1986～1990年，菏泽市共产主义青年团组织建设齐全，有基层团委31个，团
支部1625个，共青团员46070名。1990年，菏泽市部分企业划归菏泽地区管理后，
企业所在团组织同时划归团地委管理。1991～1995年，菏泽市有基层团委31个，
团支部1505个， 共青团员42623名。1995年后，企业不断深化改革，大多数改制
企业做到了团组织不断线，也有个别企业破产或者被兼并，团组织随之消失。随
着非公有制经济组织兴起，使团组织发展有了很大空间。1995～2000年，菏泽市
有基层团委39个， 团支部1623个，共青团员44476名。2001年后，牡丹区团组织
建设得到进一步发展。2001年基层团委45个，团支部1731个，共青团员47256名。
2002年， 基层团委49个，团支部1825个，共青团员51323名。2003年，基层团委
52个， 团支部2231个，共青团员54723名。2004年，基层团委56个，团支部2372
个，共青团员57342名。2005年，基层团委62个，团支部2623个，共青团员60223
名。
1988年，按照团中央的要求和团省委的工作安排意见，全市基层团组织开展
了建设"青年之家"活动。到1995年建立青年之家1348处，其中获地区以上奖励的"
青年之家"47处。2002～2005年，按照团省、市委要求，实施了共青团"凝聚力工
程"。 加强基层组织建设，调整配齐了农村团支部书记，全区87个社区全部建立
团组织，并新发展全区26所民办学校及鲁鑫超市、步步高海鲜大酒店等非公有制
经济组织团组织。2005年团区委被授予"山东省团建先进县(市、区) "、"山东省
共青团凝聚力工程优秀组织奖"等称号。