元、明及清朝前期，境内河流属运河水系。1855年黄河于铜瓦厢（今河南省兰考县城西北）决口以后，河水在境内洼地漫溜，逐步形成两大水系，一是东平湖水系，包括宋金河以西、临黄堤以东地区，依靠宋金河排水入东平湖；二是南旺湖水系，包括宋金河以东、以南地区，依靠赵王河、太平溜排水入南旺湖。这种趋势一直维持到1958年未变。1959—1960年，山东省人民政府开挖了梁济运河，宋金河以西、临黄堤以东地区河流沥水由宋金河经梁济运河进入南四湖，与宋金河以东、以南地区的沥水，流入淮河，县境始统属淮河流域。至1990年，境内除黄河外流域面积在100平方公里以上的河流12条，流域面积在20平方公里以上的河沟有46条，分别属于梁济运河、洙赵新河两大水系。各河流水源，主要是通过虹吸来自黄河，其次是雨、雪积水。境内主要河道1990年状况如下：
黃河 自西北边境穿过，于大潭乡徐码头入境，经苏阁、李集、伟庄等乡至仲潭出境，全长33.7公里，流域面积158平方公里。为境内旱年主要水源。
赵王河 自西南徐垓乡于楼入境，穿唐庙、三屯、南赵楼、郭屯、随官屯、汉石桥等乡，于谭庄出境至巨野县，境内全长40公里，除涝流量74.7立方米/秒，流域面积380平方公里。
宋金河 1964年修浚八里河后，使唐店至八里河一段成为一座中型水库，1976年正式命名为坝头水库（现称宋金河水库）。北起唐店闸，南至边庄沟，全长9.8公里，底宽100米，河底高程40米，年平均积水面积8000亩，每年引蓄水量1738.2万方。流域面积133平方公里。
郓城新河 横贯县境北部，西起张鲁集乡老李庄，穿水堡、刘口、玉皇庙、侯集、潘渡、王井、杨庄集、大人10个乡，东至唐楼入梁山县境，全长42公里。河底宽22米，除涝水位41.42米，除涝流量88立方米/秒。流域面积675平方公里。
鄄郓河 纵穿县境西部，北起张鲁集乡郑庄，流经水堡、陈坡、郭庄、五界首、双桥、武安、三屯、郭屯、南赵楼、汉石桥11个乡，于王坊村入巨野县境，全长44公里。河底宽43米，除涝水位41.24米，除涝流量254立方米/秒。流域面积975平方公里。
郓巨河 北起程屯乡李统庄，流经王井、常庄、杨庄集、丁庙、张营、丁里长、黄堆集、随官屯9个乡，自王官屯村入巨野县境，全长30公里。河底宽52米，除涝水位39.20米，除涝流量224立方米/秒。流域面积825平方公里。
洙赵新河 横穿郓南境内，西自徐垓乡于楼，流经唐庙、南赵楼、汉石桥乡，东至王坊入巨野县境，境内全长19公里。底宽58米，最大蓄水深4米，除游水位44.0米，除涝流量238立方米/秒。流域面积122平方公里。
丰收河 横于境内东北部，西北起自李集乡李晓岚村，流经梳洗楼、黄集、侯咽集、肖皮口、程屯、常庄、杨庄集、大人等9个乡，于唐楼闸入郓城新河，全长34公里。底宽26米，除涝水位34.57米，除涝流量96立方米/秒。流域面积340平方公里。
琉璃河 位于东北边境，西北起自程屯乡河王楼，经常庄、杨庄集乡，在东孟庄入梁山县境，全长16公里。底宽9—12米，除涝流量27立方米/秒。流域面积218平方公里。
三分干河 西自黄安乡桑庄，东止武安乡李垓入鄄郓河，流经黄安、武安、三屯3个乡，全长17公里。河底宽15米，除涝水位42.8米，除涝流量108立方米/秒。流域面积305平方公里。
华营河 西自陈坡乡范屯，东至双桥乡王营，流经陈坡、黄安、五界首、武安、双桥5个乡。底宽8米，除涝水位45米，除涝流量52立方米/秒。流域面积142平方公里。
地表水水质状况基本良好，除宋金河外，鄄郓河、郓巨河、洙赵新河、赵王河等污染不明显。耗氧量为二级，溶解氧一处为二级，其他均符合一级标准。宋金河水库污染严重，主要是县城工厂排放污水造成。据坝头桥和八里河桥附近取水化验，宋金河水库氨氮0.127毫克/升，达到五级标准，五项毒物中酚有1处符合二级标准，一处符合三级标准，其余各项都是一级标准。
