山东海盐产区自然灾害主要有海啸、海潮、暴雨、洪水、狂风、台风、龙卷风、冰雹等。每次自然灾害，都给盐业造成严重损失。历史上较大的自然灾害有：
清光绪十六年(1890年)春，广饶北部沿海大潮侵入盐区80里，潮水高达六七米，持续四五天始退，盐滩荡为平地。
清光绪十八年(1892年)10月5日，莱州湾南岸，东北风10～12级，持续两昼夜，海潮水位达7.19米，潍县、昌邑盐场被冲，王家冈盐场所属八面河盐田淤平，房倒塌，运盐船10余艘飘没无踪。
1939年8月31日，无棣县沿海大海啸，海水侵入内地六七十里，渔船被毁，禾苗淹没，盐田全部冲毁；寿光东北大风伴大雨，持续4天3夜，潮位达6.97米，盐田淹没，坨盐溶化，毁坏船只百余艘。
1949年7月26-28日，山东黄海沿岸遭台风暴雨袭击，并发生海啸，各盐场盐田大部被淹，生产工具设备丢失过半，溶化盐斤220万担，石岛盐区至五垒岛运盐的4只舢板船沉没。
1953年8月4日，受9号台风影响，胶东盐区平均降水量300毫米左右，出现山洪，慈家盐场一片汪洋，各地损失严重。9日，无棣县暴雨，河水倾泻，盐场内水深过膝，盐田冲毁，盐路切断，盐斤溶化，滩房倒塌。
1960年7月28日，烟台盐区遭受台风袭击，风力12级，风暴致堤坝决口190处，掖县、荣成县各盐场损失严重，共化掉原盐7591吨，冲毁盐田654副，倒塌房屋115间，大批盐田工具被冲走。
1964年4月5日，渤海盐区大海潮，伴有9～11级东北风，持续两昼夜，潮位达6.24米，比一般潮位高2.24米，寿光盐场、寿光合作盐场、山东菜央子盐场、广饶合作盐场盐田全部被淹。无棣合作盐场72%的盐田、莱州盐场50%的盐田以及掖县、山东埕口盐场的部分盐田被淹。山东羊口盐场北大坝石护坡被冲毁100余米。仅寿光盐区统计，冲毁房屋661间，冲毁场坝32940米，运盐路17150米，桥涵6座，冲走苫子30411个，苫草113.4万斤，大批生产工具物料被冲走。灾后，省轻工业厅拨款59万元进行救灾。
1969年4月23日，昌潍盐区出现潮位6.74米特大海潮，各盐场盐田被淹，工具物料被冲走，溶化盐斤数万吨，直接损失157万元。
1975年8月4-5日的2号台风和8月14-15日的4号台风，造成特大暴雨，山洪暴发，河堤决口，青岛盐区近70平方千米盐田被淹。
1976年6月29日至7月1日，青岛盐区骤降110毫米～180毫米大暴雨，并伴有8～9级大风，潮水急涨，超过正常潮位2米，即墨、胶南两盐区23平方千米盐田全部被冲毁，损失严重。
1980年4月4日夜至5日，潍县第二盐场遭受大海潮，东北风风力10级以上，并伴随降雨。盐场全部被潮水淹没，平地水浪高达1米多。池存盐及坨存盐全部溶化，新建成的2000多亩盐田被潮水冲为平地，盐田设施严重损毁，造成经济损失近百万元。
1985年8月19日，青岛、烟台、日照盐区受9号台风影响，突遭飓风、暴雨，大海潮袭击，风速达每秒35.6米，阵风12级，短时降雨量188.2毫米～270毫米，风、雨、潮并进，冲毁围滩大坝34500米，养虾池600亩，刮坏结晶池塑苫薄膜1.05平方千米，溶化原盐102761吨，刮断高低压电线杆447根，倒塌房屋246间，直接经济损失1045.27万元。
1987年10月12日与10月29日，滨州盐区遭受两次大海潮。其中，无棣盐区防潮大坝被冲毁，淹没盐田5.7平方千米，冲失四级卤水26万立方米，直接经济损失100余万元。
1987年11月26日，昌邑盐区出现8～9级大风，并伴有雨雪，当日下午风力达到10级以上，海水上涨，灶户盐区防潮坝决口700余米，淹没盐田4平方千米，溶化原盐2000吨，造成直接经济损失200余万元。
