伊斯兰教亦称“回教”、“清真教”、“天方教”。七世纪初，穆罕默德创立于阿拉伯半岛。其经典曰《古兰经》；其基本教义为六大信仰：即信真主、信天使、信先知、信经典、信前定、信后世；其主要功课为五大功修：即念功、拜功、斋戒、天课、朝觐。该教于唐代传入中国，清代传入县境。据军屯回族《张氏家谱》记载，其始祖系湖广荆州卫户，1403年(明成祖永乐元年)随明永乐北迁，在东昌府东关落户。1662年(清康熙元年)黄河决口，濮南曹北一片汪洋，田园荒芜。九世祖张万钟乘机捐资开垦荒地40余顷，任东昌卫粮。十世祖金玺立村命名杨宣屯，军屯乃西八屯之一。十一世祖芳秀立茔地，设学校，教耕读，修清真寺于村西。自此，伊斯兰教在鄄城开始传布。
清真寺是回族穆斯林(即教徒)的宗教活动场所。鄄城有清真寺4处：
军屯清真寺 位于董口乡军屯村前。该寺始建于1745年(清乾隆十年)，原址在村西，有房6间，寺宅1.6亩，寺田48亩。后因黄河决口，寺院淹没，遂于1796年(清嘉庆元年)移修于村东，房3间，寺宅1.2亩。1845年(清道光二十五年)重修寺院，规模扩大，占地60亩。1922年再度重修，扩建大殿8间，南屋5间，北屋4间。“文化大革命”期间(1966-1976)损毁甚重。1986年投资35万元在村南新建寺院，占地6600平方米，建筑面积780平方米。建有朝真殿8间，长36米，宽114米，座西朝东，门楼高耸，飞檐挑角，古雅大方，望月楼4层，高19米，直径5米，六角尖顶，巍然矗立，登楼可观新月。1987年建水房5间，长16米，宽6米，讲堂5间，大门1座。
清真寺亦称礼拜寺，是伊斯兰教徒礼拜、诵经之处。
前园清真寺 1920年从军屯分坊建寺，有大殿3间，北屋4间，寺宅3亩。抗日战争时期被日军焚为废墟。1944年重建，正殿5间，水房3间，讲堂4间，共占地340平方米。该寺古朴大方，穆斯林得以享受经堂聚礼之乐。1960年大刮平调风，将大殿拆除。自此，前园穆斯林每逢聚礼节日，如群鸟无栖宿之林。1978年后，前园穆斯林脱贫致富，精神振奋，于1989年6月重建清真寺，殿堂8间，占地2亩。
临濮清真寺 建于1923年，有正殿、南屋、北屋各3间，大门1间(两侧有小门)，二门1间，二门外有北屋3间。寺宅2.5亩，寺田10亩。1935年黄河决口时被水冲毁。后建北屋3间，土改时分给贫民居住。1989年重建大殿3间，占地0.5亩。
军集清真寺 建于1935年，有土房2间，占地0.4亩。1942年增建4间。1985年建正殿3间，北屋4间，占地1亩。
该教一般不横向发展，其教徒人数随本族人口的繁衍而变化。
境内各坊寺均属古行老派，无教派之争。各清真寺内有阿訇、二阿訇、乡老和海里凡。阿訇由寺内乡老负责聘请，主持教务和穆斯林的婚丧大事，二阿訇专司宰杀，乡老是阿訇的助手，帮助阿訇办理一切教务与民事。军屯寺现任阿訇张兆毅，二阿訇张克念；前园寺现任阿訇张兆杰，二阿訇马春英；军集寺现任阿訇马提杰。海里凡，意为学生、继承人，在寺内学习阿拉伯语、波斯语和《古兰经》，学业期满后即为待聘阿訇。军屯寺第九任阿訇杨子荣，曾于建国初期培养出三个海里凡。即：马思明(马垓人)，张苏建(沙垓人)，和定陶一人(姓名不详)。
伊斯兰教信徒称为“穆斯林”，其风俗习惯，有特异之处。服饰，平时略同于汉民，唯遇礼拜或节日，男的多戴白帽，女的则戴黑纱盖头，掌教缠头，称“台斯他”。穆斯林很注意饮食卫生，以米面为主食，兼食牛羊肉，但必须由二阿訇宰杀或放血后方可食用。忌食猪肉及自死动物肉。婚俗与汉民相似，但结婚时须由阿訇主持婚礼。汉女可嫁回男，但必须遵依回民风俗。穆斯林实行土葬，由阿訇主持葬礼，先为死者净身，用45尺白布裹身，然后行土葬，墓呈长方体型。
穆斯林必须按时参加宗教活动，主要有：1、每日五次礼拜；2、每周星期五午后主麻拜，亦称“聚礼”；3、每年开斋节和宰牲节的礼拜，合称“会礼”；三大节日为：开斋节、宰牲节、圣纪节。开斋节在希吉拉历十月初，一般要举行会礼和庆祝活动。穆斯林皆穿新衣，行洗礼，家家吃油香，欢度节日。宰牲节亦称“古尔邦节”，希吉拉历十二月十日举行。是日，穆斯林沐浴盛装，举行会礼，互相拜会，宰杀牛羊，互相馈赠。圣纪节，伊斯兰教以希吉拉历三月十二日为穆罕默德诞生纪念日，同时又是穆罕默德逝世纪念日，称为“圣忌”。今多合并纪念，俗称办“圣会”。节日活动有诵经，赞圣，讲述穆罕默德生平事迹等。