第一节 地表水
元、明及清朝前期，境内河流属运河水系。1855年黄河于铜瓦厢（今河南省兰考县城西北）决口以后，河水在境内洼地漫溜，逐步形成两大水系，一是东平湖水系，包括宋金河以西、临黄堤以东地区，依靠宋金河排水入东平湖；二是南旺湖水系，包括宋金河以东、以南地区，依靠赵王河、太平溜排水入南旺湖。这种趋势一直维持到1958年未变。1959—1960年，山东省人民政府开挖了梁济运河，宋金河以西、临黄堤以东地区河流沥水由宋金河经梁济运河进入南四湖，与宋金河以东、以南地区的沥水，流入淮河，县境始统属淮河流域。至1990年，境内除黄河外流域面积在100平方公里以上的河流12条，流域面积在20平方公里以上的河沟有46条，分别属于梁济运河、洙赵新河两大水系。各河流水源，主要是通过虹吸来自黄河，其次是雨、雪积水。境内主要河道1990年状况如下：
黃河 自西北边境穿过，于大潭乡徐码头入境，经苏阁、李集、伟庄等乡至仲潭出境，全长33.7公里，流域面积158平方公里。为境内旱年主要水源。
赵王河 自西南徐垓乡于楼入境，穿唐庙、三屯、南赵楼、郭屯、随官屯、汉石桥等乡，于谭庄出境至巨野县，境内全长40公里，除涝流量74.7立方米/秒，流域面积380平方公里。
宋金河 1964年修浚八里河后，使唐店至八里河一段成为一座中型水库，1976年正式命名为坝头水库（现称宋金河水库）。北起唐店闸，南至边庄沟，全长9.8公里，底宽100米，河底高程40米，年平均积水面积8000亩，每年引蓄水量1738.2万方。流域面积133平方公里。
郓城新河 横贯县境北部，西起张鲁集乡老李庄，穿水堡、刘口、玉皇庙、侯集、潘渡、王井、杨庄集、大人10个乡，东至唐楼入梁山县境，全长42公里。河底宽22米，除涝水位41.42米，除涝流量88立方米/秒。流域面积675平方公里。
鄄郓河 纵穿县境西部，北起张鲁集乡郑庄，流经水堡、陈坡、郭庄、五界首、双桥、武安、三屯、郭屯、南赵楼、汉石桥11个乡，于王坊村入巨野县境，全长44公里。河底宽43米，除涝水位41.24米，除涝流量254立方米/秒。流域面积975平方公里。
郓巨河 北起程屯乡李统庄，流经王井、常庄、杨庄集、丁庙、张营、丁里长、黄堆集、随官屯9个乡，自王官屯村入巨野县境，全长30公里。河底宽52米，除涝水位39.20米，除涝流量224立方米/秒。流域面积825平方公里。
洙赵新河 横穿郓南境内，西自徐垓乡于楼，流经唐庙、南赵楼、汉石桥乡，东至王坊入巨野县境，境内全长19公里。底宽58米，最大蓄水深4米，除游水位44.0米，除涝流量238立方米/秒。流域面积122平方公里。
丰收河 横于境内东北部，西北起自李集乡李晓岚村，流经梳洗楼、黄集、侯咽集、肖皮口、程屯、常庄、杨庄集、大人等9个乡，于唐楼闸入郓城新河，全长34公里。底宽26米，除涝水位34.57米，除涝流量96立方米/秒。流域面积340平方公里。
琉璃河 位于东北边境，西北起自程屯乡河王楼，经常庄、杨庄集乡，在东孟庄入梁山县境，全长16公里。底宽9—12米，除涝流量27立方米/秒。流域面积218平方公里。
三分干河 西自黄安乡桑庄，东止武安乡李垓入鄄郓河，流经黄安、武安、三屯3个乡，全长17公里。河底宽15米，除涝水位42.8米，除涝流量108立方米/秒。流域面积305平方公里。
华营河 西自陈坡乡范屯，东至双桥乡王营，流经陈坡、黄安、五界首、武安、双桥5个乡。底宽8米，除涝水位45米，除涝流量52立方米/秒。流域面积142平方公里。
地表水水质状况基本良好，除宋金河外，鄄郓河、郓巨河、洙赵新河、赵王河等污染不明显。耗氧量为二级，溶解氧一处为二级，其他均符合一级标准。宋金河水库污染严重，主要是县城工厂排放污水造成。据坝头桥和八里河桥附近取水化验，宋金河水库氨氮0.127毫克/升，达到五级标准，五项毒物中酚有1处符合二级标准，一处符合三级标准，其余各项都是一级标准。