1989年7月20日，昌邑北部盐区突降暴雨，三个半小时降雨量达220毫米，因雨急量大，超过8平方千米盐田成为汪洋，化掉坨存盐4.15万吨，3.5平方千米结晶池的池存盐全部化掉，冲掉高级卤水10万立方米，损坏机井10多眼，直接经济损失350余万元。
1990年5月1日，荣成盐区遭受特大暴风雨袭击，阵风11级以上，5小时内降雨量54.1毫米，部分盐区海水倒灌。姜家、大泊子、张蒙3盐场共刮坏结晶池塑料薄膜64700平方米，化掉原盐5200余吨，冲掉虾苗950万尾，冲毁40亩海带、30亩扇贝等养殖设施，直接经济损失266.3万元。
1990年7月15日，滨州盐区遭受特大暴雨和海潮袭击。其中无棣盐区降雨量64.3毫米，风力9级以上，阵风11级，滩田、虾池、机械设备、房屋、原盐、卤水均造成严重损失，直接经济损失1000余万元。
1991年6月21日，寿光县岔河盐区突遭暴风雨、冰雹袭击，降雨量56毫米，冰雹持续15分钟，11级以上狂风持续半小时，大洼联营盐场、寿光岔河盐场受灾严重。两盐场化掉原盐6.5万吨，刮毁塑苫池0.1平方千米，刮倒刮断低压线杆154根，毁坏变压器1台，致使整个盐区停电7小时，损失苫草98万斤，损坏堆坨机2台，运盐车6部，两座新建溴素厂管道、卤库、房屋及各种建筑物均受到不同程度损坏。此次灾害给两盐场造成直接经济损失683.2万元。
1992年8月31日至9月1日，受16号台风影响，滨州、东营、潍坊、日照、威海等盐区遭受特大暴风雨和海潮袭击。暴风雨持续33小时，盐区降雨量均在120毫米以上，其中昌邑盐区降雨量263毫米。风力6～8级，阵风10级以上。潮位上涨持续6小时，最高潮位3.5米。东营河口盐区、广饶盐区、寿光盐区、昌邑盐区防潮坝被冲毁决口，潮水浸没盐田，东营河口盐区海水入侵内陆10千米～20千米，寿光盐区盐田进水深度达2米以上，盐区受灾严重。据统计，无棣盐区直接经济损失7580万元，东营盐区损失425万元，寿光盐区损失13232万元，昌邑盐区损失3029万元，日照盐区损失250万元，威海盐区损失2173.13万元。
1993年11月5-21日，日照盐区遭受持续半个月的强降水与强寒流袭击。全市盐业企业损失重大，共计化盐5000吨，损坏塑苫结晶池0.27平方千米，冲掉各级卤水2.5万立方米，直接经济损失114万元。
1997年8月20-21日，受11号台风影响，全省各盐区均遭受暴风雨、海潮灾害。无棣盐区阵风12级以上，降雨量150毫米，潮位平均高出地面50厘米，盐区一片汪洋，直接经济损失3246万元。沾化盐区盐田、桥涵设施、场区防潮大坝被冲毁，交通、输电线路中断，直接经济损失5600万元。东营河口盐区最高潮位3.8米，浪高4米以上，冲毁防潮坝38千米。东营利津盐区降水量170毫米，风力10级以上，海水入侵，淹没盐田1.1平方千米，化掉原盐3.1万吨，造成经济损失800余万元。昌邑盐区化掉原盐10万余吨，刮坏塑苫池78000平方米，刮断电线杆20根，刮坏房屋20多间，直接经济损失1000余万元。青岛盐区南万盐场28.6平方千米的盐田、虾池及生产设施被洪水淹没，盐被溶化，虾被冲走，生产设施毁坏，经济损失5214.7万元，当年南万盐场原盐产量为零，成为青岛市特困企业。青岛东营盐场同样遭受重创，冲毁防潮大坝5000米，刮坏塑苫池53个，溶化原盐9070吨，毁坏大量动力、通信设施和房屋，直接经济损失386.85万元。威海盐区淹没盐田10平方千米，养殖受灾面积4000多亩，冲垮或严重损坏堤坝4400多米，化掉原盐5万多吨，损坏机械设备70余台套，直接经济损失2600余万元。日照盐区毁坏防潮大坝5150米，决口11处，流失石方4万余立方米，土方10.5万立方米，毁坏闸门6座，扬水设备4台套，泵房4处，淹没盐田0.4平方千米，毁坏塑苫池0.15平方千米，化掉原盐5500吨，损失三级卤水3.5万立方米，冲毁养殖场220亩，毁坏供电线路3000米、变压器2台，刮坏房屋20间，直接经济损失793万元。烟台盐区化掉原盐11.1万吨，虾池冲毁，直接经济损失2000万元以上。据不完全统计，此次灾害，全省盐业直接经济损失4.1亿元。