清末、民国时期，统治者实行分化瓦解，残酷镇压少数民族的政策，因此激起回民多次强烈反抗。抗日战争与解放战争时期，境内回民积极响应共产党的号召，踊跃参军参战，为中华民族的解放事业做出应有的贡献。
建国后，由于贯彻了党的民族政策和宗教政策，因而提高了回民的社会地位，调动了他们的生产积极性。“文化大革命”期间，由于左倾错误的干扰，伊斯兰教深受其难，清真寺遭到不同程度的破坏，穆斯林不能过正常的宗教生活，不能遵循本教的风俗习惯。中共十一届三中全会以后，伊斯兰教重获新生。截至1990年，穆斯林参加工作的共有94人，县人大代表3人，县政协委员7人，县委委员1人，团省委委员1人，经学院学员1人。军屯村政治安定，经济繁荣，文化发展，全村穆斯林已过上小康生活。1983年，在村党支部书记张广诗的领导下，建起全地区第一座回民中学。1984年，军屯村进行新村建设，村容焕然一新；1986年于村南建起巍峨的清真寺和“裘皮制革厂”。1986年，军屯村被山东省命名为“文明村”。
四坊清真寺一览表
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│寺名 │建寺时间│现有房│现任 │备注 │
│ │ │(间) │阿訇 │ │
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│军屯寺│清康熙 │18 │张兆毅│建寺后历经三迁，19│
│ │年间 │ │ │86年重建于村南 │
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│前园寺│1920年 │8 │张兆杰│建寺后曾两次被毁，│
│ │ │ │ │1989年重建 │
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│临濮寺│1923年 │3 │ │1935年被黄河水冲毁│
│ │ │ │ │，1989年重建 │
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│军集寺│1936年 │7 │马提杰│1985年复修，建正殿│
│ │ │ │ │3间，北屋4间 │
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各坊穆斯林人口变化一览表
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│时间人口村名│1956年 │1982年 │1986年 │1990年 │
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│ │户数│人数│户数│人数│户数│人数│户数│人数│
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│军屯 │146 │785 │209 │1012│300 │1050│ │ │
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│前园 │124 │636 │185 │911 │ │1100│ │ │
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│军集 │26 │163 │ │ │51 │250 │ │ │
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│临濮 │15 │43 │ │ │12 │55 │ │ │
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│总计 │311 │1627│ │ │ │2455│ │2683│
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