建设、机构设置、人员配备等问题提出要求。
2003年8月，全省17个市级工会中有15个配备同级工会副职的经费审查委员会主任，其中12人为专职主任；有7个市总工会设立经费审查办公室，6个市配备专职经费审查办公室主任；有95个县（市、区）配备同级工会副职的专、兼职经费审查委员会主任；全省县（市、区）以上工会经费审查委员会为144个，经费审查委员人数为931人；基层工会经费审查组织39848个，经费审查委员人数54000人。全省工会经费审查组织组建率达到91.3%。
2000—2005年山东省工会经费审查组织情况统计表
表7-7
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┃年份│建立工会经费审查组织的基层工会所在单位(个)│工会经费审查委员会人数(人)│配备专职经费审查干部的基层工会所在单位(个)│工会经费审查委员会开展了本级经费年度预决算审查的基层工会所在单位(个)┃
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┃2000│ 20332 │ 54576 │ │ 16361 ┃
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┃2002│ 24201 │ 73758 │ │ 18958 ┃
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┃2003│ 23402 │ 62976 │ 5908 │ 15768 ┃
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┃2004│ 32133 │ 88804 │ 4728 │ 17350 ┃
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┃2005│ 47787 │ 123588 │ 7644 │ 33179 ┃
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说明：2001年未统计