1997—2003年，全省茧丝绸贸工农一体化管理方式加快调整，同时国有丝绸企业开启产权制度改革的进程。至2002年，多数国有丝绸企业实施公司制、股份制或股份合作制不同形式的初级产权制度改革。2004年1月山东省丝绸集团有限公司成立后，接力于山东省丝绸总公司，在其主导下，以妥善安置职工为前提，以加快国有资本退出为目标，拉开国有丝绸企业深化产权制度改革的序幕。
一、山东省丝绸总公司主导下的国有丝绸企业产权改革
1998年开始，全省丝绸系统国有企业改制进入全面实施阶段，省、市（地）丝绸公司与其他企业同步进行改革。1998年，省丝绸公司机构由18个处室精简到7个，1999年又精简到5个。先后设立贸易发展部、投资开发部和中鲁丝绸有限公司等直属经营机构。人员由160余人减至50余人。各市（地）丝绸公司均精简了管理部门和人员，组建经营部门75个，减员60%。
对有一定规模、经济效益好的企业，一般采取国有控股、职工通过工会持股会参股，实现公司制和股份制改造。对规模小、长期亏损、资不抵债的企业，实行兼并或破产退出。1998年，五莲制丝厂、莱芜制丝厂、淄博制丝厂三家改制后的国有控股企业挂牌运营。1999年淄博丝织一厂、淄博丝织二厂、淄博丝绸印染厂、乳山制丝厂等9家改制后的国有控股企业挂牌运营；即墨市丝绸公司实行了股份合作制改造；山东省丝绸进出口公司部分业务部改制成10家国有控股公司；青岛丝织厂、淄博绢纺厂、平邑丝绸厂3家国有企业实施租赁和分离经营，恢复了生产。
2000年，泰安制丝厂、莒南制丝厂改制为国有控股的有限责任公司。淄博地区丝绸工业资产重组较顺利，在积极争取“债转股”政策落实后，由山东众力丝绸有限公司和山东锦天丝绸有限公司进行资产重组，并争取到9000万元银行贷款实施“债转股”，组建山东天力丝绸有限公司，各项重组及“债转股”相关程序基本完成，2001年，顺利完成“债转股”并重新注册。
2001年，省丝绸公司印发《山东省国有丝绸企业改革调整指导意见》和《关于改制企业规范法人治理结构的意见》，进一步推动企业改革改制。东营市和泰安市岱岳区、莒南、莒县等13个县（市、区）丝绸公司改制为省丝绸公司控股的有限责任公司。省丝绸公司征得省政府同意，将国有丝绸企业的划拨土地按作价方式处置，为加快企业改制，特别是农业公司的改制，合理配置土地资源提供了极为有利的条件。同时，通过压缩缫丝补贴和挖潜改造，加之省里扭亏资金及其他政策性资金到位，促进了企业脱困工作。对国有控股企业，确定由省、市丝绸公司和改制企业共同组成董事会、监事会；省丝绸公司制定国有产权代表委派、资产审批及董事会、监事会、总经理工作制度等管理办法，稳定了国有企业改革发展的局面。
2002年，省丝绸公司在改制企业全面试行年薪制的基础上，区别行业特点和阶段性任务需要，建立导向性目标责任考核办法，实行工作贡献与经营者待遇挂钩，加大奖励贡献突出的企业领导班子和经营者。坚持“两统”“三放”原则，工贸双方按互利原则，形成平等的供需关系。截至2002年底，全省丝绸国有企业141户。其中，蚕种场12户，县（市、区）丝绸公司56户，工业企业30户（其中，制丝企业19户，绢纺企业1户，丝织、印染及其他企业10户），商贸企业21户，省、市级丝绸公司19户，事业单位3户（山东省丝绸研究所、山东省茧丝检验所、烟台丝绸检验站）。完成产权制度初步改革的国有企业52户，其中改制为股份制企业的43户（外贸企业11户，工业企业19户，农业企业13户）。国有丝绸企业累计减员出册1.1万人。
1998—1999年山东省改为国有控股的丝绸工业企业一览表
表3-48
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┃原企业名称 │改制后企业名称 │原企业名称 │改制后企业名称 ┃
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┃莱阳绢纺厂 │莱阳绢纺有限公司 │乳山制丝厂 │山东华冠丝绸有限公司 ┃
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┃临朐制丝厂 │临朐制丝有限公司 │青州制丝厂 │青州华益丝业有限公司 ┃
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┃淄博制丝厂 │山东鲁梅丝业有限公司 │淄博丝织一厂 │山东众力丝绸有限公司 ┃
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┃淄博丝织二厂 │山东飞天丝绸有限公司 │淄博丝绸印染厂 │山东锦天丝绸有限公司 ┃
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┃临沂丝绸厂 │临沂瑞地丝绸有限公司 │莒南制丝厂 │莒南同立丝业有限公司 ┃
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┃泰安制丝厂 │山东泰山制丝有限公司 │宁阳制丝厂 │宁阳新岳丝业有限公司 ┃
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┃五莲制丝厂 │山东华风丝业有限公司 │日照制丝厂 │山东三维丝绸有限责任公司 ┃
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┃莒县制丝厂 │山东锦冠丝绸有限公司 │莱芜制丝厂 │山东银河丝业有限公司 ┃
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┃兖州制丝厂 │兖州华宇丝业有限公司 │惠民制丝厂 │山东飞虹丝业有限公司 ┃
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┃海阳制丝厂 │海阳鹏程丝业有限公司 │ │ ┃
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说明：淄博制丝厂、淄博丝织一厂、淄博丝织二厂，在改制时系以主要生产设备等资产注入改制企业和职工持股会募集资金组建成立国有控股的股份有限公司，其余资产和债务仍保留在原企业名下
