私塾 清末，较大村庄都办有私塾。1911年（清宣统三年），全县共设私塾402处，学生6000余人。私塾分四类：（一）学塾，若干家合资聘请塾师，按学生年龄、程度、家境交纳学资，这类私塾较多；（二）家塾，绅商大户自聘塾师，教学范围只限该户子第；（三）学馆，塾师自设，自收学童，自收学资，这类私塾较少；（四）义塾（义学），以祠堂庙宇的地租或私人捐款举办，学童免费上学，当时全县仅有两处。
私塾学童年龄不限，初入学者一般先读《三字经》、《百家姓》、《千字文》，后读“四书”、“五经”。私塾学规极严，学生上课时须持签出入塾屋。对学生的品德要求是“循规蹈矩、少年老成”。学生稍有不规，轻则呵斥，重则体罚（打戒尺、敲火筒及罚跪等）。
民国时期，部分私塾转为学校，合格塾师继任学校教师。但在偏僻村庄仍有私塾存在，学习方法和内容略有变通。抗日战争期间，日伪统治区部分村庄又办起私塾。抗日战争胜利后，郓城没人再办私塾。
书院
宣文书院 县城东门内曾有“步云书院”，后被水淹毁。1876年（清光绪二年）重建书院。邑绅侯选训导王锡辅捐房44间作书院，城东无主沙荒地批归书院，令各租户纳3年坐地租。建大门3间，门前照壁、讲堂3间、堂左右耳房6间，题名：“嶽云书院”。1881年（清光绪七年），改“嶽云书院”为“宣文书院”。书院设院董会，由有名的乡贤硕儒组成。入院学习的生员，分“文生月课”和“童生常课”。“文生月课”是秀才为乡试应举，每月定期（2次）来院听讲，并送交习作请师评阅。“童生常课”是童试合格或相当程度的生员，入院专攻经史，常年在院就读，准备届时应考。1905年（清光绪三十年），“宣文书院”改名“宣文学堂”。
书院奉行科举取士制度。从清顺治年间至清光绪年间，全县共考中举人57名、进士19名。
重华书院 1924年（民国13年），王鸿一邀请北京大学教授梁漱溟、王平叔，北大哲学系学生陈亚三等在菏泽文庙旧址创办重华书院。开设科目有：“东西文化及其哲学”、“五经”、“四书”、“许氏说文解字”、“读通鉴论”、“古典文学”、“中国文学史”、“数学”、“英语”、“地理”、“测绘”等，除专职教师授课外，还常请外地教授来院讲学。
1929年（民国18年），重华书院自菏泽迁至郓城黄安北门外古庙址，易名为“重华学院”，陈亚三任院长。教员稍有变动，学生有从菏泽跟来的，有黄安“乡村自治人员训练所”的学员转来的，其他学员多是由里长推荐的，共有学员80人。学院设有图书馆，藏有古今中外书籍4000余册。学员以学习东方文化为主，也自由阅读《列宁传》、《资本论》、《人口论》等一些西方社会科学书籍，在抗日战争时期，学院大部分学员参加了抗日救亡工作团。
重华学院的办学经费主要由王鸿一在内蒙古经营的包头面粉公司拨款捐助，同时也请省内外知名人士捐募。1930年（民国19年）7月，王鸿一突然病逝，学校经费无着，遂于年底停办。
儒学（县学） 宋、元时期即设。至明成化年间，知县任昶于新城扩地复修，有学田2顷34亩2分。清沿明制，府、州、县均设儒学。儒学长期保持廪生（廪膳生，岁考、科考成绩最优者）20名，增生（增广生，成绩次者）20名，附生（通过“童试”被录取者）20名。儒家经典、《大清律》、《训饬士子文》、《圣谕广训》为必修课，宋、明理学也是重要学习内容，还有制艺（学写八股文）、对策等科目。儒学生员定期听课，写文章，作诗词，请教师指导批阅。每月参加课试，每年参加岁试。岁试成绩优者附生补增生，增生补廪生；成绩劣者，廪生降为增生，增生降为附生，附生黜革。通过科试（乡试的预考），取得前三名者，可参加乡试，争取贡生资格。