牡丹区的地理和气候条件适于多种林木种类的生存和生长，据多年积累调查，
分布在牡丹区的树种共有51科106属228种，其中乔木112种，灌木及小乔木108种，
藤木8种。 主要树种为杨树、泡桐、刺槐、白榆、臭椿、苦楝、旱柳、国槐、侧
柏、桑等用材树种和苹果、梨、桃、柿子、枣、杏、葡萄、木瓜、山楂等果树种，
以及紫穗槐、白蜡、杞柳、牡丹等灌木类树种。
杨树
以其生长快、材质好、用途广、效益高、易栽植、易管理、深受人们喜爱，
不论是品种的引进还是从数量的增加在牡丹区发展都十分迅速。在20世纪80年代，
以小叶杨为代表， 杨树占树木比例为25.2%。20世纪90年代引进中林46杨，占树
木比例上升到60%。到2005年底杨树比例达到80%以上，品种主要有中林46、中菏
1号、107、108、L35等，杨树是牡丹区最有优势的的树种。
榆树
是牡丹区的主要乡土树种，在20世纪80年代初占到树木总数的近三分之一，
村镇四旁植树以其居多，栽植数量大、分布广。20世纪80年代发生严重的金花虫
灾害，使榆树数量急速下滑，到2005年底所占树木比例还不足3%，缩至原来的十
分之一。
桐树
是一个速生、优质的树种。20世纪80年代前菏泽市大搞桐粮间作，并引进新
品种豫林一号等， 使栽植数量迅猛增加。 到1988年，菏泽市桐粮间作面积达到
6.67万公顷， 田旁、片林总株数超过800万株，比1981年翻了两翻多，所占比例
上升到25%。 1989～2000年种植数量迅速下降，原因一是水利条件的改善，大水
灌田使桐木受害严重；二是大力发展经济林，挤占了间作地；三是粮食价格的提
升，以及桐木价格的下降。2001～2005年，虽然提倡间作但成效不大，总面积不
过6666.67公顷，比高峰期减少90%。
苹果树
1985年开始提倡发展经济林，调整农业种植结构，苹果树种植面积增加。到
20世纪90年代初期，经济林发展迅猛，1995年仅苹果园面积就达到6666.67公顷，
株数600万株， 比例由1981年的不足10%上升到20%，数量增加40倍之多。后由于
果品价格骤跌，极大地损害了果农的积极性，造成大面积毁灭果园。到2000年，
全市有苹果园1300公顷。2005年，全区有苹果园1500公顷。