为了保证漕粮运输，元、明、清都在运河上设置了运道管理机构，专门负责保证运道畅通无阻，形成了完善的运道管理体系。
元代的管理和机构
元朝十分重视会通河的管理。在中央设都水监，管理全国运河事务。“元有天下，内立都水监，外设各处河渠司，以兴举水利、修理河堤为务。”（《元史·河渠志》）在地方上则设立专门的运河管理机构，各闸、坝、堰等处设专人管理。同时，沿河还设有众多浅铺，以巡视堤岸、树木，招呼运船使其不至于搁置在沙滩，并兼有修堤浚河之任务。元朝时，有许多地方性质的运河管理机构，就设在聊城境内。至元二十四年（1287年）在临清设都漕运分司，管理该段漕运之事。至元二十九年（1292年），在东阿县景德镇（今阳谷县张秋镇），设立都水分监，管理会通河之水政。其管理区段是北起临清、南至徐州350余公里的河段。该运河段内的闸、坝、桥、涵、堰的兴建与维修，统归景德镇都水分监管理，足见当时张秋镇在运河上的重要性。据《山东运河备览》载，延祐六年（1319年），东阿设东阿监丞，为都水分监属官。元代还设有东昌纲，每编船30只为一纲，设押纲官2员，秩正八品。
明代的管理和机构
明朝建立以后，于永乐年间海运停止，南北运输专赖运河。为保证京杭运河的正常运营，运河管理机构也就较元朝更趋健全和完善。《张秋志》载：“张秋立都水分司，自成化间始，重河防也。”明朝总理河道一职为朝廷派出官员，常由侍郎、尚书衔任其职。总理河道以下按所分运河各段运道设立分司，多由工部郎中或主事任职。成化七年（1471年），明朝廷将运河分为三段管理。通州至德州为北段，德州至沛县为中段，沛县至仪真瓜洲为南段。各段均设分司，管理运河闸、坝、堰、涵事宜。此时中段分司，设在今阳谷县张秋镇。成化十三年（1477年），明朝廷又将运河改为两段管理，以济宁为界分为南北两段。南、北段各设都水郎中一员。《张秋志》载：“北河郎中一员，驻扎张秋，掌卫河、会通河漕政，北至天津，南至鱼台（属济宁）一带，凡泉、湖、闸、坝、堤、浅之事皆隶焉。”万历年间，又将运河分为四段管理，各段郎中主持管理。北河段管理机构仍设在张秋。各河段以下又设分司，主要官员为主事。临清分司即为此时所设。按其管理权限来讲，各运段郎中的职责主要是考核、稽查、调动及禁约本段运河官吏。各分司所设主事，则具体管理运河河道上各项工程设施，如闸、坝、浅、铺等。而各闸、坝、浅、铺又都有专门人员管理。从明代万历二十八年（1600年）所修《东昌府志》看，当时在东昌府境内最南部的闸是周家店闸，设闸官一员，设闸夫30人；李海务闸未设闸官，闸夫30人。聊城县（今东昌府区）境内设置浅铺23处，有浅夫70人；博平县（今属茌平县）境内有浅铺6处；堂邑县（今属东昌府区）境内有浅铺7处；清平县（今属高唐、临清二县市）境内有浅铺9处，浅夫66人；临清县境内有浅铺9处，浅夫171人。
当时所属东昌府的运河管理官员，还有管河通判一员，驻聊城。临清州有管河判官一员。聊城、堂邑、清平、临清各设管河主簿一员，博平县设管河典史一员。
明朝运河管理机构细密，管理队伍庞大，管理制度严格，在保证运道畅通方面，确实起到了相当重要的作用。
清代的管理和机构
清朝基本上沿用了明朝的管理体制，通过调整，管理机构更趋完备，职责更加分明，而且各级官员名称也有所变化。如明朝国家管理运河的官员称总河，清朝称河道总督。
在今聊城市辖区范围内，清朝的运河管理机构由南而北依次是：
兖州府捕务管河厅，设管河通判一员，驻张秋镇。据《张秋志》载，该机构在张秋镇西南隅，顺治十七年（1660年）通判吕振之重修二堂；康熙二年（1663年）通判马光远重修大堂；康熙八年（1669年）通判林梵于署中建书舍五间。阳谷管河主簿厅，设主簿一员，在张秋城北水门内北厅街。寿张管河主簿厅，设主簿一员，在张秋城南水门外河西岸。
东昌府上河厅，设上河通判一员，驻东昌府。管辖聊城、堂邑、清平、临清等处河道，又兼管馆陶卫河长18公里。聊城县设主簿一员，东昌卫设千总一员，又有聊城汛、东昌卫汛。堂邑、博平共设管河主簿二员，一位管运河东岸，一位管运河西岸，又有堂邑汛、博平汛。清平县设管河主簿一员，又有清平汛、左卫汛。临清州设管河州判一员，又设临清汛。
聊城县境内设浅夫97名，东昌卫设浅夫7名；堂博主簿管辖运河段，设浅夫51名；堂邑汛设浅夫45名；清平县之清平汛、左卫汛共设浅夫67名；临清州判管理运河段，设浅夫74名，又临清汛设浅夫35名。
明、清两朝，各闸座分别设有专门官吏和闸夫管理，人员虽有增减，但变化不大。
运道管理机构的主要职责有：一是管理运河上过往的船只，依次按漕、贡、官、民的次序通行；二是检查行运船只是否超长、超宽、超重；三是检查各闸坝官吏是否徇私舞弊，故意拖延阻滞船只通行，借以敲诈钱财；四是负责沿河堤岸、闸坝的管理和维修、水源的保护和补给。在这些方面，会通河的管理机构起了很大作用。