2001年山东省改为国有控股的丝绸农业企业一览表
表3-49
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┃原企业名称 │改制企业名称 │挂牌时间 ┃
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┃文登市丝绸公司 │山东文登万里丝绸有限责任公司 │2002.1.18 ┃
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┃诸城市丝绸公司 │诸城市华锦丝绸有限责任公司 │2002 ┃
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┃莒南县丝绸公司 │莒南县锦茂丝绸有限责任公司 │2001.12.23 ┃
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┃沂水县丝绸公司 │山东沂水冠银丝绸有限责任公司 │2002.1.5 ┃
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┃泰安市岱岳区丝绸公司 │泰安东岳丝绸有限责任公司 │2002.4.8 ┃
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┃宁阳县丝绸公司 │宁阳鹏达丝绸有限责任公司 │ ┃
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┃肥城市丝绸公司 │肥城宏达丝绸有限责任公司 │2002.3.19 ┃
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┃莒县丝绸公司 │山东省莒县华颙丝绸有限责任公司 │2001.12.28 ┃
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┃五莲县丝绸公司 │五莲县华玉丝绸有限责任公司 │2001.12.30 ┃
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┃日照市东港区丝绸公司 │日照长宇丝绸有限责任公司 │2001.12.20 ┃
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┃惠民县丝绸公司 │惠民华鑫丝绸有限责任公司 │ ┃
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┃东阿县丝绸公司 │山东东阿宏锦丝绸有限责任公司 │2002.1.9 ┃
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┃东营市丝绸公司 │东营黄河丝绸有限责任公司 │2001.11.28 ┃
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2003年8月19日，省丝绸公司印发《山东省丝绸总公司行业管理体制改革暂行意见》。《意见》确立省丝绸公司领导下的“两条线”管理体系：第一条线是省丝绸公司领导下的董事局管理框架；第二条线是对董事局范畴以外的单位，授权市丝绸公司管理，并对省丝绸公司负责。董事局管理框架的基本架构是通过职工出资和其他社会法人投资，设立民营山东德润创业投资有限公司（简称德润公司），再由德润公司、有关企业、市丝绸公司和职工出资，同时引进其他法人资本，分别设立蚕种、蚕茧、制丝、内外贸等股份制专业公司；通过德润公司及其控股、参股的专业公司，参与企业改制，构建完整的集团化民营经济产业链，分别设立工业、农业、蚕种、外贸、直属、投资股份6个专业董事局，对成员单位进行管理，并对省丝绸公司负责。省茧丝检验所、省丝绸研究所维持原事业单位性质不变。当年，省、市、县三级丝绸公司行政管理模式终结。
二、山东省丝绸集团有限公司主导下的国有丝绸企业产权改革
2000年8月，省经贸委《关于同意组建山东省丝绸集团有限公司和山东丝绸集团的批复》批准省丝绸总公司改制为山东省丝绸集团有限公司。省丝绸公司按照文件要求，办理了国有资产产权划转和登记手续。因当时省丝绸公司与直属企业之间缺乏有效的以资本为纽带的联系，国有资产投资主体不明确，未能真正构筑起适应社会主义市场经济所需要的母子公司关系，且国有资产的经营与管理相脱节，难以形成规范资本运营和资产管理体制，未及时办理山东省丝绸集团有限公司的工商注册。
2002年，省政府按照国家对蚕茧流通体制深化改革的要求，取消省丝绸公司在茧丝绸生产经营中的行政管理机构职能，鲜茧收购资格认证、缫丝资格能力审批等行政管理职能移交省经贸委，鲜茧收购定价权移交省物价局。
2003年5月，省国土资源厅针对省丝绸公司申请对丝绸系统土地估价结果备案及土地使用权处置方案审批的报告，同意将省丝绸公司及其所属的济南丝绸厂等101家企业位于济南、青岛、淄博、枣庄、东营、烟台、潍坊、济宁、泰安、威海、日照、莱芜、临沂、德州、滨州、聊城16市的453宗国有划拨土地，总面积1660余万平方米，以省政府作价出资方式处置，由省政府作为出资人，注入拟成立的省丝绸集团，委托其统一持有并运营。11月28日，省深化省属国有企业改革领导小组办公室原则同意省丝绸公司《省属国有丝绸企业改革调整工作方案》，将省丝绸公司及所属企业的国有资产整体划转，组建山东省丝绸集团有限公司，理顺产权关系，建立母子公司管理体制，行使国有资本出资人职责。在此基础上，加快推进权属企业的产权制度改革，将集团公司持有资本退到参股地位或全部退出。2004年1月16日，山东省丝绸集团有限公司正式挂牌成立。省丝绸集团实收资本（国家资本）5亿元，省政府作为其出资人。
2004年2月10日，省长办公会议原则同意对省丝绸公司实行政企分开，行政管理职能移交省经贸委，省丝绸集团按产权关系对下属企业进行改制，国有资本原则上退出。