2000年8月28日，受12号台风影响，日照盐区持续强降雨，降水量300毫米，其中廒头盐场达到310毫米。盐区各盐场均遭受重大损失，共化掉池存盐4350吨，损失三级卤水3.5万立方米，高低压供电线路被损坏，直接经济损失357万元。
2001年3月14日和4月19日，山东潍坊龙威实业有限公司连续遭受两次风暴潮灾害，风力10级以上，潮位3.5米，浪高5米～6米，冲毁防潮大坝400米，流失土方200余万立方米，石方1万立方米，淹没泥浆泵36台，损坏变压器9台、输电线路30000米，闸门、房屋、盐田机械、塑苫池毁坏严重，经济损失1700余万元。
2001年8月1日，受“桃芝”台风影响，青岛、日照等盐区遭受暴风雨和洪水灾害。青岛东风盐场滩场外的洪水下泄，漫过虾池、公路和外围坝，冲入滩场，造成多处堤坝决口，盐田被淹，设施损坏，经济损失3786.6万元。青岛海玉制盐有限公司的全部盐田、虾池被洪水淹没，经济损失3555.35万元。青岛海达制盐有限公司防洪大坝决口，滩场变成一片汪洋，经济损失2000余万元。“桃芝”台风使青岛3家盐场经济损失近亿元。日照盐区亦遭受重创，仅王家滩盐场直接经济损失就达160余万元。
2001年8月4日，山东海王化工股份有限公司遭受暴雨灾害，2小时降雨量120毫米。盐田积水，化工厂50千米供、排水渠道全部瘫痪，20个配电室被淹没，170多眼卤水井坍塌、被淤泥填满。直接经济损失400余万元，原盐较2000年减产50%，溴素减产1000余吨，共计损失800余万元。
2003年10月10-12日，特大风暴潮袭击潍坊、滨州、东营市，因恰逢天文大潮和连续降雨，3市制盐企业受灾严重，损失巨大。共化盐78万吨，直接经济损失2.49亿元。其中，潍坊市寿光、昌邑、寒亭、海化开发区北部受灾较重，盐业防潮大坝近万米被冲垮，60多千米严重受损，流失土方300多万立方米，冲毁盐田5.7平方千米，化盐32.5万吨，刮坏变压器10台、高低压线路1.52万米，冲毁机井226眼、送水沟道2.6万米，破坏塑苫池1.78平方千米、房屋25间，冲走潜水泵40台、电机32台，共计直接经济损失1.28亿元。滨州市无棣、沾化盐区普降大到暴雨，平均降雨量170毫米，并持续伴有8级以上东北风，潮水达到历史最高潮位。化盐45万吨，毁坏塑苫池1.1平方千米，电力设施和盐田设施也遭到严重损坏，各盐场卤水损失严重，池内存盐溶化，秋产绝产，直接经济损失1.2亿元。东营盐区遭受暴风雨和海潮侵袭，风力8～9级，降雨量120毫米～150毫米。冲淡三级卤水67万立方米，溶化池存盐3500吨、坨盐2250吨，损坏塑苫池46400平方米，部分电力设施、防潮坝和盐田设施被毁坏，直接经济损失550余万元。
2005年8月2-9日，受9号台风“麦莎”影响，东营、潍坊、烟台、日照等盐区遭受暴风雨及风暴潮灾害。狂风暴雨持续20余小时，东北风7～8级，阵风10级以上，降雨量98毫米，东营河口盐区9家盐场受灾，直接经济损失1446万元。山东潍坊龙威实业有限公司供电线路被刮坏4000多米，电杆刮倒50根，变压器损坏1台，塑苫结晶池损坏6万平方米，盐坨塑料布刮坏1万平方米，经济损失600余万元。烟台市莱阳、牟平两地最大点降雨量分别达到202毫米和198毫米，牟平区东海制盐公司和牟平盐场直接经济损失190万元，莱阳盐场经济损失51.6万元。