明、清时期，设有书房或书吏房，为文件档案、图书保管之地，由主簿掌管。
民国时期，国民政府由秘书掌管档案。
抗日战争和解放战争时期，县人民政府由秘书负责文件收藏、保管，无专门档案机构。
建国初期，仍由秘书部门负责档案处理。1954年，中共郓城县委成立机关档案室。1956年4月，郓城县人委档案室建立。1958年10月，县人委成立“整理积存档案委员会”。1958年8月，在中共郓城县委、县人委2个档案室的基础上，建立了县档案资料馆、编制3人。隶属县委、县政府两个办公室领导。1963年3月15日，郓城县档案管理科成立，编制4人。科、馆合署办公。1967年，由于“文化大革命”，档案机构瘫痪，干部调离。1972年，郓城县革命委员会办公室设档案组，配干部3人。1979年6月14日，恢复郓城县档案科，配干部4人，属县委办公室领导。1980年3月8日成立档案局，恢复档案馆，局、馆合署。1984年4月，机构改革，由局改科，与档案馆合署办公。1986年2月15日，恢复档案局、设局长1人、副局长3人，编制10人。1990年，档案局下设秘书、档案管理、业务指导、编研4个股。