一、第一次农业普查
1994年，国务院下发《关于开展第一次全国农业普查的通知》，决定1997年在全国开展第一次农业普查，并规定自1997年起，每10年进行一次全国农业普查，全面调查农业和农村的基本情况。年度农业统计数据的收集以抽样调查为主，普查将为常规农业统计调查提供抽样框。
为组织开展好普查，1995年，省政府成立山东省第一次农业普查领导小组，副省长邵桂芳任组长，省计委、省农委、省统计局、省财政厅等18个部门的负责人为成员。领导小组下设办公室(简称省农普办)，省统计局副局长栾炳焕兼任主任，下设综合、业务、数据处理3个组。
普查对象是全省范围内各种类型的农业生产经营单位、农村住户、非农乡镇企业、行政村和乡镇。普查的主要内容包括：农业生产经营单位的数量、规模和结构；农业用地在各生产经营单位的分布和使用情况；农业生产性固定资产的数量、结构和性能；农村劳动力的数量、素质、从事的行业和流动情况；乡镇企业和建制镇的基本概况。普查标准时点是1996年12月31日，时期标准是1996年1月1日至12月31日，普查登记的标准时间为1997年1月1-31日。全省各地动员63万普查工作人员对全省1824万个农户、8.86万个行政村、2233个乡镇和10万多个非农乡镇企业的38个调查项目、687项指标进行查点和填报。
普查工作分为三个阶段：1995-1996年，进行前期准备；1997年上半年，完成普查登记工作；1997年下半年至1999年底，完成数据处理、分析和普查总结工作。
1995年，省政府下发《关于开展第一次全省农业普查的通知》，山东省第一次农业普查工作全面展开。1996年4月下旬，在长清县开展省级农业普查试点工作，历时1个月，对崮山镇及所属33个行政村、1万多农户、40多个非农乡镇企业等逐个进行调查填报。9月上旬，省农业普查办公室分3批对全省市、县农业普查办公室业务负责人、业务骨干及省直有关部门普查工作人员500余人进行培训。1997年1月1日，全省农业普查入户登记工作正式开始。副省长邵桂芳到现场视察并对登记工作提出具体要求。2月，国务院农业普查办公室在山东省抽选16个县(市、区)进行事后质量抽查，共抽查69个普查小区的3778个农户，误差在国家规定的误差范围之内。
图2-1 1996年4月26日，全省农业普查试点工作动员会在长清县召开
1998年4月，省农业普查办公室发布全省农业普查公报，内容包括农业生产经营单位的数量与结构、农业从业人员和科技人员状况、农业机械状况、农村镇区规模及其社会经济状况4个方面。
第一次农业普查主要数据。1996年底，山东省共有2233个乡镇(其中，1026个乡，1207个镇)，88619个行政村，农村住户1823.7万户，农村居民6874.0万人。1996年，农作物播种面积10146.7千公顷，其中粮食面积8558.4千公顷，油料635.0千公顷，棉花280.7千公顷；年底大牲畜存栏合计806.4万头，猪存栏1605.5万头，山羊存栏1604.3万只，鸡鸭鹅存栏34811.4万只；年内猪出栏1880.9万头，肉牛出栏209.1万头，山羊出栏1343.5万只，鸡鸭鹅出栏66733.1万只。拥有大中型拖拉机10.3万台，小型拖拉机143.1万台。
二、第二次农业普查
按照国务院统一部署，2005年，山东省开始组织开展第二次农业普查。2005年，省政府下发《关于开展第二次农业普查的通知》，成立以副省长贾万志为组长的山东省第二次农业普查领导小组，负责全省农业普查的组织和实施工作。副组长由省政府办公厅副主任高洪波、省统计局局长杜昌祚、省发展改革委副主任杨玉贞、省农业厅副厅长吴雪珍、省委农村工作领导小组办公室主任王泽厚、国家统计局山东调查总队总队长宋志申担任。领导小组成员由省委宣传部、省政府调研室、省财政厅、省教育厅、省科技厅、省公安厅、省民政厅等23个部门的负责人组成。普查领导小组办公室设在省统计局，省统计局副局长刘兴慧兼任主任，办公室下设综合、业务、数据协调、数据处理4个组。
这次普查对象为全省范围内的农村住户、城镇农业生产经营户、农业生产经营单位、村民委员会和乡镇政府。普查主要内容包括农业生产条件、农业生产经营活动、农业土地利用、农村劳动力及就业、农村基础设施、农村社会服务、农村居民生活，以及乡镇、村民委员会和社区环境等方面的情况。农业普查采用全面调查的方法，对所有普查对象由普查员进行逐个查点和填报。普查的标准时点为2006年12月31日，时期资料为2006年度。全省共组织动员普查员、普查指导员和各级普查机构的工作人员60多万人，填报普查表近4500万张，共调查1827个乡级行政单位，其中乡277个，镇1192个；84142个村级组织，其中81354个村；2109.0万个住户。
普查工作分为四个阶段：2005年至2006年10月前，进行各项准备工作；2006年11月至2007年2月进行动员，摸底、入户登记及复查工作；2007年3月至2007年底，进行数据录入、处理、评估、分析及发布；2008年，进行资料的深度开发、数据库的建立和总结表彰工作。