随着价格体制的不断改革，山东省价格统计方法制度进行了相应的改革与完善。1990年，山东省作为国家统计局编制固定资产投资价格指数的试点单位，首次编制出固定资产投资价格指数。1994年，国家对居民消费价格统计制度进行重大改革，对居民消费价格指数、商品零售价格指数和农业生产资料价格指数进行分别编制，形成各自独立的调查统计方案和指标体系；农产品价格统计逐步形成以农产品生产价格为核心，以农产品集贸市场价格、农产品批发价格等为重要组成部分的比较完整的调查体系。2002年，国家统计局决定用价格指数缩减法计算工业发展速度试行工作，为适应和满足价格指数缩减法计算工业发展速度的要求，省统计局制定《山东省生产价格指数缩减法计算工业发展速度试行方案》。2004年，建立并实施《山东省主要生产资料产品出厂价格监测旬报制度》。同年，国家房地产价格统计调查制度进行重大改革，改进和完善了房屋、土地、租赁分类价格指数，增加平均价格的计算，增加物业管理服务价格分类指数。