【疾病预防控制】 年内，市卫生系统认真贯彻新修订的《传染病防治法》，依法加强对传染病、地方病和慢性非传染性疾病的防治工作，2006年累计报告法定传染病20种，其中甲类零报告，乙类14种，丙类6种。
流感与人禽流感防治 9月份举办“全市流感/人禽流感监测与防治技术”培训班，对专业人员进行防治技术培训。重新调整355个公共卫生监测点，在市中心医院、市儿童医院设立国家级和省级监测点，在泰山区人民医院设立省级监测点，将人禽流感和非典、流感一并列入监测内容。年内，未发现人感染高致病性禽流感。
艾滋病防治 年内承担国家转移支付项目、全球基金艾滋病防治项目、中美合作GAP项目、哨点监测、国家艾滋病防治示范区等工作。重点加强艾滋病疫情监测和控制，推广重点人群高危行为干预措施，在全省率先开展城区建筑工人艾滋病防治知识宣传和行为干预，落实“四免一关怀”（按照有关规定对艾滋病病人免费提供抗病毒药物、免费提供咨询和初筛检测、免费提供母婴阻断药物及婴儿检测试剂、艾滋病病人的孤儿免收上学费用，将生活困难的艾滋病病人纳入政府关怀救助范围）政策，防治工作取得新成绩。新泰市作为国家艾滋病防治示范区，承担全球基金艾滋病防治项目、国家艾滋病转移支付项目，多次迎接国家艾防办、省卫生厅的检查，受到检查组的高度评价。岱岳区克服地域广、人口多的困难，完成对外来妇女的专项调查工作。宁阳县创新工作思路，利用农民工返乡时机强化宣传，收到良好效果。2006年，全市哨点检测各类人群800余人，对献血人员、住院病人、术前病人、羁押人员、劳务输出人员、涉外宾馆服务人员等7.78万人进行常规监测。全年发现艾滋病感染者17例。为11名生活困难的艾滋病病毒感染者和病人办理城镇最低生活保障补助，对5例艾滋病病人进行免费抗病毒治疗（其中1例因回原籍自动放弃治疗）。
霍乱等腹泻病防治 4月1日，全市腹泻病门诊按时开诊，按照《山东省腹泻病门诊工作规程》要求，认真落实“有泻必登、有泻必检、有泻必报、有泻必治”制度，4～10月，共登记腹泻病人8123例，检查腹泻病人890份均为阴性。
结核病防治 以健康宣教为先导，以实施结核病控制项目为载体，以痰涂片检查和全程督导为手段，以病例发现和归口管理为重点，全面加强四级防痨网建设，形成市、县、乡、村现代结核病控制新体系，达到“高发现率、高治愈率”的现代结核病控制策略目标，新发涂阳结核病发现指标完成率达到122.04%，对1879例新发涂阳肺结核病人提供免费治疗，新发涂阳和复治涂阳病人治愈率分别达97.9%和90.6%。6月下旬，省卫生厅组织的结核病联合督导团，对岱岳区实施的国际防痨联盟结核病控制项目工作给予高度评价。宁阳县被省卫生厅命名为全省结核病防治示范县。
【计划免疫】 继续以巩固消灭脊髓灰质炎和麻疹控制成果为重点，以规范预防接种门诊管理为基础，全面落实各项免疫预防技术措施。①加强AFP病例监测。制订《泰安市流动人口计划免疫管理办法》，为免疫规划的落实提供政策保障。及时报告率、调查率、送样率、随访率及合格标本采集率均达到80%以上的监测指标要求。报告麻疹疑似病例942例（其中，实验室确诊麻疹19例），及时报告率98.71%，及时调查率97.10%，散发病例标本采集率96.12%，暴发病例采样率43.60%。②免疫接种。做好脊髓灰质炎和麻疹疫苗强化免疫工作，强化免疫接种率达到95%以上。市卫生局、教育局联合下发《关于进一步做好风疹控制工作的实施意见》，实行新入学、入托儿童预防接种证查验制度，对1987年1月1日至1995年12月31日出生人群进行风疹疫苗的应急免疫接种。10月，下发《泰安市入托入学查验预防接种证工作检查方案》，确保预防接种证查验和疫苗补种工作的落实，巩固提高重点免疫屏障，全市适龄儿童Ⅰ类疫苗接种率均在95%以上。③规范预防接种门诊。按照《疫苗流通和预防接种管理条例》要求，对全市201家预防接种单位资质重新审核认证，有165处通过审核。
年内，岱岳区、泰山区和宁阳分别完成国家、省CDC组织的孕妇风疹感染调查和国家CDC全国乙肝血清流行病学调查工作。泰山区、东平、新泰、宁阳先后迎接省卫生厅组织的两轮脊灰强化免疫工作检查和流脑强化免疫工作考核，均达到省厅要求。
【妇幼保健】 年内，深入贯彻“一法两纲”（《中华人民共和国母婴保健法》《泰安市妇女发展规划纲要》《泰安市儿童发展规划纲要》），建立健全全市妇幼保健信息网络，完善孕产妇、儿童死亡率和出生缺陷监测报告制度，实施降低孕产妇和婴儿死亡率行动计划，依法加强妇幼卫生管理和督导，提高母婴保健水平。
【市中心医院分院（传染病医院）门诊大楼对外接诊】 市中心医院分院（传染病医院）为副县级全额预算管理事业单位，位于长城路京沪立交桥北，占地10公顷，预计投资1.9亿元，设计床位450张。一期工程门诊楼、病房楼和综合配套楼已经建设完工，建筑面积达2万平方米，开放床位150张，于2006年10月对外接诊。