【传染病综合防治】 2016年，全省甲乙类传染病法定报告发病率为137.19/10万，处于全国较低水平，乙肝、结核病、手足口病等传染病得到有效控制。省卫生计生委配合相关部门妥善做好非法经营疫苗案件处置有关工作。完成了脊灰免疫策略调整，免疫规划疫苗接种率保持较高水平。连续五年无本地感染疟疾病例，10个市达到消除疟疾标准。连续保持碘缺乏病消除状态，地方病防治成果进一步巩固。加强疾控体系建设，明确各级疾控机构人员编制标准，启动了县级疾控中心实验室装备项目。
【慢性病防治】 截至2016年底，全省累计创建17个国家级和46个省级慢性病综合防控示范区，国家级示范区数量居全国第4位。完成减盐防控高血压项目终期评估，居民标准人日调味品食盐摄入量由2011年的12.5克下降至2016年的10.13克，高血压患病率由23.9%降至22.2%，项目入选第九届全球健康促进大会优秀案例。
【精神卫生管理】 全省注册精神科医师、助理医师2252名，所有县（市、区）全部设立有精神疾病诊疗资质的机构，50万以上人口的县（市）基本具备提供精神疾病患者住院治疗的服务能力，消除县域精神卫生诊疗服务空白。做好严重精神障碍患者报告和管理工作，全省在册严重精神障碍报告患病率4.11%，管理率85.66%。启动省级心理健康服务与精神障碍综合防治试点，卫生计生、综治、教育、公安等12部门确定烟台、潍坊、聊城3市作为省级试点，推动试点地区在全省率先建成较为完善的具有地方特色的心理健康服务与精神障碍综合防治网络。
【环境卫生与职业卫生】 开展饮用水水质监测，检测范围扩大到所有市辖区、县（市）城区和80%以上乡镇。加强职业卫生技术人员培训，职业病监测报告网络实现省、市、县全覆盖。
【减盐防控高血压百日行动】 2016年1月12日，省卫生计生委、省教育厅、省食品药品监督管理局、省商务厅、省妇联在济南市联合召开全省减盐防控高血压百日行动视频会议，就百日行动进行专项部署。减盐防控高血压百日行动以春节、元宵节等为节点，以倡导健康饮食文化为主要内容，集中开展减盐宣传干预活动。全省减盐防控高血压百日行动共包括四项内容；中小学生中“减盐，我做主”健康教育“五个一”实践活动；餐饮单位“四个一”减盐干预活动；食品商场超市“比比食品盐含量”减盐宣传活动；“减盐知识进万家”公益宣传活动。
【爱国卫生工作】 2016年，按期完成第二轮健康山东行动，各主要指标顺利实现。新创建国家卫生县城（乡镇）15个，省级卫生乡镇134个、卫生村710个、卫生先进单位306个。国家卫生城市累计26个，居全国第二位。济南、烟台、威海3市成为国家健康城市建设试点市。开展健康素养促进行动，创建6个全国健康促进试点县（市、区）、34个省级试点县（市、区）。居民健康素养水平达12.08%，高出国家平均水平1.73个百分点。
【出生缺陷综合防治】 2016年，全省出生缺陷省级监测点增至126个，产前诊断机构已达30家，实现了17市全覆盖，出生缺陷综合防治服务网络逐步健全完善。全省婚检率为65.7%、产前筛查和诊断率分别为85.04%、36.68%；免费孕前优生健康检查149.42万人，完成艾滋病初筛110.96万人；农村妇女免费服用叶酸累计73.49万人；新生儿四种遗传代谢性疾病免费筛查和听力筛查率分别达98.77%和98.13%。
【卫生应急救援】 2016年，山东省卫生部门参与处置重大级以上和敏感事件32起，累计派出省级专家组41支，完成2016中国绿公司年会、第九届海内外高端人才交流会等一系列重大活动和专项任务的医疗卫生保障任务。防范寨卡病毒、黄热病疫情输入发生，科学有效应对H7N9流感疫情。
【食品安全风险监测】 2016年，全省卫生计生食品安全监测网络进一步拓展和完善，全省新增272家食源性疾病监测哨点医院，病例监测覆盖全部县（市、区），暴发事件和异常健康事件监测网络拓展到全省所有医疗机构，初步建立省卫生计生委负总责，以省疾控中心为技术核心，区域中心实验室为骨干、各级疾控中心为主体、哨点医院密切配合的食品安全风险监测网络。年内，完成监测样本2.5万份，获得监测数据21万条。