第四节 运河聊城段的管理及其机构设置
为了保证漕粮运输，元、明、清都在运河上设置了运道管理机构，专门负责保证运道畅通无阻，形成了完善的运道管理体系。
元代的管理和机构
元朝十分重视会通河的管理。在中央设都水监，管理全国运河事务。“元有天下，内立都水监，外设各处河渠司，以兴举水利、修理河堤为务。”（《元史·河渠志》）在地方上则设立专门的运河管理机构，各闸、坝、堰等处设专人管理。同时，沿河还设有众多浅铺，以巡视堤岸、树木，招呼运船使其不至于搁置在沙滩，并兼有修堤浚河之任务。元朝时，有许多地方性质的运河管理机构，就设在聊城境内。至元二十四年（1287年）在临清设都漕运分司，管理该段漕运之事。至元二十九年（1292年），在东阿县景德镇（今阳谷县张秋镇），设立都水分监，管理会通河之水政。其管理区段是北起临清、南至徐州350余公里的河段。该运河段内的闸、坝、桥、涵、堰的兴建与维修，统归景德镇都水分监管理，足见当时张秋镇在运河上的重要性。据《山东运河备览》载，延祐六年（1319年），东阿设东阿监丞，为都水分监属官。元代还设有东昌纲，每编船30只为一纲，设押纲官2员，秩正八品。
明代的管理和机构
明朝建立以后，于永乐年间海运停止，南北运输专赖运河。为保证京杭运河的正常运营，运河管理机构也就较元朝更趋健全和完善。《张秋志》载：“张秋立都水分司，自成化间始，重河防也。”明朝总理河道一职为朝廷派出官员，常由侍郎、尚书衔任其职。总理河道以下按所分运河各段运道设立分司，多由工部郎中或主事任职。成化七年（1471年），明朝廷将运河分为三段管理。通州至德州为北段，德州至沛县为中段，沛县至仪真瓜洲为南段。各段均设分司，管理运河闸、坝、堰、涵事宜。此时中段分司，设在今阳谷县张秋镇。成化十三年（1477年），明朝廷又将运河改为两段管理，以济宁为界分为南北两段。南、北段各设都水郎中一员。《张秋志》载：“北河郎中一员，驻扎张秋，掌卫河、会通河漕政，北至天津，南至鱼台（属济宁）一带，凡泉、湖、闸、坝、堤、浅之事皆隶焉。”万历年间，又将运河分为四段管理，各段郎中主持管理。北河段管理机构仍设在张秋。各河段以下又设分司，主要官员为主事。临清分司即为此时所设。按其管理权限来讲，各运段郎中的职责主要是考核、稽查、调动及禁约本段运河官吏。各分司所设主事，则具体管理运河河道上各项工程设施，如闸、坝、浅、铺等。而各闸、坝、浅、铺又都有专门人员管理。从明代万历二十八年（1600年）所修《东昌府志》看，当时在东昌府境内最南部的闸是周家店闸，设闸官一员，设闸夫30人；李海务闸未设闸官，闸夫30人。聊城县（今东昌府区）境内设置浅铺23处，有浅夫70人；博平县（今属茌平县）境内有浅铺6处；堂邑县（今属东昌府区）境内有浅铺7处；清平县（今属高唐、临清二县市）境内有浅铺9处，浅夫66人；临清县境内有浅铺9处，浅夫171人。
当时所属东昌府的运河管理官员，还有管河通判一员，驻聊城。临清州有管河判官一员。聊城、堂邑、清平、临清各设管河主簿一员，博平县设管河典史一员。
明朝运河管理机构细密，管理队伍庞大，管理制度严格，在保证运道畅通方面，确实起到了相当重要的作用。
清代的管理和机构
清朝基本上沿用了明朝的管理体制，通过调整，管理机构更趋完备，职责更加分明，而且各级官员名称也有所变化。如明朝国家管理运河的官员称总河，清朝称河道总督。
在今聊城市辖区范围内，清朝的运河管理机构由南而北依次是：
兖州府捕务管河厅，设管河通判一员，驻张秋镇。据《张秋志》载，该机构在张秋镇西南隅，顺治十七年（1660年）通判吕振之重修二堂；康熙二年（1663年）通判马光远重修大堂；康熙八年（1669年）通判林梵于署中建书舍五间。阳谷管河主簿厅，设主簿一员，在张秋城北水门内北厅街。寿张管河主簿厅，设主簿一员，在张秋城南水门外河西岸。
东昌府上河厅，设上河通判一员，驻东昌府。管辖聊城、堂邑、清平、临清等处河道，又兼管馆陶卫河长18公里。聊城县设主簿一员，东昌卫设千总一员，又有聊城汛、东昌卫汛。堂邑、博平共设管河主簿二员，一位管运河东岸，一位管运河西岸，又有堂邑汛、博平汛。清平县设管河主簿一员，又有清平汛、左卫汛。临清州设管河州判一员，又设临清汛。
聊城县境内设浅夫97名，东昌卫设浅夫7名；堂博主簿管辖运河段，设浅夫51名；堂邑汛设浅夫45名；清平县之清平汛、左卫汛共设浅夫67名；临清州判管理运河段，设浅夫74名，又临清汛设浅夫35名。
明、清两朝，各闸座分别设有专门官吏和闸夫管理，人员虽有增减，但变化不大。
运道管理机构的主要职责有：一是管理运河上过往的船只，依次按漕、贡、官、民的次序通行；二是检查行运船只是否超长、超宽、超重；三是检查各闸坝官吏是否徇私舞弊，故意拖延阻滞船只通行，借以敲诈钱财；四是负责沿河堤岸、闸坝的管理和维修、水源的保护和补给。在这些方面，会通河的管理机构起了很大作用。